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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_27781 LG7 38433650 38436899 PREDICTED: adenylyl-sulfate kinase 3-like isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09102 Energy metabolism   C 00920 Sulfur metabolism [PATH:ko00920]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 38434390 upstream_gene_variant
T/C 38434393 upstream_gene_variant
T/C 38434577 upstream_gene_variant
G/T 38434581 upstream_gene_variant
C/T 38436291 upstream_gene_variant
C/T 38436295 upstream_gene_variant
T/G 38436722 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_27781.1
MSVVQALYPPCSCGMLQIVKCGHSATEKLGFTILSGIEAIGLSRHRKSLLKPILAKEDNGASRIEDGHQVKKQNGLTPLANHSAALFGKNLGEKSGIGNSMNILWHECPIQKLDREHLLQQKGCVIWLTGLSGSGKSTLACFLSRSLHSRGKLTYILDGDNIRHGLNRDLSFRAEDRSENIRRIGEVAKLLADAGLICIASLISPYRKDRDACRALLPEGNFIEVFIDVPLEVCEARDPKGLYKLARAGKIKGFTGIDDPYEPPYSCEVLMYVTQSEAQKSAHSSSKEIIVCF*


CDS Sequence:
>Vu_27781.1
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Promoter Sequence:
>Vu_27781::LG7:38431650-38433650(+)
AGAGCGATACTCATGGAGCATATCAAAACTCGTCGCTCCCTTGTTGCGACAGTCACCACTACTATGCATGAAACAGAACAAAGGTCACTGATGGAAATTCTCCAACAAGACATTACTCATTGTCACACAACACATATAGAAGATGCAATGGATTCCACCTACTATCGTATTCAAAGCCTTGAGAAAGAATTAAGGGATATGAAGAACCATATTCAACATCATCATCAATTCATGAATAGGAATAAGAACAATAATGTGTTGAACCAAGAACGTTCAATGAGTTTTCATTTTGAACCACCAGAGGATAGTAAAATACGAAGGGGAGGAAGAGGGTCCATTTCGTCATCAAGTTTTTTTCTTGATAATATTATAACGAAGAAACCTAACGAGGTGGAGATGTTCCCTACAGGCAAAACCTCATCAAACAAGAGAAAGTCTTTTCGCTACAAATTCATAAGTAGTTTCATGAATGTATTCGGATGTCGAAATCAACAACAAACTAAAAGGAGTTAGAAAATTAGTTATTGTGTTATTACATTCTCATTTGAGAAATTAATTTACTTATGAATGTGGAGGTAATCGGTAATCATGACTCAGTATAATGTTACATATGACCAGTGGATATTCTGTTATATATATATTTTTGTTGCTTCGTAAATATACATTGTTTTTACTATTGATTTCATTTTTTTTAATCTGTTATGATGATTAGTAGTCAAAGTCTTTTATCGTTACCAATCATATTAAAATAAACAGATTTTAAACATAATTCTATATTATAAAATTGTTTTATACACGGTTTATAACTAGTTGCATGACTTTTTTTCTAACCATTGTAGGATTTTCAACGTATATTGTAAAACTTAAAAAAAATGAAAAACATTTATTGTAAATTAAACATTTAATTTTTCTTCAAATTATTTGGAAAAGATATTAATCTAATGATAATGCAACTATTATTTTAATAACAGAAAAAAAGTCCACTACCCTTAAATTCCAAAATTTCTTTAAAAAAATCAATGGAGGTTGCGCTGACAAGGAATAAGATGAAGCACCGAAGCAGTGACCCACATTAGCAGTGCACACTGTCTCCACTTAAATCATAACTATTGATTTAACACAATCACTGGTGCTAAGTTTGATATCAATCATTATTTCCTTAAAGATAAAAGGATATACCATTGGTTTGGCCACATCAGAATCCATACCAAACGAGTAATGACAAATCATAATATTCTCAGTTTTATCACAATCACAACTCTCTAATTGGTAGTAGTATTAAAGAAAAAACAATAATTGAGAGCAAGTAGTTACCATACAGGTTACGAAAGTTCTTTTGAGAAAAAACAAAGAAATACATATATATTTTATAATTTCAATAAAATATGTATATATATTTTTATTTCTGCACCCAATAAATACATATAAATTAATTAAATATCAATTACAATGATATAAATAAAAAGTAATAATCAATACTGTCTTAAAAAACTTTAAAAATAACAATGAAATAATTTTTTTTTTTTAAAAATACAATACCTAGAGTGGGATTTTTAATGTGTTTAGGCAACAATTGGACACAAAAGTTGAACATCATTATTAAGACCAACGACAAATGCTTGGGTTGTGACTACTGACGTGGCAGCACACATTACTTTTGAATATCCAATGCACCATACGTAGTTCGCTCCCGCCACCACCACATGATGTGTCTTCGCTTTAGCTTCTGCTTCAGTTGTCTGAAACCACGACACTCACTGGCATAAATTTTGTAGGCTATATAAATTTCACTGCTCCAGCAAATTTCTTCTACCAACTGCATACATCACATTTCACAGGGAAATCTACCTTCGCAAGGTACTTCCAGTTTCTTAAAGATCTATAAGAGCCAGGAAACTTGTGTATATGTTATTTGATTTCATCACTTGTAGTGTATTCTATGTTTTCGGCTCTAGCTTTAACGCAATCTTCATTTTAATTTTTTTTTCTGTTGGTGGAGA


Gene Sequence:
>Vu_27781(+)
ATGAGCGTTGTACAAGCACTGTACCCGCCGTGTAGTTGCGGAATGTTGCAGATCGTCAAATGCGGACATTCGGCGACGGAGAAGTTAGGGTTCACAATATTGTCTGGAATCGAAGCCATTGGATTAAGCCGTCATCGTAAAAGTTTGTTGAAGCCTATTCTGGCAAAGGAAGATAATGGTGCGTCTCGGATCGAGGACGGACATCAAGTGAAGAAGCAGAATGGCCTGACACCTTTGGCCAATCACTCTGCTGCATTATTCGGTACTATCTATATTTTCAGATTCTATCAAGATCTTGAATCTGGTTTTTTTAATGCTCTATTTGTTTATTACATTATTCTTGTTATTTTCTGTTGTTTGTCAATGTAATATGAGATTACGTTTTTAATCATTATTCATAGATGACAGTGGATTGATCTTGGAATGTAAATGTTGATAGTTTTATATTCAATAAAAATTGACAAATTGATGTTCTTGAACTTGCTATATTGTAAATTAATGATGAACTGTCGTCACTGTGCAAAATGGCCATATCATCATTTGTTGAACGTTATATACTATTCATTGATTTGTTGTCCTTTCTCTAACACATAAAAGTCTTCAGTAAAAATTTATCCATCCACTCGATAATGCTTTAAAGGCTAACATGGCACGAATTAAATGATCAGGTGTGATAAAGTTTGGGTAGAAGATGATCTGGTTTGTAATGTAAGAGAATATTTTCACGATATTGGTGTTGTGTGTAAGTCTCTCTTGGGCTAAACGGCCAATTTAAAATCTGGGCACAAGTTCACCAATATTTTTTAGTTGTAAAACATAAAGAGAGTAAGTGGTTCTTGGAAGATGGAGAACAAAAAATTTAGAGTGATTGATTTGTCAGGGAGATCTGATCCTTGGTGAAACATGTGCATAGATCAGGGAAAAAATTAAGGTTACGAAGGTCGTTGTCCAAGTAAACATAATTTCGTTGAGAGAAAAAAAGAGTGTTTCTGTGCACTGCTCATTTTTGAAACCGGAAATCTCATGGACTTCACCAAATAGCTGTTTGGGCTTTATAAATGCTGTTTACCAGGCTTTGACAACATTTTTGTAAGAAAAAAACTGAACTTTTTAATATCTACTACTAGTTCTAAGCAAAGCAATACATGGTTACGATTAAAAAATAATAATTGAAATATTTAACCTGTTTATTATCTATCTAGGTAAAAATCTCGGCGAGAAGTCAGGTATTGGGAATTCGATGAACATTTTGTGGCACGAATGTCCTATTCAGAAACTTGATAGAGAGCATCTTCTTCAGCAAAAGGGCTGCGTCATTTGGTTAACGGGTCTCAGTGGTTCAGGTTTGTGATCGTTTCTGAATCCTCGCTTTAGTTTATTGTTGTTAAGCTGAAGTAAGCACACAATTGTGAGTAATCGAGTCCTATCCTCCTTTTATCATTCTTAAATGCATCCTAGATTCCAATGTGTTCTGATTGCTCGTATTTGATTTTATTTTTTATACGACGTTCATTATTTCCATAGACATGCAAAGGCAGAAACATTAAACATTTATTTTTACATACGTAACATTCTCTGCCACTTCCTATGGTACAATCTGAACTTCTATTAAAGTACAGTTGATCACTTGGACTCATAAGAATGAAATAATGAAGAGAAGCCTGTCAATTCTAATTATTTCTTCGCATATGAATGCTTTAAATAACAGTAAGGTCTTTTATGAATCAAAGTTTAACGTTACTTTCCAATTATAATTGTCTCTCTGCTGTAGAATATACACTGATAGTGAACCAAGAAAATGAAAGCAATTGTCTTTAGTTTCTTTACATTATAAGGATATTCCCTTACCTTTCATTCTTCAATTCTAGACACTGGATACCGGCACTCTCACTCTCTCTGCTTAATTTGACTCTTAAGAGACATTGATTTCAGGAAAAAGCACTCTGGCATGTTTTTTGAGTAGAAGCTTGCACTCCAGAGGAAAGTTGACTTATATCCTTGATGGGGACAATATTAGACATGGTCTAAACCGTGATCTTAGTTTTAGAGCAGAAGATCGTTCAGAGAACATACGAAGGATTGGTTAGTTACTGCATAAGAACATATATACATACACACAAAAGTTCTTCTCTCCATCTTGAACTTTGCTGTAAATATGTTATTTATTAGTATTAAAACAAAATGACAAATAAATTTCAGGTGAGGTTGCGAAACTCTTGGCAGATGCAGGTCTTATTTGTATCGCTAGTTTAATATCACCCTACCGAAAGGATAGGGATGCTTGTCGAGCTTTATTGCCAGAGGGAAATTTTATCGAGGTACTTATTGCGGAGAGTTATGCTACTTGTTTCACATTTGCTAAGTGCTAACAATGATGAACACTGTGAATCTGTGATCATCAAACAAGACAGTAGGTTCATTATTTCCTTTGCAAAGTTTACAATTCTCATTACACATGTTGCAGGTTTTCATAGACGTGCCACTAGAGGTGTGTGAAGCAAGGGATCCGAAGGGACTTTACAAGCTTGCTCGAGCTGGAAAGATCAAAGGTATCTTGGTTTAATATTTTAATAGGTATCTTCTTGGACTATTGGTTATGTGTAATAGTCATGTTTGTACTGGTGTTTGTTATTTAACTATACCAGCTTAACCAGGTTATCTGCTATGATTGGCCTTATTTCTATTTTTGTTCCTGATCAAATTGTATTAGTCTTGAGTTATTATTTCCGAAAATTTTCAGGTTTCACGGGGATAGACGATCCGTATGAACCACCTTACAGCTGTGAGGTGGGTATTTATTGCTTAACTTGTGTTGCACTAGCGTTACATTAGCACAGTGGTTGGTGTTGTGAAATAAGAACAATACGAATAAATTTAGCATGCTAAATTTACTTAGTTATAAAACTTTATCCAACTTTGATGGAAAATTGACATTAATGAGATGTCAGAATAAATTTGTCCCTGCTTTCCCTCTGAAACTTAAGCAGAACTTTCATCAAATTGACTACACTTTCTCGTTTTCTTGCAGATAGTATTACAACAAAAAGGAAGTGAATGTACGTCTCTGAGTGATATGACAAAAATAGTAATATCGTACTTGGATAAAAATGGATACCTCCGAGCTTGACATAACCTGAATGGGGTTTGTCTTCTTCCCTGTTTCTTGTCGTAGGTATTAATGTATGTAACACAGTCTGAGGCACAAAAATCTGCTCATTCCAGCAGCAAGGAAATCATCGTTTGCTTCTGA

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