Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_27568 LG7 31940906 31942756 Protein ETHYLENE INSENSITIVE 3
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04016 MAPK signaling pathway - plant [PATH:ko04016]
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 31941708 synonymous_variant p.Ser180Ser
T/A 31941717 stop_lost p.Ter177Cysext*?
T/A 31942489 missense_variant p.Arg90Trp
G/A 31942494 missense_variant p.Ala88Val
T/C 31942598 synonymous_variant p.Glu53Glu
T/G 31942610 synonymous_variant p.Val49Val
G/C 31942707 missense_variant p.Thr17Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_27568.1
MMMMMFDEMGFCNDLDTVTATLGEENITTGQADPEAIVEDDFSDEEIGVDELEHRMWKDKMLLKRLKEQSKSKEGIDADKQRQSQEQARRKKMSRAQDGILKYMLKMMEVCKAQGFVYGIIPEKGKPVTGASDNLREWWKDKVRFDRNGPAAITKYQADNAIPGRNDGCNSIEERKHENIHMSNLGMERMRGTMGVQQPSFSIKGEAVTNLDLLRKRKVSNDFNMMDLKIYTCEQPQCPYSQVQLGFPDRISRDNHRLICAFRGPSDFRGPNFHVNEVKPVIYPQSFVPPKSTAQSANMAPSVIDLTGLEVSEDGKKRISDLMTNYDTNVQGNKNMSSCNRVAGEVLNLQQHQQDNFIRGRGITMEGNVFDEATMSNNHHTFARDECQFDRFKALNSTFETNHNNNSNFHSMFGSFCDLASFDFKEDMQGVGMDALQKQTDFSVWYQ*


CDS Sequence:
>Vu_27568.1
ATGATGATGATGATGTTTGATGAGATGGGGTTTTGCAATGATTTGGATACTGTCACTGCGACCCTTGGAGAAGAAAATATTACCACTGGGCAAGCTGATCCAGAGGCCATAGTTGAGGATGATTTTAGTGATGAAGAAATTGGAGTAGATGAGCTTGAACACCGGATGTGGAAGGATAAAATGCTTCTCAAGAGATTGAAGGAGCAAAGTAAATCCAAAGAAGGAATCGATGCCGACAAGCAGAGGCAGTCTCAAGAACAGGCAAGGAGGAAAAAGATGTCTAGGGCTCAAGATGGAATTTTGAAGTACATGCTGAAGATGATGGAGGTTTGCAAGGCACAAGGATTTGTTTATGGGATAATCCCCGAGAAGGGGAAACCAGTGACAGGAGCATCTGATAATCTTCGTGAATGGTGGAAGGATAAAGTGAGGTTTGATCGAAATGGACCTGCTGCTATAACAAAGTACCAGGCTGATAATGCTATCCCTGGAAGGAATGATGGATGCAATTCGATTGAAGAGAGGAAACATGAGAATATTCACATGTCCAATCTGGGGATGGAGAGAATGAGGGGAACTATGGGTGTTCAGCAGCCCTCTTTTTCTATCAAGGGAGAGGCAGTTACAAATTTGGATCTTCTTAGGAAAAGGAAGGTCTCTAATGACTTTAACATGATGGATTTGAAGATTTACACATGTGAACAGCCTCAGTGCCCTTACAGTCAAGTTCAGCTTGGTTTCCCGGATAGAATATCTAGGGACAATCATAGGTTAATTTGTGCATTCAGAGGTCCTTCAGATTTTAGGGGTCCAAACTTTCATGTTAATGAGGTAAAGCCAGTGATATACCCCCAGTCCTTTGTTCCACCCAAGTCTACTGCTCAGTCTGCTAACATGGCCCCGTCTGTAATTGATCTCACTGGACTTGAAGTTTCAGAAGATGGCAAGAAAAGAATCAGCGACCTTATGACTAACTACGATACAAATGTACAGGGCAACAAGAATATGAGTTCATGTAATCGTGTAGCTGGCGAGGTTTTGAACCTTCAGCAGCATCAACAGGACAACTTCATTCGCGGTCGAGGAATCACTATGGAAGGAAACGTCTTTGACGAAGCTACCATGTCAAATAATCATCACACTTTTGCAAGAGACGAATGCCAATTTGACCGGTTCAAAGCTTTGAATAGCACCTTTGAGACCAATCACAACAACAACAGTAACTTTCATTCCATGTTTGGGTCCTTTTGTGATCTGGCATCATTTGATTTCAAGGAGGATATGCAAGGAGTAGGAATGGATGCTCTTCAGAAACAGACAGATTTTTCTGTATGGTACCAGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_27568::LG7:31942756-31944756(-)
GACAATTTATGTAGTTTCTCGTATAAAGCCTTAGGTTTTCATTTGACTTGAGCAAGTGCTTAGACGTTACAGGTCAAATAGGCACTTCTATTCCTGAAAGGATATTTTGTTTAATGATTATTGTTAAACTTCAAAACTCGGATTGCTAGATGGTCTAGTCTTTATAGAAGATCTTGTCTTAACAATTGCAAGTTCTTAATCTTGACTAAAAACGGTAAAAGAAAATAAACAACTCTAGACAAAAATTCAATGAATTTTTGAAAAGACACAAAACTAAAAAATTAGAAAATAATAGAAGTACCAAAAAGAGTGAAATGAGATAACGCATAAATTCTAAAAAAAGATTGAATATAATTTAATAAATTAACAATCATAAGCAATATTACAATATAATAATTTGTGTTGAACTATATAATTTTTATTTTTTATATTCTTGAATTCCTACTTTCTCTTCTTTTTTTCTTAATATATTTGTTTCATTTTGACATGGATCCATTATTTTTTTTTTCAATTTGACAGTTCAACACACAAACGAAGAAAACTAAATAAATTACACTTCAAACACCCAAATCCATGCAAGATCAAGGTAAATTAATGAATTAATATTCTCTTTTATTAAGGGTGACATTTAAAAAAAATATTTTCTTTTAAGAAAAATAATTTATTGAAAAATAAAAATGGAATCAACATAACATGTGTCCCATATAAATGAAAATAAACAAATAAACAAAATTGCTAAATTTTACAATACTCAATTTTTTTTCTAATTTTTTAAATTACGCCAAGAATATCTAGTTTTAAAAAATAATTCACCTATGTTATAAATATTGTTCCACATTATAGGTTTAAACCCACTATCTTCACATTCACCTTGGACTGCCCGCCACTCTGGCAATAAAACGGGGATGAAGTTTAACTCTTTGTCCCTTTCCCCTTTCTCTCTTCTCTCTCTTTCTTCCCACCTTCTCTGCTGAAAGTCTCTACACAAACCATCTTCATATTCTTCTTCACTTATTGACTTGTGGCAACCTAGGACGCTTCTCTGCATCTTCTGGTAATGTTCTGTTCACTTCATGTTGTGCTTACCCTTTTGACTGTTCAACTCCTTCTTGCTGTCTGGTTGGTCAATCAGATTCATGGGTTTGAGTTGTTTTTTCTTTGTTATTATCTGGGTATATGGCGGTTTTGCTCCCTTTTAATGATCTATGGTGAAAAAGTTTTTTTTTTTTTCCTTTTCATTTTACTCTTCATGTTGGAAGGTCTCTCTTTTCTTAGAGTGGTGTTCTAGGGGGTACTAGCTTGATAGTTATCCTCATCAATTAAATACTTTGTATTGTGTCTGACAGCTACAACTTTTCAAGCTGGATTTATGACAGAATCTTCTGAATTTTTCTTTTATGTGTTTGTTTGCATAGGAATAGTCATTTATTGTCTGTACTATTGTTTCTTTTGCTTTCATGTTTGATTCGTTGATGAACTGGATCTGTGGAATTAGGATTTCCCTGATCTATTTGTTTTCATCAAATTTCATGCCTGAGAAGGCTACAATTGTGATTGCAGCTTTTAAGAGCTCAAAAGTTGACTTTGTAGCCAAAAGTTTTTCAAAGCCCTATTTTCATGTTAGCTGTAACTTGTATCCTTCTATCAACTTTTTTTAAATGATTTCTTCGGTGATTAGTAACTTGAGATTATTTTATTCATGATTTTGGCCATATTAATTTTTTAATTGATGATCTTAGCATATTGAAACTTTGTGTCTGGTATATGTTACTTGGAGATATGTGTGCAAATTTTATGAAGTACTGATTTTCTTCATCTGGAAAATATTTGGTTATTGCAATGATTGTTTTGTATTGCTATTGGCAGGTGCGGAGGCCTTTAAAATATAAGAATTTGTTAACCTGAATTGGTACACAGTGGTACAGTGTAAAGTTTGAAATCTATCACACCACTTTCACTGTGAAACGCTTATAGGTTGGATTCATATCTTTCCACGGAAG


Gene Sequence:
>Vu_27568(-)
ATGATGATGATGATGTTTGATGAGATGGGGTTTTGCAATGATTTGGATACTGTCACTGCGACCCTTGGAGAAGAAAATATTACCACTGGGCAAGCTGATCCAGAGGCCATAGTTGAGGATGATTTTAGTGATGAAGAAATTGGAGTAGATGAGCTTGAACACCGGATGTGGAAGGATAAAATGCTTCTCAAGAGATTGAAGGAGCAAAGTAAATCCAAAGAAGGAATCGATGCCGACAAGCAGAGGCAGTCTCAAGAACAGGCAAGGAGGAAAAAGATGTCTAGGGCTCAAGATGGAATTTTGAAGTACATGCTGAAGATGATGGAGGTTTGCAAGGCACAAGGATTTGTTTATGGGATAATCCCCGAGAAGGGGAAACCAGTGACAGGAGCATCTGATAATCTTCGTGAATGGTGGAAGGATAAAGTGAGGTTTGATCGAAATGGACCTGCTGCTATAACAAAGTACCAGGCTGATAATGCTATCCCTGGAAGGAATGATGGATGCAATTCGATTGGTCCAACTCCACATACCTTGCAAGAGCTGCAGGACACAACCTTGGGTTCTCTCTTGTCAGCACTCATGCAACACTGTGATCCTCCTCAGAGGAGGTTTCCCTTGGAGAAGGGTATTCCTCCACCATGGTGGCCCACAGGAAATGAAGTATGGTGGCCACAAATTGGTTTACCTAAAGATCAGAGTCCTCCTCCTTACAAGAAGCCCCATGACCTGAAGAAGGCATGGAAAGTTGGTGTTCTGACTGCAGTTATAAAGCACATGTCCCCAGATATTGCCAAAATTCGGAAGCTTGTGAGGCAGTCTAAGTGCCTTCAGGATAAGATGACAGCCAAGGAAAGTGCAACCTGGTTGGCAATCATCAATCAGGAGGAGGCCTTGGCAAGAGAGCTTTACCCTGATTATATTCCCCCATTAGCCTCAGGTGGAGGGAGTGGATCTTTGGTGGTCAATGATGGCAATGAATATGATGTTGAAGGGGGTGAGGATGAGCCTAATTTCGATGTAGAAGAGAGGAAACATGAGAATATTCACATGTCCAATCTGGGGATGGAGAGAATGAGGGGAACTATGGGTGTTCAGCAGCCCTCTTTTTCTATCAAGGGAGAGGCAGTTACAAATTTGGATCTTCTTAGGAAAAGGAAGGTCTCTAATGACTTTAACATGATGGATTTGAAGATTTACACATGTGAACAGCCTCAGTGCCCTTACAGTCAAGTTCAGCTTGGTTTCCCGGATAGAATATCTAGGGACAATCATAGGTTAATTTGTGCATTCAGAGGTCCTTCAGATTTTAGGGGTCCAAACTTTCATGTTAATGAGGTAAAGCCAGTGATATACCCCCAGTCCTTTGTTCCACCCAAGTCTACTGCTCAGTCTGCTAACATGGCCCCGTCTGTAATTGATCTCACTGGACTTGAAGTTTCAGAAGATGGCAAGAAAAGAATCAGCGACCTTATGACTAACTACGATACAAATGTACAGGGCAACAAGAATATGAGTTCATGTAATCGTGTAGCTGGCGAGGTTTTGAACCTTCAGCAGCATCAACAGGACAACTTCATTCGCGGTCGAGGAATCACTATGGAAGGAAACGTCTTTGACGAAGCTACCATGTCAAATAATCATCACACTTTTGCAAGAGACGAATGCCAATTTGACCGGTTCAAAGCTTTGAATAGCACCTTTGAGACCAATCACAACAACAACAGTAACTTTCATTCCATGTTTGGGTCCTTTTGTGATCTGGCATCATTTGATTTCAAGGAGGATATGCAAGGAGTAGGAATGGATGCTCTTCAGAAACAGACAGATTTTTCTGTATGGTACCAGTGA