Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_27862 LG7 41783049 41789411 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 41783129 missense_variant p.Tyr1641Phe
G/T 41783329 synonymous_variant p.Gly1574Gly
A/T 41783764 synonymous_variant p.Ala1429Ala
G/A 41783990 missense_variant p.Pro1354Leu
T/C 41784045 missense_variant p.Lys1336Glu
G/A 41784099 missense_variant p.His1318Tyr
A/T 41784107 missense_variant p.Leu1315His
G/A 41784108 missense_variant p.Leu1315Phe
T/A 41784227 stop_lost p.Ter1275Leuext*?
C/A 41784252 stop_gained p.Gly1267*
C/A 41784331 missense_variant p.Glu1240Asp
A/T 41784567 stop_lost p.Ter1162Lysext*?
A/T 41784579 stop_lost p.Ter1158Argext*?
C/T 41784761 stop_gained p.Trp1097*
C/T 41784763 synonymous_variant p.Leu1096Leu
A/T 41784804 stop_lost p.Ter1083Argext*?
G/A 41784808 synonymous_variant p.Asp1081Asp
T/A 41785239 stop_gained p.Lys938*
C/T 41785261 synonymous_variant p.Gln930Gln
T/A 41785579 intron_variant
T/A 41785589 intron_variant
A/G 41785601 intron_variant
T/A 41785866 stop_lost p.Ter903Leuext*?
T/A 41786046 intron_variant
T/A 41786313 intron_variant
C/T 41786736 synonymous_variant p.Gln863Gln
A/T 41787033 synonymous_variant p.Leu793Leu
T/A 41787136 missense_variant p.Asn759Ile
A/T 41787156 synonymous_variant p.Val752Val
A/T 41787169 missense_variant p.Val748Glu
A/T 41787259 missense_variant p.Leu718Gln
A/T 41787297 synonymous_variant p.Ser705Ser
C/A 41787778 missense_variant p.Gly545Val
C/T 41787818 missense_variant p.Gly532Ser
T/A 41787862 missense_variant p.Lys517Ile
A/T 41787988 missense_variant p.Ile475Asn
A/T 41788327 missense_variant p.Val362Asp
A/T 41788785 synonymous_variant p.Leu209Leu
G/A 41788810 missense_variant p.Thr201Met
T/A 41788811 missense_variant p.Thr201Ser
T/A 41788933 missense_variant p.Glu160Val
G/T 41788997 missense_variant p.Leu139Ile
G/T 41789109 synonymous_variant p.Thr101Thr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_27862.1
MNPIICSGYIFILYLSNLQLVAVADDGSYVPTENIVLSCGSNTSEYVQYDGRNWNGDIVSPYVPSDADTKSLAVRAPNTLESIPEVPYMTARIFYSKFTYTFNVTPGPKFIRLHFYPASYINLNISDAFLSVSAANFTLLHNFSASLNADYYNLAYFMKEFIVHVSGSVLQLTFSPSYNASRAFAFVNGIEVVSMPHNLYTMGSDDVPLPLVGHNNGLDIYNDTAMENLYRLNVGGEQIPPKYDTGMFRSWDSDEVYIFGASISFQSFDISMLVLYSDNAPPYSAPVDVYRISRSMPTFYDGLINLNFNLTWFFPVDSGFLYLVRLHFCQIYQGITKVNQVVFTVFLNNQTAEEQVDIIALVGKPGVAVHRDYVVMVPHANEGKQDLWLDLHPYKDSKPMYYNAYLNGVEIFKLSNFGDKSLAGLNPSKSFLSGSDEKASHVAHFNKSSKKLKFVLIGCGLLAVVLPVLLCLLLIRLKVIKLRRVVSLCGLTVHTPNRIEKAKKWSLCTQFSMRDIKLATNDFHEDLLIGTGGFGSVYKGSFTDGATYVAVKRANPMSEQGISEFEAEILLLSQLKHHNLVSLLGYCNEDGEMILVYDFMANGSLHDHLHLRQRDGSPLDWIQRLEICMGIARGLHYLHTGTKDRIIHRDIKTTNILLDHNWVPKISDFGLSKEGFPSFVTTNVKGSIGYLDPECYESHKLTEKSDIYSLGVVLLEVLSARPAVSVGEDDEHINLAEWTVSCLENGNVEEIVDPNLKENIIKECFELYLGVAMKCLAERGTERPSIGEVLESLVLAMHLQKNEGSVPNGNHNAALQGNSDLTPGVEFSEIMTPIGIKSTIRNHLYCATTAAILSFFLNFPVNNRPIASYKWLTASAKYVHFCIVYCKMPTLKLSAWTSKHNSNKEVAWSQLNYQSTRDGVSSFLPPQYGNSSSTLLLSNMKDSLVPKVPYSTARITHSPLTYSFPSSPGLKFIRLYFLSSLYLMMIPSDKAYFSVKAGPYTLVSDFNPSDFAEELNSKFFTKDFLLNVREDKLTITLTPSPLISKAFAFVNGIEIFPVPKSIYFPFSKVPVPYLGHQQILLTNDEYALETLYRVGICGGENAFGMWSDDSRYISRSHIGGVLNIKSVTVSLNYTTLSSKDYNYSAPEEIYWTARTMGSDGDANMKYNLTWSFPVDSGFKYLVRLHFCEISIGVTKPNQRVFKVYINNQTAEERMDVVASAGAPFTPLHKDYVVMVPTETGRRKDLWISLQPNLESKPKYADAILNGMEIMKISDSNHSLAAMFQLRSEQRKKKGQHVIIVVAATLGTIFGLLFTLFINIHRAGKKLKWRTSNILPSNSSRSHKNIQPTVTSGLCHQFTLEEISIATSNFSEDLVIGEGGFGKVYKGIMHHDGVTDVAVKRSNRRSGQGYKEFQTEINFFSFCHMNLVSLLGYCQEGNELILVYEYMAEGPLSDHLYKKRKQPLSWIQRIKICIGAARGLHYLHTSTRHPVIHRDVKSANILLDENWVAKIADFGLCRTVPSLYHSHVSTEVKGTLGYLDPEYYKRRKLTQKSDVYSFGVVLFEVLCGRAAVNPVAVEEENEKVGLATWAVHCYKCGSIDELVDPHLAGNVRPECLRAFVDLGIHCLADRTADRPTMGEVLNTLERILYLQDSLEEQEPHTISTIACD*


CDS Sequence:
>Vu_27862.1
ATGAACCCTATCATATGCTCAGGCTACATTTTTATATTGTATCTCTCAAACCTACAACTAGTTGCAGTTGCTGATGATGGTAGTTATGTTCCTACAGAGAACATAGTTCTCAGCTGCGGCTCCAACACTTCAGAATATGTTCAATATGATGGAAGGAATTGGAATGGGGATATTGTTTCACCGTATGTTCCCTCTGATGCTGACACCAAGTCCCTGGCAGTGAGAGCCCCTAACACTCTTGAATCCATTCCAGAAGTTCCCTATATGACTGCAAGGATCTTTTACTCTAAATTCACCTACACCTTCAATGTAACTCCAGGTCCCAAATTCATTCGCCTTCACTTCTACCCAGCTTCCTACATCAATCTCAACATCTCCGATGCTTTCTTATCAGTAAGTGCTGCTAACTTCACTCTTCTCCATAACTTCAGTGCTTCCCTCAACGCTGATTACTATAACTTGGCCTATTTCATGAAAGAATTCATTGTGCATGTTAGTGGGAGTGTTTTACAACTCACTTTCTCCCCATCATATAATGCCTCTCGTGCCTTTGCATTTGTGAATGGTATTGAAGTTGTTTCAATGCCACATAATTTATACACGATGGGTAGTGATGATGTTCCTCTTCCCTTAGTTGGCCATAACAATGGTTTGGACATTTATAATGACACTGCCATGGAGAACTTGTACAGATTGAATGTAGGAGGTGAGCAAATCCCACCCAAATATGACACTGGCATGTTTCGGAGTTGGGACTCTGATGAAGTTTACATTTTCGGGGCTAGTATTAGTTTTCAATCCTTTGATATAAGCATGCTCGTTTTGTATTCTGATAATGCTCCACCATATTCAGCCCCAGTAGACGTTTACCGCATATCCCGCTCAATGCCAACTTTTTATGATGGACTTATAAATTTAAATTTCAATTTGACATGGTTTTTTCCCGTTGATTCTGGTTTCCTTTATCTGGTCAGGCTTCACTTCTGTCAAATTTATCAAGGTATAACAAAGGTCAATCAGGTAGTTTTTACCGTATTTTTAAATAATCAAACAGCTGAAGAGCAAGTTGATATAATTGCTTTGGTTGGGAAGCCCGGAGTTGCTGTACACAGAGATTACGTAGTGATGGTTCCACACGCTAACGAGGGAAAGCAAGATTTGTGGCTTGATCTGCACCCATACAAGGATTCTAAACCCATGTACTATAATGCTTACTTGAATGGTGTGGAGATCTTTAAACTCAGCAATTTTGGTGATAAGAGTCTTGCAGGGCTCAACCCTTCCAAAAGCTTCTTGTCTGGGTCCGATGAAAAGGCTTCCCATGTTGCACATTTTAATAAAAGTTCGAAGAAACTCAAATTCGTCCTGATTGGATGTGGACTTCTTGCAGTGGTGCTGCCAGTTCTCCTTTGCTTACTCCTAATCAGGTTAAAGGTGATCAAGCTTAGAAGGGTCGTTTCACTGTGCGGTCTCACTGTCCACACACCTAATCGAATTGAAAAAGCAAAAAAGTGGTCACTTTGCACTCAATTTTCAATGCGAGATATAAAATTGGCGACAAATGACTTCCATGAGGATTTACTTATAGGCACTGGTGGATTTGGCAGTGTTTACAAGGGTAGCTTCACCGATGGTGCAACTTACGTGGCTGTTAAACGTGCCAATCCAATGTCAGAGCAAGGTATTTCAGAATTTGAGGCAGAGATCCTTTTGCTCTCACAGCTTAAGCATCATAACCTGGTATCCCTTTTGGGTTATTGCAATGAGGATGGGGAGATGATATTGGTGTATGACTTCATGGCCAATGGAAGTCTGCACGATCATCTTCATCTGAGGCAGAGAGATGGATCCCCTTTGGATTGGATTCAACGTCTTGAGATATGCATGGGAATTGCAAGGGGTTTGCACTACCTTCACACTGGCACAAAGGACAGGATCATTCACCGCGACATCAAGACAACCAACATACTCTTGGATCACAACTGGGTGCCCAAAATTTCAGATTTTGGGTTGTCAAAGGAAGGTTTCCCTTCCTTTGTCACTACCAACGTGAAGGGTAGCATTGGTTACTTAGATCCCGAATGCTATGAAAGCCACAAGTTGACTGAGAAATCTGATATATACTCACTTGGGGTGGTGTTATTGGAGGTTCTGAGTGCAAGACCTGCTGTAAGTGTAGGTGAAGATGATGAGCATATTAACTTGGCTGAATGGACTGTGTCGTGCCTTGAGAATGGAAATGTGGAGGAAATAGTTGATCCCAACTTGAAAGAAAACATAATTAAGGAGTGCTTTGAGTTATATTTAGGAGTTGCAATGAAATGTTTGGCTGAAAGAGGAACGGAAAGGCCATCCATTGGTGAAGTGCTAGAGAGCCTTGTTCTGGCAATGCATCTTCAGAAAAATGAAGGCAGTGTCCCAAATGGAAATCATAATGCTGCTCTGCAGGGTAATTCAGATTTGACACCTGGGGTTGAGTTCTCTGAAATCATGACGCCTATTGGAATCAAAAGCACTATTAGAAATCATTTGTATTGCGCTACCACTGCTGCAATTCTGAGTTTTTTTCTGAACTTTCCCGTAAACAACAGGCCAATTGCTTCGTACAAATGGCTTACGGCAAGTGCTAAATACGTTCACTTCTGTATTGTCTATTGCAAAATGCCAACATTGAAACTGTCCGCGTGGACTAGTAAACACAACAGTAATAAAGAAGTGGCTTGGAGTCAGCTAAACTATCAGTCAACTCGAGATGGTGTATCTAGTTTCTTGCCTCCACAGTATGGCAACAGCTCTTCCACACTCTTGCTCTCAAACATGAAAGACTCTCTAGTACCAAAAGTTCCATACTCAACAGCAAGAATAACTCATTCTCCATTGACCTACTCCTTTCCTTCCTCCCCTGGCCTTAAATTCATTCGTCTTTACTTTCTCTCATCTTTATATCTGATGATGATCCCCTCTGACAAGGCTTATTTCTCTGTAAAAGCTGGGCCTTACACTCTTGTAAGTGATTTCAATCCATCAGATTTTGCAGAAGAGCTAAACTCGAAGTTTTTCACCAAGGATTTCTTACTAAATGTTAGGGAAGACAAACTGACCATTACACTTACTCCATCTCCTTTAATTTCCAAAGCATTTGCTTTTGTAAATGGCATTGAGATATTCCCGGTGCCCAAAAGTATATACTTTCCGTTTTCCAAGGTTCCTGTTCCTTACCTTGGGCACCAGCAAATTTTGTTGACTAATGATGAATATGCTCTAGAGACGCTTTACAGAGTTGGCATTTGTGGTGGAGAAAATGCTTTTGGAATGTGGTCAGATGATTCTAGATACATATCTCGTTCACACATTGGAGGTGTCCTCAATATAAAGTCTGTTACTGTTAGCTTGAATTACACCACTTTATCTTCAAAGGATTACAATTATTCAGCACCGGAGGAGATATATTGGACTGCCAGGACAATGGGTAGTGATGGAGATGCTAACATGAAGTACAATTTAACATGGTCTTTCCCTGTTGATTCTGGATTCAAGTACCTCGTTAGGCTTCATTTCTGTGAGATATCTATTGGGGTAACGAAGCCCAATCAAAGGGTGTTCAAAGTGTACATAAACAACCAAACAGCAGAGGAGAGGATGGACGTAGTTGCTTCTGCCGGAGCACCATTTACTCCTTTGCACAAGGACTATGTTGTTATGGTTCCTACGGAAACTGGGAGGAGGAAAGATTTGTGGATCTCGCTTCAACCAAACTTGGAGTCAAAACCAAAATATGCCGATGCCATACTGAATGGAATGGAGATCATGAAGATAAGTGATAGTAATCATAGTCTTGCAGCAATGTTCCAGTTGAGAAGCGAACAAAGAAAGAAGAAAGGTCAACATGTCATCATTGTGGTTGCTGCTACTTTAGGTACTATCTTCGGACTGCTCTTCACACTCTTCATTAACATCCACAGAGCAGGGAAAAAATTGAAGTGGAGAACTTCTAATATACTTCCATCAAATTCTAGTAGAAGTCACAAAAACATTCAACCCACAGTAACCTCAGGTCTTTGCCATCAATTCACACTTGAAGAAATCAGCATAGCTACAAGCAACTTCAGTGAAGATCTAGTCATCGGGGAGGGAGGCTTCGGAAAGGTGTACAAAGGCATCATGCATCATGATGGAGTTACTGATGTTGCAGTAAAGCGCTCTAATCGTAGATCTGGTCAAGGATATAAAGAGTTTCAAACTGAGATCAATTTTTTCTCATTCTGTCACATGAATCTAGTGTCACTGCTGGGATACTGCCAAGAGGGAAATGAACTGATACTTGTGTATGAATACATGGCTGAGGGTCCTCTGTCTGACCACTTATACAAGAAAAGAAAACAGCCACTGTCTTGGATTCAAAGAATAAAGATCTGTATTGGTGCAGCTCGAGGACTACATTACCTCCACACTAGCACAAGGCACCCAGTGATTCACCGTGATGTGAAGTCAGCCAACATATTATTGGATGAGAATTGGGTAGCCAAGATTGCAGATTTTGGGTTGTGTAGAACAGTTCCCTCACTTTACCACTCACATGTAAGCACGGAGGTTAAAGGTACTTTAGGATATTTAGACCCTGAGTACTATAAGAGAAGAAAACTGACTCAAAAATCTGATGTGTATTCATTTGGAGTGGTTTTGTTTGAGGTGTTGTGTGGAAGAGCAGCTGTGAATCCTGTGGCAGTGGAAGAGGAAAATGAGAAAGTTGGATTGGCTACATGGGCCGTGCACTGTTACAAGTGTGGAAGCATCGATGAATTAGTTGATCCTCATTTAGCAGGGAATGTTAGGCCAGAATGCCTGAGGGCGTTTGTGGACTTAGGCATCCACTGCTTGGCTGATAGAACTGCAGATAGGCCAACTATGGGAGAGGTCCTCAATACTTTAGAGAGGATCCTTTACTTGCAGGATAGTTTAGAGGAACAAGAACCTCATACAATTTCTACAATAGCTTGTGATTAG


Promoter Sequence:
>Vu_27862::LG7:41789411-41791411(-)
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Gene Sequence:
>Vu_27862(-)
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