Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_27678 LG7 34237358 34240444 wall-associated receptor kinase-like 20
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 34237413 missense_variant p.Arg19His
C/T 34237417 synonymous_variant p.Ala20Ala
G/A 34237420 synonymous_variant p.Pro21Pro
C/T 34238410 downstream_gene_variant
A/G 34238416 downstream_gene_variant
G/T 34238445 downstream_gene_variant
A/T 34238481 downstream_gene_variant
C/T 34238580 downstream_gene_variant
T/A 34238584 downstream_gene_variant
G/T 34238686 downstream_gene_variant
T/C 34238726 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_27678.1
MEFTTRHFVLAIMLLMLSRAPHVSPATPCPACGNTTVPFPLSTTSTCGDPLYKIRCSSGTLIFDTLNNSYPIESIDAKSQRLVIRPAALVQNTCVPDKVHQGIQLNSTLPFNITSSNTIVYLNCTLTLLQSPLNCSAASACNAYINATASASACQSGLCCTYRTGGSSNSYMIRVRDSGCSAYSSFVNLNTAQPVSRWPNQVWRFSGSRPEKPFVDPRRIATLPRRLVGPTPPLRAGSRGASVTMGSCGTPSKGCVLKNPDGCGDSTNKKVIIAGSVCGAGAAIILAIIAFLFYKRHKRIKEAQARLAKEREGILNASNGGRAAKLFSGKEIKKATNDFSNDRLLGVGGYGEVYKGFLQDGTAVAVKCAKLGNPKGTDQVLNEVRILCQVNHRNLVGLLGCCVELEQPILVYEFIENGTVLDHLQGQIPKGRGSLSWTHRLEIAHMSHISTCAQGTLGYLDPEYYRNFQLTEKSDVYSFGVVLLELLTAQKAIDFNRAPDDVNLAIYVHRMMEEELLMDVIDPVLKNVANTIELETMKAVAFLALGCLEEKRQNRPSMKEVAEEIEYIISIITSAKVV*


CDS Sequence:
>Vu_27678.1
ATGGAGTTCACCACCAGACACTTCGTTTTGGCAATTATGCTGCTGATGCTATCACGCGCCCCGCACGTGTCCCCCGCCACACCGTGTCCCGCGTGCGGCAACACCACGGTGCCGTTTCCCCTCAGCACCACCTCGACATGCGGCGATCCGCTGTACAAAATTCGGTGCAGCTCCGGCACACTCATCTTCGACACGCTGAACAACTCGTACCCGATCGAGTCCATCGACGCGAAATCGCAGCGCCTTGTGATACGGCCTGCTGCGCTCGTGCAGAACACGTGCGTCCCCGATAAGGTGCACCAGGGGATCCAGCTCAACAGCACCCTCCCCTTCAACATCACCAGTTCCAACACCATCGTCTACCTCAACTGTACCCTCACGCTCCTTCAGTCCCCCCTCAACTGCTCCGCAGCTAGCGCCTGCAACGCCTACATCAATGCCACCGCCTCCGCCTCCGCCTGCCAGAGCGGCCTCTGCTGCACCTATCGTACTGGCGGCTCCAGCAACTCCTATATGATTCGCGTAAGAGACTCTGGTTGCAGCGCCTACTCCAGCTTCGTTAACCTCAACACGGCTCAACCTGTGAGCCGCTGGCCGAACCAGGTTTGGAGATTCAGTGGCTCTCGCCCAGAGAAACCGTTTGTGGATCCCAGGAGGATTGCGACTCTGCCACGTCGACTTGTGGGCCCGACGCCTCCTCTACGAGCGGGATCAAGAGGTGCTTCTGTCACGATGGGCTCGTGTGGAACCCCATCCAAGGGGTGTGTGCTAAAAAACCCAGACGGTTGTGGGGATTCAACTAATAAAAAGGTCATAATCGCAGGTTCAGTATGTGGGGCTGGAGCAGCAATCATCCTTGCCATCATTGCCTTTCTATTCTACAAACGCCACAAGCGCATCAAAGAAGCACAAGCCCGGTTAGCCAAAGAGCGTGAAGGAATTCTGAATGCCAGTAATGGGGGAAGAGCCGCTAAACTTTTCAGTGGCAAAGAGATAAAGAAAGCCACAAACGACTTCTCCAATGACCGACTTCTTGGTGTCGGGGGCTATGGTGAAGTTTACAAGGGCTTTCTTCAAGATGGTACTGCTGTGGCTGTCAAGTGTGCCAAGCTTGGCAACCCCAAAGGCACTGATCAAGTCCTTAATGAGGTTCGCATATTATGCCAAGTTAACCACCGAAACCTTGTCGGTCTACTTGGTTGCTGCGTGGAACTGGAGCAGCCTATTTTGGTTTATGAGTTCATAGAAAATGGTACCGTTCTTGATCACTTGCAAGGTCAAATTCCTAAGGGCCGTGGTTCGCTTAGTTGGACTCATCGCCTTGAAATTGCACATATGAGTCATATCTCCACTTGTGCTCAGGGGACCCTTGGGTACCTTGATCCTGAGTATTATAGAAACTTCCAATTGACTGAGAAGAGTGATGTTTACAGTTTTGGAGTGGTGCTTCTTGAGCTTTTGACAGCTCAGAAAGCAATAGATTTTAACAGGGCACCAGATGATGTGAACTTGGCAATTTATGTTCATAGAATGATGGAGGAGGAACTGTTGATGGATGTCATTGATCCAGTGTTGAAGAATGTAGCCAACACTATAGAGCTAGAGACTATGAAGGCAGTGGCATTTCTGGCATTGGGCTGCTTGGAGGAAAAGAGACAGAACCGACCTTCAATGAAAGAGGTAGCAGAGGAGATTGAGTATATCATCAGTATTATTACCTCAGCAAAGGTAGTGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_27678::LG7:34235358-34237358(+)
AGGAAAATTTTTTAAAGGCATGTGTTTCTGATTTTTTTCAATTGGGGCTACAGTAGGGATGACAGAGAAAAGGTTGGAGTGAGAAAGAGGAAAGAGAAAGGGTTGAGAGGAATGAGATAGGTGAGTAAGGGTTTGGGGTTTTTTTTTTTTTTTTAGTTTTGAGAATGAAAATTATTAAAATACCCTTAACCTTAAAACTTAAAATCCATGATATATAAGGATATTTTTGTCTACTAAAACCCGGTACACATTGCTAAAATGTACCAACTGAAAAACAGGCGTACGCGCGTTAGCAAACCCCTATATATATATATATATATATTTATATATATATGCTCTCACGTATTTTATATAGGAAATAATTCCTTCCTAACATTGAATTTTTGCAAGACTTTGAATTCGACGCATTTCTTTAAAAAAGAAACAAAGCATAATGCAATTCAAAATTAAAAAAAAATGCTTTAGTCAAGAAAGCAAACATAGAATAACACGTTGAGTACTGTTTTGGCAACACCCAATAAACTATAAACTCTACAGTTTGTGCAAATAAAATACAGTGATAAAAATAGTTGCAAATAAAATACAATGATAAAAATAGTAGTAAAATGATGCTACGGTTGATAGCATTATTGGAAAAAAAATCAATCATAAACACAAAAGTCAACTTCAAGAAATATATTCTCTTTTGTTTTCTCCTACAACAATCTTCACTAAATTATCAATTTAGATTTTCAAAGTGTACTATTTACAATTAAAAAAATTTCAATTTTTTATTAAAATTCTTAAAGTTAACGTTTTATTATTACTTTGTCCAAAAAATATGTTCATGCTGTTGTTTAAAATTTGAATTAAAAAAGTTACATAATTATATTTTAAGGACTAATATAAATATGCATTTTTAAATATTAAGAAAGTAGTTTCCTCATCATTAACTACTGAGTGCATAAAGTAATCAGTGTACAATGATCTATATTTGAGAATTGGATTTGTTTGTTTGGTTCTACTAAATGCCTGTAATTCTAAAATATCAAAGTATTTCAGAATTGATTTTTTAAAATTCAAACTTAAATAATTTTAAAATAAATAAAATTACATATATTCGAATACTTCACTTAAAGGTATTATTAATTTTTATAAGCATATATGAAAAACAAAAAAAATACTATAAAGTAGGGTTTAAATAAAAAATGTGGACAACTAGCTTTATAAATGGTGGGTTAAATTTTATTGGTTTTGAGTGACTTTTTATTGCCACAATTTCAGGTATAATCTCTTATTAAATAGTGAGATTATTATCAGTTTAAGTCAAATGTAATTGTAATTAGTGGATTTTTTTTTAATTTTGATGATCAAAGCTTCTATATAAATTTAATCATTTTTAATAAAAATAGAGTTTTTATTCATAAAAGTAGAGTTTATTTATTTTATTTTAGTTAGAATTATTTTTTAAGTTTATAAGTCATTCAAGAATATTTTGACTGTGTTAGATGACTTTCTTATCTTTTGTACGTTCACCCTCTTAAAAAGAATGATTTTTTTTTTCGTCTTTAATATTCACCTATTGTTTTTCGTTGACCCGAAATTCAAAAATTCACTTTTGTCCAAAATTATTTTGTAGTTATATCTCTCTCGTTCTATCAGAACAAATTAAGTAATTCTCCAACTTAACTTGAAATTTAAAACGTAAATCTTTTTCTCATTTTTGAAATTCTCTCAATTAAAGTTATATAATTCCATATATCTGAGTTTCTTAGATAGTGTGTAACCTAAATTTCCGTAAACTTTTTAATTCACCTTCTCATTAATTTTTCAAATTCAATTCAAAGTTCTAACCCTATAAATAGTGAAAAGGGTTTCATCAAGTATATTTATCATATTGAGTTGCAGTATTAAATACAAATTATATTAAATAAAATATAAATTTAAGAAAGTTAATGAATTAACATGACAGTATTTAAGAAGGAAGAAGCAGCAGTTTCAACTGCCAGCTTTGCCACCAA


Gene Sequence:
>Vu_27678(+)
ATGGAGTTCACCACCAGACACTTCGTTTTGGCAATTATGCTGCTGATGCTATCACGCGCCCCGCACGTGTCCCCCGCCACACCGTGTCCCGCGTGCGGCAACACCACGGTGCCGTTTCCCCTCAGCACCACCTCGACATGCGGCGATCCGCTGTACAAAATTCGGTGCAGCTCCGGCACACTCATCTTCGACACGCTGAACAACTCGTACCCGATCGAGTCCATCGACGCGAAATCGCAGCGCCTTGTGATACGGCCTGCTGCGCTCGTGCAGAACACGTGCGTCCCCGATAAGGTGCACCAGGGGATCCAGCTCAACAGCACCCTCCCCTTCAACATCACCAGTTCCAACACCATCGTCTACCTCAACTGTACCCTCACGCTCCTTCAGTCCCCCCTCAACTGCTCCGCAGCTAGCGCCTGCAACGCCTACATCAATGCCACCGCCTCCGCCTCCGCCTGCCAGAGCGGCCTCTGCTGCACCTATCGTACTGGCGGCTCCAGCAACTCCTATATGATTCGCGTAAGAGACTCTGGTTGCAGCGCCTACTCCAGCTTCGTTAACCTCAACACGGCTCAACCTGTGAGCCGCTGGCCGAACCAGGTTTGGAGATTCAGTGGCTCTCGCCCAGAGAAACCGTTTGTGGATCCCAGGAGGATTGCGACTCTGCCACGTCGACTTGTGGGCCCGACGCCTCCTCTACGAGCGGGATCAAGAGGTGCTTCTGTCACGATGGGCTCGTGTGGAACCCCATCCAAGGGGTGTGTGCTAAAAGTGAGTTGTACAGGATTATACCCCTTCTCCTATTTCTTCTTACGTTGACTAAGTTTGGAATTCCGGTTTGACTTTTTATGCAGAAATTACATGCCAGAACCCAGACGGTTGTGGGGATTCAACTAATAAAAAGGTCATAATCGCAGGTATTAGTTTCGCCTTTTTGTTTTCCTTTTTAATCTCTCATTTTTATTTTACAAAAATTAACTTGATTTTTAGAATATGAACCAGTTTAATAGACATAATGCATGTTAGATTAAAGTTTATTGATGTATGGTCGGTGAATTACTAGTCGAGTTTGGATTAAAACGACGGTATTATTTTCATTATCAAATATGATGAGCTTGTAAGCGTAATTTGAAGAAAAGCTAACATATCTCAGTGAGTTTACTGAGAAATGTCATTTAAAAGAGGCCAAACGTAAACCGAACAAAACACAACCGGATGTCGTCTGTATAAAAGAAGTTATTATTATCAATTATCGGAAGTCATGTTTAATATAATTTAAGATAATTTTTTTTGTTAATTTTAAAAGATTTATCCTATTGTGATTAGAAGATAATGTATAACCTTGTTAATTAACATCAACACGTGTATTATTAATGTAACTTCTGGATTTTTTTTAGGAAAAAATGTAAATTTTTTAAGTCTATAATAATATATATTTGGATGACAATTGAAAAATTAATTGCGAGAGGATTCTAACTAAATTTTATGTATGAATATGGTATTGTTTAATAATAAGCCTTCTTGGTTTGCTATTTGTTAGAGGTGATTTTGTTTTGACATCTCTTTTTCATAGTCTGGACTAGTTGTAACACGGATTTCTTAAAAAAAGTCAGGGATGTTTCGTGCGGATAATTGGTCGTGCACTACATGATAGGTGAACACATAATTCATATACAACGAAATTGTTGAAAAAGTGCATTAATGACGGCATGTGAATTGAGTCTTTGTCATATAATGGAAGTTAAATACAGGTCAAAGAATCAACCTACTCAAGCATTGTGAGTTAATAGAAGAGATAAAATTTTAATTTGCATGTAAAGAACTAAATAAATATGTACCGGTACATTTTTGTGTGAATTTAGAGCTGATAAATTGCTGGTATATTTCATCCATTGAGAAAAGAAAAATATGTTCTCAGTATCCTTGATGAGTGAAAACTTGACCACGATTCTGAACAATGGTTCTTGTGGCCTCTTTCGTATGATGCACTATTTATTTACAATTTGATGGTAACAATGTGCAGGTTCAGTATGTGGGGCTGGAGCAGCAATCATCCTTGCCATCATTGCCTTTCTATTCTACAAACGCCACAAGCGCATCAAAGAAGCACAAGCCCGGTTAGCCAAAGAGCGTGAAGGAATTCTGAATGCCAGTAATGGGGGAAGAGCCGCTAAACTTTTCAGTGGCAAAGAGATAAAGAAAGCCACAAACGACTTCTCCAATGACCGACTTCTTGGTGTCGGGGGCTATGGTGAAGTTTACAAGGGCTTTCTTCAAGATGGTACTGCTGTGGCTGTCAAGTGTGCCAAGCTTGGCAACCCCAAAGGCACTGATCAAGTCCTTAATGAGGTTCGCATATTATGCCAAGTTAACCACCGAAACCTTGTCGGTCTACTTGGTTGCTGCGTGGAACTGGAGCAGCCTATTTTGGTTTATGAGTTCATAGAAAATGGTACCGTTCTTGATCACTTGCAAGGTCAAATTCCTAAGGGCCGTGGTTCGCTTAGTTGGACTCATCGCCTTGAAATTGCACGTCAGACTGCTGAGGGTCTTGCTTATCTTCACTTCATGGCTGTGCCTCCTATCTACCACAGAGATGTCAAGTCTAGCAACATTCTGCTAGATATCAATCTGAATGCCAAGGTTTCAGATTTTGGGTTGTCTAGATTGGCCCAGACAGATATGAGTCATATCTCCACTTGTGCTCAGGGGACCCTTGGGTACCTTGATCCTGAGTATTATAGAAACTTCCAATTGACTGAGAAGAGTGATGTTTACAGTTTTGGAGTGGTGCTTCTTGAGCTTTTGACAGCTCAGAAAGCAATAGATTTTAACAGGGCACCAGATGATGTGAACTTGGCAATTTATGTTCATAGAATGATGGAGGAGGAACTGTTGATGGATGTCATTGATCCAGTGTTGAAGAATGTAGCCAACACTATAGAGCTAGAGACTATGAAGGCAGTGGCATTTCTGGCATTGGGCTGCTTGGAGGAAAAGAGACAGAACCGACCTTCAATGAAAGAGGTAGCAGAGGAGATTGAGTATATCATCAGTATTATTACCTCAGCAAAGGTAGTGTAG