Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28074 LG7 44689591 44693376 PREDICTED: receptor-like cytosolic serine/threonine-protein kinase RBK1
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 44689710 missense_variant p.Ser40Arg
G/A 44689711 missense_variant p.Gly41Arg
T/A 44689983 intron_variant
C/T 44689984 intron_variant
T/A 44690944 intron_variant
T/C 44691371 intron_variant
T/C 44691379 intron_variant
A/T 44691382 intron_variant
A/G 44691647 intron_variant
A/G 44691662 intron_variant
G/A 44691719 intron_variant
C/A 44692899 intron_variant
A/G 44692900 intron_variant
T/C 44693231 missense_variant p.Leu347Pro

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28074.1
MALTRSNAKEFVSDGDGSPRAILETPVSETESETDSSIDSGKEGYMMPWKSMVDVFKFKSVRKLTSIPLLSVSHDITRKGLTKKLARIRSAEDGIDIGDIPAKPSWRNFDYEELAAATKNFSAENLVGKGGHAEVYKGCLPDGQIIAVKRLMKNEKDAADRAGDFLTELGIIAHINHTNATHLVGFGVDGGLFFVLQLAAHGSLSSLLFGSEGMDWEKRFKISDFGLAKWLPNKWANHVVYPIEGTFGYLAPEYFMHGIVDERTDVFAFGVLLLELITGRRAVDSDSRQSLVSWAKPLLDTNNVKEIADPRLGEAYDRTEMIRVMVTASMCVHHASSKRPFMNKVVQLLKGEETIIDIKQNSIEPKSQLLEACDLEDYTCSSYLKDMSRHMQLIME*


CDS Sequence:
>Vu_28074.1
ATGGCATTAACGCGTAGTAACGCAAAAGAGTTTGTGAGCGATGGCGACGGATCTCCTAGGGCGATTCTGGAAACCCCTGTTTCGGAAACAGAGTCCGAGACAGATTCGTCGATTGATAGCGGAAAAGAGGGTTACATGATGCCATGGAAGTCTATGGTTGACGTTTTCAAGTTCAAGTCTGTGCGAAAATTAACTTCCATTCCCTTGCTTTCGGTGAGCCATGATATCACTCGGAAGGGTTTGACCAAAAAACTGGCTCGTATTCGAAGTGCCGAAGACGGTATCGATATTGGAGATATTCCCGCGAAACCCTCTTGGAGAAACTTTGATTATGAAGAGTTAGCAGCTGCTACTAAAAACTTCAGTGCTGAGAACTTGGTTGGGAAAGGTGGTCATGCTGAAGTGTACAAAGGGTGTTTACCTGATGGTCAAATTATAGCTGTAAAGAGGCTGATGAAGAATGAAAAGGACGCTGCAGATAGAGCTGGAGATTTTTTGACAGAGCTTGGGATCATTGCACACATAAACCACACAAATGCAACACACCTTGTTGGGTTTGGAGTTGATGGCGGCCTCTTCTTTGTCCTGCAATTAGCTGCGCATGGAAGTCTCAGTTCTCTGCTTTTTGGTTCTGAAGGCATGGACTGGGAAAAACGATTCAAGATTTCAGATTTTGGACTGGCAAAGTGGCTTCCAAACAAGTGGGCCAACCATGTTGTCTACCCAATAGAAGGCACATTTGGGTATTTGGCTCCGGAGTATTTTATGCATGGAATTGTGGATGAGAGAACTGATGTATTTGCATTTGGAGTTTTGCTGTTGGAGCTCATAACTGGCCGTCGTGCAGTTGATTCAGATAGTAGGCAAAGTCTTGTCAGTTGGGCGAAGCCACTGTTAGACACAAACAATGTAAAGGAAATAGCAGACCCCAGATTAGGAGAGGCGTATGACCGTACAGAAATGATACGTGTCATGGTGACAGCTTCCATGTGTGTCCACCATGCATCCTCCAAGCGTCCATTCATGAACAAGGTTGTGCAGCTGCTAAAGGGTGAAGAGACAATTATAGACATAAAGCAGAATTCAATTGAACCAAAATCTCAATTGTTAGAGGCATGTGACCTAGAAGATTATACTTGCTCAAGTTACCTGAAGGACATGAGTAGGCACATGCAACTGATCATGGAGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_28074::LG7:44687591-44689591(+)
TCAAGAATCTCTTATTAGATCCAATATTACTAAACTTAATTTTTAAACTATGTGAAAGTGTTAACACAGTGAAACATATTATTTTTAATTAATCAATTGTTAATTATAACTTTTAACACAATAATAAAATAGTAGAAGAAGAAAAAAACAATCAATAACTTAGGAATATTATATATGTAATCTAATGTAATGTTATAGAGACATGAAGTTCAGTTCACCTGCCTTTTTACAATGCTGCTGCTCGACAACACAAACAGCACAAACACAAAGGCAACAAACTCAACCACTATAAGGTGCTACGTTAAGTAATCAACTCCTTAAAAAATTATTGCAACGAAGGATAGATACCCTTCTTTATCCTCATAACATGTTTACCTAATTTTTAATCATTTTCTCTTATCATTCCATATGCCTTTGAGACACACGTTTATTAAATATATAAAGGACATTTTTTTGGTCAAAATATAATAAAGGACATGTACTCATTGATAACGAAATTACATTTTTATTTAGTTTTACGTGTGATCAATATATAGAAATAAGCATATGAAAAATTGACAACAGATTGTTATATATTATAATTATAATAAGGTTTGTCGTGGAAGATTTAGAACATTCAGACAATGAGCGTCTAATATCTATTAGTTTTAATCTCTTTAGGTTTAATTTATTATAATGCCTAGTAATTCGGGGAAGAATATGTTTATTATTGGTGAAATCAAAAGGCAGTAATGTTTGATTGAAAAAAATAAACATATAAATAAATATTCTGTGTGCTTTCAGCCTCTTCAAAAGTCTCTTTTATCTGCACCTTTAATTTCTTCAATTATTTATTAAAATGTTTAAATGATGTAATTAATGAAAAGAAAATAATATTTATAACAAGTGTTAATGCTCTCCTCACATTTGCTCTTTATTCGGCTACGCATTTTCCAACTTTGGAGGTGTTTTTGTTTGTGCGTTAGTTACGGCAAAAGTCACGACCAATTAAACTATAACCATTCTTTTATTTTATTTATTTTATTTTATTTTTATTTTTATTTTCCTAACTACTTGCATATTTTATCCTAAATAACATTATTTACGAAAAATAATTTATTAATAGTAAAATAAATGAAATAAAAATAAAGACAGTTGTGTTGGTTGTGTAACTAAATTTACAGTTATAAAAATTGGTGATGATTGGCATTCTAAGACAGAGGGTGCAAAAGATTGAATTAAAAATTGAGGTTTATTGATGTGATGATAACATTAGCAACCGATCCAATAAAAAGTTAAAAATAAGAGAGACTTAAACTAAACCAATTGAAAAGGTTGAAAGGAAATAAATGGAGAAGAAAAATAGAAACGAAAAGAGTAGGTTGTATAAATATAGGAAACATTCTAACGCTGGACATTGCATGCTTCTCTCCTCTTAAATAAGCACCCTTCAAACACAGACCATTTTTGCAACCCTTCATTCTCTGTCATCTCTCCCCTGCTTCTATTCTGCATCCCCTTCTCTTTCCTCTGCATTACTCTGTTTTTGCTCATGCCCTCACCGATGTAAAGGAGGATTTTCACCACCCACGGTTTACTTCTTCTAACTTTCGGGTGCGGGCACGGGCTTTTGGATTTCGACTTAGAACGGGCTTTTGGATTTCCAATATGCACTCCGGAAGCCCATAACTATGTCAAAATAAGGTGACATTTCGTTAGCTCACTTTCTTTTTCGGTTAAATAACCACCCCTGTTTCAGGTGGAGAACACACCAAACAGAACGCTCAACCGGGAATATAGAAAAAAACAATAATACTAATTTGACCACAGAAGAAAACCATGTTGGTTTTTAATTATTTTGTTAAATCGTGTGAATGGAATTTTTGTTTATTATCTGTTTACGTTGAATGAGAAGTGGAAGCTTTAAAGACCTTTTTTTTTTGTATTTTCTGCTTCTGCTGTTGCTCTGTTTCTGCAGAGTTCAAGAAAAGGGGTCAAAATAGAATAGAAGAACTCAGAAA


Gene Sequence:
>Vu_28074(+)
ATGGCATTAACGCGTAGTAACGCAAAAGAGTTTGTGAGCGATGGCGACGGATCTCCTAGGGCGATTCTGGAAACCCCTGTTTCGGAAACAGAGTCCGAGACAGATTCGTCGATTGATAGCGGAAAAGAGGGTTACATGATGCCATGGAAGTCTATGGTTGACGTTTTCAAGTTCAAGTCTGTGCGAAAATTAACTTCCATTCCCTTGCTTTCGGTGAGCCATGATATCACTCGGAAGGGTTTGACCAAAAAACTGGCTCGTATTCGAAGTGCCGAAGACGGTATCGATATTGGAGATATTCCCGCGAAACCCTCTTGGAGAAACTTTGATTATGAAGAGTTAGCAGCTGCTACTAAAAACTTCAGTGCTGGTATGAGCTAGATCCTCTTCTTTCTTTTCATAATTTGGTGGAAGTTTCAGTCTTTTTTTTAATACTAGATATAAGTTTTCCAAGTTTGTGCATATGAAGAAATCTCATAGCAAAGATCAGTTCATTTGATGGTTCTCGTTATGTGGGGGAATCAATCCTCCGCTTTTGCAAGTTGTTTGGTATTCATTAATCAGTTCACCATTAACAGAAGAAAAAAGGCAAGGTTGAATGCGATTTATTTCTATTTTGGTGTGTCTTTTATAATTAATTTTGCAAAATTTCATTTTTATTACAAGCATAGACTCTCGTGCCATTAGATAATGTTTCGTTTTCGCCATAACTTTATTGAATGGCTCAAAGTAGTTTCTATCTTGTGATGAAGAAATGTAACGAGAATTTATATTTTCCAACTTTGTCAAATGAATAGGATTATGAACTCCCAATGTAATAAATTCCAGACTCTGCATTCTTCTACTTTCGATGAGGCATCCCTCGTGGGATGTGACAAAATAATTGGTATGTGTGAGAGATTTATCGTTGAAAAGAGAAATCAGAAAAATGGGGTTTTTAGATATCTTTTGTGGGTGAAGTGGGTTTAGAATTCTATTAATTTATACAACATGGTTGATTCTGTATAGTATTATGGTTGATGGTTGATGGTTGAAGGTTGATGATGAGTTAGTGATGGTAATTTGGCGCCATTAGCTTGTGAGTTGGTTAGTGCCTAACTTTCCCTTGGAAACTGTAGAGAGTAGACGAGCTTTTTGACCAAACATAGGGTTCCTGTTTCTGCATGTCCAAAGAAAAGGACATCTATTCTCACATTAATATTCTTTACCCTTTAGTGCAGATTGCAAGTGTACGCTAGATACTAAAGTCTGACACCATGAAAATATGAATAAGATTTATTTTGTTCCGTTAAGTGCGTCATTAGTTTAATACTATCAAACTATTAGGGTACAAAGAAGTATTACACTGTTACATAATCACAAGCCTGGGTATGAGTTGTGTACTTTGCCCAAAAGACACCTACTTTAATTAAAGGCAATTTTCCTTGAAAATACACAGGCGTGCCATTTTCTGGTGCTTTCAGTTGTCACTTGTCAACCACATTGAACAGTGTCCCACCCTTTAACCTGTAGGATTGGGCAGTGTGTCCCTTGAAAACTGACATATCATGTCACCATAGTTTGCAAGAAAGTTACTTCTCACTTGGTTTCATCCATAGCACATGCATGAGCCAACTCATTAAATTTGCTATTGTAAATTTGTCAAGGGTACGGCTTCGGTTTAGTTCACACCTGACATCTTCCAAAAGATGTTTATGATGATGTCAAATGTAGTTGCTACATGTCATATGTTTGTGATAGGGACATTCTTGTATGGGGCAGGAACTAGTGTATTGTTTAGTTCATAGTTATAGTAATCAGGCTTTATTATATGCATTTTGGCTGTTTGTTTCTTTCCATCTAAAGATAAATATTCATTCAATCTTATAAGATATTATCAGGAATGTCCCAAATCATTTCTTATAAAGAATGACCCCACTTGAGACAATGTATGATTAATTTGCGGAAAGTTAGAGTTTTAAATGTTCAGCATTGGACCGAGACATAAATATTGAAAATTGATTGCCTTTGTTTTGAAAAATCTCAGCTTTTAGGCAAAGGTGAAATAAGTCTAATGAGAAAAGCCGTTGTCAAGTAGTTCAATAAGACGCCAGTCAAATAGCGTTTCCACAATGGAGTTAATTTCAACGTGACATCGAACTATGTATTTTACCAAAATATGCTTCTGGGTCAAAGTCTTAAATTCCACGGGATGTTGTGACCCTTTGAGATTGTCCTTCTGGTCCTATTAAAGTAAAATGAATATTTCCTTTTGGTCTTTCTCATAAAGAGTCTTTTTGTGCCTGAATTCAGAAACTATACATTAATACTGACATGATCAATAACAGTTAACCAATGACTTTTCGTTCGTTTTAATGTTGTAATGTATGACTTTACAGAGAACTTGGTTGGGAAAGGTGGTCATGCTGAAGTGTACAAAGGGTGTTTACCTGATGGTCAAATTATAGCTGTAAAGAGGCTGATGAAGAATGAAAAGGACGCTGCAGATAGAGCTGGAGATTTTTTGACAGAGCTTGGGATCATTGCACACATAAACCACACAAATGCAACACACCTTGTTGGGTTTGGAGTTGATGGCGGCCTCTTCTTTGTCCTGCAATTAGCTGCGCATGGAAGTCTCAGTTCTCTGCTTTTTGGTGCGGAGATGCATCCATTTCTTGCTTCACTTTTCATGTTTTCCTCCTCTTACTGTGCTTGTTCTATTTTTCATTTCTAACAAAGAGGTGTTCAACATGTCAGGTTCTGAAGGCATGGACTGGGAAAAACGATTCAAGGTAGCTGTTGGAGTGGCTGATGGATTGCATTATCTCCATAAAGAGTGTCCAAGGCGAATCATTCATAGGGACATCAAGGCCTCCAACATCCTACTAAACGAAAATTACGAAGCTGAGGTACTATGGCATCAACTTAAAATATAAACTGAATTTTTCGAATTATTTTCTATGCGAAGAAAATAACCCGCGCTGTTATAAACTCAGATTTCAGATTTTGGACTGGCAAAGTGGCTTCCAAACAAGTGGGCCAACCATGTTGTCTACCCAATAGAAGGCACATTTGGGTCAGTGCTGTAGCTTCATTGACTCACATTTCCTATTGTAAGCATTATCTTTGTGTTGTAAACAGTGCATGCATGATATGGTTGGTTGCAGGTATTTGGCTCCGGAGTATTTTATGCATGGAATTGTGGATGAGAGAACTGATGTATTTGCATTTGGAGTTTTGCTGTTGGAGCTCATAACTGGCCGTCGTGCAGTTGATTCAGATAGTAGGCAAAGTCTTGTCAGTTGGGTAAGTCTTCGTTATCCTTGCATTTGGAGTTGTAATAGACCTCTAACATGGACGAGTAAGAAAAGGTCGAAGATGTTTATATAATAAAATTGTGCTTATTGTTGTCAGGCGAAGCCACTGTTAGACACAAACAATGTAAAGGAAATAGCAGACCCCAGATTAGGAGAGGCGTATGACCGTACAGAAATGATACGTGTCATGGTGACAGCTTCCATGTGTGTCCACCATGCATCCTCCAAGCGTCCATTCATGAACAAGGTTAGATTTTGTCTTGAAAACAGTGTTGTAAGTTTTTGTATGATGTGAAAGTAACATTTTGTATGATTGTTGAGTATGTAGGTTGTGCAGCTGCTAAAGGGTGAAGAGACAATTATAGACATAAAGCAGAATTCAATTGAACCAAAATCTCAATTGTTAGAGGCATGTGACCTAGAAGATTATACTTGCTCAAGTTACCTGAAGGACATGAGTAGGCACATGCAACTGATCATGGAGTGA