Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_27968 LG7 43225383 43227364 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 43225501 3_prime_UTR_variant
A/T 43225503 3_prime_UTR_variant
A/T,* 43225534 3_prime_UTR_variant
T/A 43225682 3_prime_UTR_variant
T/C,A 43225688 3_prime_UTR_variant
T/G 43225690 3_prime_UTR_variant
C/A 43225808 3_prime_UTR_variant
C/A 43225810 3_prime_UTR_variant
G/A 43226025 missense_variant p.Ala270Val
G/T 43226153 synonymous_variant p.Val227Val
T/C 43226210 synonymous_variant p.Leu208Leu
T/G 43226293 missense_variant p.Thr181Pro
A/T 43226370 intron_variant
C/A 43226383 intron_variant
G/A 43226796 synonymous_variant p.Leu101Leu
A/G 43226843 intron_variant
A/G 43227035 synonymous_variant p.Tyr62Tyr
G/A 43227197 synonymous_variant p.Cys8Cys
T/G 43227203 synonymous_variant p.Ser6Ser
A/G 43227225 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
T/G 43227229 5_prime_UTR_variant
G/A 43227245 5_prime_UTR_variant
A/G 43227254 5_prime_UTR_variant
A/C 43227296 5_prime_UTR_variant
G/A 43227297 5_prime_UTR_variant
G/A 43227330 5_prime_UTR_variant
T/G 43227341 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_27968.1
MSRTCSQCGNNGHNSRTCTDGGAAVSGGSSPRESGFMLFGVRVTEGISSFRKSASMNNLSQYDADSNTADAGYASDDVVHASGRARERKRGVPWTEEEHRLFLLGLHKVGKGDWRGISRNFVKTRTPTQVASHAQKYFLRRHNQNRRRRRSSLFDITTDTVMESSTIMEEEQVQQETAALTIPAAYPPSHYGGFPGAGFPMSLSPVVLPASSERLAKPIRPTPILPVPPSSKMASLNLKEKASPTNLIEPLPLSLNLPSPTPRSQDQSPASSDHSSPSSSSSAFQAISAGKFGGGGDSIISVA*


CDS Sequence:
>Vu_27968.1
ATGTCTCGCACGTGCTCACAGTGCGGGAACAACGGCCACAACTCAAGGACATGCACCGACGGTGGTGCTGCTGTTTCCGGGGGCTCGTCTCCCCGGGAGAGCGGCTTCATGCTGTTTGGCGTGCGAGTCACCGAAGGAATTTCCTCCTTCAGGAAGAGCGCTAGCATGAACAACCTCTCTCAATATGACGCCGATTCCAACACAGCCGACGCCGGGTACGCCTCCGACGACGTCGTTCACGCCTCCGGTCGCGCGCGCGAGCGCAAGCGAGGTGTTCCTTGGACGGAGGAAGAGCACAGACTGTTCCTGTTAGGGTTGCACAAAGTTGGAAAGGGAGATTGGAGAGGAATTTCTAGAAACTTCGTCAAAACTCGCACGCCAACTCAGGTCGCCAGTCACGCTCAGAAGTACTTCCTCCGTCGCCACAACCAGAACCGCCGCCGCCGGAGATCTAGCCTCTTTGACATCACTACCGATACGGTGATGGAGTCTTCTACTATAATGGAAGAAGAACAAGTTCAGCAGGAAACGGCGGCGCTGACTATCCCCGCAGCATATCCGCCGTCGCATTACGGCGGTTTCCCTGGCGCAGGTTTTCCGATGAGTCTATCTCCAGTGGTTTTACCGGCGAGCAGTGAGAGGCTAGCCAAGCCGATTAGGCCGACGCCGATTTTGCCGGTCCCACCGTCGTCGAAGATGGCTAGTTTGAACTTGAAAGAGAAAGCTTCTCCGACTAATCTCATAGAGCCTTTACCGTTGTCGTTGAATCTGCCATCGCCGACGCCGCGGTCACAGGATCAGTCACCGGCGAGTAGTGACCACTCATCGCCGTCGTCGTCATCATCGGCTTTTCAGGCGATTTCTGCTGGGAAGTTCGGCGGCGGTGGGGACAGTATCATCAGCGTTGCTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_27968::LG7:43227364-43229364(-)
GACTTCATAAATTATACACCACTTCAATGTTCAATTCACTATTTTTTTTTATCTCTCAGTCCATTATATTATTTATTATAATTATTTTCTTTTCCTTTCTAGGTCTTAGTTAAAGGAGTGCTCACTCAATTTTTTTTTTCGCAAACAAAATTTGAATGTAATACTATTTATTTAATACAAATTAGATACACTAATATCCTAAAAAATAAGACTACATTTGAATAGTTATTAAGAAATCCTAGTCAAAAATAACACAGTAACATTTTTTAAAATAAGTAAAAAAATATTTTATAATGAATTTCTCAAAGTCATTGTCGTGTGCTACTTTTAACAATAAATATAAGTAAAATTATTGTCGTTTATATGCTTTTGATGACACGTATCTATAGATTTTTCATCGTATTCCTTTTAAATACAATCCAAAGTATTCATGTGCAACTTTTTGTTTATGTTGTTCATCTTCTTTGTTCTCTTTGTACAGTCTTTTGATTTTCTTTTGTGTCGTAATTGTTCATCTCCTTTCTCCATTATGGGAATACCTATAGTCCCTAAACTTAAATGTAAATTGTAAAAGTGCTTCCCAAGTATAAGCAATAATTCAACATCAACTGGGTTATTAACACTGGTGAAATTCAACTTTGAATATGCAACAATTTATGGATCAAGGAATATAGTTTTGACGTGTATAAAATAATATATAAATATATTTTTCAAAATTTTTAATATATTTGGTCTTTCTAATTATTTGTAAATCTAGTTTGAAACCCACAAAAATATTTTCTAAACATCCGTCTATTATATCTCGTACATTCAAAGATTAAACATTGACATTATACGTTGATATTCTAAAATAATTTCAATTCATCATTATTAGAATAGCGTTTTATTAATAGGTTATGTTAATAAATGTTTTGGAACAGTTATTTAAAGCTTTTTTTAAAAAAAATATTATCTACTAATGTTTTCGTTTTTGTTATCGGAACTCATTTAAATGTTTTTGAAAATTTTTACAATGACACACCTCTTACACTTTATATTCTTCAATTATTTATAAAAACATTGTATTTTATATGAAGAAATATTACAAATATCAAAAGAAATTGTAAGGATAATATACAGTGTGGAAAAATAAAGAGTGTTAATATTATATATACATCACGTTTTTATTACTAATTTTTTTAAACTGCACACAATAAACCATCTATTTGACCGTTAATACTATAGAAAGAATAGTATACCTATGAAATGACTCCTTTATAGCAGAGATTTGATGAAGACGAAACGCGTAAAATTGTTGTAAAGCAAGTTAGAGAATATATAAAAAAATAAAAATGGATAAAATTTAGCTTCCGTCCTACTAGCTTGTACGTGTTAGTGGTACTTTAACCATCAATAATTTTATTTTGTATGTTTTTTAACTCTTTCACTCTAAGTGTATATAATAAATATATATTCTTTTTGTTGACCACACTAATACTAAAAATAATTAATGTAATATTTTTAATTTTTTGATAACTTAATTTTTTTTATTGCATCACTTAATTCATTACGTGTTTTATTTTATTTTTTGTCTGGGTGTTGAAAGGAGTATTTATGGATAATTTCTTTTCCATATTTGCAGCGTGTCCATAAATATTATGGGACATATATTAAATGCTAAACGATCGTAGGACACACGTTTTGGGTCGTGCTTACCGAGGCAAGCCAAACATGGCACAGTATTTGACGGTCCTGATTGATGGATTCTGTCTCCTCAACGAAAAATGACCACCAATACCATGACGACACCAATCGACGTTCATAATAATTTCTAGTGCCAAACAACCCCTCTTTCGTTTCCCACCGCATAGTATTAGTAAGTAATTCTAGTAACCCTAGTAGTAACTTTAGTGTACGGCAGCGCCTACCACAAACACCAATGCCATCACCACACTTTCAACACTTCAACCCTACCAAAGCAAAACTCTCTATATATCACCCAAACATCCCTATGTCTCTTT


Gene Sequence:
>Vu_27968(-)
CTTTCTCTCCATCACAAACACAAACCCAACAACACCCTTTCTTCTTTCAAACCTTTTATTTCTTCACCTTATATTATCACATCTATTAATCTTCCACACACATATCATATTCATATAGCCATATTTATTGCATGGACTGTTGAGATGTCTCGCACGTGCTCACAGTGCGGGAACAACGGCCACAACTCAAGGACATGCACCGACGGTGGTGCTGCTGTTTCCGGGGGCTCGTCTCCCCGGGAGAGCGGCTTCATGCTGTTTGGCGTGCGAGTCACCGAAGGAATTTCCTCCTTCAGGAAGAGCGCTAGCATGAACAACCTCTCTCAATATGACGCCGATTCCAACACAGCCGACGCCGGGTACGCCTCCGACGACGTCGTTCACGCCTCCGGTCGCGCGCGCGAGCGCAAGCGAGGTCAGTAATTAACCGATTAACAATCATTAACGATTTCTTTAATTGTTCTGATATGTTCTTTGGCGTTGTTTGGTTTGAGAGACAAATTAATTGATCGATTGAGTTTTTGGATTGGTGAACAAAGGTGTTCCTTGGACGGAGGAAGAGCACAGACTGTTCCTGTTAGGGTTGCACAAAGTTGGAAAGGGAGATTGGAGAGGAATTTCTAGAAACTTCGTCAAAACTCGCACGCCAACTCAGGTCGCCAGTCACGCTCAGAAGTACTTCCTCCGTCGCCACAACCAGAACCGCCGCCGCCGGAGATCTAGCCTCTTTGACATCACTACCGATACGGTACTTTCAGTTTCCTTTTCTTCTTTTGCACAATAAATTGATGTTAATTTCTGTTGGCATCCATCTAAATGTCATTAGATTTTATTTCTAATTTATTTTAAATTAAATAACTGGATTCACAATTTCAAAACAGTTATAAACTAACTCCAAAATGAAATAATTAATTGATTAAAACAAACTAGAGATTCATTTAAATATTCTTAAATAATTTGAGAGTAATTAGTAATTTTAACGTTTAATTGATTTTTATTTTGGAATTCCAGGTGATGGAGTCTTCTACTATAATGGAAGAAGAACAAGTTCAGCAGGAAACGGCGGCGCTGACTATCCCCGCAGCATATCCGCCGTCGCATTACGGCGGTTTCCCTGGCGCAGGTTTTCCGATGAGTCTATCTCCAGTGGTTTTACCGGCGAGCAGTGAGAGGCTAGCCAAGCCGATTAGGCCGACGCCGATTTTGCCGGTCCCACCGTCGTCGAAGATGGCTAGTTTGAACTTGAAAGAGAAAGCTTCTCCGACTAATCTCATAGAGCCTTTACCGTTGTCGTTGAATCTGCCATCGCCGACGCCGCGGTCACAGGATCAGTCACCGGCGAGTAGTGACCACTCATCGCCGTCGTCGTCATCATCGGCTTTTCAGGCGATTTCTGCTGGGAAGTTCGGCGGCGGTGGGGACAGTATCATCAGCGTTGCTTGAAAAGAAGGAAACCTAAAAAAATTAGCGTCATTAAGTTACTATTAAGCAAGTACGGTCGTGGATAATTTGAATATGTAAATTAATTTTACAAAGTCGGAGATGTATCCAAGAGGGGGAAAATTGAAGATATGTGTTGGAGATTTATTGATTACTAAAGATAAAGATAATATCGGTAGGAGGGAGGGGATATTTGAATCAATGAGTATGATCATAATTATGATTTGAAGAAAAAAAAGAAGAGTATGTTAGGCTATATAGGTAATTAGTAAATTAAATTGCTGGTTTGCATTGAATGTACAGGTTTAGAAATGAATTAGATAGATGGGTTGTCACATTCTCTAGCTGTCGGGGGATTCTTGTTTCTATTTGTATGGGGGAGTGTGACATTGAAATGATAGGGCACCAGGTACTCTTTATATGCTATTGGTCTCGCTCTGTATTGCATTGCCATTGGGGTCATTAAAATATCACTGCTAGCTTAGACAAACGAATATATTATGCTCACCCTTCAATTCTTAAGCACATGCCATTCAATCACC