Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_27475 LG7 29001270 29005758 PREDICTED: serine/threonine-protein kinase D6PK-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 29002580 downstream_gene_variant
A/T 29002623 downstream_gene_variant
G/A 29002631 downstream_gene_variant
T/G 29002664 downstream_gene_variant
C/A 29004190 missense_variant p.Gly215Trp
T/C 29004245 synonymous_variant p.Pro196Pro
G/A 29004259 missense_variant p.Pro192Ser
G/A 29004304 synonymous_variant p.Leu177Leu
A/G 29004316 synonymous_variant p.Leu173Leu
G/T 29004359 synonymous_variant p.Thr158Thr
G/A 29004391 missense_variant p.Pro148Ser
G/A 29004397 missense_variant p.His146Tyr
G/A 29004443 synonymous_variant p.Ser130Ser
C/G 29004452 missense_variant p.Lys127Asn
C/A 29004475 missense_variant p.Val120Leu
C/T 29004482 synonymous_variant p.Glu117Glu
G/A 29004492 missense_variant p.Pro114Leu
G/T 29004524 synonymous_variant p.Pro103Pro
G/C 29004534 missense_variant p.Thr100Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_27475.1
MERVAEPKLLPRNLPILVEVSKAHTSAAREPGQRHNRQEVSGAAGISLREVNQLSKTRDVHVPLSHLASIREVAQLTNARIYLVQEDMGFDGRSSEESLTFEPTMTWKGKGSSPEAEEFVPDGDTLKESSYSFEDGGPSLFAGASHPPEPVDTDLMRTVYVPIGQNKSEAGCLIKSLPTKGPFLEDLSIRVPAKKPNPAVLTPEQSLVEEINGIGNLAFLGPRASQNTENSLLPPDAEEKECVWDASLPPSGNVSPLSSIDSTGVVTAMSIVNSCASTYRSDAMTSDGMLSLDRNCDSTKGSVRGDSLESAKTSASRASDSSGLSDDSNWSNITGSANKPHKGNDPRWKAILAIRLRDGILGMSHFRLLKRLGCGDIGSVYLSELSGTRCYFAMKVMDKASLASRKKLTRAQTEREILQLLDHPFLPTLYTHFETDRFSCLVMEYCPGGDLHTLRQRQPGKHFSEYAARFYAAEVLLALEYLHMLGVVYRDLKPENVLVRDDGHIMLSDFDLSLRCAVSPTLIRSSYDGDPSKRAGGAFCVQPACIEPSSVCIQPACFIPRLFPQKNKKLRKPRADPGLPSSTLPELVAEPTAARSMSFVGTHEYLAPEIIKGEGHGSAVDWWTFGIFLHELLYGKTPFKGSGNRATLFNVVGQQLRFPESPATSYASRDLIRGLLVKEPQHRLGVKRGATEIKQHPFFEGVNWALIRCSTPPEVPRPVENELPGKVGPADNAVGLGSTSKRIVGTTTDNMKSGGKYLDFEFF*


CDS Sequence:
>Vu_27475.1
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Promoter Sequence:
>Vu_27475::LG7:29005758-29007758(-)
GGTTGTAATGTAAATTAGATACTCAACTTAATTCATCACATATTTAAGTTAGACTGAATAAAAAAAAAAATTCTTTTAAATATTTTAATTAAATGATTTCGAGTAGAGTTAATTAACAACCTACTAAAACAATACTTTATTATTTTATTCTTATAATTTTCATAATTTTTTATTATGACGTCAAATTATATAAATTAACAATTTAATATCTTTAAAGATTAAAATGCAGTTTAATAATGTTTGAATAATATAAATATTTAATTAATTTATTTATTCAATAATATAAATTAACATTTTAATTTGTAATTATTTTTTTAATATTTAATGCTATAAATAAATGAGCGATTAAGTCTACTTTTATTTATTATAATAAATATATAAAATATGTTTGGAGGACAAAATAAATTAACCCATCTAAATAAATAAGATTGATCTGACTAAGAATTTGATACCGCTGTCTAAATTTAAAAGAATTTCATTACTTTCTTAATAATTATCATTAAATGAAAAATAGAGCTGCTGTGAAGTGGGCCCACCTAAATTGGTATTTGAAAAAATGGGCCCCACTCACTAATCATAATCCACTTCCAGTGAAGGATATTCCACTTCATCACAACAAACAAAAGAAAAGAAACACACGCGCGTTCAAAAGAAGTTGGAATCACGCGCCATTTGAGAATTCCAAAAGCCAATCAAGGAAAACGGCTTGACGTTGATGAAAGAGAGAAAAGAAGTGTACCTTAAAGAACCAACACTGTGGGTCCCACTCTCATTTTTCTCTATCTTGACTGATATTATTTTTTAGGATTGATGAAGATCATGAATGGTTTTAATATATGTATTTTATATGTAATATTTTACTTCTATAATTATCATTATTAGTTTCCTTTCATAATTATTATTTATATGAATTGATATATATATATATATATATATATATATATAATATTTAAAGAATACAAATTGTCATTAATATATGGGTTAAATATGTTTTTAGTCCCTAAAGTATTGGTCATTTCTGGTTTTCGTCCCTCATTCTTTTTGAAACGTTTGTTTTAGTCCTCGGAATTTTGGTTTTAGTCCTTATTTGTTGCTAAATGAGGACCAAATTTTTAAACAATGTTTAGTTTTCGAGAACTAAAACGAACGTTTCGAAAAGAATGAAGACCAAATTGTACCTTACTCTAAAACAGGGACGAAAACCAAAAACGACCAATACTTTAGTGACTAAAAACATATTTAACCCTTAATATATACAGACAAACATTTTCAAATATTACAATCTACTATTATTTTTAAACAGACATGGTATTATTAATGAATTTATTTTCCTTTTATTTAAAATTAAATTATACTATTAAAATTAAATTATTTTTATTATAAAATGACACAATTATTTATATGGCTAATGTTCCTTGTAATATTTATTATTACCGTTACATTCGTATTAATACATATTATTTATTATAAGATGCAATGAATGATACTGAAACAATAATTTTCTCAATATTCATTAGTCTACATTTATTTCATTTAGATATTACCAATTTATATATTTAAAATTTTAATTTGTTAATGTCAATTTTTCAAATATAACTTTTTTAAATATATCTGCCATAAACTATACTTATACTTTTAAAGTAGTAACACTGAAAGTAACTTTTTTACTGATTTATAGTGGAGTAACACTGTAAATTTCTTTTATACTAAAAGTAAATTTTTACTGATTGATAATTGAGTAACACTGTAATATTTTTTACACTGGTAATATAGTTTCATTATATTTTATTTTTTCTATAACTATGTAAATACTCAACAAATAAAATAAGTGAAATAATAATAAAAGTTTATAAGTATTTGGTGTAAGAACTTTTTTATACTTTCAATCAACAAGAGTTCATTGTTATTATCCTTTTATAAAATAATTATTATAAAAGAATTAAAAAAACAAAAATAATAATATTAAAAAAAGCAAAAGCTTGTACCCACAGTTCATAACT


Gene Sequence:
>Vu_27475(-)
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