Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28066 LG7 44571510 44575495 hypothetical protein LR48
 Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 44571832 synonymous_variant p.Gly393Gly
C/T 44572043 intron_variant
T/C 44572235 missense_variant p.Glu319Gly
T/C 44572250 missense_variant p.Glu314Gly
C/T 44572289 intron_variant
A/G 44572341 intron_variant
C/T 44572555 intron_variant
T/G 44572563 intron_variant
C/A 44572564 intron_variant
A/G 44572801 intron_variant
G/A 44572838 missense_variant&splice_region_variant p.Pro281Leu
T/A 44572908 stop_gained p.Arg258*

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28066.1
MARATNWLSFSLSPMEMLRTSEPQFVQYDAASATNSNHYFLDNLYTNGWGNGNLKPQVLMDQNLNQSDVSFVESSQSQSQSVSHAPPPKLEDFLGDSSAVMRYSDSQTETQDSSLTHMYDHHGSAYFGDQQDLKTIAGFQAFSTNSGSEVDDSASIGKTQPSEFGTHSIESSGNEFAAFSGGPTGTLSLAVAQSSEKAVVAADSGSSKKIVDTFGQRTSIYRGVTRHRWTGRYEAHLWDNSCRREGQARKGRQGGYDKEEKAARAYDLAALKYWGPTATTNFPVSNYSKELEEMKHVTKQEFIASLRRKSSGFSRGASIYRGVTRHHQQGRWQARIGRVAGNKDLYLGTFATEEEAAEAYDIAAIKFRGANAVTNFEMNRYDVEAIMKSALPVGGAAKRLKLSLESEQKVGVSSSQQNPPCGNVSGSINFSAIHQPVASIPCGIPFDSSTAYYHHNLFQHFHPTNAATAVSTVTSGNVAGLTALPPPATTAAEFFIWPHQSY*


CDS Sequence:
>Vu_28066.1
ATGGCACGTGCCACTAACTGGCTATCGTTCTCCCTCTCCCCCATGGAAATGCTCCGAACCTCGGAACCTCAGTTCGTGCAATACGACGCCGCTTCTGCAACTAACTCGAATCACTACTTTCTCGATAACTTGTACACCAACGGGTGGGGAAACGGGAACCTCAAACCTCAGGTGCTGATGGACCAGAATCTGAACCAGAGCGACGTCAGTTTTGTCGAATCCTCCCAGTCCCAGTCCCAAAGCGTCAGCCATGCGCCACCGCCCAAGCTTGAGGACTTTCTCGGTGACTCCTCTGCGGTGATGCGCTATTCCGACAGCCAGACGGAGACTCAGGACTCTTCGCTGACTCACATGTATGACCACCACGGCTCTGCATATTTTGGTGACCAGCAGGATCTCAAGACCATTGCTGGATTTCAAGCTTTTTCTACCAACTCTGGCTCGGAGGTTGATGATTCCGCGTCCATTGGAAAAACACAACCCAGCGAGTTCGGGACTCACTCTATTGAGTCCTCTGGGAACGAGTTCGCCGCGTTTTCCGGTGGTCCCACCGGCACTCTCTCTCTGGCTGTGGCACAGAGCTCCGAGAAGGCGGTGGTGGCAGCAGATTCCGGTAGCTCGAAGAAGATCGTGGATACCTTCGGCCAGCGGACTTCTATTTACAGAGGTGTCACCAGACACCGATGGACAGGTAGATATGAAGCCCATCTATGGGACAACAGTTGCAGGAGGGAGGGTCAAGCCAGGAAAGGGCGTCAAGGTGGATACGATAAGGAAGAAAAGGCCGCGAGAGCTTATGATTTGGCAGCTCTAAAGTACTGGGGTCCCACTGCTACCACCAACTTCCCTGTGTCCAATTATTCAAAGGAATTGGAGGAGATGAAGCATGTAACGAAGCAAGAATTCATTGCATCACTGAGGAGGAAAAGTAGTGGGTTCTCTAGGGGAGCTTCCATATACAGAGGTGTCACAAGACATCATCAACAGGGAAGGTGGCAAGCAAGAATTGGCCGCGTAGCTGGAAACAAAGATCTGTACCTGGGAACATTCGCAACGGAAGAGGAGGCAGCGGAGGCATATGACATTGCAGCTATAAAGTTCAGAGGTGCAAACGCAGTAACAAATTTTGAGATGAATAGATACGATGTGGAAGCTATAATGAAGAGTGCTCTTCCAGTGGGTGGGGCAGCAAAACGCTTGAAGCTTTCCCTTGAATCGGAACAGAAAGTTGGTGTGAGCAGCAGTCAGCAGAATCCACCGTGTGGAAACGTCAGTGGAAGCATAAATTTCTCGGCCATTCACCAGCCTGTTGCTTCGATCCCTTGTGGAATTCCCTTTGATTCTTCAACAGCATATTATCACCACAACCTTTTCCAACATTTTCATCCTACCAACGCTGCCACGGCAGTTTCCACCGTCACTTCGGGCAATGTAGCTGGGCTTACCGCACTTCCTCCACCGGCGACAACGGCAGCTGAGTTCTTTATTTGGCCTCACCAGTCTTATTGA


Promoter Sequence:
>Vu_28066::LG7:44575495-44577495(-)
TTTAGAGATCGAAATTTTATCTTGTTGTTCTTAAAAGATGTTTTAGAAGGTGAAAAAGGAAGAAAATGTATTTAAATTACGTTTCACGTCAATTTATAAGTGATGTGAAATTATTAAGTGATGTAAAATTATTGTGTATTTCTGAGATATTATCCGTTTTAAAAAAATTTTTATCACGATTTTGTTTTAGAATATAAAAGTATTAAGTGTATCTTAATATATTTAATCCATACTTGACCACAGTTATTAATATATTCGCTTAAAAAAAATAATGACAAAATTGTCGTAGTTTTAATATAGTTCTTATTCTAAGTTACTAGTTGTTGGAGAGACTTTAAATCAAACATGTTTTTTTTTTCTTCAGCAAACATGATGATATCCTTCAAAAATTAATGGACATTGGGTACTTTGCTCAATCATGTATGTATTTTCATTATCACTTAAAGTTTTGCATGTTAGTTAGCTACATATTATGAAAATATAATTAAGATCTTTTATTCAAACTTGAAAGTGATGACTTGGTTACCTGTACAATAGGATCAGACAAAGATCAAAATTAAATATGACTAGTGTGAATGATCTTTGATGATATTGCAGGTTAATCAAGCTGATGTACAACATCTTGATAATAAATATCCATTAAGCAGCAATTTCAAACAAACCAAACTCCACTAATATGTTCAATATTTACAAAATTTAGAATAGTGAACAAAATTAGGAAATAATTGAATAGTTTAAATATGAATCTCTACACAAGTTTTAAGAGACTTTAGTAAAGAGTTGGTGACTTAAAACAAGAATTTAATTAATTCTAGAAAATTTTAAAATAAATGAACATGTTATTTTATTTTTATTTAATCATTATAATTTAATTATTTTTTATATGTTATTTTGCCTTGTATGTTTATACCATATAAGTTAGATGCCACGCTGACACCAATTTAAATTTATTATTTTAAGTTTAGCTTAATTTAAAATTCGGTTTCAATATTGTGCAAAAATTTTATTTTTTTATTTTTAATTTAACTTAATCTTATCAAAATAAAATCTAAATTTACTTTTAACACGAACATTATATAATCACTGTACAAATTTATCTACTGAAAAAAAAAACTTTATTCTATTTCATTAATTAAATCAATTAAAAAAATTTCACTTCCATTCATCCTCCCTTTAATACAAATAAAACGTCATGGTATAAAATAATTAAACATTAGGAATATTTAAATAATGTTTAACAGCAATAATATAATCAGAAAACAATGTGTATCCGTCCGGTGCAGGTCCCATTAGTGGCAGTATTTGAATGTGAAAAGTGACAAAATTTGTTGGCTGAATGAGGAAGTGGGGGAACAAGAGTTACGGGTTTGAATTTTGTGACTGGACCCAAACCATTTCCGGAACAGCTGCATGTAAGACAAGTGTGGCAAAACCCAATTTAATTTTCCTTCCTTAAAAAACATCCAAGTACCCAAACCCCACTTTCGTAATTTCTCACCCTTCCCTCAACCCAACCCTATCAAACAGCCCCAGCCCGGATCTTTCGCGGACGTGTTTCAGACAAATTTTCTTCCGCGCAGAGCCAAAAGTCACTTCTCTCCGCTCTTTCTTTATTATTTCTTTCCCTTCCGTTTCTATCTCTCTCCCTAAAATCAAACTCTCTCTGCCTTTACGCTGAAACTCTTGCCATTATATAAACAACTCACCACCCTCTCACAATCTCTCTCTCTTGCTCACCATTTCTCTGAAAACGAGCAACCCAACCTTGCATGCATTCTTCTGCTTCTCTCTTAATTTATTCTTTGCTTTCTAACATGGAGAAGAAGTAGCTATCTGTTCAACCAGTAACGCTTCTCCGGAGTAAGACTTTCTTTCAGTTTTCGCCCTTTATTTAAGCCTTTTTTTCTGTCTCTCAATCAACTGTTACTCATTTTCTGCTTCTTCAGAAACGTTTTATTTCAGCACTTCATTTTGCACCATTCTTATTCCTATACCAATCA


Gene Sequence:
>Vu_28066(-)
ATGGCACGTGCCACTAACTGGCTATCGTTCTCCCTCTCCCCCATGGAAATGCTCCGAACCTCGGAACCTCAGTTCGTGCAATACGACGCCGCTTCTGCAACTAACTCGAATCACTACTTTCTCGATAACTTGTACACCAACGGTAATATACAGTAGTTACTTACTACTTACATCCTTGCTTACTTACCAGTTACTGTTTGCTGCTTCCATAAAACAAGTGCAACTGAGAGATCTCTGAAAATGTTCGTTTTCTGTGCAGGGTGGGGAAACGGGAACCTCAAACCTCAGGTGCTGATGGACCAGAATCTGAACCAGAGCGACGTCAGTTTTGTCGAATCCTCCCAGTCCCAGTCCCAAAGCGTCAGCCATGCGCCACCGCCCAAGCTTGAGGACTTTCTCGGTGACTCCTCTGCGGTGATGCGCTATTCCGACAGCCAGACGGAGACTCAGGACTCTTCGCTGACTCACATGTATGACCACCACGGCTCTGCATATTTTGGTGACCAGCAGGATCTCAAGACCATTGCTGGATTTCAAGCTTTTTCTACCAACTCTGGCTCGGAGGTTGATGATTCCGCGTCCATTGGAAAAACACAACCCAGCGAGTTCGGGACTCACTCTATTGAGTCCTCTGGGAACGAGTTCGCCGCGTTTTCCGGTGGTCCCACCGGCACTCTCTCTCTGGCTGTGGCACAGAGCTCCGAGAAGGCGGTGGTGGCAGCAGATTCCGGTAGCTCGAAGAAGATCGTGGATACCTTCGGCCAGCGGACTTCTATTTACAGAGGTGTCACCAGGTAGAGTAATTTTTCATTTATGTAATACTATTATTATTGAATCAATCCATTACTGTTTTATGTTTTTTGTTTGTTTGTATGGTGCTTGTACTAAAAAATGAGGTTTCTCTTTTTCTTACCGAAAGGATCTTTTGACACGTTGGAAGTTGAAAAAAGCAGCTTGCGAGTTGTTGTCTATTTGTGAAAATATATCAAGATAGGGATTTTAGATGCGGAGTGTTGACAATGGCTTGAGAGAGGTCAAGGTCATAAATTTGGCCTCTTCTCACATCTATTTGATGTTAGATTGTGATTTTCCTTTAATTATGTTTTTTGTGATTCTGCAGACACCGATGGACAGGTAGATATGAAGCCCATCTATGGGACAACAGTTGCAGGAGGGAGGGTCAAGCCAGGAAAGGGCGTCAAGGTCTATCTATCTATCTCTCTATTCTTTAAAATAAAGAAAAAGAAAATGAGAATAAGGAAGGAATAGGTGTGATCATATAGCACTGAAAAGTGGCTTGCATGCATTGAAGGAGCAGTTAATGGTTGGAGTGGGGTAGGACACCTGGAGTTTCTTTGTAAACAGTCCTTTTTATGATTGACTGATGGGTGTATATGCATATATACTACGGTGGTATGTGCCGCCATTTTGCCCCTTGTGAGTCGGGTGTCTATGCTTTCTTGTCTGGTCAGACATGTTAATCTCTCAGTGTTGCTGTTCTCTCTGCATTCTCTCCCTGTTCCGTACGCTTTTGTTGACACCTTCTTGTCTAGTATCTTATCTATCCGTCCTTCCCCTTCCTCATTAGTCATGAGTCATAACTGATATGGTGCATTAGGGCTTTATCTTTTGCTTTTGCTTTCCCACTTGCCAGGGAAAGCTGTGTTTGACCACATCACCCATCACTCCCATATTGAAATTTGTACTTCCTTACATTAAGACGGAGGAGGAGAGTCTACTGTAGCTCTGAAGGGTTCAACCACACTGCCTCTGGCCCCCATCTCAGAATAATGTTCTGAAACAAACTCACGGGATTTCTTAGATTCTATGTTCCAGAGACAAATAACAATAATGTTTTTCTTACCAAGCCTCTTTATTGGACGAAAATATTTGTCTACAATTCGTTCCCATGAGAGATAGGCAATTCGGCATTTCTTTTTTCTGTCTGTTTTTTAATGCCGGGATATGTCTTTGACTATAAGCTATCTACTTACTATGATTGTTGAGATTTTTATTAACCTGAAAGCAAAATTTGATTATCACTTTGCACGGATACCATCAATCTTTGTCTTTAAATTAATGTTTTTCGTAGATGGAGCCTTTTAGTACAAATAAAATTCGACTAGTCCTTGTTCTAGGAAAAGAGGATGGGGTTGATGGATCTAATCCAGTGTACAGTTGTTTTCATCCTATCTAGCAGCCATAAAGGGCGTGAGAGAGAAAAAAAATAAAGGAAAAAAGAAAGGTTTGTTGTGCGCATGCACCGTGGCAATTGGCAAGCATATGATCACTTTTCTTTTCGGCCATTTGCATTTTGGGTTAGAAAAGTAATTTTTGGCAGATAATTTTGACTATTCCGGTAGCTGATGTTTGATATTTTTGGCTTTTCCTTTGCATGGAACGGGACTTTGGTGCATTTCTGGCTGTCATTCAACTTTTTGACTCTTGTACAGTTTATTTGGGTAAGTAGTACTTTTCACTTAGATTTGGTTCAATAACCTTAATAATATCTTAAACTTTTTCCGTTGTTTGAGAGATGGTTGTGACATAACCCATTGTCGTGGTTATCAGGTGGATACGATAAGGAAGAAAAGGCCGCGAGAGCTTATGATTTGGCAGCTCTAAAGTACTGGGGTCCCACTGCTACCACCAACTTCCCTGTAATGCAGTCACTTCTTTCTTGTATTCAGTTTTTGATAGATCTTAGTTGCATGAAATCCTACCCATATTCAACGAGTGAAAACCTACACTCTACGCAAGGAATCGTGCATGTTGTGTGTTCATATTTTAATACGCTTGTATATATAAAAATCTCTCTTTTCAGAAATTGGTTGGAGTGAAAGAAATATGCTTTACTTGGTATGTAAAAAGTTCAGGCTAAGGTGCCAAGAAAGGGTGTGCATGGTATCTTCATACTAACGTGACAAGAATGAAAAGAAAGAGATAGCTAGCTTTTGTTCCGTTTTGTGTCTTGTTTGTGCTTCGTCTGTGTATTGCACGCTTGTGTACAATGCATGGATTAGTATTATAACTAACATCACTTGCCTTATTTTCTATCATCTTTCTCAGGTGTCCAATTATTCAAAGGAATTGGAGGAGATGAAGCATGTAACGAAGCAAGAATTCATTGCATCACTGAGGAGGTTTGCTTGAGTCAGCTTATAAAAATTTATCACAGCACTTCTATGCTGTTACTGAAACTTTGAGTTTCATTCATGCAGGAAAAGTAGTGGGTTCTCTAGGGGAGCTTCCATATACAGAGGTGTCACAAGGTTTGGAGTTTAAAATTTAAAATTATACAAGAAAAATAACATATTGGTGTTAGATTCTGTTTTAATACTTGTAAGTTGTATCCTGCAGACATCATCAACAGGGAAGGTGGCAAGCAAGAATTGGCCGCGTAGCTGGAAACAAAGATCTGTACCTGGGAACATTCGGTATATATATATTTTGTTCTTCCATAGTTGTCGTGTTTGACAGTATCCATAGTTGTTGTGTGATGAAGTAACTGAGTTGAGATTGTAACAGCAACGGAAGAGGAGGCAGCGGAGGCATATGACATTGCAGCTATAAAGTTCAGAGGTGCAAACGCAGTAACAAATTTTGAGATGAATAGATACGATGTGGAAGCTATAATGAAGAGTGCTCTTCCAGTGGGTGGGGCAGCAAAACGCTTGAAGCTTTCCCTTGAATCGGAACAGAAAGTTGGTGTGAGCAGCAGTCAGCAGAATCCACCGTGTGGAAACGTCAGTGGAAGCATAAATTTCTCGGCCATTCACCAGCCTGTTGCTTCGATCCCTTGTGGAATTCCCTTTGATTCTTCAACAGCATATTATCACCACAACCTTTTCCAACATTTTCATCCTACCAACGCTGCCACGGCAGTTTCCACCGTCACTTCGGGCAATGTAGCTGGGCTTACCGCACTTCCTCCACCGGCGACAACGGCAGCTGAGTTCTTTATTTGGCCTCACCAGTCTTATTGA