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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_27520 LG7 30790049 30792577 hypothetical protein LR48
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 30790503 intron_variant
C/T 30790728 missense_variant p.Gly617Glu
T/C 30791235 missense_variant p.Tyr448Cys
A/T 30791236 missense_variant p.Tyr448Asn
A/G 30791426 synonymous_variant p.Val384Val
G/T,* 30792064 missense_variant p.Leu172Ile
T/A 30792412 missense_variant p.Asn56Tyr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_27520.1
MFHRAASGTSFHLVCNEKDRSALQIFKLGVVNHSNKLPSWSSQQDCCSWKGVHCDNNTGRVTRLDLKQQYLEGEINLSLFQIQFLSYLDLSLNGFTSLSAPFDAHASFSDVQFLDLSFNDDLHVDNLLWLNQLSSLKYLNLSEINLQNESNWLQSMQLHPSLLELRLASCHLTNISPSIKFVNFSSLLSLDLSGNLFDSELPYWLFNLTTISNIDLSFNFLKGSLPKSLLSLGNLKSLRLHDNEINGSIPEWLGQHEHLQYLGLSDNMFVGSIPSSIGNLSSLVDLSISSRSLNGNLPTSLGQLFNLKSLFIGGESLSGVLHENHFSNLSNLEALVLNAPFSFDLASDWIPPFQLEGISLSNAKLGPKFPEWLYTQHSLVYLEVPNSSISSINGDQFWRFVANITQLNLSKNNISADLTNITLNSQLIFMDHNNFTGGLPHISANVIYLDLSRNSFYGPIAPLFCHKLGSQNNLDYLDISFNLLTGGVPDCWEYWKGLSFLFMESNMLTGELPPSMATFIDLIALDLHNNSLSGHFSLDLSNITNLEFINIKQNNFSGTVPTKMPRAMEVMLLGSNQFEGNIPTQLCNLSSLIQLDLFHNNLSGPIPPCISDIPSMGGAQRTRSNDDAFETESLYLGTGVGFAVGFWGLWGSLFLNRTWRRVYIRFLNYGAHKLHVFVAVKLKALVAHH*


CDS Sequence:
>Vu_27520.1
ATGTTCCACAGAGCTGCCTCTGGAACCAGTTTTCATCTTGTTTGCAACGAAAAGGATCGATCCGCATTGCAGATATTCAAACTTGGTGTTGTGAATCATTCCAACAAGCTCCCTTCCTGGTCCTCTCAACAAGATTGCTGCTCGTGGAAGGGAGTCCACTGTGACAACAACACAGGAAGAGTTACAAGGCTTGATCTAAAGCAACAATACTTGGAAGGTGAAATCAACTTGTCTTTGTTTCAAATTCAATTTTTGAGCTACTTGGACTTGAGCTTGAATGGCTTTACTAGTTTAAGTGCACCATTTGATGCTCATGCTAGCTTCTCTGATGTCCAGTTTCTCGACTTATCCTTTAATGATGATCTTCATGTTGATAATCTCCTCTGGCTTAATCAACTTTCTTCCTTGAAATATCTCAACCTTAGTGAAATCAATCTTCAAAATGAGTCCAACTGGCTTCAGTCAATGCAATTGCATCCATCACTGTTAGAGCTAAGATTGGCAAGTTGTCATCTTACCAATATCAGTCCATCCATCAAGTTTGTCAATTTTTCCTCACTCTTATCTCTTGACCTCTCTGGGAATCTTTTTGATTCAGAATTGCCCTACTGGCTTTTCAACCTCACCACCATCTCCAATATCGACCTCAGCTTCAATTTCCTAAAAGGTAGCCTACCAAAGAGCTTGTTGAGCCTTGGAAACCTTAAATCTTTAAGGTTGCACGACAATGAAATTAATGGATCGATCCCGGAGTGGCTAGGCCAACATGAACATTTGCAATATCTTGGTTTGTCTGATAACATGTTTGTTGGTTCAATCCCTTCATCAATTGGAAATCTCTCATCCTTAGTTGACTTGAGCATAAGCTCCAGGTCATTGAATGGTAATCTTCCAACCAGCCTTGGACAGCTCTTTAATTTGAAAAGCTTGTTCATTGGTGGTGAATCCTTGTCAGGTGTTCTTCATGAAAACCATTTTTCCAATCTCTCTAATTTAGAAGCACTGGTGTTGAATGCTCCCTTTTCATTCGACTTGGCTTCTGACTGGATTCCTCCTTTCCAGTTGGAGGGCATTAGTTTGAGCAATGCAAAGTTAGGTCCTAAATTTCCAGAATGGCTTTACACACAACACTCACTAGTATATCTAGAGGTTCCTAATTCAAGTATCTCATCCATAAATGGTGACCAGTTTTGGAGGTTTGTGGCTAATATTACACAACTCAACCTCTCCAAGAACAACATCTCTGCAGACTTAACAAACATCACACTCAACTCACAGCTCATATTTATGGATCATAATAATTTCACTGGAGGCCTCCCACATATATCAGCAAATGTTATCTATTTGGACTTGTCCCGCAATTCTTTCTACGGACCAATTGCCCCTTTGTTCTGTCACAAGTTGGGCAGTCAAAACAATTTGGACTATTTGGACATATCATTCAACCTTTTAACCGGAGGAGTTCCTGATTGTTGGGAGTATTGGAAAGGTTTGTCTTTCCTTTTCATGGAGAGTAACATGCTAACAGGTGAACTCCCTCCATCAATGGCTACATTCATTGATCTCATAGCACTGGATTTGCACAACAACAGCTTGTCTGGCCATTTTTCATTGGACCTATCGAACATAACAAATTTGGAATTCATCAATATCAAACAGAACAATTTTTCTGGGACTGTACCAACAAAGATGCCACGTGCTATGGAAGTGATGCTACTGGGATCTAACCAATTTGAAGGAAACATTCCAACCCAGCTATGCAATCTCTCTTCACTGATTCAGTTGGATCTTTTCCACAACAATCTCTCAGGACCTATTCCTCCATGCATCAGTGACATTCCTAGCATGGGGGGAGCACAAAGAACAAGAAGCAATGATGATGCCTTTGAAACCGAGTCACTCTACCTTGGGACAGGAGTTGGTTTTGCAGTGGGATTTTGGGGGCTTTGGGGTTCTCTATTCCTTAACAGGACATGGAGGCGTGTGTATATTCGGTTCCTTAATTATGGTGCACACAAACTTCATGTCTTTGTGGCTGTCAAGTTAAAAGCTTTAGTGGCACATCACTAA


Promoter Sequence:
>Vu_27520::LG7:30792577-30794577(-)
CACTCTTTTACAACACTTGAGAACACTCACAACTCTCAACACCTGGCCACACCTCACAAGTACAGAAATACATAATGTTTGTGATGATTTTGATCTTCAAGTCACACTCCTCTTGGTGTAGACTAAATCAGAACAGTTTTTAGCCCACTTTCTTCAAAGAATCTTGATGTATAAGCAACCAATGTAGCCTTGATTCTCTAAGATCTTTTCTTGAACGCTCCTGTATTCAAAACACAATGTAAACGTTAGTATTTGAAAACGATAGCAATTGATTTTTTTGAAACAGAACTCAAGACACATATATATATAGGATTTGTTGAATCATGACGCATTATAATGGATTAAGGTTTTTATGTAATCTATTAAGGTTTTGGTTCTGTTTTAACATTTTTTTTCTTATGTTTTAATGGATTATCCTGAGCATATAATTGATTATAATATCACATAAGTCAATTATAAATTCAAATGATAGTTATAACAAATCACTCTATTAAATGAACTGATTAAACAAAGTAAATTGTTTTAATCGATTAGACAACTTATGTAATCGATTAATCGTGTACTTAAGCAAATTTCTAAGCCAATTTCCTTTTTAAACAGATTAACCCACTTATGCAACAAATCATGACATTGCTTTCTATTTTAATCAATTAGACAACTTATGTAATAGATTACTACAAAGCAGTTTTCCCCTATTAAGCATACAAAGTGAACTGGTGAAATCTAACAGATTATATACTATGTTAAATCGATTATTTTATCCAAAAATAAGATTATTAATCAGTTTAATACATGATTTATTTAATATAAATGAATTCTCATATCAAGCACACACAAGATATAAATAAAGCAATTGTTATGTCATTTGTTGTGCAAGAAACCAAAAAATCATTCTTTTATTCATCATTAAAAACCAAGATATATAAGGAAGTTGAAGGTCCCCTATCAATAATTTGGAATTCAGGTATCGAGAACGAAAAAGAAAGTTAAATAAAGTGTTTAAGATAACCTAATATGAATCGTGTGAAAAAAGTGTTTTGTAGAGATCATCCCTCTTACTACTGAAACATGGGTTAAAATAGATATGTTATTTAGTGGAAGATGTAGAGAATGAAATAGTAATTAATTTAATAATAAACGGGTTAAAATAAGTTTAAGTCTTGTCTAACTCATTAAATTTGTTTAATAAAATAATTAGTTTAATAATAAAAGAGTTTTTCACCAATAAATTTGTTTTGACATCTCTTGTCTAACTCGTTAAATAAGCCTGTAATGAAGTGTATAAATCCACCATTCTATTGTTTAAATAAAAGTTATAAAAAAAACTTTAAAATTAATTTTTGTGTATTATATTACTTCAAAAATACAATATTATTATAACTTAAATCATTAACACATAAATCAAATTTCTAATTATTAATTATAATAGAATAATTTAAAATATAAAAGTAACTATTTTAATTTATTTGATTAAAAAAATATTTTAATATATATATATATATATATATATATATATATATAACAAGTTTTAAAAATAAAAAATGAAAAATTAGAAAGAAAAAGTTGACCGACTAGATCCCACTAGTTCACATTTTAACCGAATGAGTTAGGATTTTTAGTCCGTTCTCCTACCAGGGACCATCCCACTCCATCCCATTTTTAAGGGACCATGATACATTTTTGCCACGCCTTTTAAATAGTAGTAAAACCAACAAATTTCTGAAGTAAATATACTTGAAGTAAATAACACAATCGAAGACTGTTGAAGAATCAACGCGCAAAGTTTTAGTGTTGAACGTTTCCTGATGCCTCTGATTAATGCTTGTTGCCAGCATGCTTACTTTGATGACACGAACATGATTGATATGGTATATAGAGGGGAAACGCAACATGCGCTATATAGATAAGGTGGTAGGAGTCAGCACTAACACCATCTTCTCATTTTCCAAGCCATGTCCTCACAACTTTCAATTTTTCTTCTGTGGTTGCTATATGCAACT


Gene Sequence:
>Vu_27520(-)
ATGTTCCACAGAGCTGCCTCTGGAACCAGTTTTCATCTTGTTTGCAACGAAAAGGATCGATCCGCATTGCAGATATTCAAACTTGGTGTTGTGAATCATTCCAACAAGCTCCCTTCCTGGTCCTCTCAACAAGATTGCTGCTCGTGGAAGGGAGTCCACTGTGACAACAACACAGGAAGAGTTACAAGGCTTGATCTAAAGCAACAATACTTGGAAGGTGAAATCAACTTGTCTTTGTTTCAAATTCAATTTTTGAGCTACTTGGACTTGAGCTTGAATGGCTTTACTAGTTTAAGTGCACCATTTGATGCTCATGCTAGCTTCTCTGATGTCCAGTTTCTCGACTTATCCTTTAATGATGATCTTCATGTTGATAATCTCCTCTGGCTTAATCAACTTTCTTCCTTGAAATATCTCAACCTTAGTGAAATCAATCTTCAAAATGAGTCCAACTGGCTTCAGTCAATGCAATTGCATCCATCACTGTTAGAGCTAAGATTGGCAAGTTGTCATCTTACCAATATCAGTCCATCCATCAAGTTTGTCAATTTTTCCTCACTCTTATCTCTTGACCTCTCTGGGAATCTTTTTGATTCAGAATTGCCCTACTGGCTTTTCAACCTCACCACCATCTCCAATATCGACCTCAGCTTCAATTTCCTAAAAGGTAGCCTACCAAAGAGCTTGTTGAGCCTTGGAAACCTTAAATCTTTAAGGTTGCACGACAATGAAATTAATGGATCGATCCCGGAGTGGCTAGGCCAACATGAACATTTGCAATATCTTGGTTTGTCTGATAACATGTTTGTTGGTTCAATCCCTTCATCAATTGGAAATCTCTCATCCTTAGTTGACTTGAGCATAAGCTCCAGGTCATTGAATGGTAATCTTCCAACCAGCCTTGGACAGCTCTTTAATTTGAAAAGCTTGTTCATTGGTGGTGAATCCTTGTCAGGTGTTCTTCATGAAAACCATTTTTCCAATCTCTCTAATTTAGAAGCACTGGTGTTGAATGCTCCCTTTTCATTCGACTTGGCTTCTGACTGGATTCCTCCTTTCCAGTTGGAGGGCATTAGTTTGAGCAATGCAAAGTTAGGTCCTAAATTTCCAGAATGGCTTTACACACAACACTCACTAGTATATCTAGAGGTTCCTAATTCAAGTATCTCATCCATAAATGGTGACCAGTTTTGGAGGTTTGTGGCTAATATTACACAACTCAACCTCTCCAAGAACAACATCTCTGCAGACTTAACAAACATCACACTCAACTCACAGCTCATATTTATGGATCATAATAATTTCACTGGAGGCCTCCCACATATATCAGCAAATGTTATCTATTTGGACTTGTCCCGCAATTCTTTCTACGGACCAATTGCCCCTTTGTTCTGTCACAAGTTGGGCAGTCAAAACAATTTGGACTATTTGGACATATCATTCAACCTTTTAACCGGAGGAGTTCCTGATTGTTGGGAGTATTGGAAAGGTTTGTCTTTCCTTTTCATGGAGAGTAACATGCTAACAGGTGAACTCCCTCCATCAATGGCTACATTCATTGATCTCATAGCACTGGATTTGCACAACAACAGCTTGTCTGGCCATTTTTCATTGGACCTATCGAACATAACAAATTTGGAATTCATCAATATCAAACAGAACAATTTTTCTGGGACTGTACCAACAAAGATGCCACGTGCTATGGAAGTGATGCTACTGGGATCTAACCAATTTGAAGGAAACATTCCAACCCAGCTATGCAATCTCTCTTCACTGATTCAGTTGGATCTTTTCCACAACAATCTCTCAGGACCTATTCCTCCATGCATCAGTGACATTCCTAGCATGGGGGGAGCACAAAGAACAAGTCATTACCCGTTTGAGTTCAATTTGTACAACAAAGGCCAGGAGCTACAGTATGAAGACTATGGATTACTCAGAACACTTGATCTTTCATCTAACAACTTGTCAGGAGAAATCCCTTCACAAGTTTTCAGTCTTGTTCAGTTACAGTCCTTGAACTTGTCACGAAATCATTTCACAGGAAAGATATCAAGGGAGATTGGAAGCATGAAGAACTTGGAATCTCTTGATCTATCTAGCAACGAACTTTATGGAGAAATTCCTGGTTCCATTTCCTCTATATCTTTCTTGAGCTTCTTGAATATGTCATACAATGATTTCACTGGACAAATCCCAGTTGGGACTCAGCTTCAGAGCTTGAATGCTTCTAGCTTTGCTGGGAACCCTAGGCTTTGTGGAGCTCCTCTACAAATTAACTGCACACAAGGAAGTGGTAGCGTTGAAGTGTCAATGCAATATGCAGGAAGCAATGATGATGCCTTTGAAACCGAGTCACTCTACCTTGGGACAGGAGTTGGTTTTGCAGTGGGATTTTGGGGGCTTTGGGGTTCTCTATTCCTTAACAGGACATGGAGGCGTGTGTATATTCGGTTCCTTAATTATGGTGCACACAAACTTCATGTCTTTGTGGCTGTCAAGTTAAAAGCTTTAGTGGCACATCACTAA

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