Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28075 LG7 44705812 44709800 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 44707213 stop_lost p.Ter256Tyrext*?
C/A 44708802 intron_variant
C/T 44708820 intron_variant
C/T 44708952 intron_variant
A/G 44709024 synonymous_variant p.Leu220Leu
G/A 44709066 missense_variant p.Leu206Phe

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28075.1
MARATNWLSFSLSPMEMLRTSEPQFVQYDAASATNSNHYFLDNLYTNGWGNGNLKPQVLMDQNLNQSDVSFVESSQSQSQSVSHAPPPKLEDFLGDSSAVMRYSDSQTETQDSSLTHMYDHHGSAYFGDQQDLKTIAGFQAFSTNSGSEVDDSASIGKTQPSEFGTHSIESSGNEFAAFSGGPTGTLSLAVAQSSEKAVVAADSGSSKKIVDTFGQRTSIYRGVTRHRWTGRYEAHLWDNSCRREGQARKGRQGGYDKEEKAARAYDLAALKYWGPTATTNFPVSNYSKELEEMKHVTKQEFIASLRRKSSGFSRGASIYRGVTRHHQQGRWQARIGRVAGNKDLYLGTFATEEEAAEAYDIAAIKFRGANAVTNFEMNRYDVEAIMKSALPVGGAAKRLKLSLESEQKVGVSSSQQNPPCGNVSGSINFSAIHQPVASIPCGIPFDSSTAYYHHNLFQHFHPTNAATAVSTVTSGNVAGLTALPPPATTAAEFFIWPHQSY*


CDS Sequence:
>Vu_28075.1
ATGGCACGTGCCACTAACTGGCTATCGTTCTCCCTCTCCCCCATGGAAATGCTCCGAACCTCGGAACCTCAGTTCGTGCAATACGACGCCGCTTCTGCAACTAACTCGAATCACTACTTTCTCGATAACTTGTACACCAACGGGTGGGGAAACGGGAACCTCAAACCTCAGGTGCTGATGGACCAGAATCTGAACCAGAGCGACGTCAGTTTTGTCGAATCCTCCCAGTCCCAGTCCCAAAGCGTCAGCCATGCGCCACCGCCCAAGCTTGAGGACTTTCTCGGTGACTCCTCTGCGGTGATGCGCTATTCCGACAGCCAGACGGAGACTCAGGACTCTTCGCTGACTCACATGTATGACCACCACGGCTCTGCATATTTTGGTGACCAGCAGGATCTCAAGACCATTGCTGGATTTCAAGCTTTTTCTACCAACTCTGGCTCGGAGGTTGATGATTCCGCGTCCATTGGAAAAACACAACCCAGCGAGTTCGGGACTCACTCTATTGAGTCCTCTGGGAACGAGTTCGCCGCGTTTTCCGGTGGTCCCACCGGCACTCTCTCTCTGGCTGTGGCACAGAGCTCCGAGAAGGCGGTGGTGGCAGCAGATTCCGGTAGCTCGAAGAAGATCGTGGATACCTTCGGCCAGCGGACTTCTATTTACAGAGGTGTCACCAGACACCGATGGACAGGTAGATATGAAGCCCATCTATGGGACAACAGTTGCAGGAGGGAGGGTCAAGCCAGGAAAGGGCGTCAAGGTGGATACGATAAGGAAGAAAAGGCCGCGAGAGCTTATGATTTGGCAGCTCTAAAGTACTGGGGTCCCACTGCTACCACCAACTTCCCTGTGTCCAATTATTCAAAGGAATTGGAGGAGATGAAGCATGTAACGAAGCAAGAATTCATTGCATCACTGAGGAGGAAAAGTAGTGGGTTCTCTAGGGGAGCTTCCATATACAGAGGTGTCACAAGGCATCATCAACAGGGAAGGTGGCAAGCAAGAATTGGCCGCGTAGCTGGAAACAAAGATCTGTACCTGGGAACATTCGCAACGGAAGAGGAGGCAGCGGAGGCATATGACATTGCAGCTATAAAGTTCAGAGGTGCAAACGCAGTAACAAATTTTGAGATGAATAGATACGATGTGGAAGCTATAATGAAGAGTGCTCTTCCAGTGGGTGGGGCAGCAAAACGCTTGAAGCTTTCCCTTGAATCGGAGCAGAAAGTTGGTGTGAGCAGCAGTCAGCAGAATCCACCGTGTGGAAACGTCAGTGGAAGCATAAATTTCTCGGCCATTCACCAGCCTGTTGCTTCGATCCCTTGTGGAATTCCCTTTGATTCTTCAACAGCATATTATCACCACAACCTTTTCCAACATTTTCATCCTACCAACGCTGCCACGGCAGTTTCCACCGTCACTTCGGGCAATGTAGCTGGGCTTACCGCACTTCCTCCACCGGCGACAACGGCAGCTGAGTTCTTTATTTGGCCTCACCAGTCTTATTGA


Promoter Sequence:
>Vu_28075::LG7:44709800-44711800(-)
TTAAAAGATGTTTTAGAAGGTGAAAAAAGAAAATGTATTTAAATTACGTTTCACGTCAATTTATAAGTGATGTGAAATTATTGTGTATTTCTGAGATATTATCCGTTTTAAAAATTTTTTTATCACGATTTTGTTTTAGAATATAAAAGTATTAAGTGTATCTTAATATATTTAATCCATACTTGACCACAGTTATTAATATATTCGCTTAAAAAAAATAATGACAAAATTGTCGTAGTTTTTAATATAGTTCTTATTCTAAGTTACTAGTTGTTGGAGAGACTTTAAATCAAACATGTTTTTTTTTTCTTCAGCAAACATGATGATATCCTTCAAAAATTAATGGACATTGGGTACTTTGCTCAATCATGTATGTATTTTCATTATCACTTAAAGTTTTGCATGTTAGTTAGCTACATATTATGAAAATATAATTAAGATCTTTTATTCAAACTTGAAAGTGATGACTTGGTTACCTGTACAATAGGATCAGACAAAGATCAAAATTAAATATGACTAGTGTGAATGATCTTTGATGATATTGCAGGTTAATCAAGCTGATGTACAACATCTTGATAATAAATATCCATTAAGCAGCAATTTCAAACAAACCAAACTCCACTAATATGTTCAATATTTTCACAAAATTTAGAATAGTGAACAAAATTAGGAAATAATTGAATATTTTAAATATGAATCTCTACACAAGTTTTAAGAGACTTTAGTAAAGAGTTGGTGACTTAAAACAAGAATTTAATTAATTCTAGAAAATTTTAAAATAAATGAACATGTTATTTTATTTTTATTTAATCATTATAATTTAATTATTTTTTATATGTTATTTTGCCTTGTATGTTTATACCATATAAGTTAGATGCCACGCTGACACCAATTTAAATTTATTATTTTAAGTTTAGCTTAATTTAAAATTCGGTTTCAATATTGTGCAAAAATTTTATTTTTTTATTTTTAATTTAACTTAATCTTGAAAAGTATACTTTTTACAATAACAATATAAATTTGGAATAAAAAAGTTATCAAAATAAAATCTAAATTTACTTTTAACACGAACATTATATAATCACTGTACAAATTTATCTACTGAAAAAAAAACTTTATTCTATTTCATTAATTAAATCAATTAAAAAAATTTCACTTCCATTCATCCTCCCTTTAATACAAATAAAACGTCATGGTATAAAATAATTAAACATTAGGAATATTTAAATAATGTTTAACAGCAATAATATAATCAGAAAACAATGTGTATCCGTCCGGTGCAGGTCCCATTAGTGGCAGTATTTGAATGTGAAAAGTGACAAAATTTGTTGGCTGAATGAGGAAGTGGGGGAACAAGAGTTACGGGTTTGAATTTTGTGACTGGACCCAAACCATTTCCGGAACAGCTGCATGTAAGACAAGTGTGGCAAAACCCAATTTAATTTTCCTTCCTTAAAAAACATCCAAGTACCCAAACCCCACTTTCGTAATTTCTCACCCTTCCCTCAACCCAACCCTATCAAACAGCCCCAGCCCGGATCTTTCGCGGACGTGTTTCAGACAAATTTTCTTCCGCGCAGAGCCAAAAGTCACTTCTCTCCGCTCTTTCTTTATTATTTCTTTCCCTTCCGTTTCTATCTCTCTCCCTAAAATCAAACTCTCTCTGCCTTTACGCTGAAACTCTTGCCATTATATAAACAACTCACCACCCTCTCACAATCTCTCTCTCTTGCTCACCATTTCTCTGAAAACGAGCAACCCAACCTTGCATGCATTCTTCTGCTTCTCTCTTAATTTATTCTTTGCTTTCTAACATGGAGAAGAAGTAGCTATCTGTTCAACCAGTAACGCTTCTCCGGAGTAAGACTTTCTTTCAGTTTTCGCCCTTTATTTAAGCCTTTTTTTCTGTCTCTCAATCAACTGTTACTCATTTTCTGCTTCTTCAGAAACGTTTTATTTCAGCACTTCATTTTGCACCATTCTTATTCCTATACCAATCA


Gene Sequence:
>Vu_28075(-)
ATGGCACGTGCCACTAACTGGCTATCGTTCTCCCTCTCCCCCATGGAAATGCTCCGAACCTCGGAACCTCAGTTCGTGCAATACGACGCCGCTTCTGCAACTAACTCGAATCACTACTTTCTCGATAACTTGTACACCAACGGTAATATACAGTAGTTACTTACTACTTACATCCTTGCTTACTTACCAGTTACTGTTTGCTGCTTCCATAAAACAAGTGCAACTGAGAGATCTCTGAAAATGTTCGTTTTCTGTGCAGGGTGGGGAAACGGGAACCTCAAACCTCAGGTGCTGATGGACCAGAATCTGAACCAGAGCGACGTCAGTTTTGTCGAATCCTCCCAGTCCCAGTCCCAAAGCGTCAGCCATGCGCCACCGCCCAAGCTTGAGGACTTTCTCGGTGACTCCTCTGCGGTGATGCGCTATTCCGACAGCCAGACGGAGACTCAGGACTCTTCGCTGACTCACATGTATGACCACCACGGCTCTGCATATTTTGGTGACCAGCAGGATCTCAAGACCATTGCTGGATTTCAAGCTTTTTCTACCAACTCTGGCTCGGAGGTTGATGATTCCGCGTCCATTGGAAAAACACAACCCAGCGAGTTCGGGACTCACTCTATTGAGTCCTCTGGGAACGAGTTCGCCGCGTTTTCCGGTGGTCCCACCGGCACTCTCTCTCTGGCTGTGGCACAGAGCTCCGAGAAGGCGGTGGTGGCAGCAGATTCCGGTAGCTCGAAGAAGATCGTGGATACCTTCGGCCAGCGGACTTCTATTTACAGAGGTGTCACCAGGTAGAGTAATTTTTCATTTATGTAATACTATTATTATTGAATCAATCCATTACTGTTTTATGTTTTTTGTTTGTTGGTGTGTATGGTGCTTGTACTAAAAAATGAGGTTTCTCTTTTTCTTACCGAAAGGATCTTTTGACACGTTGGAAGTTGAAAAAAGCAGCTTGCGAGTTGTTGTCTATTTGTGAAAATATATCAAGATAGGGATTTTAGATGCGGAGTGTTGACAATGGCTTGAGAGAGGTCAAGGTCATAAATTTGGCCTCTTCTCACATCTATTTGATGTTAGATTGTGATTTTCCTTTAATTATGTTTTTTGTGATTCTGCAGACACCGATGGACAGGTAGATATGAAGCCCATCTATGGGACAACAGTTGCAGGAGGGAGGGTCAAGCCAGGAAAGGGCGTCAAGGTCTATCTATCTATCTCTCTATTCTTTAAAATAAAGAAAAAGAAAATGAGAATAAGGAAGGAATAGGTGTGATCATATAGCACTGAAAAGTGGCTTGCATGCATTGAAGGAGCAGTTAATGGTTGGAGTGGGGTAGGACACCTGGAGTTTCTTTGTAAACAGTCCTTTTTATGATTGACTGATGGGTGTATATGCATATATACTACGGTGGTATGTGCCGCCATTTTGCCCCTTGTGAGTCGGGTGTCTATGCTTTCTTGTCTGGTCAGACATGTTAATCTCTCAGTGTTGCTGTTCTCTCTGCATTCTCTCCCTGTTCCGTACGCTTTTGTTGACACCTTCTTGTCTAGTATCTTATCTATCCGTCCTTCCCCTTCCTCATTAGTCATGAGTCATAACTGATATGGTGCATTAGGGCTTTATCTTTTGCTTTTGCTTTCCCACTTGCCAGGGAAAGCTGTGTTTGACCACATCACCCATCACTCCCATATTGAAATTTGTACTTCCTTACATTAAGACGGAGGAGGAGAGTCTACTGTAGCTCTGAAGGGTTCAACCACACTGCCTCTGGCCCCCATCTCAGAATAATGTTCTGAAACAAACTCACGGGATTTCTTAGATTCTATGTTCCAGAGACAAATAACAATAATGTTTTTCTTACCAAGCCTCTTTATTGGACGAAAATATTTGTCTACAATTCGTTCCCATGAGAGATAGGCAATTCGGCATTTCTTTTTTCTGTCTGTTTTTTAATGCCGGGATATGTCTTTGACTATAAGCTATCTACTTACTATGATTGTTGAGATTTTTATTAACCTGAAAGCAAAATTTGATTATCACTTTGCACGGATACCATCAATCTTTGTCTTTAAATTAATGTTTTTCGTAGATGGAGCCTTTTAGTACAAATAAAATTCGACTAGTCCTTGTTCTAGGAAAAGAGGATGGGGTTGATGGATCTAATCCAGTGTACAGTTGTTTTCATCCTATCTAGCAGCCATAAAGGGCGTGAGAGAGAAAAAAAATAAAGGAAAAAAGAAAGGTTTGTTGTGCGCATGCACCGTGGCAATTGGCAAGCATATGATCACTTTTCTTTTCGGCCATTTGCATTTTGGGTTAGAAAAGTAATTTTTGGCAGATAATTTTGACTATTCCGGTAGCTGATGTTTGATATTTTTGGCTTTTCCTTTGCATGGAACGGGACTTTGGTGCATTTCTGGCTGTCATTCAACTTTTTGACTCTTGTACAGTTTATTTGGGTAAGTAGTACTTTTCACTTAGATTTGGTTCAATAACCTTAATAATATCTTAAACTTTTTCCGTTGTTTGAGAGATGGTTGTGACATAACCCATTGTCGTGGTTATCAGGTGGATACGATAAGGAAGAAAAGGCCGCGAGAGCTTATGATTTGGCAGCTCTAAAGTACTGGGGTCCCACTGCTACCACCAACTTCCCTGTAATGCAGTCACTTCTTTCTTGTATTCAGTTTTGATAGATCTTAGTTGCATGAAATCCTACCCATATTCAACGAGTGAAAACCTACACTCTACGCAAGGAATCGTGCATGTTGTGTGTTCATATTTTAATACACTTGTATATATAAAAATCTCTCTTTTCAGAAATTGGTTGGAGTGAAAGAAATATGCTTTACTTGGTATGTAAAAAGTTCAGGCTAAGGTGCCAGGAAAGGGTGTGCATGGTATCTTCATACTAACGTGACAAGAATGAAAAGAAAGAGATAGCTAGCTTTTGTTCCGTTTTGTGTCTTGTTTGTGCTTCGTCTGTGTATTGCACGCTTGTGTACAATGCATGGATTAGTATTATAACTAACATCACTTGCCTTATTTTCTATCATCTTTCTCAGGTGTCCAATTATTCAAAGGAATTGGAGGAGATGAAGCATGTAACGAAGCAAGAATTCATTGCATCACTGAGGAGGTTTGCTTGAGTCAGCTTATAAAAAATTATCACAGCACTTCTATGCTGTTACTGAAACTTTGAGTTTCATTCATGCAGGAAAAGTAGTGGGTTCTCTAGGGGAGCTTCCATATACAGAGGTGTCACAAGGTTTGGAGTTTAAAATTTAAAATTATACAAGAAAAATAACATATTGGTGGTAGATTCTGTTTTAATACTTGTAAGTTGTATCCTGCAGGCATCATCAACAGGGAAGGTGGCAAGCAAGAATTGGCCGCGTAGCTGGAAACAAAGATCTGTACCTGGGAACATTCGGTATATATATATTTTGTTCTTCCATAGTTGTCGTGTTTGACAGTATCCATAGTTGTTGTGTGATGAAGTAACTGAGTTGAGATTGTAACAGCAACGGAAGAGGAGGCAGCGGAGGCATATGACATTGCAGCTATAAAGTTCAGAGGTGCAAACGCAGTAACAAATTTTGAGATGAATAGATACGATGTGGAAGCTATAATGAAGAGTGCTCTTCCAGTGGGTGGGGCAGCAAAACGCTTGAAGCTTTCCCTTGAATCGGAGCAGAAAGTTGGTGTGAGCAGCAGTCAGCAGAATCCACCGTGTGGAAACGTCAGTGGAAGCATAAATTTCTCGGCCATTCACCAGCCTGTTGCTTCGATCCCTTGTGGAATTCCCTTTGATTCTTCAACAGCATATTATCACCACAACCTTTTCCAACATTTTCATCCTACCAACGCTGCCACGGCAGTTTCCACCGTCACTTCGGGCAATGTAGCTGGGCTTACCGCACTTCCTCCACCGGCGACAACGGCAGCTGAGTTCTTTATTTGGCCTCACCAGTCTTATTGA