Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28025 LG7 43950238 43958108 PREDICTED: nodulation receptor kinase-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 43950251 missense_variant p.Arg5His
T/C 43950333 synonymous_variant p.Thr32Thr
T/A 43950456 downstream_gene_variant
A/T 43950488 downstream_gene_variant
T/G 43950512 downstream_gene_variant
C/T 43950623 downstream_gene_variant
T/C 43950930 missense_variant p.Ile130Thr
G/A 43951077 stop_retained_variant p.Ter179Ter
A/T 43951106 stop_gained p.Lys189*
T/A 43951204 downstream_gene_variant
A/G 43951312 intron_variant
G/T 43951472 intron_variant
T/A 43951662 intron_variant
C/A 43952128 missense_variant p.Leu329Met
G/A 43952244 intron_variant
A/T 43952417 intron_variant
A/T 43952642 stop_gained p.Arg364*
A/T 43952645 stop_gained p.Arg365*
T/A 43952748 missense_variant p.Leu399His
G/C 43953357 intron_variant
C/A 43953589 intron_variant
G/C 43953800 intron_variant
T/C 43953938 intron_variant
T/G 43953941 intron_variant
T/G 43953945 intron_variant
A/T 43953948 intron_variant
G/A 43953949 intron_variant
A/T 43953950 intron_variant
T/C 43954168 missense_variant p.Ile458Thr
T/A 43954197 missense_variant p.Ser468Thr
G/A 43954435 intron_variant
T/A 43954479 splice_region_variant&intron_variant
G/T 43954484 splice_acceptor_variant&intron_variant
G/A 43954579 synonymous_variant p.Leu531Leu
A/G 43954655 missense_variant p.Lys557Glu
C/T 43954781 intron_variant
T/C 43954873 intron_variant
G/T 43954882 intron_variant
C/T 43955014 intron_variant
G/A 43955034 intron_variant
T/C 43955153 intron_variant
G/A 43955188 intron_variant
C/T 43955192 intron_variant
G/A 43955197 intron_variant
T/A 43955202 intron_variant
G/A 43955213 intron_variant
A/G 43955587 intron_variant
G/T 43956265 downstream_gene_variant
C/T 43956405 downstream_gene_variant
C/T 43956515 downstream_gene_variant
A/G 43956581 downstream_gene_variant
A/G 43956594 downstream_gene_variant
C/T 43956808 downstream_gene_variant
C/T 43956856 downstream_gene_variant
C/T 43957130 downstream_gene_variant
G/C 43957348 downstream_gene_variant
G/C 43957399 downstream_gene_variant
T/C 43957838 synonymous_variant p.His827His
G/A 43957927 missense_variant p.Arg857His

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28025.1
MMELREIWVSKLVVACAVCLHIFIRSVSGSATEGFENIACCADSNYTDPQTTLNYTTDYTWFPNRGSCRRPKIGLNEKVRLFSIDEGKRCYNLPTIKNKVYLIRGTFPFDSINSSFNVSIGVTQLGAVRPSTPQDLEIEIEGVFRATKDYIDFCLVKGEVDPFISQLELRPLPEDYLLHDLPASVLKLISRNSLWDTKDEIRFPDDPSDRIWKATSSPSSALPLSYNDKNFDLKSNMTPPLRVLQTALTDPERLEIHSSLDTEDYEYRIFLYFLELNSTVKEGKRVFDIYVNSEIQREKFDILARGSNYTYTVLNVSANGLLNLTLVKASGAEFGPLLNAYEILQMRPWIEETNQKDVEVIQKIREELLLQNQNTKVLESWTGDPCIFPWHGIECDGSNGSSVITKLDLSSSNFKGPIPSTVTEMTNLKILNLSHNNFNGYIPSFPPSSLLISIDLSYNDLMGSLPESIVSLPYLKSLYYACNKRMSEDTPANLNGSLINTDYGRCKAKEPRFGQVFVIGAITCGSLLITLAVGIIFVCRYRQKLIPWEGFGGKNYLMETNVIFSLPSKDDFLIKSVSIQTFTLEDIEVATERYKTLIGEGGFGSVYQGTLNDGQEVAVKVRSATSTQGTREFDNELNLLSAIQHENLVPLLGYCNENDQQILVYPFMSNGSLQDRLYGEPAKRKILDWPTRLSIALGAARGLAYLHTFPGRSVIHRDVKSSNILLDHSMCAKVADFGFSKYAPQEGDSNVSLEVRGTAGYLDPEYYKTQQLSEKSDVFSYGVVLLEILTGREPLDIKRPRNEWSLVEWAKPYIRASKMEEIMDPGIKGGYHAEAMWRVVEVALQCLEPFSEYRPSMVDIVRELEDALIIENNASEYMKSIDSLGGSNRYSIVIEKRVLPSTSSTAESTITTQALSHPQPR*


CDS Sequence:
>Vu_28025.1
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Promoter Sequence:
>Vu_28025::LG7:43948238-43950238(+)
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Gene Sequence:
>Vu_28025(+)
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