Genomic Resources - Ricebean Portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Gene Details:

Gene ID	Chr. No.	Start Position	End Position	Function	View on
Vu_27710	LG7	36486379	36487110	PREDICTED: transcriptional regulator SUPERMAN-like	Map

Annotations

category		relationship type		keyword

SNP	Position	Effect	Amino acid change
C/A	36486678	synonymous_variant	p.Pro100Pro
T/A	36486770	stop_gained	p.Leu131*

View accession wise SNPs

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_27710.1

MKRNNFMKDYTHTCANNNPSKDFTHVVNCYNNKQNQMAKDLWECSTNSHSNADQDYVNGFPWPPRSYTCSFCRKEFKSAQALGGHMNVHRRDRARLRQSPPAEGQAAHMFNLNLDPTTTNPNNSTSSWSSLPPSSSSATLKPVTCTLPLFVSPTPPSPSSDLKRWVLVDGILLNPLSTNTPEPAKSKIPESLSAGAGEYDHAFAREDGFTVLKKGEILRMDLEIGLPRTYDLDLELRLGTTYS*

CDS Sequence:
>Vu_27710.1

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Promoter Sequence:
>Vu_27710::LG7:36484379-36486379(+)

TAGAAACTATTTAACATACGTGAAATGAGTAATTATGAATCAATTTTCCAAATCAATGTCTCTACCCAAATTTTTATAACTCTTTGGTTAATATAAGTCTTTTCATTTTCTTTACCTATTAGTTCATCAATATCTCCACAATAACTTTAAAGAATGAGACTCTTAATTATCTATCACATTAATTGATCCAAATTCAATATAAATATAAAACATATTTAGCGGTTATTTACTAAGGCTATACACATAATGTTTTTTTAAAACATATACAACTTTTTGGCTTGTATTTATATACTTATTTTTATTAGTTAGTAAATAAATCAATTACAATGAATCTTTACATTCATATTTATTTCTATTATGTAACACAAATTAATTATAGCTATTTTGTTGCATTATATATCATTTTTCTTTAAAAAATAGTCCCCACAATCCATGTGTTATACCATGTTACTTGTTCCAAATCTTAATTAAGTTATTGTTGAAATAGAGCTTCAAGCATTAAAACTTTTAGGAATTTAAGTATTGTATTCAAAAGATTTTGAAACTAGATTTCAATTTTTCTTTTGTCTAATCTTTGATTTAAATTTAGGTACCTGCTGTGTTGATAGAACAATAAGCATAATGAAAAATAAATTATTCAACTTTAAGGTAATTATAAAAAAAAAAAAAGTTAATGTTGGAAGTTGCACGTTAACTAAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAATTTTATTTTACACATTGATTTTGTAAAATTGTGTTAGATTTAAATTTCAATTTTTAACCTAGTATCAAAGTTATGAATTACAATTTATCTTAGTAAAATTTATTGGACAAATGAGTTTTTGTTACATTCACCTTCATGTACAAATGAGTTTTTGTAACATTCTTTTACACTTAAAATTCTCTTCTTAATAAAAATAATTAAGAATATCATAATTTATAATTAAGAATATCATAATTTAATATGTTAGAATTTAATATGTTGAACTTTAATATGTTGAACTTTGATGGTCAAAATCTTGACTAAACTCAATTATTAGGGTGATGATTTCATAAACAATCTATTTTAAGTGAGTTTTCTGCACAACTGATTGCTGAAAAGATCATTCTAAAACCAGAACTCTAAACTTTAAGCCATATCCCAAGTCTCAAAACATGCACCCCTACCCCGGATTCCCTTTGCTGCTATAACCTAATCAACATTTCCTAATAACTTTATCAGAAAATAGCCCCTTTCATATTTATACATGTTTAAACATTATATTATATTATATAGATGTAATAATTTCATCTAAACATGCATGAAGATAAATGTGTGGTGATGATATATATTAAACTTTGACATGAGATCATCCTTATTTAAGCTGGATTGACTGAGAAGTCCTCTAGCCTATTTATGACTCAAGGCTCATTAACTCCTCTCTCTTATGTTCTTTTTTTGATACAATTGTTATTTGTTTGGTACAAAAGTTGTTCTATCTGTGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAATGTGAGAGTTAATAAGGTTGGATCTTTACCGAGAACAAAATATGAATATGTCATGTTAACTTGACCAGTGACAGAAATATGGCATAAAGGTGTGTAACCCTGGCAGGCCGAGGTTCCAAATTTAGCAAGCAGTGACCAAACACACAGGACTTTTCAGGGGTACCCTCCAATGGGATTCCCTCTCTTCGGTTTAGAAAATTGATGCTCTTTTTTCTTTCTACCTATAACCTCTTTCTAATTTCTACCACTCCCTCATAAACTCATCATCCCAACCCTCATCTTCATCTTTCTCTACTTCACAACACGCAACCCTTTTCACCCTTTTAGATCTCTCTTTTCAACATTTGTTGATATGATTTGAGTAGGACAGTTTAGTTTCTTTTTCAGATATACACCATTGCAATCTGCCTGAGGAATCAAAAAGGGGAGCTAGCTATATCTAGGCCAA

Gene Sequence:

>Vu_27710(+)