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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_27930 LG7 42577015 42580044 PREDICTED: probable receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g34500
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 42579532 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_27930.1
MAASATASGGVLTDLTHRTPFLGLKLYALILILVIMVVAAVLLILLCFRRSSKKRKMRVKHSSGAIPLVSKEILEVNTLELKIEEADEEDPKKEEMKLEDSPSVESPNIGWGRWYSLSELEAATQGFAEGNVIGEGGYGIVYRGNLLDGSVVAVKNLLNNKGQAEKEFKVEVEAIGKVRHKNLVGLVGYCAEGAQRMLVYEYVDNGTLEQWLHGDVGPVSPLTWDIRMKIAVGTAKGLAYLHEGLEPKVVHRDVKSSNILLDKKWNAKVSDFGLAKLLGPEKSYVTTRVMGTFGYVSPEYASTGMLNEGSDVYSFGILLMELITGRSPIDYSRPPGEMNLVDWFKGMVANRLGDELVDPLIDIQPSQRSLKRALLVCLRCIDLDVSKRPKMGQIVHMLEADDFPFRSEHRTNREKDPVYSKAAGSSKIPYPTRHVEPVDKSNWR*


CDS Sequence:
>Vu_27930.1
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Promoter Sequence:
>Vu_27930::LG7:42580044-42582044(-)
TTCATGATCTTGAATTTCAGTTGTAAATTTGATCTTCTAATCACGATTAAGAATAGTCTTTTTATGTTATAGTTATACTAATGAGATTCTCCAGGAATCAAGGTTTTATACCTTAGTTCTATTAAACATGTTTTAAGTAAACGTGACAAAGAATTTTACGGTTGAAATCACACAATTGTGATTCATATAGATCTAGTCGAAATAGCTAGAATTACGGCATTAATCACACACTTAAGAAAAAAACAAACAATTAAAATATAATAAATTTAATAGTAAGAGTTATGTTATAGACCAAAAGTGGAAATAAGGGGATAAATAAAACAAGGAAGTGAATAACTTTCTTTTCTAATTGGGTAAATTTTTCATTGTAAATTTTGATCAAAATGTACTTAATATATTTTTGAACAAATTAATTTCAGTTTATTTTCTTAACCATAAGAGATACATTAATGATACTAACTATGTTTTTAATAATAATTTACTGTTAATTAATTGTTGATACGATGGTTAACAACCATATATGATTTGAATTATTTTGAAAATAGGGTTGAAGTAGAGGGAATGCAATTCATACCGACACATTTAATATCTATGAACTGATAGCTCACGACAACTAATTTTTTCACGTACTTCCACATTCCTTAATTATTTGGACACGCGCTCAATAACTTCTCCATCATCGTATACATAATATTTATAAGAAATACGTCTATTAATATAAAAAGATTAAAAAGCTCGTTTTTATAAAAGTGATTGTGGTATGAATAAGTTATTTAGCAATGTATGGGAGATATTTGAGTTGCATGTGTAGGGCATTGGAAGTTAGTTACTGTAGGTGGAGCTAGTTGAGTTGGTGAAAGTAAATGGGAAGTATGAAAAGAGAATGAAAATGGCATATTGAAAGAAATGGTTTGGTGGTGAGTTACGTTGGATAATCACGTTTACGAGTCAATTTGTCATCTACATATATAAGATCAACCCTAGTCCTTTTCATCAAATCACAATGGATAATTCTGTTTCAACTTCCACCATTCGCTCCAATTCAAAGCAAACCAAACCCTATTTTCTTCTCAAAATATTACAAGTTAGTTACTATATATTATTCCAGATATTATCTATTTTAAAGACTACAATTTTGTCATAATTTTATTTTTAGAAAACATATTACATTATTGAAAATAAATATTTAAATTATCTTGCCTACGATATTTGATCACTAATATTGTAAAAGTAATATCTTAAATTAATTATTTTTTATTATTAGTGTTTAGATTAAATGTATTTTTAATTTCTAATATAAAATTAATTTTTTATTTTATTTTAAATTTTGATATAATTTAATTTTTAAATTTTATAAATGAATAAATACATTTTTTTTTCAAATCTAATCATGTGAATTGTTAAACAGTATTTCAAGCTAAGATTAAAATTATTAACACAGTTTAACATGTTATTGATAAAATATCGTTCTAAAGTCTTATTTAAGACATAAAATTATATCAATTTATTTTTTAAATTTAATAAGCAAAATATATTAAAATTTTAAAACAATAAATTTTTACTTTCGTTCAAGATTTAAAAAATAAAAACATATTTCATTATTATTATTTATACCAATTCATCATGTACTTGAGTTGTAATTACATTGGAGTCCCCACGGTGATGACGTGAATGGGGAAGTTAAGGGAGCGTGCGCGAGTGGCATTTATGTAAATAGAGTCCCAATCGGACCCAAAAAGCAATAACTACAATCCCGGTTCTGTCTTGCTTTGCTTTAGCTTTTGTATCCGTTGATGAAAGTTGAAACTTCACACTTTTCCCAATATTCTCGCTTCTTTTCTTTTTCTTCTTTTCTTCTTTCGTTCATATCATTTTTTTTCAATTCTGAAGCAACCACTTCACTGCATCACAGTTTCCACAACAGCAACAACCAAACGCTGTCAACACTACATTCTCTCGTTTTCACTCCATTCCATTCTCGCTCCAAATAAATATCAGCA


Gene Sequence:
>Vu_27930(-)
ATGGCGGCATCCGCCACCGCCTCCGGCGGTGTGTTGACGGATCTAACTCACCGAACCCCCTTTCTCGGTCTCAAACTCTACGCCCTGATCCTCATTCTAGTTATAATGGTGGTGGCAGCAGTGCTCCTGATCCTCCTCTGCTTCCGCCGGAGCTCGAAGAAGCGGAAAATGCGAGTGAAGCACAGCTCCGGCGCGATCCCGCTGGTATCGAAGGAGATCCTGGAAGTGAATACTCTGGAACTGAAAATCGAAGAGGCGGATGAGGAGGATCCGAAGAAGGAGGAGATGAAGCTTGAAGATAGTCCGTCGGTGGAGTCACCGAACATAGGGTGGGGACGCTGGTATAGCCTCAGTGAGCTTGAGGCTGCGACGCAAGGGTTCGCCGAAGGGAATGTGATCGGAGAAGGAGGGTATGGGATTGTGTATAGAGGAAATTTGCTCGACGGTTCTGTCGTCGCGGTCAAAAATCTTCTCAACAACAAGTATGCATTTCTCTCTACGTTTTTCTGTTTCTTTTTCATTTTTTTCTCACGTTGCTGTGTAGTTTTCTTATATTGGTTTGTATATAATGCAAATAAAAAGCAGCTAAGAGAAACTGTTTTCTGTTCTGGGATCCTACACGTGAATTGTGGAACAGGAATTTCACATGTGTTTCTAAACATAACTATAGACAGAAATTCCTTAAATAAATCTTAATATATCAAGAAATTAGAATCTGAATATCGATTAGATTAGAACTGGCGTAAACAATGAGTAGCTTTTTAGTCTCCGACAAGGATCGTCTCGAATTTATAATTATGAGTTGTTACTTGTTTTGGGGAGTATTAAGGACTAACGTGAGTGGATGGTCAATGTGCTCTTCTTCTTTGCTTTTTTCTTTGGGGGGCCTCTGGGTGATGTTATTTTAGTATTTTACCTTTTTCTTTGTCTACTTTTGCTTTTTTGTTTATTTATTTATTATTATATTGTTCGTGATTTCTGTATCTCAACCTTTTCTTTTCTAGGCATGTTAATTTAGCTTAATCTGGATAATACTTTAGTTTAAAGTTTAAACAAACGTGTCAGTTGCTGTGAATTAGGTGGGCCAGCGAGAGACTGATGGTAGTATTAATTAATAGCTTCATATTACTCTATACAAAAATGAACTTGGATCTTCTCTCTCTAATTTTTTTTTTCCAAGTAAAGTGCGATAATCACGTTAGAAAGTGAAAAACACAATTGTTGTCAGATATAATTATTGGATCTTATTTGTGTTCGTTTTCAATGTCACTCTATATTGAAGAGATCTAAATCTAACCAAAACGGCAGCTACGCATTTGCATGACATTGGAACTCGCTGCAATAAATTAAGTAGCATTGTAGAACTCTAGACTAGAGGAAAATATGCGAAGGTTGTTTTACCACAGCAACTTTGCTGAAATCACGGAATGTTTTCAATACTCTTTCTTCCTCACCATCCTGCAATGGCTTATTGAAACTCATGTGTTATTGTATTGTAACAAAGGGGGCAGGCAGAGAAAGAGTTTAAGGTGGAGGTTGAAGCCATTGGAAAAGTGAGGCACAAGAATTTGGTGGGGTTAGTTGGATATTGTGCAGAAGGTGCTCAAAGGTAAAATATGTTTAAGCATGTGGCTTTAATTATTTCTTTGAAGGTCTTTCAAATGAAGAAACTTGTGAATATGACACTTTTGCTGACTATTCATTCAGGATGCTTGTTTATGAATATGTTGACAATGGAACATTGGAACAGTGGCTGCATGGTGACGTAGGACCTGTTAGCCCCTTGACATGGGATATACGAATGAAGATTGCTGTTGGGACTGCGAAAGGGTGTGTTTATGGAGTCTCCTGTGTCGTTTTATTGAACATATACCTCAAACTTTCACTCATGCCAGCTATCTCTAATTGTAGTATAATTCTTGTCAACTGATATATTACTATTTTTTACAATACGTATTTCTAGTACAACTCTTATCATGATCCCTTAATATTACATTTCTATTACTTTAAATATTTTTTCGTGGAGTATTAATTAACCTTCCTACATTACGAAACAGGCTAGCCTACTTGCACGAAGGATTAGAACCCAAAGTTGTCCATCGAGATGTAAAATCCAGTAACATTCTTTTGGACAAAAAGTGGAATGCTAAAGTATCAGACTTTGGACTGGCCAAGCTCTTAGGGCCTGAGAAAAGCTACGTGACAACGCGTGTAATGGGGACATTTGGGTTAGTTTCATTCTCAAGTAAACATTCTCTTACATGGAGGTGGATACTATTTATCTGTTTCATTCAACGCCACAAATTTTGTGCAGATATGTGTCACCTGAGTATGCAAGCACGGGTATGCTTAATGAAGGCAGCGATGTGTATAGTTTTGGGATTCTACTTATGGAGCTAATTACAGGGAGGAGTCCGATCGATTATTCTAGACCACCTGGAGAGGTGATTCTATGATTTCTCTATATTTTCTTACTGTCTCCCCTGAAACTCCAATGAGTCTTATGTGTGCGTTTTGTTTGGTGCGCTCAGATGAACTTGGTTGATTGGTTTAAAGGAATGGTTGCAAATCGTCTTGGTGATGAACTAGTTGATCCTTTAATAGATATTCAACCCTCTCAAAGATCTTTGAAACGAGCTTTACTTGTTTGTCTGCGCTGTATAGATTTGGATGTCAGTAAGCGACCAAAGATGGGCCAAATTGTTCACATGCTTGAGGCTGACGATTTTCCCTTTCGTTCTGTAAGCCTCCTCCCATGCTTTCATCCTCTGTGATTTATAAGACAAAAACATGTGATGCAGCGTTACACACAGTTTTTGATACTATATGTCACATCCTAATGTGGAATATTTAATTTCACAGTAAATTTGAGTATAGCTTCACCAACTGAAATGACTTGCTTTGCTTTCTGAATAGGAACATCGAACAAACAGAGAGAAAGATCCTGTTTATTCTAAAGCAGCTGGTTCCAGCAAGATTCCATATCCAACAAGGCATGTAGAGCCAGTAGATAAATCAAACTGGAGATGA

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