Genomic Resources - Ricebean Portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Gene Details:

Gene ID	Chr. No.	Start Position	End Position	Function	View on
Vu_27847	LG7	40435972	40439593	PREDICTED: LOB domain-containing protein 4-like	Map

Annotations

category		relationship type		keyword

SNP	Position	Effect
G/A	40436328	intron_variant
T/C	40436563	intron_variant
T/C	40436845	intron_variant
A/T	40437164	intron_variant
T/A	40437951	intron_variant
G/A	40438012	intron_variant
T/C	40438037	intron_variant
T/A	40438402	intron_variant
A/G	40438411	intron_variant
G/T	40438994	intron_variant
A/T	40439147	intron_variant

View accession wise SNPs

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_27847.1

MKDGGRKQGAMSPCAACKLLRRRCAEDCVFAPYFPADEPHKFASVHKVFGASNVNKMLQELPEYQRSDAVSSMVYEANARVRDPVYGCVGAISSLQQQVDVLQTQLALAQAEVVHMKLSQVSTSSEQLKAVPATSNSSSENLSPSSKLAKTLFAMDMVVDQPNMGVSLWSC*

CDS Sequence:
>Vu_27847.1

Promoter Sequence:
>Vu_27847::LG7:40433972-40435972(+)

ACACTTCTTCCAACTACTACTTCTACATTCTACTATCTCTACATCTTCTCTACCACATCAACTACTCCTTTCACAACCTTAAAATACTAACAGTTTACCCATCATGAAAAAATGCATTATTTTTGTTTTATTCATCTTTAAATATTACAGAAATTCATTATCTAGTCTAAACCATGTTGACAACCTACTAATACAACAACTATGGCTAGACACGCATTATAAACACATATGATTAACTACCTTAAAAAACCTACTTGGGAAACAACGACGTCGATTGAAGGACTGGGAACTTGGAGAAAAATGTAAATGCAGAGACAAGATAGCTGCACGAAAAGGAAGATGAAGGTAAAGGAAGAAAACAGGGTTGCGTTGCTAGAAAAGAATTTTTAGCTTTGAAAATGGGAGGAGAAAAAAGTTGAAGAGGAAGGAAGAAGGAAAGGTACATTGCAAGAGGGACTTTTGAGATTTTTAAACCACTTTTACATCAGTTCTTATTTAAATCCAAGTCAATAGACCCAGTAGATTTTACATCGGTTCTATTCTACAAAAATTGAAACCGCTTTTTTTACAACAATTTTAACTAAACCTATATAAAATATTCTCACAGAAAAATAATTTTGTATCAGTGTAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTATTTCACATAGTTTTGGATCGAATACAGTTTATATATTTTTTTCATTATTCAAAACGTCTTTTAAAAACAAAAATTAAAATTATGATAGAATTTCACGCTAAAAAACGTACAATATTATTATGATGATATTATGATTTACTTTAACAACGTTTATACTTTTATACTTTGGTTTACCTCACTAATCTAATATTAATTAATGAATTCAACAAGTTTGGTCTTCCACTAAGCTTATGGTTTCTGAGCAATCTTTTGTCTTCAGCTCTGCTCACCGTCTCCAACTCTGACACGCTTCTTATGCCTTTCTTCTGGTTCTCCTCTTCAAGCACACTCTCCTTTGTTTCATGTATATCTTCCTCTCTTTTTTTTCACCTCTTTTTGCTTGACAAAATCTTAAATTTCAAAGATTTTCTTTTTTCTAATTATGAATTACGCTTGTTGACTCAACTCATGTTATTATTAAAAGACAAGATCATGCGGTTAATTGTTTAAAAGAAACTCGGTATCAAAGATCAATTTACATATTATTTTTTTATCAAAAGCTCAAATTATTACAACATTTATAAATCGATCGTGCAACGAACATGTTGTTCCGTATGCACTTTTATCTTGTTTCTATTTTTTTCCTTTTTGTAAGAAAATAAATTTATTAATGAAATCTAAGTAGGGTACTCAATCCAATACAAGCTAAACATCCTCATATTGTGCTCAAACTCTTCACAAAAAACCAAAGTAAAGTTCATTCCTACGACTAAATAAAACGATTCTTAATCCGTGTTAAGACATATTGCCTTCCAATAACTCTTGTATCCGACCATAACGCCAAATAAGAAACTGCAAGAATAGCGATGTTCTACAAACTGATTCATTCTATGTTTACCTTGTAAACGAAAAAGATGAAGAAAAAGGGAAATTGTATGTCCCTTTTGAATGAAAATCTGTAGATTGTTCAAAGCATGAGGATATATATGTTAAGCATTAAAAACAAAAGAAATAATTAAAGAGTGAAAAAATAAATAATGTACATGTGGGGCAAAAGATCTTATCAACATCCATGATTTTGTCTAGCAAAATCTAGAGTTTCGTCTTTCATGGGACCCTTCCAAGATTTTCTGTCCCAAAACGTCTCTATATAACATCATGTCCACACTCCTTAAGACCCCCTCTCCCTTCCCATCGATCAAATTTTCATCTGCTCATCATTTTCCAACAATAAATTACCCTACACAACTTCATTTCTCCAGGTTCAACTAAATCTTTCAGCTCAAAAGTGCTTATCATATTGACTTATTCTTCTTCTTCTTTTTCTGCTTGAAGAAA

Gene Sequence:

>Vu_27847(+)

ATGAAGGATGGTGGAAGAAAACAAGGTGCAATGTCACCATGTGCAGCATGCAAGCTTCTTCGAAGGAGATGTGCAGAGGATTGTGTGTTTGCTCCTTATTTTCCTGCAGATGAGCCACACAAGTTTGCCAGTGTGCACAAGGTTTTTGGAGCTAGCAATGTCAACAAAATGTTACAGGTTTTCAATTCTCAGGCACCCCTTAATGTCCTTTCACTATATCTGCTCATCATGATATATGTTTATCATTTCATTGATACCAGTCAAATACTGTTTAAAAACCCTCCCAATCACTTTCATTAGGGTTGGTCTACTTGGATTTTTGTCTGAACCTTCTTACAAGTTCTCTGCTTTTGTTAGGAAGATAGGTTGCACTTTTTTAAAGCAGAGATCAAAACCTCATACACAAATTTACTTCTACTATAAGGTTAAATTGATAACTTAGGTTCAACATAAAGAAAAAAAGTATTAGACAAAGAACCTGCAGCTACTTTTTGTCTCAAACTGCAAAGTGACTAATGGTTATATACTAAACCACCATTGCAGTTTAACCTAACACACACACACATATACATAGCTTACTTGGATTTACATTCTTTTATTTGAAATGTGATTTAGCAAGGAAACTGATGTATCAAGCACTGTGTTTGTGTGTGTGAGAGAGAAAGATCAATGTATTAAGCAAGGAAACTGATGAAATACAATACCCACTTGCTAGTTCTTATAGAAGCTTTGTCAAAAGTGGCTTATTTATACTGAGAAGAATCTAATCAGCAGCACAGAGACTCACATGCTGATCAGATAAAAAGAAATGAAAAACATCCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATACTATATTCATGCATTTTGTGTAATATTTTCATTCTGATATATATCAGAAAAGCATTACTTGCTCTAGGGTTTTCTAATTTATCTGCTGCTGCTTACTTAAATAGGGACACAGATCAAACTTTCAAATATATAGATATTATAGAAGAAGAAAGTAGTCTTCCATCCATAAAAGCTTAAAGGGCTTACTTGTTCTTTGTTGTTTTCCCACTTTTACTTCCGTTGTAGTAGTTAATTACGGTTGATGTCCCCAAGCTAACTTTAATAATACATAGGTTTTATTTATACAAGCTTTTTTATGAACATGTTTAAAATAAATAAATAAAAATCTCTATAAATTAATATTAATATATACGTAGACTAGTTTGTAAAAGTTGTCTCCTAAATTTAACTAATTTTAATTTATTATGAAGAAACTTGTTTCTTTCTTTCTTAAAAATCTTTATGAAAAAATATGAGAAAATCCATAGTAATTGTTCTTCTTTATTAAAGTGAGGTAAGTATCTTAGCACATATAAAGAAGACAAAGGATCAAGTATATATAAATTAGCTTTAGTGCTGAGAAGCTACACCCATGTCAAGAAGATAAAGTTAAAAAAGATATGCAGCTAGGTACGTAATTATTATTGGCCATGTATTGCAATTTGTATTCCTTTCTTTCTTTATGACCAGTTAGCTTTTTTTTTCTTAGTCCTGGGTTCGTTGGTTAATCAATGTTATTTTAGAAAAGAAGAAAAAAAAGCTTATAGAGTTCATCTTTTTCTCTTTTCTCTTTAAAATCATGGGTTACATTGATAGAGACTGCTTATGCATGTTGAAAGTGATGTTGATTTCCCAAATAAAGATATTTCAATTGGTGATAAAATTAATGATATATGAAATTATCTTTTGTAAGCATGACTCATTGATGACATATTTTAACTTGTGTTCATTATATTCATGTAACAAATGCTATAAAAGAAAAAAGCAATGAAAAAAAAACTTGGGTCATGTCCATGACATCATTTTCATTTAGCTTTTTAGTTAAATAGTAACATGCGTATATTATTTAAAATTTTGTAATACATATATTTGTTAAGAATGCATTTGAGAGTGGAGATCAATAAAATGAAAAAAAAAAAAATTTCTCTTAAAATTTTGGATAAGTCAAATGTTATATATATATATGTTTGTTCGTGACTCGAGAATCATTTGATTCACCTCTTCTATTTTTTTTTATCGACTCTATAATGTGTCCTCCTAAAATAATCCAATAATATTACTTAATAGATATTAGAAAATATTCCCACTTGTTATTGAATTGAAAATATTTCAAATGAACATGATGTAAATTTTATCTTATAATCTATTTAAAAATGTAATATTGAAGAAATTGATTAAACATACATGCATATAAAAACATATATATATATATATATAATAACCATTAGTACTAAACAATAAACCTTAAACAATATAGTATTAACCATGATTTTAAATTCATACAAGAAGCCAAGACAAAATAATTGCAGGTTTTTTGAGAGACGAATATGCATAAATCAAGATAAAATTGTTGGCTGAATTTTCATACACGTTATGATATCACATGGTGAATTATTGTCCTAGTCTATACATTGCATCCTTATTTATTTAAAAGTAGCCAAGCCAGGGTTATGATTTTACTATTATATATTCTCTTAAGTCAACAACTTCTTGTTTTGTTTTCCCCTCCGAAGCACATAGTTTCAACATACACATGCAACTCTTTTTTGACTAAACATGATCTATATTTCTATTCAAAAGAACGATGGTTTTCATCATATCACTCATGAATCTAGGTCAACACATAGAGCTTCCACCTGAATATTCCTTTTACTTGTACTCAAGTTACGGCTAACGTTACTTTTTTTACACATATTCACACATATCATGATAACCTGTTGAGTGTGATATATAACTTTTTGTAAGCAACCTAACTTCTAAGTTCACCACACGATTTGTTCAAAATAATCATTATATAATAAAGTCCTGTTACACATTATATGCACTGTATCTGAGACACGTCACTTAGAATCTTCAATCCAAACGTGAAAGAGTTCTATAAGTTTTAAGTTTTCTTTTTCTCTATACATACTGCACTTGGCCTGTTCAACTTAAAACTTACATAGCTAGATTTATGAGGTTTTGGATGGAAGGAAGTATATAATAATTATTGATGGCCAATATCCTCAACATATTCTTTTAAAAAAGACTCAGCAATATACCTCACTTACATACAGTAATTTAATCATATTTTCAATTGAGATCAATCTCTAACTTTATCCAAATAACAGAAAAGGTACATGGTGAAGTGTCCAAAGATTATACCTGATGTGAGTTCTGATGGTTTAAGACCTTGATTGAATGTATAGTAATTGGTTTGATGAATTATATATATAACATTGGCAGGAACTACCGGAGTACCAACGAAGTGATGCTGTTAGTTCAATGGTATACGAAGCCAATGCAAGGGTGAGAGATCCCGTGTATGGATGTGTGGGAGCCATATCTTCTCTGCAGCAACAAGTTGATGTTTTACAAACCCAGTTGGCACTTGCACAAGCAGAGGTTGTGCACATGAAACTGAGCCAAGTTTCAACTTCCTCTGAACAACTCAAAGCAGTGCCTGCAACATCCAATTCATCCTCAGAGAACTTATCTCCATCAAGTAAACTTGCCAAAACCCTTTTTGCTATGGACATGGTCGTTGATCAGCCAAACATGGGAGTGTCTCTGTGGTCATGTTAG