Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_27821 LG7 39744674 39748025 hypothetical protein LR48
 Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 39744838 intron_variant
G/A 39744854 intron_variant
T/G 39744866 intron_variant
C/A 39744951 missense_variant p.Arg40Ser
T/A 39745148 synonymous_variant p.Arg105Arg
C/T 39745186 missense_variant p.Thr118Ile
C/A 39745201 missense_variant p.Pro123His
A/C 39745806 synonymous_variant p.Arg325Arg
A/C 39746222 intron_variant
A/G 39746366 missense_variant p.Asn445Asp
T/C 39746376 missense_variant p.Leu448Pro
T/A 39746387 missense_variant p.Cys452Ser
C/T 39746414 missense_variant p.Pro461Ser
C/G 39746567 intron_variant
C/A 39746667 intron_variant
G/A 39746788 intron_variant
T/G 39746806 intron_variant
A/T 39746871 intron_variant
C/T 39747066 intron_variant
G/A 39747278 splice_donor_variant&intron_variant
T/A 39747279 splice_donor_variant&intron_variant
G/T 39747322 intron_variant
T/G 39747493 intron_variant
C/T 39747508 intron_variant
C/T 39747613 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_27821.1
MAVHVGGIAVEDVRAASYDIIRYRKVVVGRYWCNEGRIGDAKALFAWSPFTLRLLTSEFVIANHHMLNQFGAYCDIAGREPKMVSCKPQYFVLALSFWWWITCIHVTSEKNSLKPGEKLNSTTLVQSENGYGLGFQTLDNCCYLIISGIGPKYEYWPSWIGNRNQPVDKDASLLLSHSGVLKIESKDIEPIILYSSPQPSENTVATLLDTGNFVLQQLHPNGTNTTLWQSFDYPTDNLFPGMKLGVNHKSGHKWSLVSWLTSEKPSLGAFELEWEPTERELTIKRRGKLCWASGNLGNGGFIHDTYYIIVSNENESYFSITTFNEEHTRWALLETGQLINRNGADNNVARADLCYGYNTDEGCQKWEEIPLCRHPGDVFDRREGYPNEDMITNLANSSYGLSDCRDMCWRNCTCAGFTNYDDNDGTGCVFYHWNFIKGKKMWIWITVVSVVAALLVICAIALVIKKRKRLLQDYDKGKVLDWKKRFNIIGGISQGLLYLHKYSRLKAWELWKEGAPLQLVDPSLSESFDLDEVKRCIQVGLLCVAQYANDRPTMFDVVSMLTNESSIVTLPQKPAFYLERGYFDKKMSSEDLNTNSMDEITASF*


CDS Sequence:
>Vu_27821.1
ATGGCGGTGCACGTAGGTGGTATCGCGGTCGAAGATGTTAGAGCCGCTTCCTACGATATCATCAGATATAGAAAAGTCGTCGTGGGGCGCTACTGGTGCAACGAGGGCCGGATCGGCGACGCTAAGGCTCTTTTTGCATGGTCGCCTTTCACGCTCCGGCTTCTCACGAGCGAGTTCGTCATTGCCAACCACCATATGTTGAACCAATTCGGTGCATATTGTGACATTGCCGGGCGAGAACCGAAGATGGTTAGTTGTAAACCTCAATATTTTGTGCTTGCTTTGAGCTTCTGGTGGTGGATCACTTGTATCCACGTTACCTCCGAAAAGAACAGTTTGAAGCCTGGAGAAAAACTGAATTCCACCACCCTGGTTCAATCTGAAAACGGTTATGGCCTTGGATTTCAAACACTTGACAACTGCTGTTATTTGATCATATCAGGTATAGGCCCCAAATATGAGTATTGGCCGTCTTGGATTGGTAATAGAAATCAACCTGTTGACAAGGATGCAAGTCTGTTGCTAAGCCATTCTGGTGTACTGAAAATAGAATCCAAAGATATTGAACCCATCATCCTTTACTCTTCACCACAACCTTCCGAAAACACTGTCGCCACCTTGTTGGACACGGGCAACTTTGTACTGCAACAACTTCACCCCAATGGAACAAACACAACGCTGTGGCAAAGTTTTGATTACCCTACTGATAATTTGTTCCCTGGGATGAAGTTAGGTGTCAATCACAAGAGTGGTCATAAATGGTCACTAGTTTCGTGGTTGACCTCTGAAAAACCAAGTCTTGGGGCATTTGAACTTGAATGGGAACCCACTGAAAGGGAATTGACCATCAAGCGAAGAGGAAAATTGTGTTGGGCAAGTGGGAATCTGGGAAACGGTGGATTCATACACGACACATATTACATTATTGTCTCAAATGAAAACGAAAGCTACTTCTCAATAACAACTTTCAATGAAGAGCATACAAGATGGGCGCTTTTAGAAACTGGGCAGCTGATAAATCGGAATGGAGCCGATAATAATGTTGCGAGGGCTGATTTGTGTTATGGCTACAACACAGATGAAGGGTGCCAAAAATGGGAGGAGATACCATTATGCAGGCATCCTGGTGATGTGTTTGACAGAAGGGAAGGGTACCCCAATGAAGACATGATAACCAATCTAGCAAATTCGAGTTATGGCCTAAGTGATTGTCGGGATATGTGCTGGAGAAACTGCACTTGTGCTGGATTCACAAATTATGATGATAATGATGGAACTGGTTGTGTATTCTATCACTGGAACTTCATCAAAGGTAAAAAAATGTGGATATGGATAACTGTTGTCTCAGTAGTAGCTGCTCTGTTAGTAATATGTGCAATTGCCCTTGTCATAAAGAAAAGAAAACGTCTGCTTCAAGATTATGACAAAGGCAAGGTTTTGGACTGGAAGAAGCGCTTCAATATAATAGGAGGAATCTCTCAAGGATTACTCTATCTTCATAAGTACTCAAGACTAAAAGCGTGGGAGTTATGGAAAGAAGGTGCACCTCTCCAATTAGTAGATCCATCATTGAGTGAGTCATTTGATCTTGATGAAGTGAAAAGATGCATTCAAGTGGGTCTCTTATGCGTAGCACAATATGCAAATGATCGACCAACAATGTTTGATGTTGTATCAATGTTAACAAATGAAAGTTCAATAGTTACCTTGCCTCAAAAACCTGCTTTTTATTTGGAAAGAGGTTACTTTGATAAGAAAATGTCTTCTGAAGATTTAAATACTAACTCTATGGATGAAATTACTGCTTCCTTCTGA


Promoter Sequence:
>Vu_27821::LG7:39742674-39744674(+)
TTTTCCATTCAGTCTTGCATTAATATCGTTCGGCCCATTTGCATTTAAATTCGCTACTGCTTTAACATCGATCGATATCTTTGTCAGAACCGTTCGGCCTGTGACCAGAGTAGATCGGTCTCTAACACGCTTGTTGTTAGAACCGTTCGGCCTTTTGAATTGGACCGTTCGGCCCTGTGAAGAGCACCGTTCGGTTAAATTTTTCTACAATAAAGATGTTTTTGCTACATCTTAATTTAGCAAAACGTTGGAAAGTTGTTTTTCTTGATTTTACTCCTTCATTAAGTGGTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAACTTTTTATTCTCAATATTTTTTTCTCATTTTGGTCCCGAATAAAAAAAATATTATTGTTTTAATGGCCATTGTTCATCTATTAAAAGTTTATACCTTACACAAACCCAAAATATTCTCTCATTTATTGACTTAACTAGTTTTTTAAATTGAACAGTTTTATATCATTTTTTTGTTTAATCTGTTCTAAATAAACCTTCATTTGTTACAATTTTTTAAAATGGTTTCTAGACAGAAAGTTATTTACAATTTCAAACTATGCTTTAGGAAAAAGAAGTATGAAAACAAATTTAAAAACTAAATGACAATAAATGTTGTACTTAGAGATGTCAAAACGGGTTACCCGGCTCGACCCGGCCCGGTCCACCAATTGTTGGTCACTTAGTGAGTCAATCCAACCTGGCTCACTTATTAACGAGCTGAAAAAATTCGAATCCAGCCCAACCCACTACGAGTTGGTGACTTAAACAGGTTGGCTCACTGACTCATTTAATTATAAGTTATTTTTATAATAAAAAAATTACAATTCTTTTTAATTCAAATCTAAATAAACCTCACAGTAAAATTATTTAAACTCCAAAGACAAATCAAAATAAAATAAAAAAGTATCATACAGTCCAAAAACATGTAGAAAAGGCGAACAAATAAGTTTTTAATATTGATAGTTTTTGTATCACTTGTCCATTTATAATATTAGAGTCTTAAATAGATAAATCTATAATATTTTTCTCTCTTGAAATATCTTATTCTTTATCACCATAAAAAAATGCTAATTAATAATATTGAAACACAAAAATAATAAATAATTAAATTAAATTAAGTGGGTTCGTGAGCTAACCCGACTCACCACGAGTTCAATCCAGTGAGCCGAGTTGAAAACTAGTCCGCATAAAAAAATTATATTTTTTTTAAATCAAATACAACTCAAACCCGCAGTGAACGGAGTTGGCTCGTGAGTTCGAACCTATTTTGACCGCACTAGTTGTACTGATTAGATTTAAAAATAAAAATGGAATTATCGGTACATCCAATCCAATCCAATTTTAAATGTTTTTTTCTTGAACTGAATGGGTTAGATTAGATCAAACTTCATGAAAATAATGGATATAAATTACTTTTAAGCTTTATTTTTTATTTTTTTGTCTCTTGGTTATTAACAGTTAGTTTCTTGTCCTTAATACTAAAAGATATACCTAAAGTACTAAACGACTTCTAAATTATATGGAAAGATTTCACAATTGATAGAAGATGAAGAAAAAGGGAGAGAAAAATGATGAAGATTGGATAATGTTTAGAATGAGAGAGTTTCCATATACTTTATTAAGGATTACTTAATGATGTTTGTTTTATTGTGCTCCTTCTTTAAGTTTTGAAACATTTATTACCTGACTCTCCATCTATAGTATGCCGTTTGTAAATATTTTACACAGTCACTTTATTTATTTAATTTTAATAAGATCTAAACGTAATTTTAAGAGACTCTTCTTCCTATACAAAGTTTATTTTCATCTTCCGATCCACCTGTACAACTCCTTCCTCCTACACAACGTCATAGTCCCTGGCGGAGGTTGACATTGGTGAGGGTGCTGATATTGGTGACAGTGCGCATGAGGATGCAGATCTCGTGCTCA


Gene Sequence:
>Vu_27821(+)
ATGGCGGTGCACGTAGGTGGTATCGCGGTCGAAGATGTTAGAGCCGCTTCCTACGATATCATCAGATATAGAAGTAACAAAAAAAACCTAATCCGTTCCGAACCGTTTGATCAAGCCGACAAATCTGAATTTGTTCCCAGCGAATTAGGCAACTGACAAAAAGTCGAAGCATTCGTTCGCGCATGTTCTTCCTCTTTGGACATGAGAGATAACCTGTTCCATTGTTGTCAGAAGTCGTCGTGGGGCGCTACTGGTGCAACGAGGGCCGGATCGGCGACGCTAAGGCTCTTTTTGCATGGTCGCCTTTCACGCTCCGGCTTCTCACGAGCGAGTTCGTCATTGCCAACCACCATATGTTGAACCAATTCGGTGCATATTGTGACATTGCCGGGCGAGAACCGAAGATGGTTAGTTGTAAACCTCAATATTTTGTGCTTGCTTTGAGCTTCTGGTGGTGGATCACTTGTATCCACGTTACCTCCGAAAAGAACAGTTTGAAGCCTGGAGAAAAACTGAATTCCACCACCCTGGTTCAATCTGAAAACGGTTATGGCCTTGGATTTCAAACACTTGACAACTGCTGTTATTTGATCATATCAGGTATAGGCCCCAAATATGAGTATTGGCCGTCTTGGATTGGTAATAGAAATCAACCTGTTGACAAGGATGCAAGTCTGTTGCTAAGCCATTCTGGTGTACTGAAAATAGAATCCAAAGATATTGAACCCATCATCCTTTACTCTTCACCACAACCTTCCGAAAACACTGTCGCCACCTTGTTGGACACGGGCAACTTTGTACTGCAACAACTTCACCCCAATGGAACAAACACAACGCTGTGGCAAAGTTTTGATTACCCTACTGATAATTTGTTCCCTGGGATGAAGTTAGGTGTCAATCACAAGAGTGGTCATAAATGGTCACTAGTTTCGTGGTTGACCTCTGAAAAACCAAGTCTTGGGGCATTTGAACTTGAATGGGAACCCACTGAAAGGGAATTGACCATCAAGCGAAGAGGAAAATTGTGTTGGGCAAGTGGGAATCTGGGAAACGGTGGATTCATACACGACACATATTACATTATTGTCTCAAATGAAAACGAAAGCTACTTCTCAATAACAACTTTCAATGAAGAGCATACAAGATGGGCGCTTTTAGAAACTGGGCAGCTGATAAATCGGAATGGAGCCGATAATAATGTTGCGAGGGCTGATTTGTGTTATGGCTACAACACAGATGAAGGGTGCCAAAAATGGGAGGAGATACCATTATGCAGGCATCCTGGTGATGTGTTTGACAGAAGGGAAGGGTACCCCAATGAAGACATGATAACCAATCTAGCAAATTCGAGTTATGGCCTAAGTGATTGTCGGGATATGTGCTGGAGAAACTGCACTTGTGCTGGATTCACAAATTATGATGATAATGATGGAACTGGTTGTGTATTCTATCACTGGAACTTCATCAAAGGTACTAATTTTGCTAGTGGGGGCTCTACATTTTACTTACTTGTAAACAGAAACCATCACAAAGGTATGCTTACCATATACAGTTTCACAACTTCTTAGTACTTCCCTTTTAACTTAGTTTATAAATTTTACTTAGCACAAAAAGTAACTAATATTTAACTTTAGTCACTTGTGTTTGTAAATGTTGAATGCTGCATGCAGGTAAAAAAATGTGGATATGGATAACTGTTGTCTCAGTAGTAGCTGCTCTGTTAGTAATATGTGCAATTGCCCTTGTCATAAAGAAAAGAAAACGTCTGCTTCAAGGTTAGTTATATATATGAAATAAACATGGTTCTAGATGCTTTATAACTTAATTTCTTTATTTGATCTCAATCTTAATCATTCATATTTCAATCTAAACAGAGAAAAAAAGAAAAGGGGTCGCTGAGAATAACATGGCAGATTTAGCAGCACCAAATAGATTCTTTGATGTCAAAGCCTCGGACGATGAATTCAAGATGATACAAAATCTAAACGTGTTTCACTATACATTAGTATTGTCGGCAACAGACGACTTTTCTTCTGAAAACAAATTAGGAGAAGGAGGATTTGGACCTGTTTATAAGGTGATATGAGACCAAGTATTGATTTTTGTGTTATTAAGAAGTTTCTTTATTAAAGTTCTAATAATCTTTTTGTTGGCATTTTAGGGAATCCTTCCTTCTGGTCAAGAAGTTGCCATAAAAAGACTTTCAAAAACATCAGGACAAGGAATTGTAGAATTCAAAAATGAACTGGTGCTTATATGTGAACTTCAGCACATGAATCTTGTACAACTACTTGGATATTGTATTTATGAAGAGGAAAGGATTCTAATTTATGAGTTCATGTCAAACAAAAGCTTGGACTGCTATTTATTTGGTGAGAATTATTTCTTAACTCAATTTTGCAATATGTTTCATGCTCTGTATAACTTAAGAAAGTCCTTTTGCTTTTTACCTTTATCTGTAGTATATATTTTCAGAATATTTATGTTTCCTTTCTTTGTGAAGATTATGACAAAGGCAAGGTTTTGGACTGGAAGAAGCGCTTCAATATAATAGGAGGAATCTCTCAAGGATTACTCTATCTTCATAAGTACTCAAGACTAAAAGTAATTCATAGAGACTTGAAAGCTAGTAACATACTTCTTGATGAGAATATGAATCCAAAAATTTCTGATTTTGGATTGGCAAGAATGTTTACACAGGAAGAATCCATGAAAAATACTAGTAGGATTATTGGAACCTAGTAAGCTTTCAAAACTATTTCTTTCCAACATAAGAATATGTAAATTAAGCTTGTTTTTGTCATATTATGAATAAATTTTTCTTGTAGTGGTTACATGTCCCCTGAATATGCCATGGAAGGAATTTTTTCTACAAAATCTGACGTTTACAGCTTTGGAGTGTTGCTGCTTGAAATTGTTAGTGGGAGAAGAAACACTAGCTTATATGATGTTGATCTCCCTCTTAATCTTCTAGGACATGTATGTGAAATTACGGTAAAAGAGTTCCTTTTTCTTAATATTATTCCTCTTTGTCTAATTTATCTAAAATTGATAGGCGTGGGAGTTATGGAAAGAAGGTGCACCTCTCCAATTAGTAGATCCATCATTGAGTGAGTCATTTGATCTTGATGAAGTGAAAAGATGCATTCAAGTGGGTCTCTTATGCGTAGCACAATATGCAAATGATCGACCAACAATGTTTGATGTTGTATCAATGTTAACAAATGAAAGTTCAATAGTTACCTTGCCTCAAAAACCTGCTTTTTATTTGGAAAGAGGTTACTTTGATAAGAAAATGTCTTCTGAAGATTTAAATACTAACTCTATGGATGAAATTACTGCTTCCTTCTGA