Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28002 LG7 43617634 43620193 PREDICTED: transcription factor MYC2-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04016 MAPK signaling pathway - plant [PATH:ko04016]
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 43617945 missense_variant p.Ala34Ser
C/G 43618334 synonymous_variant p.Pro163Pro
T/A 43618365 missense_variant p.Ser174Thr
T/A 43618610 missense_variant p.Asp255Glu
C/A 43618611 missense_variant p.Pro256Thr
C/G 43618735 missense_variant p.Pro297Arg
C/T 43619078 synonymous_variant p.Asn411Asn
G/T 43619436 missense_variant p.Asp531Tyr
C/T 43619627 synonymous_variant p.His594His
C/A 43619628 missense_variant p.Pro595Thr
T/G,* 43619874 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28002.1
MNLWTDDNSSVMEAFMSSSDLSSIWPPPAPPQSAAVFNQDTLQHRLQALIEGARESWTYAIFWQSSYDYSGSTLLGWGDGYYKGDDDKAKAKAKAKATSAAEQDHRKKVLRELNSLISGSSATASDDVDEEVTDTEWFFLVSMTQSFVNGAGLPGQAFFNSNPVWVTGGDRLSSSPCERARQGQVFGLQTLVCIPSANGVVELGSTELIYQNPDLMNKVKVLFNFSNNNFDMGSSWPATSADQGENDPSTLWLNDPEVRDSINTVAATPSVSVSVPPHNSTHGISKTMQLESSIQTPGSSTLTETPSSIHAVPQNQSVFSRELNFSEYGFDPKSGNTNNQHSLKPESCEILSFSDSKRTSYGGGGGAGAVNGNSNSNSNFFSGQSPFVAVADENNNNNNGKRRSPNSRGSNDDGMLSFTSRAILPATNLKSAGGGDSDHSDLEASVVKDPVVEPEKRPRKRGRKPANGREEPLNHVEAERQRREKLNQRFYALRAVVPNVSKMDKASLLGDAISYITELKSKLQTLESDKDGLQKQLEGVQKELEKSSDNSNHMKHAGNSNIKSANQALIDLDIDVKIIGWDAMIRIQCSKKNHPAARLMAALMELDLDVHHASVSVVNDLMIQQATVKMGSRFYTQEQLRLALSAKVGDVR*


CDS Sequence:
>Vu_28002.1
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Promoter Sequence:
>Vu_28002::LG7:43615634-43617634(+)
ACTCTCAACTAAGTTAAATAAACTAATACATTAATATATAAAAATATACACATATATGTATGTACGTGTACGTATGCACTTGTGCTATAAAAGATAAACAAATTCTATCAAATGTTAAACAAATTTAATAGATAAGTAAGAAGTAAAATATAAATGAATCATTCCAAGATTTATGTATGTTTTATTGCTTTAAATAACATGTAAAAAAACAGTAAAAGATAATTAGTATCATGAGAGTCATCTACAATTATTTTTAATAGGATAATAACTTTTCTTTATTGTATATCGTTTTCTTTCATTCTTACCTACATAGTTTTAATGAGAGGAGCGTTTTTTTTTCACTATTTTTTTTATTGTGCTTTTATATCTAATATATAATATATTGATAATTTGAGAATCAATATAATTAATAACAAAAGTAAGAACATAGATTGTGTATGGAAGCACATTATATATGACTAGTGAAAATAATATTTTTATGATAAAAAAATAATGAAAATATAATTATATAGATAAATATAAATAATAGGGTTAAATGTGTTTTTACATTTTTTAAGTTTTAGTAAAAATTAAAATTAGTTCTTCCTAAGAATTTTAGTCTTATTTAGTCCCTCAATTTTAGAATAAAAATTTCTTTTAATGTTAGTTGATAAACGTGTTTAAAACCTCAAATAAATTTAACAAAATTTGTTTAAATATATTAAGTTTACATGGTTATAAAGATGAGAAACTAAATTAGTCCGAAGATTCGAAGAGTAACTAATTTTAATTTTCAATTAAAGTTAACATATTAAAATTCTGATATAAATATTTTTATTTATTTTGTAAATTAATTTTATTTATTTATTTTAAATAATTTTAAATTTTAAAAGAATTCATTTGGAAGGTAAAATTAAAAAAAAATATGGACATAAAACAATATCTTTTACATATAAGTATAAATAATATATTATATTATTATTTTTATTTGAATGAAGAAATACTTCAACTTTAAGATAATAAAGTTAATAGTATAATTATATAAAAAATAGTGGGTGATTTATAATATATGATATGATTGAAAGTAAAATATATTTCGTTTACTTTTTTGAATTATAAAATATAATTAAAAGTAATATAGAAATATATATATTTTAAAAATAAATAAAAACTAAGATATAAATGATATATATGTAATGGGTATATTTTTCATTATCTTATTATTGTATGGTTTTAAAGCCTCATCACTTTTGAATTGATGTGTGGGTTGTCAATCCCACGAAGCACAAGAGAAAGACAATTTACAGGTGGAATGCAGACTTTTTTGTCGTCCACAAAATTATAAGAAAATAAGACAAAACAAAAATAATTGTGAAAATGAACCTCAAGCAGGTCCACTTTACACCACCCAGCACTATTCTTTTTGTTATACAACTATGATCTTATAATTTTAAAATTAATTTCCGTACACATAAGATGTTTTATACAAAAGCAGGAGAAATATTTTATATAAAATGTTTATTGTGGTAAATATAATTAATATTTACTATTTTAACAACTAAGATTACTTAATGAAATATATTAAACATTTCAACCAGGTGTTTTTGTAATATTAATTAAGATAACATTTCAGTTTAATACTTCTTCCGTTATTAATAAATATAAGACTCTGTTGCTTAATTCATCAGGGTTAAATAATGTTAATTCAATTGATAAAAGAATAAATAACAATAAATATGTATTAATTTTTAAAATTATACTTATATTTAATATTTTAATTTTTTAAAAAACTGTCTTCTAATTAAAAGTAATTCGAAATAAGTTGTTTTAAGAAAGAATGAAAGAATTATATTAATAATAAAAAATATAGTATAGTAAAGCAGTAAAAAAGAGATGGAAAGATACAAGACGCGGCGTGTTTACGAAAAACTCGGCGTGGGCGTTTGGGTTTCGCGGAAGGCTCGCGCTTGCTCACTCTCGGTCAGTCCTCTTGAAACAAAATACTACTAAAATTCACCCTA


Gene Sequence:
>Vu_28002(+)
AAATGCACTCCAAATAAATTCCAAACCCAAATGCATTCTCTCTTGTTGGGTAGCTAGCTTTCTGTGTTTATCCCCTTTTCTCTTTCTTTTTTTCTCTCCCAATCCAACCCAATTTCAATTGCCCAAACGCCAAACTCCAAACTCCAATCACCACAGCTCAATCACCACAGCTCAATCACCAACATCATCAACAACTCAGCGTCAGCGAGTGGATGAATCTCTGGACGGACGATAACTCTTCTGTTATGGAGGCTTTCATGTCCTCCTCCGATCTCTCCTCCATATGGCCTCCGCCGGCGCCGCCGCAATCCGCCGCCGTCTTCAACCAGGACACCCTCCAGCACCGCCTACAGGCCCTCATCGAGGGCGCCAGAGAGAGCTGGACCTACGCTATCTTTTGGCAGTCCTCCTACGACTATTCCGGCTCCACGCTCCTTGGCTGGGGCGACGGTTACTACAAAGGCGACGATGACAAGGCCAAGGCCAAGGCCAAAGCTAAAGCCACCTCCGCCGCCGAGCAGGACCACCGCAAGAAGGTCCTCCGGGAGCTCAACTCCCTCATCTCTGGCTCTTCAGCTACCGCCTCCGATGACGTAGACGAGGAGGTCACAGACACCGAGTGGTTCTTCCTTGTTTCCATGACCCAGTCCTTCGTCAACGGCGCCGGCTTGCCCGGCCAGGCCTTCTTCAATTCCAACCCCGTCTGGGTCACCGGTGGCGACCGCCTCTCCTCCTCCCCCTGCGAGAGAGCCCGCCAGGGACAAGTCTTCGGCCTCCAAACCCTAGTCTGCATACCCTCCGCAAACGGAGTCGTTGAACTGGGGTCTACCGAATTAATTTACCAGAACCCGGATCTGATGAACAAGGTGAAGGTCCTCTTCAATTTTAGCAACAACAACTTCGACATGGGTTCTTCTTGGCCTGCAACCAGCGCCGATCAAGGAGAAAACGACCCCTCCACGCTCTGGCTCAACGATCCTGAAGTTAGGGATTCCATTAACACTGTCGCAGCTACTCCTTCTGTATCCGTTTCTGTTCCCCCTCATAACAGTACTCACGGGATTTCAAAGACGATGCAGTTGGAGAGTTCTATTCAAACCCCCGGTTCCAGTACCTTAACTGAAACCCCAAGCTCTATCCACGCTGTTCCACAGAACCAGAGCGTGTTCTCCAGAGAATTGAACTTCTCTGAGTACGGTTTTGATCCCAAGAGTGGCAACACTAACAATCAGCATTCCCTGAAGCCCGAATCCTGCGAGATTCTCAGCTTCAGCGATAGCAAGAGAACCTCTTACGGGGGCGGGGGCGGGGCCGGGGCCGTCAATGGTAATTCCAATTCCAATTCAAATTTCTTCTCTGGTCAATCACCGTTTGTTGCTGTTGCGGATGAGAACAACAATAACAACAACGGGAAGAGAAGGTCACCGAATTCGCGAGGCAGCAACGACGACGGAATGCTTTCGTTCACCTCCCGCGCGATTCTTCCGGCCACTAATTTGAAGTCTGCCGGTGGCGGCGATTCCGACCACTCGGATCTGGAAGCGTCGGTGGTAAAGGACCCTGTGGTGGAGCCGGAGAAGCGGCCCCGGAAGAGAGGGCGGAAGCCGGCGAACGGAAGAGAGGAACCGTTAAACCACGTGGAAGCGGAGAGGCAGAGGAGGGAGAAGCTGAATCAGAGGTTCTACGCGCTTCGTGCTGTGGTTCCCAACGTGTCCAAGATGGACAAAGCGTCGCTTCTGGGTGACGCAATATCTTACATTACGGAGCTGAAGTCCAAGCTTCAAACTCTGGAATCAGATAAAGATGGGTTGCAGAAACAACTTGAAGGAGTGCAGAAGGAACTCGAGAAATCAAGTGATAACTCTAATCACATGAAACACGCGGGTAATAGTAACATTAAGTCGGCTAATCAGGCGTTGATTGACTTGGACATCGACGTGAAGATTATTGGGTGGGACGCGATGATAAGAATCCAATGCAGCAAGAAGAACCACCCCGCGGCGAGGTTGATGGCGGCGCTGATGGAGTTGGACTTGGACGTTCACCACGCCAGCGTGTCGGTGGTTAACGATTTGATGATTCAACAAGCGACGGTGAAGATGGGGAGTAGGTTTTACACGCAGGAGCAGCTTCGTTTGGCCCTGTCGGCTAAGGTTGGGGATGTACGATGATAACGGGTCTGCACTTTGCGGCGTTGAGTTGAGTTGAGATTATATGAATTGTGCTTATGTCATGTTAGCTAGCTAGCTAGCTCTGTGTAAGTTGTGCTGCTCTGGGATATTTTAAGCCTTCCCGGTAGCTGTTTCTGTAAAATAATAATAATGTCTTTTCTTTTTGGGTAGTAGATGAGTATGAATTTTGAGGTAATCATGTTGGGAAGCTTCATGGAGTTGTAGAACCAGCTAGGCACAATTGTCACCAAATCTGTGGGTGGAGTGGAGATAGGAGCCAGGTAAAATAGGGTATTTTTATCTGTCTAGATAATGTATATATTAATAATTATAAATGTGAAGGAACATCATGCAAGTTTTCAATATTATCATTCTTCATCTTATGAGTT