Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_27742 LG7 37651173 37653249 PREDICTED: transcription factor bHLH137-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 37651896 intron_variant
G/A 37651972 synonymous_variant p.Thr174Thr
C/A 37651979 synonymous_variant p.Arg177Arg
A/T 37651990 synonymous_variant p.Pro180Pro

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_27742.1
MAAFSSQSYHPFLLHSTNTQQPLINTPTTHSFHKEKTSLNTLTNQESTSSDIEPSVIKNHSPQTSMVEDKLEIGEQVTQNLTSMQKKRTQKNGPSLTSPLSMDSAEGASKKQKKSNGGDQGENKPKEVKKDQKKGPEDPPTGYIHVRARRGQATDSHSLAERVRREKISERMKTLQRLVPGCDKVTGKALVLDEIINYVQSLQNQVEFLSMKLASVNPMFFDLAMDLDTLTVRPDQKLNNAASPSLLPCVEQCRPNQAIAFADTTTLTTTTSSFPTANNDDFLLDYSSSSFLQPHRPNVFFEVGKFKTRIGISVKKKYSDA*


CDS Sequence:
>Vu_27742.1
ATGGCAGCTTTTTCATCCCAATCCTACCATCCCTTTCTACTTCACTCCACAAACACCCAACAACCCCTTATAAACACTCCTACCACCCATTCTTTTCACAAGGAAAAAACGTCTCTTAATACTCTCACTAATCAAGAATCTACCAGCAGTGACATTGAGCCTTCTGTCATAAAAAACCACAGTCCTCAGACATCCATGGTTGAAGATAAACTTGAAATAGGTGAACAAGTTACTCAAAACCTCACCTCTATGCAGAAGAAGAGAACACAAAAAAATGGACCTTCCTTAACCAGCCCCTTATCGATGGATTCGGCAGAAGGGGCAAGCAAGAAACAGAAGAAAAGCAATGGTGGTGATCAAGGAGAAAACAAGCCAAAAGAAGTGAAGAAGGATCAAAAGAAGGGTCCAGAAGATCCTCCAACGGGGTATATCCACGTTAGAGCAAGAAGGGGTCAAGCAACGGATAGCCACAGCCTTGCCGAAAGGGTGAGAAGAGAGAAAATAAGTGAAAGGATGAAGACGTTGCAGCGACTTGTGCCAGGCTGTGATAAGGTAACCGGAAAGGCCCTTGTGTTGGACGAAATAATCAATTATGTTCAGTCCTTACAGAATCAAGTGGAGTTCTTGTCAATGAAACTTGCTTCTGTGAATCCCATGTTCTTTGACTTGGCAATGGACTTAGACACGCTCACGGTTAGGCCTGATCAGAAGTTAAATAATGCAGCATCCCCATCACTACTACCATGTGTGGAACAATGCAGACCAAACCAGGCCATTGCTTTTGCTGACACGACCACCCTGACCACCACTACCAGCAGCTTCCCCACCGCTAATAATGATGACTTTCTTTTGGATTATTCATCTTCATCTTTTCTTCAACCCCACAGGCCAAATGTCTTCTTCGAGGTTGGCAAATTCAAAACACGTATCGGTATCTCAGTGAAAAAGAAATATTCTGATGCATGA


Promoter Sequence:
>Vu_27742::LG7:37649173-37651173(+)
ATAATTTTCAAATTCTTCACATCCATATCAGTTTTATAACCTTTATATATTGCTTCGCGCGGACGAAGCTTGTGACCCTTTTTAGACCTTAGGTGTCTTCTGTATCTTTCATTCACTTATTAAAAAATATTAAAAAAATGTATCAGAAAATATAACTTTAAAGTTATTATTACACAATATATCAAAATTAAATAAAAAGCCTTTATATTAATAATATGTTAGGGTTAAACTTTTATTATATTATACATCATATATGCCAGCATATAATTAATGCTATGTTTTCAAGCTTGGTATAGAAAAATAAATATTCCACTTTTTACATTAATTGTTCTGTTTTTACGTTTATGTTCAATTTATCTAATTAAATAAGTCCAACCATATGTTTTCACAAATTTCTCTCCAAATTCTTTCGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAGTTAAAATAACCTATAGACAAGTATCAACTCAACAATGAAAAATACTTGTATGAATACAAGAGATACGGGCATTTCAATCACTTTCCTTTTTTTTTTAAAAAAAAAGTAACATATTATATATATATATATATATATATATATTATATATATATATATATTATATATATATATTATTTAATTTGTTGACATGTTATATATGATTGTGACTTTCAGTACTTTTTTTTATTAATTTCTTCCATGGATCGCTTTTAATTACGACCCTACACATTCCTGTTTGTTTACACGAGTTTTTTCCATAACAATCCAAACACATCTCAACCATACATACTTCATTGGAAAGTCTAAAATTTTGGTTCCTTTCTCAAACACTTTAATGTCATTCTATACTTAACACTGTCACTAATCGTTAATTTCTATTTAGGGTTATGTTTACCAAATTAATATTTAATTCGTTGCTTAGAATGAATCTGTTCAGAAAACATTTAAAGAAAAGAAAGAAATATTAATGATGGGAATAATTCAAGGCAAACTTCTTGTGTTCAATTAAATTAATTATTCACAATTCTGATAATAAATTAAGCAATTATTATTTCAGGTACATGAAAAAGGTAGATTATTAATTAATAAATACATGAGAGTTGGGAGAGAAATTTAAGTTTTGTAATGTGATGAAACTCTATATATATAAAAGATGGAAAGCTAAGCAAACATCTGGGAAGTACCTCATTTGCTAGGTACTCCTTTATTTCGTAGTACTGTTCTAGTAGCTGAATTTTCCTGTAAATAAACCCCCTAATTTTTTGGGCAAGGACACTTTACAAGAAAAAGTACTGCACAATCTATTTATGTGTGTGTGTTTTAAATATAAATATATATTATTTTTTTGCCAAAGAACTTTCTGTGCACTTTATTGCCAAATATCAGTGTAACTACTGTCTCTAATAAGGTATTAGTAAGTCAAACAAAAGTCATACATCAACTAAACAAAAAGAACTATTTAATCTTTTGACAAATGTTAACAATTTGAGACTTCATATATATAATAGTTAAAGAAAATGAGAGTAACGAAAAAGTTAAAAACATTAAAACTATTTATTATCTATTCTAAAATAAAAGATTGAAATTTTATTTATGGGGTTGTTATTTATTATCTGAAAAATAAAAATTTAGTCAAGGGTAGAAAATGTTTTGCTAGAAAAAGGAATGAATAGTAATTACTATTGTGGTTCATTTATTGTTGACAATCACGTTAGAGAAAAAGTTAGAGTTGATGACAGTATTATAAAAAAATAAAAATAGATTGAGTTGATAAGATTAGACCAGTCAAATGTACTGTCTCTGCATGAGAATGAGTTACTGCATAAAAAGATTTCAGCATTTTATGTGGCAAAGATCTTTTATATATAGGCCTGGCTTCTGAGTTTTGCACAGACCAACTTTTGCTGAGTCCAAACTACTGATACACCTGCATTCTGCAAACCTTTGAGTATCACACTTGCTTTTCTTCTTCCATCACTTTCCTCACCACTACTCTTCTTTCATTTTCCAACCCAAACCTTTCATCAAA


Gene Sequence:
>Vu_27742(+)
ATGGCAGCTTTTTCATCCCAATCCTACCATCCCTTTCTACTTCACTCCACAAACACCCAACAACCCCTTATAAACACTCCTACCACCCATTCTTTTCACAAGGAAAAAACGTCTCTTAATACTCTCACTAATCAAGAATCTACCAGCAGTGACATTGAGCCTTCTGTCATAAAAAACCACAGTCCTCAGACATCCATGGTTGAAGATAAACTTGAAATAGGTGAACAAGTTACTCAAAACCTCACCTCTATGCAGAAGAAGAGAACACAAAAAAATGGACCTTCCTTAACCAGCCCCTTATCGATGGTATACTTTTTAAACCATTTTTTGTGTTTTCCTTTTCTTCAAACACATCTTCATAGTCTTTCTAATTGAACTATTTTATTAATATGATTAACTGGTGCTTAATTACTATGTAAATTGTTACAGGATTCGGCAGAAGGGGCAAGCAAGAAACAGAAGAAAAGCAATGGTGGTGATCAAGGAGAAAACAAGCCAAAAGAAGTGAAGAAGGATCAAAAGAAGGGTCCAGAAGATCCTCCAACGGGGTATATCCACGTTAGAGCAAGAAGGGGTCAAGCAACGGATAGCCACAGCCTTGCCGAAAGGGTACAATTACATCACTCTTAACAACTATGAACCAGTGTGTCTGTGTATGTTTCAATATTAGGTGACCAGTTGAACATGTACCACAATTCCTTAAAAAAAAAAACATGTCTCATTTTGAATGTTGCAAAAGTAAATAATAAAATGGATTATTTCAGGTGAGAAGAGAGAAAATAAGTGAAAGGATGAAGACGTTGCAGCGACTTGTGCCAGGCTGTGATAAGGTTTTGAATTGCATTCATATATATATGTATCTTCCTTGAAGCATTTGCTTGTTTCTGTCAACCCTTCTTGACAGCTACGTTTGATTTGCTTCATAAATATTATTAGGTAACCGGAAAGGCCCTTGTGTTGGACGAAATAATCAATTATGTTCAGTCCTTACAGAATCAAGTGGAGGTATATGAAGTTTCTTTTTCTTTCTTTTTTGAAACATTGTTCGTTACTTATATAATGTCTAAACCAACGATTTAGCTTTGTAACTCTGAATTTTTCTGCAGTTCTTGTCAATGAAACTTGCTTCTGTGAATCCCATGTTCTTTGACTTGGCAATGGACTTAGACACGCTCACGGTTAGGCCTGATCAGGTGAGAAAAATAGAAAATTAAGATTGTTTTTTTTTTTGTGGTAAAATGATAGATTATAGTTGTTGGTGGTGGTGTCTGAAATATGAGTAATGATGAAAGTTTGTCCCACTGAATTTCAGAAGTTAAATAATGCAGCATCCCCATCACTACTACCATGTGTGGAACAATGCAGACCAAACCAGGCCATTGCTTTTGCTGACACGACCACCCTGACCACCACTACCAGCAGCTTCCCCACCGCTAATAATGATGACTTTCTTTTGGATTATTCATCTTCATCTTTTCTTCAACCCCACAGGCCAAATGTCTTCTTCGAGGTATGCTAGATCATTCAAACCACTTCTTTATCAATTCAAATTTTGGTTGTTTTCTTTAAAGCGACTTTTTTTTTTATAATTTTGATAAAAGCTTTTACTATAATTTTTAAGTGTGAATATATATAAAAGTTCGATTTTTTCTGTCTTGTCTTTTACTTTTTCTCATCCAGAAAAACATACTAGCATCAGATAATTACAAGATTATAAAAATGGGAAATAATAAATAATTGAGAGAAGGGGTTTTTCTTTTTTCCTGTATTCTGACAAAAACATAATTTTCAGTATAACGGTGGTCAGATTTGGGAAGTAGACCAGCGACAAAAGTTTCTTCAACCATATGGATTCGCCAATAATACTGGCTCTTTCAATTAATATCAATGTTTCACATATGGTAAGTTTTCAATAACTTTATGACTATATATAATTCTATTATCATGAACATGGTCTTCTTAAATTCTACCCTTTTATTTTAATCATTTTTAAGAAACTGTTGTTTGTTGCTGGCAGGTTGGCAAATTCAAAACACGTATCGGTATCTCAGTGAAAAAGAAATATTCTGATGCATGA