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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_27352 LG7 27110583 27111359 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 27110652 synonymous_variant p.Ser236Ser
A/T 27110711 missense_variant p.Ser217Thr
G/A 27111115 missense_variant p.Ser82Leu
G/T 27111165 synonymous_variant p.Thr65Thr
C/T 27111180 synonymous_variant p.Val60Val
G/T 27111234 missense_variant p.Asp42Glu
C/T 27111332 missense_variant p.Val10Ile
G/C 27111347 missense_variant p.Gln5Glu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_27352.1
MEEHQEKTIVTKFVKSKFFFPKVIRISATDQNATDSSSEEDDEERNLHRVKKVVSEIRIVHANKTKGHNKNINNNTDCCCCSAKYNKTMEQHYQQEKSEPKFRGVRQRPWGRWAAEIRDPFQRKRVWLGTFDTAEEAAMVYDRAAISFRGVDAVTNLIKPPLKECESVVKPKSCCACASPTSVLLFQPWMEPLSLEETFKEEMFDGLNYEVDSLLFSDHALYEQPLPTMLSNVDVSLDEDLESCKWDVDSFFSDETFE*


CDS Sequence:
>Vu_27352.1
ATGGAAGAGCACCAAGAGAAAACCATCGTCACCAAGTTCGTGAAATCTAAATTTTTCTTTCCCAAAGTTATTCGCATTTCAGCAACGGATCAGAACGCCACAGACTCCTCTAGCGAAGAAGACGACGAAGAAAGGAACCTTCACAGAGTTAAGAAGGTGGTTAGTGAGATAAGAATTGTGCATGCAAACAAAACCAAAGGACACAACAAAAACATCAACAATAATACTGATTGTTGTTGTTGTTCGGCCAAATACAACAAAACTATGGAACAACACTACCAACAAGAAAAATCAGAGCCCAAGTTTCGCGGCGTGCGGCAACGGCCATGGGGACGGTGGGCCGCCGAGATAAGAGACCCTTTCCAGCGGAAGCGAGTGTGGCTTGGAACCTTCGACACGGCGGAAGAAGCTGCTATGGTTTACGACAGAGCTGCTATAAGCTTCAGAGGTGTTGATGCTGTCACGAATCTCATCAAACCGCCTCTGAAAGAGTGTGAAAGTGTTGTTAAACCGAAGAGTTGTTGTGCATGCGCTTCACCAACTTCTGTTCTGTTGTTTCAGCCTTGGATGGAACCTTTGTCTTTGGAAGAAACCTTCAAAGAAGAAATGTTTGATGGGTTAAACTATGAAGTTGATAGTTTATTGTTTTCTGATCATGCTCTTTATGAGCAACCTCTTCCTACTATGTTGTCTAACGTTGATGTTTCTTTGGATGAGGATCTTGAATCATGTAAATGGGATGTAGATAGTTTTTTCAGTGATGAAACTTTTGAATAA


Promoter Sequence:
>Vu_27352::LG7:27111359-27113359(-)
ATGAAGTCTGACAGAAAATATTAACAATTTAACTTTAATCTAATTTGAATAGTTTTCCTTGTAGTTTTGGAGAAATGAATTTCTAAAGTTAACTAACAATAAATAAAATACTTTAATTCTAACAAATATTTCATTCTAAAATACATGGTGAAAACGTGAAACTTAAACTTTCAATAATATTTATAATTTTCAAATATATATGAAATTTGTTGGTGAAATCTAAATCATTTTGTCATTATCCTTTAATTTTTTTCAGAATTTTTTTTAGAAAGAATGATATTTTTATTACATAGAAAATAGTTATAAGTTTAAATTTTTTTCACTTATTTAAAAATACATATTTCTATCAATAGTTAAATTAAATATTAATTAAAATTGAACCTTAAAAAAGTTTACTAAAAGTTGTAAAGAATTTTTATAAATAATGTAAGACGGAAAAATCCACACAATAAATTATCACCTGTTATCATTTGTCTTTAAACGAAAAATTATTTTTTCTTACTATTAATACTGTTAAAAATATATTCATTTATGTACATCACCATCCGTTCACTTTTATTTAATGATAATAAAAAGATAAAAAATTAATTTTTAATTATTATTAAAATAAAAATATTATTAAAATTTAGAAAAAAATATTCTTAAAAGATATTTTAAAAAATAAATACAAAATTTAAAGATTAAAATAATTTATATTAATAAAAATAAAATCAATAATAAGATATATACAATAAAAAATATTATCTAACAGTTACTAAAACATAGTTATATATAAAATATTTTTTTTAACTTAGACGTTTATATTTGTATTTTTCCTTTTTTTATAAAGATAATTAAAAGTGATTATATATATTTTTATTTGTGCTTTCTTGCCTCATAAAGATAATTAACAAAAATTGTATTATGTAATTACTCCCTTATAGATACTTTCTATCCCTTTTATCTTGAACAAAAAAAAATTATAAAAATTAGTAAAAAAAAATGCATAACTATGTTATTCCACCAAATAATTTTTTAAATATATATTTTTAATTACAACTCCAAGTTATAATATTATTAGAATTAATTATTTTATTTAAGTTATTGATCTCTTTATATTTTAAAGCTCTTTCACATATTAAAGAAAACATATTTAAATTATCTTTTTAAAATTAAATTTCAAACATTTAAAAATATTACATATATGAAAATATTTTATTATAATAAAATAACCATTGATACTACAAAGCGACTATGTGTTTCCAATTATTATTTTATCATTAAAGCAACGGACCATTCAGTTTTCTTTGCTTGATCCCGAGATCAAACCATATAATAGTGTGCAGACACACCATCGATCAAAGAAAAACTTTGACACAGTCTTACACTTATTTAACATATTTTTTTCACTTTTTTATTATAAAAGCATTTTCCATTAAAAAAAGCAAGTTTTTCTTATATATGTCTCAATTTAACTTATTCTTATATAAATAAATTAAGTTAACCTAAGTCAAACATAAAGATTATTAACCTATTTTTCTAATATTATATATTATAATCCATTTAAGGTAACATAATGGTATTTCACTGATTTTAAAATCATTAATTTTCTAAACAGAAAAATAATTAGCTTTAAAAATAGTCTTTGAAAGAAATTGATGATGACACAGAGAACAAGGGTGACTGAGTTCCTTGATGACCAAGGAAGCTTGTTACTTGTATCTCAAGGACTCGCAATAATTGAATTCTTTAATTATTAAAAGAGGAAATGTTGTATTTCCTTCTATTAAAATCTCCTTACAAATTCTCTGTTACTTTACATATATTAAATAAAATAAATAAATAGACTTACAAATATAAAATTCATTCTTCCACACTTTCCATAAAAAAAATTCTGAAAATTAATATTAATATTTAAGGAAAAAGAAAGTGAAAATAGAAACAAAACATGCTATAAAACAACCATTCTTTTCCAAAAGAACATTCTCAGAAAAGAAGAATCCTTTGTCTTTCTTGTTGCC


Gene Sequence:
>Vu_27352(-)
ATGGAAGAGCACCAAGAGAAAACCATCGTCACCAAGTTCGTGAAATCTAAATTTTTCTTTCCCAAAGTTATTCGCATTTCAGCAACGGATCAGAACGCCACAGACTCCTCTAGCGAAGAAGACGACGAAGAAAGGAACCTTCACAGAGTTAAGAAGGTGGTTAGTGAGATAAGAATTGTGCATGCAAACAAAACCAAAGGACACAACAAAAACATCAACAATAATACTGATTGTTGTTGTTGTTCGGCCAAATACAACAAAACTATGGAACAACACTACCAACAAGAAAAATCAGAGCCCAAGTTTCGCGGCGTGCGGCAACGGCCATGGGGACGGTGGGCCGCCGAGATAAGAGACCCTTTCCAGCGGAAGCGAGTGTGGCTTGGAACCTTCGACACGGCGGAAGAAGCTGCTATGGTTTACGACAGAGCTGCTATAAGCTTCAGAGGTGTTGATGCTGTCACGAATCTCATCAAACCGCCTCTGAAAGAGTGTGAAAGTGTTGTTAAACCGAAGAGTTGTTGTGCATGCGCTTCACCAACTTCTGTTCTGTTGTTTCAGCCTTGGATGGAACCTTTGTCTTTGGAAGAAACCTTCAAAGAAGAAATGTTTGATGGGTTAAACTATGAAGTTGATAGTTTATTGTTTTCTGATCATGCTCTTTATGAGCAACCTCTTCCTACTATGTTGTCTAACGTTGATGTTTCTTTGGATGAGGATCTTGAATCATGTAAATGGGATGTAGATAGTTTTTTCAGTGATGAAACTTTTGAATAA

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