Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_27189 LG7 25268167 25268802 PREDICTED: ethylene-responsive transcription factor 13-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 25268204 missense_variant p.Pro13Leu
G/T 25268526 missense_variant p.Arg120Ser
G/T 25268555 missense_variant p.Arg130Ile
A/T 25268625 synonymous_variant p.Ala153Ala

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_27189.1
MNPHASNTHLNAPHLSELPATMPFQDASAVLGRTSSFRSIFSAENWAELPLKEDDADDMVIYGALLEAAATTGWFPANGSGVSKVPVKKENGGESSGTKGESGTHAPPVKGLSYRGVRRRPWGKFAAEIRDAKRNGVRVWLGTYETAEDAALAYDRAAFRMHGSKAKLNFPHLIGSDEAEPIRVTSKKRSLNVLPLVTAKRSKDNSLVIRR*


CDS Sequence:
>Vu_27189.1
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Promoter Sequence:
>Vu_27189::LG7:25266167-25268167(+)
TTCATCTTACAATATAACCACCTATAATATAACATCCCCACCACTCAATACATTACTTCACTAATAATAATATGTCAACAAATTATTAAAAAAATTCTAACAAATTTAAAATAAAAGTAAAAGCAAAAACCTAAAAATAAGAAAAAAAAATTAAAGAAGTAATAAAATTTTGAAATGTAGTAAAGGTAGTAATCAGATTTGGAAATCGGCTGAAGTAAGTAATTAGATTTCGAAATCCATTTAAGAAAGCTATCAAAATTCAAAATCAGGTTAAGATTTCACTAAATTATGAAATCCAACATATATCTTAATCGAATCTTAAAATCTAATTATTTCCTTAATCAAATTTCGAAATATAATGGTTCTCTTAATAAGATTAAAATCTAGTGGTTTCCTAAACCAGATTCTAAAATCCGATTAGTTTTAAAATTTACTAATTTTTCTAATCGAAATTTAATAAATTTCTGAATTTCCAATTTTGATGTGGTGGTTTCCTAAATCATATTTTAAAATTCGATTAGTTTTAAAATTTATTAATTTTCCTAATCGAATTTTAAAATCCAAAAAATTTCTTAATTGAATTTCCAATTTTGGTGACATTTTAAATCAGATGTTAACATCCGATTTGCTTCGTAACAGTTCGAAATGAAGCTTAAGTAAAAAAATCTTAAATAAACACTTATATCTAATGTCAAATCAAGAAGATGAATAGACTATCTTGCACCATCAACAAAACTTAAGAATGCAAGATGCCGTGAATATATAACTCAAGATAAGATAGTAACACTATTTAAGTGCTTAAATTTAAGTGTTTAAAGTGATATTAACACCTTTACAATATATTAGTATTCACAACAAGAAAATCAGAAATAAATTATAAAAACAAAAAAAAATAACTAGTCACTATAATAATTAATTTTAACATTAATTTATAACCTAAAAATAATTATAATTTAAAATAAATTTTATTATGAATAAAAATTTATAATTAATTTGTAAATTAAAATATACAATAATAAAATGATAATTTGTTTGTGAATTAGAATCTAAACTGATATTTAATATTAACCACCAGTATTTTAACTATAAAAAGAATTACACTAATTTAAACACTTAAGCATATCCAGAATAACAATAAAAATATTTAAGCAAAATGCCTACACACTCATTCAAAGTATTCGTAATTTTAAGCTAGACAAGTATCTCACTTTTAATAACAATTATCTCACATCAAGCACGTATGCTTTTTATAAGTAATGTAATTTTTAGCTTTTTAGAAGGTATTAGACTCCTAATACTTATGGTTTTTTCATTTGTTAAATTAAGTATGTGACCATCATGCTTTTTCCAGAACTTGCAACCTATTGAAAATTGGATCTTCGTATTAGTTTGTTTGAAAATATTAAGTAGATTCTATATTTTATTAGTCTCAAATACATTCTCAATTTTGAAAATACATACAATTTGATCATTTTCATTAGTATTATATCAACTATGGTAATTCATGTGCCATACATAATTTTTTACTTTTTAAAAAAATATACTTTTTAAAATTTAAATAAAAAACTATCATATAGAAATGTGAATACAGGATTTTATATATAAGAGAATTTCAGAAAAATAGAAGGCAAAATTGGAATCACGATACATTGTGTATGAGAAAAAGAAGTTAAATAGCAGACACGTTGAGCTTGGGAGACATTGTTACTTTAAAAACTAGCAAAATGATTTGACATTCCTCACTTCCAACTCTCAAATCTGACCAATCTTCTAAGACAAATGTGAAAACAACAAAAAATAAAGTGAAGATTTTCCCACGTGGGACAAACCCTAATTCACATGCTAAATTAAGAACCTTCACGGAACCACCACATAGTCCACAGTTCAATTGAATATTATTACTGGTTCGCACAACCTTGTCATATATAACACGACACAACACTCACAAGTCGCAAACCACACAACCTACGAAACTATCGAAACATCACACTTGTACACGA


Gene Sequence:
>Vu_27189(+)
ATGAACCCTCATGCTTCAAACACCCACTTGAATGCCCCTCATCTCTCCGAGCTCCCTGCAACGATGCCGTTTCAGGATGCGTCGGCGGTGCTCGGCCGTACCTCCAGCTTCCGGAGCATTTTCTCCGCCGAGAACTGGGCGGAGCTGCCGCTGAAGGAGGACGACGCTGACGACATGGTTATCTACGGCGCTCTGCTTGAGGCCGCCGCCACCACCGGATGGTTCCCGGCAAATGGCAGTGGGGTGAGCAAAGTACCAGTTAAAAAGGAAAATGGGGGTGAAAGCAGTGGCACCAAAGGCGAGAGTGGAACTCACGCGCCTCCGGTGAAGGGGTTGAGCTACCGAGGCGTGCGGAGGAGGCCGTGGGGAAAGTTTGCGGCGGAGATAAGAGATGCTAAGAGGAATGGTGTGAGAGTGTGGCTTGGAACCTATGAAACTGCTGAGGACGCAGCTTTGGCATATGATCGAGCTGCGTTTCGAATGCATGGCTCCAAAGCAAAGCTCAATTTTCCACATTTGATTGGTTCGGATGAAGCCGAACCGATTAGGGTTACATCAAAGAAACGTTCGTTGAATGTTTTACCGTTGGTGACTGCAAAACGGAGTAAAGATAATTCTTTGGTTATTCGGAGATGA