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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28065 LG7 44552341 44556125 PREDICTED: receptor-like cytosolic serine/threonine-protein kinase RBK1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 44552668 missense_variant p.Asp110Asn
T/A 44552815 intron_variant
T/A 44552827 intron_variant
T/C 44553620 intron_variant
A/T 44553702 intron_variant
A/G 44554322 intron_variant
A/G 44554663 intron_variant
G/T 44554795 stop_gained p.Glu149*
A/T 44555200 intron_variant
A/G 44555631 splice_region_variant&intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28065.1
MALTRSNAKEFVSDGDGSPRAILETPVSETESETDSSIDSGKEGYMMPWKSMVDVFKFKSVRKLTSIPLLSVSHDITRKGLTKKLARIRSAEDGIDIGDIPAKPSWRNFDYEELAAATKNFSAENLVGKGGHAEVYKGCLPDGQIIAVKRLMKNEKDAADRAGDFLTELGIIAHINHTNATHLVGFGVDGGLFFVLQLAAHGSLSSLLFGSEGMDWEKRFKISDFGLAKWLPNKWANHVVYPIEGTFGYLAPEYFMHGIVDERTDVFAFGVLLLELITGRRAVDSDSRQSLVSWAKPLLDTNNVKEIADPRLGEAYDRTEMIRVMVTASMCVHHASSKRPFMNKVVQLLKGEETIIDIKQNSIEPKSQLLEACDLEDYTCSSYLKDMSRHMQLIME*


CDS Sequence:
>Vu_28065.1
ATGGCATTAACGCGTAGTAACGCGAAAGAGTTTGTGAGCGATGGCGACGGATCTCCTAGGGCGATTCTGGAAACCCCTGTTTCGGAAACAGAGTCCGAGACAGATTCGTCGATTGATAGCGGAAAAGAGGGTTACATGATGCCATGGAAGTCTATGGTTGACGTTTTCAAGTTCAAGTCTGTGCGAAAATTAACTTCCATTCCTTTGCTTTCGGTGAGCCATGATATCACTCGGAAGGGTTTGACCAAAAAACTGGCTCGTATTCGAAGTGCGGAAGATGGTATCGATATTGGAGATATTCCCGCGAAACCCTCTTGGAGGAACTTTGATTATGAAGAGTTAGCAGCTGCTACTAAAAATTTCAGTGCTGAGAACTTGGTTGGGAAAGGTGGTCATGCTGAAGTGTACAAAGGGTGTTTACCTGATGGTCAAATTATAGCTGTAAAGAGGCTAATGAAGAATGAAAAGGACGCTGCAGATAGAGCTGGAGATTTTTTGACAGAGCTTGGGATTATTGCACACATAAACCACACAAATGCAACACACCTTGTTGGGTTTGGAGTTGATGGCGGCCTCTTCTTTGTCCTGCAATTAGCTGCGCATGGAAGTCTCAGTTCTCTGCTTTTTGGTTCTGAAGGCATGGACTGGGAAAAACGATTCAAGATTTCAGATTTTGGACTGGCAAAGTGGCTTCCAAACAAGTGGGCCAACCATGTTGTCTACCCAATAGAAGGCACATTTGGGTATTTGGCTCCGGAGTATTTTATGCATGGAATTGTGGATGAGAGAACTGATGTATTTGCATTTGGAGTTTTGCTGTTGGAGCTCATAACTGGCCGTCGTGCAGTTGATTCAGATAGTAGGCAAAGTCTTGTCAGTTGGGCGAAGCCACTGTTAGACACAAACAATGTAAAGGAAATAGCAGACCCCAGATTAGGAGAGGCGTATGACCGTACAGAAATGATACGTGTCATGGTGACAGCTTCCATGTGTGTCCACCATGCATCCTCCAAGCGTCCATTCATGAACAAGGTTGTGCAGCTGCTAAAGGGTGAAGAGACAATTATAGACATTAAGCAGAATTCAATTGAACCAAAATCTCAATTGTTAGAGGCATGTGACCTAGAAGATTATACTTGCTCAAGTTACCTGAAGGACATGAGTAGGCACATGCAACTGATCATGGAGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_28065::LG7:44550341-44552341(+)
CTATTATATTCAACAATCTCTTATTAGATCCAATATTACTAAACTTAATTTTTAAACTATGTGAAAGTGTTAACACAGTGAAACATATTATTTTTAATTAATCAATTGTTAATTATAACTTTTAACACAATAATAAAATAGTAGAAGAAAAAAAAACAATCAATAACTTAGGAATATTATGTAATCTAATGTAATGTTATAGAGACATGAAGTTCAGTTCACCTGCCTTTTTACAATGCTGCTGGTCGACAACACAAACAGCACAAACACAAAGGCAACAAACTCAACCACTATAAGGTGCTACGTTAAGTAATCAACTCCTTAAAAAATTATTGCAACGAAGGATAGATACCCTTCTTTATCCTCATAACATGTTTACCTAATTTTTAATCATTTTCTCTTATCATTCCATATGCCTTTGAGACACACGTTTATTAAATATATAAAGGACACTTTTTTGGTCAAAATATAATAAAGGACATGTACTCATTGATAACGAAATTACATTTTTATTTAGTTTTACGTGTGATCAATATATAGAAATAAGCATATGAAAAATTGACAACAGATTGTTATATATTATAATTATAATAAGGTTTCTCGTGGAAGATTTAGAACATTCAGACAATGAGCATCTAATATCTATTAGTTTTAATCTCCTTAGGTTTAATTTATTATAATGCCTAGTAATTCGGGGAAGAATATGTTTATTATTGGCGAAATCAAAAGGCAGTAATGTTTGATTTGAAAAAAATAAACATATAAATAAATATTCTGTGTGCTTTCAGCCTCTTCAAAAGTCTCTTTTATCTGCACCTTTAATTTCTTCAATTATTTATTGAAATGTTTAAATGATGTAATTAATGAAAAGAAAATAATATTTATAACAAGTGTTAATGCTCTCCTCACATTTGCTCTTTATTTGGCTACGCATTTTCCAACTTTGGAGGTGTTTTTGTTTGTGCGTTAGTTACGGCAAAAGTCACGACCAATTAAATTATAACCATTCTTTTATTTTATTTATTTTATTTTATTTTTATTTTCCTAACTACTTGCATATTTTATCCTAAATAACATTATTTACGAAAAATAATTTATTAATAGTAAAATAAATGAAATAAAAATAAAGACAGTTGTGTTGGTTGTGTAACTAAATTTACAGTTATAAAAATTGGTGATGATTGGCATTCTAAGACAGAGGGTGCAAAAGATTGAATTAAAAATTGAGGTTTATTGATGTGATGATAACATTAGCAACCGATCCAATAAAAAGTTAAAAATAAGAGAGACTTAAACTAAACCAATTGAAAAGGTTGAAAGGAAATAAATGGAGAAGAAAAATAGAAACGAAAAGAGTAGGTTGTATAAATATAGGAAACATTCTAACGCTGGACATTGCATGCTTCTCTCCTCTTAAATAAGCACCCTTCAAACACAGACCATTTTTGCAACCCTTCATTCTCTGTCATCTCTCCCCTGCTTCTATTCTGCATCCCCTTCTCTTTCCTCTGCATTACTCTGTTTTTGCTCATGCCCTCACCGATGTAAAGGAGGATTTTCACCACCCACGGTTTACTTCTTCTAACTTTCGGGTGCGGGCACGGGCTTTTGGATTTCGACTTAGAACGGGCTTTTGGATTTCCAATATGCACTCCGGAAGCCCATAACTATGTCAAAATAAGGTGACATTTCGTTAGCTCACTTTCTTTTTCGGTTAAATAACCACCCCTGTTTCAGGTGGAGAACACACCAAACAGAACGCTCAACCGGGAATATAGAAAAAAACAATAATACTAATTTGACCACAGAAGAAAACCATGTTGGTTTTTAATTATTTTGTTAATTCGTGTGAATGGAATTTTTGTTTATTATCTGTTTACGTTGAATGAGAAGTGAAAGCTTTAAAGACCTTTTTTTTTTTGTATTTTCTGCTTCTGCTGTTGCTCTGTTTCTGCAGAGTTCAAGAAAAGGGGTCAAAATAGAATAGAAGAACTCAGAAA


Gene Sequence:
>Vu_28065(+)
ATGGCATTAACGCGTAGTAACGCGAAAGAGTTTGTGAGCGATGGCGACGGATCTCCTAGGGCGATTCTGGAAACCCCTGTTTCGGAAACAGAGTCCGAGACAGATTCGTCGATTGATAGCGGAAAAGAGGGTTACATGATGCCATGGAAGTCTATGGTTGACGTTTTCAAGTTCAAGTCTGTGCGAAAATTAACTTCCATTCCTTTGCTTTCGGTGAGCCATGATATCACTCGGAAGGGTTTGACCAAAAAACTGGCTCGTATTCGAAGTGCGGAAGATGGTATCGATATTGGAGATATTCCCGCGAAACCCTCTTGGAGGAACTTTGATTATGAAGAGTTAGCAGCTGCTACTAAAAATTTCAGTGCTGGTATGAGCTAGATTCTCTTCTTTCTTTTCATAATTTGGTGAAAGTTTCAGTCTTTTTTTTAATACTAGATATAAGTTTTCCAAGTTTGTGCATATGAAGAAATCTCATAGCAAAGATCAGTTCATTTGATGGTTCTCGTTATGTGGGGGAATCAATCCTCCGCTTTTGCAAGTTGTTTGGTATTCATTAATCAGTTCACCATTAACAGAAGAAAAAAGGCAAGGTTGAATGCGATTTATTTCTATTTTGGTGTGTCTTTTATAATTAATTTTGCAAAATTTCATTTTTATTACAAGCATAGACTCTCGTGCCATTAGATAATGTTTCGTTTTCGCCATAACTTTATTGAATGGCTCAAAGTAGTTTCTATCTTGTGATGAAGAAATGTAACGAGAATTTATATTTTCCAACTTTGTCAAATGAATAGGATTATGAACTCCCAATGTAATAAATTCCAGACTCTGCATTCTTCTACTTTCGATGAGGCATCCCTCGTGGGATGTGACAAAATAATTGGTATGTGTGAGAGATTTATCGTTGAAAAGAGAAATCAGAAAAATGGGGTTTTTAGATATCTTTTGTGGGTGAAGTGGGTTTAGAATTCTATTAATTTATACAACATGGTTGATTCTGTATAGTATTATGGTTGATGGTTGATGGTTGAAGGTTGATGATGAGTTAGTGATGGTAATTTGGCGCCATTAGCTTGTGAGTTGGTTAGTGCCTAACTTTCCCTTGGAAACTGTAGAGAGTAGACGAGCTTTTTGACCAAACATAGGGTTCCTGTTTCTGCATGTCCAAAGAAAAGGACATCTATTCTCACATTAATATTCTTTACCCTTTAGTGCAGATTGCAAGTGTACGCTAGATACTAAAGTCTGACACCATGAAAATATGAATAAGATTTATTTTGTTCCGTTAAGTGCGTCATTAGTTTAATACTATCAAACTATTAGGGTACAAAGAAGTATTACACTGTTACATATTCACAAGCCTGGGTATGAGTTGTGTACTTTGCCCAAAAGACACCTACTTTAATTAAAGGCAATTTTCCTTGAAAATACACAGGCGTGCCATTTTCTGGTGCTTTCAGTTGTCACTTGTCAACCGCATTGAACAGTGTCCCACCCTTTAACCTGTAGGATTGGGCAGTGTGTCCCTTGAAAACTGGCATATCATGTCACCATAGTTTGCAAGAAAGTTACTTCTCACTTGGTTTCATCCATAGCACATGCATGAGCCAACTCATTAAATTTGCTATTGTAAATTTGTCAAGGGTACGGCTTCGGTTTAGTTCACACCTGACATCTTCCAAAAGATGTTTATGATGATGTCAAATGTAGTTGCTACATGTCATATGTTTGTGATAGGGACATTCTTGTATGGGGCAGGAACTAGTGTATTGTTTAGTTTATAGTTATAGTAATCAGGCTTTATTATATGCATTTTGGCTGTTTGTTTCTTTCCATCTAAAGATAAATATTCATTCAATCTTATAAGATATTATCAGGAATGTCCCAAATCATTTCTTATAAAGAATGACCCCACTTGAGACAATGTATGATTAATTTGCGGAAAGTTAGAGTTTTAAATGTTCAGCATTGGACCGAGACATAAATATTGAAAATTGATTGCCTTTGTTTTGAAAAATCTCAGCTTTTAGGCAATGGTGAAATAAGTCTAATGAGAAAAGCCGTTGTCAAGTAGTTCAATAAGACGCCAGTCAAATAGCGTTTCCACAATGGAGTTAATTTCAACGTGACATCGAACTATGCATTTTACCAAAATATGCTTCTGGGTCAAAGTCTTAAATTCCACGGGATGTTGTCACCCTTTGAGATTGTCCTTCTGGTCCTATTAAAGTAAAATGAATATTTCCTTTTGGTCTTCCTCATAAAGAGTCTTTTTGTGCCTGAATTCAGAAACTATACATTAATACTGACATGATCAATAACAGTTAACCAATGACTTTTCGTTCGTTTTAATGTTGTAATGTATGACTTTACAGAGAACTTGGTTGGGAAAGGTGGTCATGCTGAAGTGTACAAAGGGTGTTTACCTGATGGTCAAATTATAGCTGTAAAGAGGCTAATGAAGAATGAAAAGGACGCTGCAGATAGAGCTGGAGATTTTTTGACAGAGCTTGGGATTATTGCACACATAAACCACACAAATGCAACACACCTTGTTGGGTTTGGAGTTGATGGCGGCCTCTTCTTTGTCCTGCAATTAGCTGCGCATGGAAGTCTCAGTTCTCTGCTTTTTGGTGCGGAGATGCATCCATTTCTTGCTTCACTTTTCATGTTTTCCTCCTCTTACTGTGCTTGTTCTATTTTTCATTTCTAACAAAGAGGTGTTCAACATGTCAGGTTCTGAAGGCATGGACTGGGAAAAACGATTCAAGGTAGCTGTTGGAGTGGCTGATGGATTGCATTATCTCCATAAAGAGTGTCCAAGGCGAATCATTCATAGGGACATCAAGGCCTCCAACATCCTACTAAACGAAAATTACGAAGCTGAGGTACTATGGCATCAACTTAAAATATAAACTGAATTTTCGAATTATTTTCTATGCGAAGAAAATAACCCGCGCTGTTATAAACTCAGATTTCAGATTTTGGACTGGCAAAGTGGCTTCCAAACAAGTGGGCCAACCATGTTGTCTACCCAATAGAAGGCACATTTGGGTCAGTGCTGTAGCTTCATTGACTCACATTTCCTATTGTAAGCATTATCCTTGTGTTGTAAACAGTGCATGCATGATATGGTTGGTTGCAGGTATTTGGCTCCGGAGTATTTTATGCATGGAATTGTGGATGAGAGAACTGATGTATTTGCATTTGGAGTTTTGCTGTTGGAGCTCATAACTGGCCGTCGTGCAGTTGATTCAGATAGTAGGCAAAGTCTTGTCAGTTGGGTAAGTCTTCGTTATCTTTGCATTTGGAGTTGTAATAGACCTCTAACATGGACGAGTAAGAAAAGGTTGAAGATGTTTATATAATAAAATTGTGCTTATTGTTGTCAGGCGAAGCCACTGTTAGACACAAACAATGTAAAGGAAATAGCAGACCCCAGATTAGGAGAGGCGTATGACCGTACAGAAATGATACGTGTCATGGTGACAGCTTCCATGTGTGTCCACCATGCATCCTCCAAGCGTCCATTCATGAACAAGGTTAGATTTTGTCTTGAAAACAGTGTTGTAAGTTTTTGTATGATGTGAAAGTAACATTTTGTATGATTGTTGAGTACGTAGGTTGTGCAGCTGCTAAAGGGTGAAGAGACAATTATAGACATTAAGCAGAATTCAATTGAACCAAAATCTCAATTGTTAGAGGCATGTGACCTAGAAGATTATACTTGCTCAAGTTACCTGAAGGACATGAGTAGGCACATGCAACTGATCATGGAGTGA

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