Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_27376 LG7 27439968 27442466 hypothetical protein
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 27440012 synonymous_variant p.Leu719Leu
G/A 27440019 missense_variant p.Ser717Leu
T/C 27440056 missense_variant p.Lys705Glu
T/C 27440313 intron_variant
A/T 27440319 intron_variant
C/G 27440321 intron_variant
C/T 27440927 missense_variant p.Gly514Arg
C/T 27441072 synonymous_variant p.Gln465Gln
G/C 27441248 missense_variant p.Gln407Glu
G/T 27441913 missense_variant p.Ala185Glu
G/T 27441945 synonymous_variant p.Thr174Thr
C/T 27441998 missense_variant p.Val157Met
A/T 27442055 missense_variant p.Ser138Thr
A/G 27442059 synonymous_variant p.Thr136Thr
C/G 27442242 synonymous_variant p.Gly75Gly
T/C 27442280 missense_variant p.Thr63Ala
G/A 27442346 stop_gained p.Gln41*
C/T 27442426 missense_variant p.Ser14Asn

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_27376.1
MVLLNIFVVAQTRSSKIIDQYLLKETIKASWVVSSSGEINQTTRNITVGDSHFAETTSSNSSTWVVSRLGHFAFGFLPLEDTNHFLLSIWYAKIPGKTVVWYANGDTPAPKGSKVELTGDDGLVLTAPNGELLWKTKSLTGKVHQGFLKDNGNFVLVDENHQGAWETFKHPRDTLLPTQTLEKGAKLSSRFVESNYSEGRFEMMLQMDGILSIHALNSPSGYANENYYESRTEESNTSSPGIRLVFEPSGYVYVLRKNSEKYNLSTWSGASTTDESYFRATLNFDGVFTLYQYSQSSFGSDGWSAVWSQPDNICLSRLATEGSGVCGFNSVCTLGSNQRPSCQCPKWYSLVDPNDPYGSCKPDFIQGCAEDELIGKVGAAGYDFEVLVNTDWPLSDYVLLKPFTEEQCEQSCLEDCMCAVAIYKSGSDCFKKKLPLSNGRVDVGLNGAKTFIKVRKDNSSLVVPQAKVNENSKSSLSLVAWVLFGSSSFLNVIFIGALCMCFFYIFQYKKKLRGIGKSANALETNLRCFCYEELERATNGFQKELGRGSFGVVYEGVINIGSEIPIAVKKLNTLLFQQVEMEFKNELHAIGLTHHKNLVRLIGYCEAEKERLLVYEYMSNGTLASLIFSEVKPEWKLRRNVEMDLEEEEKVILIDWACDCYSRGTFDPLVEDDKEAFDDKKNMMKLVMISIWCIQEDPILRPTMKKVTQMLEGVVEVEPPPFPSQFSRHSQNP*


CDS Sequence:
>Vu_27376.1
ATGGTGCTGCTAAACATTTTTGTTGTAGCCCAAACCAGAAGCAGTAAAATCATTGATCAGTATCTTCTGAAAGAAACCATCAAAGCCTCATGGGTAGTTTCATCTTCTGGTGAGATAAACCAAACCACAAGAAACATAACTGTTGGTGATTCACATTTTGCAGAAACAACTAGCAGCAACTCCTCAACGTGGGTGGTTTCACGTCTTGGCCACTTTGCCTTTGGGTTTCTTCCACTTGAGGACACTAACCATTTCTTACTTTCCATTTGGTATGCTAAGATTCCTGGCAAGACTGTTGTTTGGTATGCCAATGGAGACACTCCTGCTCCAAAGGGGTCAAAGGTTGAACTCACTGGTGATGATGGGTTAGTCCTCACTGCCCCAAATGGTGAACTGTTATGGAAAACTAAGTCCCTTACTGGTAAAGTTCATCAAGGGTTTTTAAAGGACAACGGAAACTTTGTGCTTGTGGATGAAAATCATCAAGGTGCGTGGGAGACGTTTAAGCATCCAAGGGACACCTTGTTGCCCACACAAACTCTTGAAAAAGGTGCGAAGCTTTCATCGAGATTTGTAGAGTCAAATTACTCAGAAGGAAGGTTTGAGATGATGCTTCAAATGGATGGCATTCTTTCCATTCATGCTTTAAACTCGCCATCTGGGTATGCCAATGAAAACTACTACGAAAGTAGGACTGAAGAGTCCAACACATCAAGTCCTGGAATTCGTTTGGTGTTTGAACCATCAGGGTACGTGTATGTTTTGAGGAAGAACAGTGAGAAATACAACTTGTCAACATGGAGTGGAGCCTCTACTACTGATGAATCTTACTTTAGAGCAACTCTTAATTTTGATGGGGTGTTTACACTCTATCAATATTCTCAGAGTTCGTTTGGGAGTGATGGTTGGAGTGCTGTTTGGTCTCAGCCAGATAACATCTGTCTCAGCAGGCTTGCCACTGAAGGTAGTGGTGTTTGCGGGTTCAATAGTGTGTGTACGTTGGGAAGTAATCAAAGGCCAAGTTGTCAATGCCCAAAATGGTACTCTTTGGTTGACCCTAATGACCCCTATGGTAGCTGCAAGCCAGATTTCATACAAGGATGTGCAGAAGATGAACTCATTGGAAAAGTAGGTGCAGCTGGATATGATTTTGAGGTGTTGGTAAATACAGATTGGCCTCTTTCAGATTATGTGCTTCTTAAGCCCTTTACTGAAGAACAATGTGAACAGTCATGTTTGGAAGATTGTATGTGTGCAGTTGCCATCTACAAGTCAGGAAGTGATTGCTTCAAGAAGAAGTTGCCTCTTTCAAATGGTAGAGTTGATGTTGGACTTAATGGTGCAAAGACTTTCATCAAAGTGAGGAAAGATAATTCCTCTTTGGTTGTTCCACAGGCCAAAGTGAATGAGAATAGTAAGAGCTCTTTGAGTTTGGTTGCTTGGGTACTTTTTGGAAGCTCTTCATTTCTCAATGTCATATTTATTGGTGCCTTATGCATGTGCTTTTTCTACATCTTTCAGTACAAAAAGAAGCTTAGAGGAATTGGCAAAAGTGCCAATGCCCTTGAAACTAACTTGCGTTGCTTCTGTTATGAGGAGCTTGAAAGAGCTACAAATGGTTTCCAGAAAGAGTTAGGAAGAGGGTCTTTTGGTGTTGTCTATGAAGGAGTCATAAACATAGGCTCAGAAATTCCAATAGCAGTGAAAAAGCTAAACACTTTGCTTTTCCAACAGGTTGAGATGGAGTTCAAGAACGAGTTACATGCCATTGGTCTCACTCATCACAAGAACTTGGTGCGGTTGATAGGCTATTGTGAGGCTGAAAAAGAAAGATTGTTGGTTTATGAGTATATGAGCAATGGCACTTTGGCAAGTCTTATTTTCAGTGAGGTGAAACCTGAGTGGAAACTGAGAAGAAATGTAGAAATGGATCTAGAAGAGGAAGAGAAGGTTATACTAATTGATTGGGCTTGTGATTGCTATTCAAGAGGTACTTTTGATCCCTTGGTTGAAGATGACAAGGAGGCATTCGATGACAAAAAGAACATGATGAAGTTGGTGATGATTTCCATTTGGTGCATTCAAGAGGATCCAATTCTTAGACCAACCATGAAAAAAGTGACACAGATGCTTGAAGGTGTTGTAGAAGTCGAACCTCCACCATTCCCCTCACAATTTAGTAGACATTCTCAAAATCCATGA


Promoter Sequence:
>Vu_27376::LG7:27442466-27444466(-)
CTCACACAAAAGCTAATAATCAATTTCATTTCTAAGATAATATTATCTTTTAATAAATTAAAAAAATATTATTAGAAATAAATTTTATGTTAGCACGGTAATTATATATTTATTAAAAGTATTAAAGTATAAATATTTTTAGATAATATTGTATGTTGACACGGTCAATTCAAAAGTATTAAAGTAATTATTAGAAACAAATCCATACATTTATTGAATGTTAAGTATAGATAGTTCCAAAAAAGTTTTAGAAGTACTCATCTAAGTACAAGACATCATTAAAAATTATTTACATCCCTATAATGACCCACCTTACTTTATACTCCAAAATAAGTATTAAAAATAAATAAAATTATCCAGAAAGTTATGTCAACCTAACTTTGATAGACTAACATTAACATTATTATATTATCTATGAGATTGATATTTTTACATTTAAAAAATAAGCACAATTTTTTCAATCGGCAAAGAAAATATTATATAAACTGGTACTTGAATAGAAAAGTTACAATATTATCCAAACAATAAACAAACACAAGAAAATATAGAATTATTATTATCTTTTACAATATTTTCAAAATAATTCACAGATTTCTTCCATACCCCTCTTTATTTTTCCACATCTAAGTGGGCCATTTTAATAAAGGAAAGCTTGGTGGAAGGGTTAATATTGACCAGCTTGGTAGGTATATATAGACTCACAAATTCAACCAATCAAACTTTTTTTTTCTTTTTTCTCAAAAATTTGAGAAAAATATTTTTTTAAATGAAAAAAAAAGAAAATTTTAACGAAGAGATCACGTTATTCTTTGATTTGATTTTTGATTAAAAATATATCTAAACTAATATAAAAATTAAATTAAAGCAAGCTAAAACATTAAAAAAGTGTTATGGTTTTACCAAACAAATGATAACGTTCACATCTACTAATTAACACTAACTAGACATTTAAGTGGCTACATTTTTTAACATACACTAATTCATACTATGCACACATAAAATTGTTTTTTCTAACTAAATAATGATTAACTCTATAAAAGTTAAGTTAAATAAGAGCATGTTCAAACCAACTTCTAATAAGATTTTCCATATAGTTTTTTGAATTTGTATTGTTAAATAGTAGACAAACTAATTTTTATTTACAGAGTTTTTTTTTTCTTTCTAAAACTTTTTTTATAAAAAGCTTGTTTAAATGGGTTCTAAAACCATGTTTGAAATACTTTTTTCTACGAATTAAAATTATTTAATTTATAAAATAAACCATAGAAACTATTTCGTATTAGCATCTCTCACTTCTTTTTTTCAACTCATAAGATGTTTATTTTTTAAAATTTTCCTCTAAATTTTTATGAAGATACCCTAAATGACTTGTGGACATTGCATGTAATCTTGAGGATGGAACGCATATACCTAATTCTGTTTTATAATAAAATAAAATATTAAACCTTAAAATTCATGGCTGCATAGACTTGTGTACTTTTGGGTCTTTGCCCTTGTGCTAGCCAAGCAAATGAAATAGACTTTTTCACTTTCAAAGACGTGTCCAATCCATTGATAATAAATGAGAAAATCACAATCATGACATTTAATATTTTTTATTATATGACATTATTTTAAGAAGTTTTTGTAATATTTTTTTCAATGCTCTTCATAAAATTTTATATTTTTAATATCTTTTGAATTTATTGAATAAAGAATTACTTTTAAGACACAGAATTTAATATTTTTAATTACTTTTAAGACTAATGTGAAACGAAGTTGTGGACAAAGTGGAACACTTGGAGAATTCAATGGAAAGAAAAAGTGAAAGCAATAATAGTCTGTCCTATTACTTCATTCGTGTTGGATACGTTCTAGATTTGGTTCATATAGAAGAATGAATTACGAGTTTAAGAAAAACATTGCATGATTTACATAAACAAAATCTCAATGAACATATGATCCAATTAGTATTCTAGCTCGTCATGGTTTCACCTATATTTGCCTTTCTTCTTTGCTCA


Gene Sequence:
>Vu_27376(-)
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