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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28270 LG7 49584103 49587495 PREDICTED: probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g36180
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 49584116 missense_variant p.Pro1127His
T/A 49585323 missense_variant p.Asn725Tyr
G/A 49585851 missense_variant p.Pro549Ser
G/A 49586296 synonymous_variant p.Phe400Phe
G/A 49586381 missense_variant p.Ala372Val
G/A 49586391 missense_variant p.Leu369Phe

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28270.1
MATTVTFFTLRLVAFFAFLTITITITTAQNTTASEIQALTAFKRNLHDPLGSLDGWDSSTPSAPCDWRGIVCLNNRVHYLRLPRLQLAGELSPSLSNLLQLRKLSLHSNNLNSSIPPSLSQCLFLRAVYLHNNRLSGHLPRQLLNLTNLQILNLAHNLFTGEIPDQLSVSLRFLDLSDNAFSGDIPANFSSKSQLQLMNLSYNRLSGGIPGSLGKLQNLQFLWLDSNHIHGTFPSAIANCSSLVHLSAEDNVLTGLLPLTLVTIPKLQVLSLSGNQLSGLVPKSFFCNSHLQSLNLGFNSFTGFSAPQSEECNSILEILDVQENHIAPTRFPSWLTQTTKSLKVLQLSGNFFTGSLPVDIGNFLALEELRVANNLLSGGIPPSIVNCRLLKVFDLEGNRFSGLIPEFLGDMRNLKEFSLAGNLFTGSIPSSFGTLSALETLNLSDNKLTGVVPKEIMKLGNVTELNLSNNEFSSQLWSNIGDMTGLQVLNLSRCGFSGRVPASLGNLMRLTVLDLSKQNLSGELPLEVFGLPSLQVVALQENRLSGKVPEGFSSIVSLRYLNLSSNEYVGGIPMTYGFLSSLTILSLSHNSVSGEIPPEIGGCSQLEVLQLQSNFLQGNIPGDISRLSHLKELNLGHNRLKGDIPDEISECSALSSLLLDGNHFTGRIPGSLSKLSNLTVLNLSSNLLNGEIPVELSSISGLEYLNVSSNNLGGEIPYVLGARFNNPSVFAMNQGLCGKPLQRECAKVRRRKKRRLIMLIGVGVAGLCLLALCCCGYVYSLLRWRKKLREGVTGEKKRSPSTSAGSRGSGENGGPKLVMFNNKITYAETLEATRNFDEENVLSRGRYGLVFKASFQDGMVLSIRRFVDGFLDEANFRKEAESLGKVKHRNLTVLRGYYAGPPDVRLLVYDYMPNGNLGTLLQEASQQDGHVLNWPMRHLIALGIARGLAFLHSVPIVHGDVKPQNVLFDADFEAHLSEFGLERLTVAAAAEASSSSTPVGTLGYVSAEAVSSGVATKESDVYSFGIVLLEILTGKKPVMFTEDEDIVKWVKKQLQRGQISELLEPGLLELDPESSEWEEFLLGVKVGLLCTATDPLDRPSMSDVAFMLQGCRVGPEIPSSADPTTLPSPA*


CDS Sequence:
>Vu_28270.1
ATGGCAACAACGGTTACATTTTTCACCCTCAGACTCGTCGCTTTCTTCGCCTTCTTAACCATAACCATAACCATAACCACTGCGCAGAACACCACTGCTTCGGAGATTCAAGCCTTAACAGCATTCAAGCGCAACCTCCATGACCCTCTGGGTTCCCTCGACGGCTGGGACTCTTCCACGCCCTCTGCACCCTGTGACTGGCGCGGCATTGTCTGTCTCAACAACCGAGTTCACTACCTCCGTCTTCCCCGTCTCCAGCTCGCCGGTGAACTCTCTCCCTCCCTCTCCAATCTCCTCCAACTCCGTAAACTCAGCCTCCACTCCAACAATCTCAACTCCTCCATCCCTCCCTCCCTCTCTCAATGCCTCTTCCTACGCGCAGTTTACCTCCACAACAACCGCCTCTCCGGTCACCTTCCTCGACAGCTTCTCAACCTCACCAACCTACAAATTCTTAACCTTGCCCACAATCTATTCACCGGAGAAATCCCGGACCAGCTTTCCGTCTCCCTACGTTTTTTAGACCTATCTGATAATGCCTTCTCCGGCGATATTCCGGCTAATTTCTCATCAAAGTCTCAGCTTCAACTCATGAATCTCTCTTACAACAGGTTGAGTGGAGGAATTCCTGGTTCACTGGGAAAGTTGCAAAATCTGCAATTTCTTTGGTTAGACTCTAACCATATTCATGGAACATTTCCGTCTGCCATTGCCAACTGTTCCTCTCTAGTTCACCTTAGTGCAGAGGACAATGTTCTGACCGGACTTCTTCCTCTTACGTTAGTAACCATACCAAAACTTCAGGTACTTTCACTTTCAGGGAATCAACTTTCCGGTTTGGTTCCCAAGTCCTTTTTCTGCAACAGTCACCTACAAAGCTTGAATCTTGGTTTCAATTCCTTTACGGGGTTTTCTGCACCTCAAAGTGAAGAATGCAATAGTATTTTAGAAATTTTGGATGTTCAAGAAAATCACATTGCTCCCACAAGATTTCCCTCGTGGTTGACCCAGACTACAAAATCGTTGAAGGTGCTTCAGCTCTCGGGAAATTTCTTTACTGGTTCTCTCCCTGTTGATATTGGTAACTTTTTAGCTTTGGAAGAGCTTAGAGTCGCAAATAATTTGTTATCCGGTGGTATTCCGCCTAGCATTGTGAATTGTAGGTTGTTAAAGGTTTTTGATCTTGAGGGGAACCGTTTCTCTGGGTTAATTCCTGAATTTCTCGGGGATATGAGAAACCTAAAGGAGTTTTCTCTTGCCGGTAACCTTTTTACCGGTTCGATTCCTTCTAGTTTTGGAACACTTTCTGCACTAGAGACGCTTAATTTGAGTGACAATAAGTTGACGGGTGTGGTGCCTAAGGAGATCATGAAACTGGGGAACGTGACTGAATTGAATCTCAGCAATAACGAGTTTTCGAGTCAACTTTGGTCAAATATTGGAGACATGACGGGTTTGCAAGTTCTTAATTTGAGTCGATGTGGGTTTTCAGGAAGGGTTCCTGCTTCGTTGGGGAATTTAATGAGACTAACGGTTCTGGACTTGAGCAAGCAGAACCTTTCGGGTGAGTTGCCCCTTGAGGTTTTTGGGTTACCTAGTCTGCAAGTTGTGGCACTTCAAGAGAACCGTTTGAGTGGTAAAGTTCCTGAGGGGTTCAGCAGCATAGTTAGTCTGCGATATCTTAATCTCAGCTCTAATGAATATGTTGGTGGCATTCCAATGACTTACGGGTTCCTCAGTTCTTTAACTATTCTCTCTCTGTCTCACAATAGTGTTTCTGGTGAGATACCGCCAGAAATTGGTGGTTGTTCGCAACTTGAAGTATTACAGCTGCAGTCAAATTTTCTACAGGGTAACATTCCTGGTGACATCTCTCGGCTATCTCATTTAAAGGAGCTTAATTTGGGGCACAATAGGTTGAAAGGTGATATCCCAGATGAGATATCAGAGTGTTCTGCCTTGAGTTCACTCTTGTTGGATGGTAATCACTTCACGGGTCGCATTCCCGGTTCCTTGTCAAAACTGTCTAATTTGACCGTGTTGAACCTTTCTTCAAATCTTTTGAATGGGGAAATTCCCGTTGAACTGTCAAGCATTTCTGGTTTGGAGTATTTAAACGTGTCTAGTAATAATCTTGGGGGTGAGATTCCATACGTGCTTGGTGCCAGATTCAATAACCCTTCCGTGTTTGCAATGAACCAAGGTTTGTGCGGGAAGCCCTTGCAGAGGGAATGTGCAAAGGTGAGAAGGAGAAAGAAGAGAAGGCTAATAATGTTGATAGGCGTGGGAGTGGCTGGCTTGTGCCTTTTGGCGTTGTGTTGTTGTGGGTATGTTTACAGCCTCTTGAGGTGGCGGAAGAAGCTTCGAGAAGGGGTGACGGGTGAGAAGAAACGGAGCCCCTCAACAAGTGCAGGTAGTAGAGGGAGCGGTGAAAACGGAGGACCAAAGCTAGTGATGTTTAACAACAAGATCACGTACGCGGAGACATTGGAAGCAACGAGAAACTTCGATGAAGAGAACGTGTTAAGCAGGGGAAGATATGGCCTCGTGTTCAAAGCCTCCTTCCAAGATGGAATGGTTCTCTCCATTCGTCGCTTCGTTGATGGGTTCTTAGACGAGGCTAACTTCCGCAAGGAAGCAGAATCACTGGGCAAAGTGAAGCATCGAAACTTGACAGTTCTTCGTGGTTACTATGCGGGTCCACCAGATGTGAGACTTCTTGTGTATGACTACATGCCCAATGGAAACCTTGGCACACTGCTTCAAGAGGCGTCTCAGCAAGATGGCCATGTGCTGAATTGGCCAATGCGTCACCTCATTGCACTGGGAATTGCTCGAGGGCTAGCTTTCTTGCACTCGGTACCAATAGTTCATGGTGATGTGAAGCCTCAAAATGTTCTTTTTGATGCGGATTTTGAAGCCCATTTGTCTGAATTTGGATTGGAGCGGTTGACAGTGGCAGCAGCGGCAGAAGCATCGTCGTCGTCGACTCCAGTAGGGACATTGGGGTATGTTTCAGCAGAAGCTGTATCGAGTGGGGTGGCGACAAAGGAGAGTGATGTTTATAGCTTTGGGATAGTGTTGTTGGAGATACTAACGGGGAAGAAACCGGTGATGTTCACGGAGGATGAAGACATAGTGAAGTGGGTGAAGAAGCAGTTACAAAGGGGCCAAATATCGGAGTTGTTGGAGCCAGGGTTGCTTGAGCTAGACCCAGAGTCATCGGAATGGGAAGAGTTTTTGTTGGGTGTGAAAGTGGGTCTCCTCTGCACAGCAACGGATCCTCTTGATCGACCGTCAATGTCGGACGTTGCTTTCATGCTACAAGGTTGCCGGGTCGGACCGGAAATCCCGTCATCGGCCGATCCCACAACACTACCTTCTCCTGCTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_28270::LG7:49587495-49589495(-)
TTTATTATACATTGACAGGTTAAACTTTTAAAAACAATAAGATATTATGAAAATTATTTATCTTAATCAATACACATTATTTATATCATATCGTAATCAAAATTTAAATAGTAACAATATTAGCTAAATTTAAATGCTTTTATTTGAGAATAACAATGGCAGAAATAAAAACTAGTAGTATGTTCGAAATTAAAAACAAGAGAGATAGACAGTTGAAGTTTATATTACATGAGAACAAACCTTAAATCATAGTATAAAATTGCAATTTTAATTTACATTTACGATTGAATAAAGTAAACTTAAGTCATGATAATTACAAATGATAAGAAAATATAAGTAAAATACAAAATTATTTTGTAAATCCTATAGTTTTCATTTTACTAAACTCAGTCTCTTTAGATAAAGTTTATGTTTTACATCTTGTTGATGAAAAATACAATTAGGAGGAAAACCTCAAGTTTTCAAAGTATTAGTCAACAACAATTTGATTATTCGTATTAATAACAAAATTATCTAAAAATTTGTTTCATAATTTATTTAAAAAAAAAAAGAAACATAGTATATAATCCTTCACAAGAAACCTACTTGCATGGAAGCTAATAAAATCCTGTACCTCCTACTATGTCATTCTTTCATTCATGATATTGAATGTTAATTGATATCTTCACGATACCATTTCTATTTTGGTACTCTCCATCACCATTCATAATATTAAATGTTATTCACATCACAACTACTCATGCCTATAATTAACCAGTTTCAAGTTTTAAATTAATGCACAAATCTGAATAAATTGATGTATTTTATTTAGTTTGAATGCATTTATCACGTTATCAAATATCCGGTCTTATTATAGTTTTTTTATCAATGAAAATATTTTTAATTAATCATTAATGTACTTTTAACAATTTTTATTATCCAATTACTTAAAACAAACTAAATAGTTTAAAAACAGAATATACTTAAAAAGCACTTTAATTTTTGTTTTCATATACCCAAAAATGGAATAAATATACTTAACCTATACATTATCATTTATCAAAACTCATGACTTTTAAGATTTAATTTATTACATTAAAAAAAATCATTTTAGAAAAAATGTCTCTATTGTAACTCTAGTAATTAGTTTTTAAATAACTATATTACCTAGTGTTTAAAATAATATTAAGACAGTAGAAGTGACGTTCTCTCAACCTATATTAATCATTACTAGCTAACTTTAAAATATTCTGTGGATTACATCTATAGAAAACAAATACAATAATTCATACAGGTTTTTAAGTTAAAAATAGTAGTTATGTGATATCTATTTCAAATTATCCAAATCAGATTCTTTAACTTTTTAACTAGTATGTCTATAAAAGAAATTATTGACTAATTAGTAAAAGAAGTACTATAACTTACATCGATATCATAAATTATAAATACTCATATAAAGTAACGTTGGATAACATTTCCCGTAAAATTTTAAAAAGTTTACATCTTTTCCAATTAAAAATTAACGGCAATACATTATGAATGTATTAAGTTGTTTTATTTTCAAAACAAAACATTGAAAGTAAATATTTTGAATAAAATAAGATTATGATATATATCATTTAGAATGTGTGATATGAATAAGTGAATGCATTGAGTCCGAGGTGAGGTGCAGAAAACAGCTAACAAACAGTAACAGGGTAGACCACGCCACACACCATGGTTCAAAAAAACCCTTCAAATCAAACCATTTAAGGAATAAAATAGCAATGGCGACCAAAGCCATTCATAAGATAACTTAAAGCCTTGTCATTTGCGGGGAACATGGCTAGCTAACAAACGCTCCTCTCTCTATTTTCCAAACTCCAAAGTACACAGAAACACAACACAGCACTACCAAACAAACAAATGCTGTCAGCCCCTGAACCTAAAAACTCACTTTAACCTCTCACAATCACCACCATCACCACCACCACAATTCCAATAATAACATCAACACCTTCTCCAACAACACACACCTCCAA


Gene Sequence:
>Vu_28270(-)
ATGGCAACAACGGTTACATTTTTCACCCTCAGACTCGTCGCTTTCTTCGCCTTCTTAACCATAACCATAACCATAACCACTGCGCAGAACACCACTGCTTCGGAGATTCAAGCCTTAACAGCATTCAAGCGCAACCTCCATGACCCTCTGGGTTCCCTCGACGGCTGGGACTCTTCCACGCCCTCTGCACCCTGTGACTGGCGCGGCATTGTCTGTCTCAACAACCGAGTTCACTACCTCCGTCTTCCCCGTCTCCAGCTCGCCGGTGAACTCTCTCCCTCCCTCTCCAATCTCCTCCAACTCCGTAAACTCAGCCTCCACTCCAACAATCTCAACTCCTCCATCCCTCCCTCCCTCTCTCAATGCCTCTTCCTACGCGCAGTTTACCTCCACAACAACCGCCTCTCCGGTCACCTTCCTCGACAGCTTCTCAACCTCACCAACCTACAAATTCTTAACCTTGCCCACAATCTATTCACCGGAGAAATCCCGGACCAGCTTTCCGTCTCCCTACGTTTTTTAGACCTATCTGATAATGCCTTCTCCGGCGATATTCCGGCTAATTTCTCATCAAAGTCTCAGCTTCAACTCATGAATCTCTCTTACAACAGGTTGAGTGGAGGAATTCCTGGTTCACTGGGAAAGTTGCAAAATCTGCAATTTCTTTGGTTAGACTCTAACCATATTCATGGAACATTTCCGTCTGCCATTGCCAACTGTTCCTCTCTAGTTCACCTTAGTGCAGAGGACAATGTTCTGACCGGACTTCTTCCTCTTACGTTAGTAACCATACCAAAACTTCAGGTACTTTCACTTTCAGGGAATCAACTTTCCGGTTTGGTTCCCAAGTCCTTTTTCTGCAACAGTCACCTACAAAGCTTGAATCTTGGTTTCAATTCCTTTACGGGGTTTTCTGCACCTCAAAGTGAAGAATGCAATAGTATTTTAGAAATTTTGGATGTTCAAGAAAATCACATTGCTCCCACAAGATTTCCCTCGTGGTTGACCCAGACTACAAAATCGTTGAAGGTGCTTCAGCTCTCGGGAAATTTCTTTACTGGTTCTCTCCCTGTTGATATTGGTAACTTTTTAGCTTTGGAAGAGCTTAGAGTCGCAAATAATTTGTTATCCGGTGGTATTCCGCCTAGCATTGTGAATTGTAGGTTGTTAAAGGTTTTTGATCTTGAGGGGAACCGTTTCTCTGGGTTAATTCCTGAATTTCTCGGGGATATGAGAAACCTAAAGGAGTTTTCTCTTGCCGGTAACCTTTTTACCGGTTCGATTCCTTCTAGTTTTGGAACACTTTCTGCACTAGAGACGCTTAATTTGAGTGACAATAAGTTGACGGGTGTGGTGCCTAAGGAGATCATGAAACTGGGGAACGTGACTGAATTGAATCTCAGCAATAACGAGTTTTCGAGTCAACTTTGGTCAAATATTGGAGACATGACGGGTTTGCAAGTTCTTAATTTGAGTCGATGTGGGTTTTCAGGAAGGGTTCCTGCTTCGTTGGGGAATTTAATGAGACTAACGGTTCTGGACTTGAGCAAGCAGAACCTTTCGGGTGAGTTGCCCCTTGAGGTTTTTGGGTTACCTAGTCTGCAAGTTGTGGCACTTCAAGAGAACCGTTTGAGTGGTAAAGTTCCTGAGGGGTTCAGCAGCATAGTTAGTCTGCGATATCTTAATCTCAGCTCTAATGAATATGTTGGTGGCATTCCAATGACTTACGGGTTCCTCAGTTCTTTAACTATTCTCTCTCTGTCTCACAATAGTGTTTCTGGTGAGATACCGCCAGAAATTGGTGGTTGTTCGCAACTTGAAGTATTACAGCTGCAGTCAAATTTTCTACAGGGTAACATTCCTGGTGACATCTCTCGGCTATCTCATTTAAAGGAGCTTAATTTGGGGCACAATAGGTTGAAAGGTGATATCCCAGATGAGATATCAGAGTGTTCTGCCTTGAGTTCACTCTTGTTGGATGGTAATCACTTCACGGGTCGCATTCCCGGTTCCTTGTCAAAACTGTCTAATTTGACCGTGTTGAACCTTTCTTCAAATCTTTTGAATGGGGAAATTCCCGTTGAACTGTCAAGCATTTCTGGTTTGGAGTATTTAAACGTGTCTAGTAATAATCTTGGGGGTGAGATTCCATACGTGCTTGGTGCCAGATTCAATAACCCTTCCGTGTTTGCAATGAACCAAGGTTTGTGCGGGAAGCCCTTGCAGAGGGAATGTGCAAAGGTGAGAAGGAGAAAGAAGAGAAGGCTAATAATGTTGATAGGCGTGGGAGTGGCTGGCTTGTGCCTTTTGGCGTTGTGTTGTTGTGGGTATGTTTACAGCCTCTTGAGGTGGCGGAAGAAGCTTCGAGAAGGGGTGACGGGTGAGAAGAAACGGAGCCCCTCAACAAGTGCAGGTAGTAGAGGGAGCGGTGAAAACGGAGGACCAAAGCTAGTGATGTTTAACAACAAGATCACGTACGCGGAGACATTGGAAGCAACGAGAAACTTCGATGAAGAGAACGTGTTAAGCAGGGGAAGATATGGCCTCGTGTTCAAAGCCTCCTTCCAAGATGGAATGGTTCTCTCCATTCGTCGCTTCGTTGATGGGTTCTTAGACGAGGCTAACTTCCGCAAGGAAGCAGAATCACTGGGCAAAGTGAAGCATCGAAACTTGACAGTTCTTCGTGGTTACTATGCGGGTCCACCAGATGTGAGACTTCTTGTGTATGACTACATGCCCAATGGAAACCTTGGCACACTGCTTCAAGAGGCGTCTCAGCAAGATGGCCATGTGCTGAATTGGCCAATGCGTCACCTCATTGCACTGGGAATTGCTCGAGGGCTAGCTTTCTTGCACTCGGTACCAATAGTTCATGGTGATGTGAAGCCTCAAAATGTTCTTTTTGATGCGGATTTTGAAGCCCATTTGTCTGAATTTGGATTGGAGCGGTTGACAGTGGCAGCAGCGGCAGAAGCATCGTCGTCGTCGACTCCAGTAGGGACATTGGGGTATGTTTCAGCAGAAGCTGTATCGAGTGGGGTGGCGACAAAGGAGAGTGATGTTTATAGCTTTGGGATAGTGTTGTTGGAGATACTAACGGGGAAGAAACCGGTGATGTTCACGGAGGATGAAGACATAGTGAAGTGGGTGAAGAAGCAGTTACAAAGGGGCCAAATATCGGAGTTGTTGGAGCCAGGGTTGCTTGAGCTAGACCCAGAGTCATCGGAATGGGAAGAGTTTTTGTTGGGTGTGAAAGTGGGTCTCCTCTGCACAGCAACGGATCCTCTTGATCGACCGTCAATGTCGGACGTTGCTTTCATGCTACAAGGTTGCCGGGTCGGACCGGAAATCCCGTCATCGGCCGATCCCACAACACTACCTTCTCCTGCTTGA

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