Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_27734 LG7 37567662 37570606 PREDICTED: transcription factor ICE1-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 37567810 downstream_gene_variant
A/T 37567815 downstream_gene_variant
A/G 37568371 downstream_gene_variant
C/A 37568396 downstream_gene_variant
A/G 37568478 downstream_gene_variant
A/G 37568552 downstream_gene_variant
C/A 37568859 downstream_gene_variant
A/G 37569443 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_27734.1
MMSGWMQETEEQNSASWSNPNANELSCFYKPISDIHEDWHVPNSTTQIHSHVTDTAFSTNFAHNMLLHQHQPLHAFSSSTSLDLSQGHNFFTPKPFFYPLDHAFRAGSDVGFLDPHALNKVHHGGVFSSSNDNNQFALPNLATLCAMPPQQDGVGFPGFKNIVDSDHVEGSRKALLLSTSNVLKPLESFPPSGVQPTLFQKRAALRKSMEDNCKGKSKGNGDSSKRKTCNNGEDEGSGLNLDSDESGEMEESGRNGGNSSNANSTVTGGVDQKGKKKTGIPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPNISKMDRASILGDAVEYLKELLQRIGDLHNELESTTPAGSSLTSSFLHPLTPKLPTSMQEELSLSSLPSPNGQPVRVDVGLSEGGVKIQMCCERKPGLLLCTMRALDNLGIDIHQAVITYFNGFAMDILRAQICSERQDVHPEQIKAVLLDSAGYHGMI*


CDS Sequence:
>Vu_27734.1
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Promoter Sequence:
>Vu_27734::LG7:37570606-37572606(-)
GTAAGATAAACCAAATATCTATAAATTGTTTTAAGATTTTAAGTTGAATATAATATTATATTTTTTTATACGAGCATGTTGACGTTTACGTTTTATTTGTTTCGTATATCTCCCTTCAAAAAAGTTTAGATTTGTATACCTGACTAGGAAAATAAAAATAATTGGTAATTCATATTTTTAAACATGTATTGTCTATTTCAATACCTTTGGAGTATACATTATATAATTTGAATGAGTAAATTAATTGATGATGCAGAGTTTGAAAAAGTATTTATAAATGACAAATTTGATTAGCTGTTAGAATTTGAAGAAACAAAATTGATGGTTTAGTCTGAACTAAAATTTGAAGAATTAATTTAAGAGTGTAGAAAATAAAATAAAAAAATTGGTTATAAATATTGTAATAAGAAAGAAGGTCCCACAATTAGGGGTGGCATACCCCAGAAGAGAAAGGGAAAGGGAAATTAAGAGGCATGTCCCATACTCACGAGGTTAGTAGAGAAACAATAAAGTAAGGAGTATCTTCCTTTTCCATACCTTCACTCACTCAAACTTATTTAAGATTCTTGTCCCTCTTTGCTTTCTATACCTTTTCAAATATCTTTTCATTTCATTTTTCTATTCATTGCATTCAATTCTCTCCCTCAATCACACATGCATGTTGCCTCCTAATACTTTCCCTTACATCCATTCTTCAACTACACTACTTTCACTTTCCAACCATACTCAAATAATATCAAATACTTCACCACAATTCTAATAAACTTTACATTCATTCTATCAAAAAACAAAATAATAGTTCTTTACATTAAATTCAGAATTCATTCGTTTCATTGCACCTACAAATATATTTAAGTTATTTTATTTTGAGAAAAATCTAGGATATAAAAACAAAAACCATTTGAGTTTCTTATAATATTAAAAATGAAAAAAATATATTTTCACTTAGATTTTTTTGTAACTTTCTTACACAAGTGTTATTATTTTCCTTATTTATTATTTATTTGTTATTTTGCTAACATATTTAATAAAAAAATGACATGTATATTATATTAAAATGTTATTAAATAAATTTATATTAACATATATTTTTTCACTGATTTATTATTTATTTGTTATTGTGCTGATATATTCTATATTTAATAAAAAAAATATGACATGTATAATATTAAATCAAAATATTATTAAAAAAATCTGTATTAACATATTATTTTTCGTTAAAAATTATGTTATGTATTCTATATCACTCTTAATAATAAAGAAACTTCAAAAATATACATTTTTATTCTTTTAACTTAATCGGATAGAAACTCACTTTAAGAAACAACCTTTTACGATGAAGTAACAATTTTTTTTGTAGAACATGAACCTTTTTAAGAAGAAGAAACTAAAACGGTTACTTTATCATTTAAGAAAAGCAATAATTCTTAAACAACTACATAAAGGAATTGGCAGTAAATTAACCTTAAAGACTATACACAGAAGTAGTTGATTTATTCGTGTTGAATAAATTTTGAATGAAGAAAAATAATTGAATGACATTGAAGTGGTTATACCTTATAGTAGATAAGGATATAATAGATAAAGGATAGGGTTGAATTAAAGACTTCACAAGACACATATGAATGTTCATATACATTACTTTCACCCATATATTCCATTTCCCTCTCTTTTCTACAATATTCCCTGTACTCACAATAATATATATAAAACAAACAAACAACAGTTTTTAAATTATATTAACAAATTTTCAATTTGAAAAGTTACGTACACTGGAATGTTTCTTCAATTTTAGTCTTCTTCCTCGGATTGCTTTCTGTTAAATACTAAACAAAGATGATGTTTTTTATATATTGTGTTTATTTAAGAAGAGAGACGATACACGTACACCGATATTGATGCCCTTTTCCTTCTGCAAAGTTCTCTTCTTCAATTCTTCTACGCCCATCCAAGCAAAACACAAGCCATCATTTGTCAAAAACAAAAGAAAACAACATCAA


Gene Sequence:
>Vu_27734(-)
ATGATGTCTGGTTGGATGCAAGAGACAGAAGAACAAAACTCTGCTTCATGGTCAAACCCAAACGCCAACGAGCTAAGCTGCTTCTACAAACCCATCTCCGACATCCATGAAGACTGGCACGTGCCCAACAGCACCACCCAGATTCACTCACATGTTACAGACACGGCTTTCTCCACCAACTTCGCTCATAACATGTTACTCCATCAACACCAACCATTACACGCTTTCTCTTCTTCCACCAGCCTTGACCTATCTCAAGGGCACAACTTCTTCACCCCCAAACCCTTCTTTTACCCGTTGGACCACGCCTTTCGAGCGGGTTCCGATGTGGGGTTTCTTGATCCTCATGCTTTGAACAAGGTTCATCATGGTGGTGTCTTCTCCAGCTCAAATGATAATAACCAGTTCGCCCTTCCAAATTTAGCAACCCTGTGTGCAATGCCTCCCCAACAAGACGGTGTTGGATTTCCCGGATTCAAGAATATCGTTGACTCTGATCATGTGGAGGGTTCAAGAAAGGCCTTGCTTCTGAGCACGTCCAACGTACTGAAACCCCTTGAATCGTTCCCTCCATCAGGTGTGCAACCAACACTTTTTCAGAAGCGAGCAGCACTAAGGAAAAGCATGGAAGATAACTGCAAAGGCAAGAGTAAAGGGAATGGCGATAGTAGCAAGAGGAAGACTTGTAATAATGGAGAGGATGAAGGGTCCGGGTTGAATCTTGATTCTGATGAGAGTGGTGAGATGGAAGAGAGTGGAAGGAACGGCGGAAACAGCTCGAATGCGAATAGCACCGTCACTGGCGGCGTGGATCAAAAGGGCAAGAAGAAGACAGGGATACCTGCGAAGAATTTGATGGCCGAACGCCGGCGAAGAAAGAAGCTCAATGACAGACTCTACATGCTGAGATCAGTTGTTCCCAATATCAGCAAAGTAAGACTTAATTTTCTTTAGCACCAAACTTGCTGCATTTATCCAATTACGTTCGGTTTTGTTTTTCATGTCAGACTTTTACTTCAATACAATCTTGTCTAATTAAAGATAGACACCATATGCAGAAACTTCAATTCCAAACATTGTAGCACAGCACTAGTTAAAAACACACAGAAAATAAGAAAAAAACATGTAAGTTTCATGATGATATGGAATGATTAAGCACCACTTCATTGATACTTTTTTCTTAGGAACTAGGGTTACTCAATCATGTTATAGGCTATACATGATTCATAATATCCACTAATAAATCAACAAATACATAACAAGTGATTGTGCAAGGTAGTGTTTATAGAAGAAGCTAATCAACATTTATCATGGTTCCATAGCTCTCTATGGTGGATATGATATGCATGGATTTGTTGAACTATTTGATAAGTTTGGTTTAAAACTAAGATGGACAGAGCTTCAATACTGGGGGATGCAGTAGAGTATTTGAAGGAACTTCTGCAAAGGATTGGTGACCTTCACAATGAATTGGAGTCAACAACACCAGCTGGTTCTTCATTGACTTCAAGCTTTCTTCATCCCTTGACGCCCAAATTACCAACAAGTATGCAAGAAGAACTTTCTCTCAGCTCATTGCCAAGCCCTAATGGCCAACCTGTGAGGGTAATGTATTGCTTGCCCTATTCTGGAACTTCTTCTTTTTTCCCATATATATGCTTCAACTCACATGCCTTTCTTAATTTCTGTTCCTATATTTGGGTATGAATATCATATATGTCACGACAAGAAAAAAAAAAATGAGAAGGTTAGCTCTTTCTTGTTCTTGGAAGTGCATGATTGCATGAAAAGGAGTATCTTTCTCATTTCCTTTTATATTCTTTAATCTAAAAACTAAACTAGAGAAAACGATGGAGTATATGTTTGTTTTAAGAGTTTAAATTCATCCCAAAAGTTGGAAATTTCCCAAACTTTATATATATATATATGAGTTTTAAAATGGAAATTCAAGGTAGAGTTCATTTTCAGAAAAGTAAGAACCTTGTTTATTGTTCTTTGTTGATTATTCGTGTCTTCAAAATATGTCTATTTTGATAGATTGATTTTTTTTAATATGTTTTAAAATATTAGTATTAATATATTTTGAAGTATTATACATTAGAAAAGGTCTGCAAAGATTCATCTTTACTAAAGTATCAGTTTTTAATTAGGAACGGAGAAAGTTGAATTTAGTAATGTTACTCTTAAGCCAAATTCATAAAAGCGAAGTTGTTTTAAGAATTTCTTTTCAGTTGTTAATGAGTAAAACCATTTAACATATTAAAAGTCAAAGTTTATTCCTTAATAAATAGATAGGGAAAATAATTAGCATTTGACATGATTGAGTTGATGAAAAGTAATAGAAAAGTTTTGGCGGGAAATATAGGTTGATGTTGGGTTGAGTGAAGGAGGTGTAAAGATTCAGATGTGTTGTGAGAGGAAACCTGGTCTCTTGCTGTGTACCATGAGGGCTCTCGACAACCTTGGCATAGACATCCACCAAGCTGTCATCACCTATTTCAATGGATTTGCCATGGATATTCTCCGAGCTCAGGTCAACCTTTTTCTATTCTTTAATCCTCATTATAAAATCAAACCATGTGCATCATTTCAAATGCACTCACTATTCATATCAAACTTTTTTTATACTGTTATCATAAATCATGCTTTATAGAATATTCTTATAAAATTCAACAAACAAGATGCACTAATTCTTCATATTTTATTTTATGTCTTCCCAGGAACATTCCTTGCTTTATAATTAAGGTTGAAAGTTGTATTGAGATGATATCTAGGAATAAAAAACCATGGCTATTATGAATTGATGAGTTTTTTATTATTATTATTATTCTGAGGTCTAATTTTTTTCTTCTCTCAATCAGATATGTAGCGAACGTCAAGATGTCCATCCAGAGCAAATAAAAGCAGTTCTATTAGATTCGGCTGGCTACCATGGCATGATCTAG