Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_27129 LG7 24709264 24711562 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 24709479 stop_gained p.Trp72*
G/T 24710303 upstream_gene_variant
C/T 24710328 upstream_gene_variant
T/C 24710380 upstream_gene_variant
T/C 24710384 upstream_gene_variant
G/A 24710507 upstream_gene_variant
C/T 24710551 upstream_gene_variant
T/C 24710594 upstream_gene_variant
G/A 24710615 upstream_gene_variant
T/A 24710687 upstream_gene_variant
T/A 24710688 upstream_gene_variant
G/A 24710691 upstream_gene_variant
G/T 24711256 upstream_gene_variant
C/G 24711515 stop_gained p.Ser343*
T/A 24711532 missense_variant p.Ser349Thr
T/G 24711535 missense_variant p.Ser350Ala
G/T 24711557 missense_variant p.Arg357Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_27129.1
MNFGDTTNTFTLTTTPTKQETSNNILSYSSCLQPTNLLPTPNSIHITTPPPDSYAAAHRRQLYAREGSHVHWDPHLTCLHLGKRHYFEDVTIDDVSKYNNNGNSVATLGKPHVCRVGGGVVISGSRHVGADDGDITLGNRHVYGGDGGAGYFLQGNDKRARGCHGGAAGGGGGGGSVKTAALGMVPRCQVEGCHVALVNAKEYHRRHRVCDMHSKAPKVVVLGLEQRFCQQCSRFHLVSEFDDSKRSCRRRLAGHNERRRKSSHLSVTRSSRQGCALSLLSFESSDNWWSHSDLSTRCSAALRELIAENRAALITRQQQQHVYVVPHHDDDALDELEFVEIQPQSNYFPHHMFSQTQE*


CDS Sequence:
>Vu_27129.1
ATGAACTTTGGAGACACCACCAACACCTTCACCCTCACCACCACCCCCACAAAACAGGAAACCAGTAACAACATTCTTTCCTACTCATCATGCCTACAACCTACTAATCTTCTTCCTACTCCTAATTCTATCCACATCACCACGCCGCCACCGGACAGTTACGCCGCCGCTCACCGCCGCCAACTATACGCCAGAGAAGGGTCTCACGTGCACTGGGACCCTCACCTCACGTGCTTGCATCTTGGTAAGAGACATTACTTTGAGGATGTTACCATCGATGATGTTAGTAAATATAATAATAATGGTAATAGTGTTGCCACTCTGGGGAAACCACACGTGTGCCGCGTTGGTGGTGGTGTTGTTATTTCGGGGAGCCGACACGTGGGCGCTGACGATGGTGATATCACACTGGGGAATCGACACGTGTACGGCGGTGATGGTGGTGCTGGTTACTTTTTACAGGGCAACGATAAGAGAGCGCGGGGGTGTCATGGAGGAGCTGCCGGTGGGGGTGGCGGTGGCGGGAGCGTGAAAACGGCGGCGTTAGGGATGGTTCCGAGGTGTCAGGTGGAGGGGTGCCACGTGGCGTTGGTGAATGCGAAAGAGTACCATAGGAGACATAGAGTTTGTGATATGCATTCGAAGGCACCCAAAGTTGTGGTGTTGGGTTTGGAGCAGAGATTCTGTCAGCAGTGTAGCAGGTTTCATCTGGTATCAGAGTTTGACGACTCAAAGAGAAGTTGCAGGAGAAGATTAGCAGGCCATAACGAAAGAAGAAGAAAAAGCTCTCACCTTTCTGTTACCAGAAGTTCTAGACAAGGGTGTGCTCTCTCTCTTCTGTCATTTGAGAGCAGTGATAATTGGTGGTCTCATTCTGATCTCTCCACAAGATGCAGTGCAGCATTGCGTGAACTCATAGCAGAAAACCGTGCTGCCCTAATCACAAGACAACAACAGCAACATGTTTATGTTGTGCCCCACCATGATGATGATGCACTGGATGAACTAGAGTTTGTGGAGATACAACCTCAGTCCAATTATTTTCCTCATCACATGTTTTCCCAGACACAAGAATAA


Promoter Sequence:
>Vu_27129::LG7:24707264-24709264(+)
ACAGATGTGCATGGTAGCACTAGAGTCTACCACCCAATTACTCACATTGGTCATAGATTTATTTATGAAATAATTGCAACAATAATATCTTTCCCTTCAACTATATTTGTGTTAGGAAGATTGTCGTTTCTTACTCTACGACTACATTGAGTTGTATGATGACCTGACTTTCCACATATAAAGCAATTTCCTCCTTTTTTAAGGTGTCGTTAGATCCATTGGGATGAGAAGTTCAAAAATTATTTTTCCTTTTATAATCAGGTTTGTTCTTGTACCTTTTTTAAGCAGGTTTCTCTTCTACTATATTTGCTTTTGTAGATAATGCTTTGGTCCTTGTAGTAGAACACTACTTCCTTTTGGTATCTTCGATTATGATGTATGTAATAAGATATGGAAGCAACATCTGCATGTGTCTATGTTTCAATTGTTATTTGTAGTTAGTCTAGGATGAAGGTAGTTTCTCGATTAAAAGTTCTGAAACAAACTCATAAGGCAGAATTATGTTCTCTACTTTGATATCTTCAAGGAGCTTGTGATATTGGTTGATTTAGATCTTAATCTTTAATTATCTCTTGATAGTAGTAATTTCTTATGATGAATCTTTGTTGAATGATGTCTTCAATACTATATTTGAGAATCAACGAATCTCAAATCTCTTTCGCTTTCTTATATGAGTAGTACACATCGAACAAGTAATTAACCAAGACATTAAGTAAGGTATGTTGGCATATCTTGTTCGCAACAGTCTAGTCTTCAACGTGTTTTGTAAGGATACTAAACTCAAGTTTTGAAGATGTGAGAGCGGAACCAATTTCATAAGTGTGTCTAAAAGGATAGAGCCACATTTCTTTTAATGTCAGAAGTTCTGTTCAAAGAAGAAATCACTTTTTGACATATCTAAAAATAGTTTTTGAGCTCCAAAAACAATGTTTTGAGTTTTTAAATTTGGATTGTAGTTGATATCAACCATAGATCCTTAATATTATTGTTAAAACTTATTAAATTAGATTTTTTGAATTGTGTAAATCTATTGTTCTTATGGACTTGTAATTTTTAAAAATCTCAAAAATAGAAAAAAAAAGGAACTTTGAAAAACAATAGATAACTAAATCCAGGTAAAGAAAGATAAAAGAGGAGATAAGAGAATGAAAGGGGAAGAGAAGAAGTGTGAATTGTGTTGTATATTTATGGAGGAAGCAAAAGATCTATTTATAATGGTAACAAGCTAAATGTTTCCTTAGCTCCTGCGGAGGAGGTAGCAAAAGTTTATCGATTCCCATGTCATCTAAAACCACTCCATTATTGCAGGACAATACGTGTCTTTATCCTTTGAAGACGATGGATATATTTGTACGCAAAAGCCCACGAAGATCTCGTTCTATAAGTTTTGGGATTTTATACTTTACAATATATAATACCTTATAAAATTAAACTATAATTATATTTCTTAAAATATATTTTAAAGATTTGCATAAAAGAAAATATAAAAATGAAGCGAAAAAGATTTTTATGAATTCAAAATATTGCAAATATTGGATATTGCTTAAACTCATGTTTCACATCTCCATCAAACAAAATATTAAGTATTATTTTGTGATTGATTCAAAAATTATTTCACAGTTAATAATAATAATCATAAACACTAACGTTAATAATAATAATTATAAACACTAACATAGACACATTAATGATGTTAAAATGTTGTCAATTATAAGTATTATTATTTAATAATATATATATATATATATATATATAAATAATTGAGTACTGTGTATTTCTGAGTGAGTGAGTAGCTTTGCAGCCTAAATCCTGACCCCATTGAAGCATAACTCACCTTACAAATCAAGCAACCTAACCTACTCACCATCACCTTACTCTTTCTTTCCTCTTTTGCCCCAAACAACCAAACACACTCTTTTTTCACATCACACATTCCTCTTTTCCTCATCACAAATTCTCTCTCCCTTTTCATCTTTTTCTTCACACAAACAAAAAAAAAA


Gene Sequence:
>Vu_27129(+)
ATGAACTTTGGAGACACCACCAACACCTTCACCCTCACCACCACCCCCACAAAACAGGAAACCAGTAACAACATTCTTTCCTACTCATCATGCCTACAACCTACTAATCTTCTTCCTACTCCTAATTCTATCCACATCACCACGCCGCCACCGGACAGTTACGCCGCCGCTCACCGCCGCCAACTATACGCCAGAGAAGGGTCTCACGTGCACTGGGACCCTCACCTCACGTGCTTGCATCTTGGTAAGAGACATTACTTTGAGGATGTTACCATCGATGATGTTAGTAAATATAATAATAATGGTAATAGTGTTGCCACTCTGGGGAAACCACACGTGTGCCGCGTTGGTGGTGGTGTTGTTATTTCGGGGAGCCGACACGTGGGCGCTGACGATGGTGATATCACACTGGGGAATCGACACGTGTACGGCGGTGATGGTGGTGCTGGTTACTTTTTACAGGGCAACGATAAGAGAGCGCGGGGGTGTCATGGAGGAGCTGCCGGTGGGGGTGGCGGTGGCGGGAGCGTGAAAACGGCGGCGTTAGGGATGGTTCCGAGGTGTCAGGTGGAGGGGTGCCACGTGGCGTTGGTGAATGCGAAAGAGTACCATAGGAGACATAGAGTTTGTGATATGCATTCGAAGGCACCCAAAGTTGTGGTGTTGGGTTTGGAGCAGAGATTCTGTCAGCAGTGTAGCAGGTAACTTTATCATCGTCTTTTTCTTTTTTATTTTTTTATTTTCAGATTAAATTCATGCATAAGCTTTTAGTATTTTTTTATATAATTTTTATAAATAAAGATTAGAGTTTTGCTTTCTTTCACCTGAGTAAAATATTAAACAGTTAATTAATTTATACCGAATAAAATGGTTAATTATTTTCGATTAATTGTGAGCTTTAATTTAGTCCCCTTGAATAAAAAATGGAAATTTTCATTTAGTATATGATGTTGATTTTATTATTAAGATATAGGGTTAAATATGTTTTTAGTCCCTAAACTATTGGTCGTTTCTGGTTTTCATTCCTCTTTCAAAGTAAGGTACAATTTGGTCCTCATTCTTTTCGAAACGTTCGTTTTAGTCCTCGAAATTTTGGTTTTAGTCCTCATTTGTTGCTAAATGAGGACCAAATTTTTAAACAGTGTTTAGTTTTTGAGAACTAAAACGAACGTTTAGAAAAGAATGAGGACCAAATTTTTAAACAGTGTTTAGTTTTTGAGAACTAAAACGAACGTTTAGAAAAGAATGAGGACCAAATTATACCTTACTTTGAAAGAGAACCAAAACCAGAAACGGCCAATAGTTTAGGAACTAAAAACATATTTAACCCTAAGATATATAATACTAAAAAGTTAAATTTCACTCTCACATTTACACAAAATTGTAACGTTATGGAATTTACTTTTGTGTGTTTTTTTAAATATTTAGTGACTAAATCAGATTTTAAACAAATGTTACCATTTTAATTTGTTTTAGAGCTCAAAATGGTTGATTATCTAATTATTTGTAATCAATTATCTTTGATTGACCTAAATTACGTTAATGATGTTTACAAAATGTAGGTTTCATCTGGTATCAGAGTTTGACGACTCAAAGAGAAGTTGCAGGAGAAGATTAGCAGGCCATAACGAAAGAAGAAGAAAAAGCTCTCACCTTTCTGTTACCAGAAGTTCTAGACAAGGTAAAAACAACACATTACATTATATTTCTCAGTTAACTAACATAAAACTGAAGTTTAATGATGGTAGTTGAGCTATGACATTAAGCTGGTTTATTTTAATATCAGTTTGTATGGTAAAAGTGTGATACATGATGAATTGAGAAGCTACGTATCAGAAAACATAAAAGTTGAACGAAGCCGATACAAACAGAAGCAGCCAATAAGATGGATAGGTTTTGACCTCAATGATTTTGTGGTAACTTGAATGAAAATTAAGATGATCCTAACATGAAATTTGCCTTTTGTTGATTTGACATGGTATGTTCCTATGGGAAGAACAAAATGTGATGGTTGGAGGGTTGTGAATGATGTTATTATGCAGGGTGTGCTCTCTCTCTTCTGTCATTTGAGAGCAGTGATAATTGGTGGTCTCATTCTGATCTCTCCACAAGATGCAGTGCAGCATTGCGTGAACTCATAGCAGAAAACCGTGCTGCCCTAATCACAAGACAACAACAGCAACATGTTTATGTTGTGCCCCACCATGATGATGATGCACTGGATGAACTAGAGTTTGTGGAGATACAACCTCAGTCCAATTATTTTCCTCATCACATGTTTTCCCAGACACAAGAATAA