Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_27019 LG7 23100498 23103095 disease resistance protein RPM1
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 23100684 stop_lost p.Ter620Leuext*?
T/C 23101037 synonymous_variant p.Pro502Pro
G/A 23101038 missense_variant p.Pro502Leu
C/T 23101046 missense_variant p.Met499Ile
A/T 23101972 intron_variant
A/C 23102243 intron_variant
T/G 23102303 splice_region_variant&intron_variant
A/T 23102331 synonymous_variant p.Pro255Pro
G/A 23102333 missense_variant p.Pro255Ser
T/C 23102342 missense_variant p.Asn252Asp
A/G 23102346 synonymous_variant p.Asp250Asp
T/C 23102350 missense_variant p.Asn249Ser
G/A 23102361 synonymous_variant p.Ile245Ile
A/G 23102371 missense_variant p.Ile242Thr
A/C 23102376 synonymous_variant p.Leu240Leu
A/C 23102432 missense_variant p.Cys222Gly
G/A 23102439 synonymous_variant p.Ile219Ile
A/C 23102469 synonymous_variant p.Leu209Leu
T/C 23102472 synonymous_variant p.Thr208Thr
G/A 23102487 synonymous_variant p.Gly203Gly
A/G 23102661 synonymous_variant p.Ile145Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_27019.1
MAELFLFSIAESLITKLASHAFQEAYRVVGLYHDLRNLRKTLSLVKAVLLDAQQKQDHNHQLREWLTHLKTVFSEAEDVLDEFECQTLQNKVVKAHGNTKDKVSNFFSTSNPLLFRYKMTQQIKYINKRLDKVAAHRHKFSLQIIDVDTRVVYRRDMTHSRVSDSDVIGRKNDKEKMIELLMQQNPNDDDTSLSVIPIVGIGGLGKTTLAKFVFNDNRIQECFPLKMWVCVSDDFDIKQLIIKIINSANDENVPPHQQNLNIYEIAAIWGSLGLIALPKTNRTLEDVANQYLHELLSRSFLQDFENFGNKFRFRIHDLVHDLALFVASDECLHVSFKIQNIPDNVRHLSFAESSLFRNFVTKKSTLVRSVLFSNGAAAAIDEALLNTCLTKFKCLRVLDLRGSTCKTLPRAIAKMKHLRYLDISENLNIRRLPDSICKLQSLQVLSIKRCMKLEILPKGLRKLISIRSLEFSTKQTILPVNEIAQLGSLEFLSIESCHNVESIFGGVRFPSLKTLCVGDCQSLKSLSLDGQNFPELETLLVKDCGNLDLELCKGHHEEESPKLKLKLVLFFGLSQMVALPKWLQEASKSLQRLYVLNCDNIETLPDWLTTLTDLKALGLINCPNLVSLADNIHHHTALESLRIEGCANLYKKYEPNVGEFWPKISHIKNIVIDEPEELKKN*


CDS Sequence:
>Vu_27019.1
ATGGCCGAATTATTTCTCTTCAGCATAGCAGAGTCACTCATAACAAAGCTTGCTTCTCATGCTTTTCAAGAAGCTTATCGAGTGGTGGGTTTATACCACGATCTTCGAAACCTTAGAAAGACTCTCTCTTTAGTCAAGGCTGTTCTGTTAGATGCTCAGCAAAAGCAAGATCACAACCATCAACTCCGCGAATGGCTCACTCACCTTAAAACTGTCTTCTCCGAAGCCGAAGATGTTTTGGATGAATTTGAGTGTCAAACACTGCAAAACAAAGTGGTCAAAGCTCATGGTAACACCAAAGACAAGGTAAGTAACTTCTTCTCCACTTCTAATCCACTTCTTTTTCGCTACAAGATGACACAACAAATTAAATATATCAACAAAAGACTAGACAAGGTTGCAGCGCATAGGCATAAGTTTAGTCTTCAAATAATTGATGTTGACACACGTGTTGTTTATCGGAGAGATATGACACACTCTCGTGTGAGTGATTCAGATGTGATTGGAAGGAAAAACGATAAAGAAAAGATGATAGAACTTTTGATGCAGCAGAATCCTAATGATGATGATACAAGTCTGTCTGTTATCCCCATTGTGGGGATTGGAGGCTTGGGAAAGACTACACTTGCAAAGTTTGTGTTCAATGACAACAGGATCCAGGAGTGCTTCCCATTGAAGATGTGGGTGTGTGTTTCTGATGACTTTGACATTAAGCAACTTATTATCAAAATCATCAATTCTGCCAATGATGAAAATGTTCCTCCTCACCAACAGAATTTGAACATTTATGAAATAGCTGCGATTTGGGGATCACTTGGACTCATTGCACTACCAAAAACAAATAGGACACTTGAAGATGTGGCCAATCAATATTTGCATGAACTCCTGTCAAGATCCTTTCTCCAAGATTTTGAAAACTTTGGCAATAAGTTTAGGTTTAGAATACATGATTTGGTGCATGATCTCGCCCTATTTGTTGCGTCGGATGAGTGTCTACATGTGAGTTTCAAAATTCAAAATATTCCAGATAATGTTCGACATCTGTCTTTTGCCGAAAGCAGTTTGTTCAGAAATTTTGTCACCAAAAAATCAACACTTGTGAGATCCGTACTGTTTTCAAATGGTGCAGCAGCTGCCATCGATGAAGCTTTACTAAATACGTGTCTGACAAAGTTCAAATGCTTGCGAGTTTTGGATTTACGTGGTTCGACATGCAAGACTTTGCCCCGTGCCATTGCTAAGATGAAACATTTGAGATATTTGGACATTAGCGAAAATCTCAACATTAGGAGACTCCCAGACTCTATTTGCAAGCTCCAAAGTTTGCAAGTGTTGTCTATTAAGAGATGTATGAAGCTGGAAATATTGCCCAAAGGATTAAGAAAACTAATCAGTATCCGTTCTTTGGAGTTTAGTACAAAGCAAACTATTTTGCCTGTGAATGAGATCGCCCAATTGGGGTCGCTTGAATTCTTGAGCATTGAATCATGCCATAATGTGGAGTCCATCTTTGGAGGGGTGAGATTCCCTTCTCTTAAAACATTATGCGTTGGGGATTGTCAAAGTCTAAAGTCATTGTCTCTGGATGGTCAAAATTTTCCTGAATTAGAAACATTGCTTGTTAAGGACTGCGGTAACTTGGACTTGGAACTGTGTAAGGGCCACCATGAAGAAGAAAGCCCGAAGCTGAAGCTAAAACTTGTATTATTTTTCGGTTTATCACAGATGGTGGCCCTGCCTAAATGGCTTCAGGAAGCTAGCAAATCCTTGCAGCGCTTGTATGTTTTAAATTGTGACAATATTGAAACACTTCCAGATTGGTTAACAACTCTGACTGATCTCAAAGCACTTGGTTTAATAAATTGTCCAAATCTGGTATCTCTGGCAGATAACATTCATCACCACACTGCACTTGAAAGTTTGAGGATAGAAGGTTGTGCTAACTTATATAAAAAGTATGAACCCAATGTTGGAGAGTTTTGGCCCAAAATATCACACATCAAAAACATTGTGATTGATGAACCAGAAGAACTTAAGAAGAATTAG


Promoter Sequence:
>Vu_27019::LG7:23103095-23105095(-)
GTAATTAAGTTTTTGACACATAATAAATTTAGATTTTGATACATAATAAATTTAAATAAAGTTAATGTCAATGATCATATTGATTTTTAAATTATAACTCATAATAAAGGTGATGTTTTTTTCAATTTTGAATGTTGAAAATATGAAGAGAAAGAAAGGTTTTTCTAGTTGTAATATTCTTGTGTGTCACTTTTTTTAATTATTTGAGAGCATTGTTGTATGATTTTTCTTAACTTATTATAACTATTATTTTCCACTTGAAGATTTTGTGTACCTTTTCTCAATAATAAGAATTCTTGTATGTTTAAAATCTTTGTACAGTACATATGAAGATGCTTTTAGAAGGAAAAATAAAAATCTTAGTACCTTTTTCTTGGTTTTTTTTAAAAATTCTTGTACACATTCTTGCAAGTTGGAAGAATTTGTGTCCCTATATTTAATGCTCTATTATTTAATTGGTGTTTTGTTGCTTAAGTACATTACATCAGCACAATGTCTTAGTTAATGGAGTATTTATTTGGGCTTGATGGAGATTTTGGGCCTGTTTGAATTATGGAAGAAGATCAGTTGCTTCTTGCACCCCCTCAAATGTCTTCCTTCACCCATCAATTATGTGAGTTATTAAAATTAATCTTATGGTTATTTAATTTAAGCCTAATTTTTTTTTATCTCCATTTTTCTTCACTTTGGAGCTGCACCAATTCCACCCTCTATGCACAGTTTACAGTTGTGTTTTCTTCACCGTGACTTGCAGCAGTGCATTCTGTTGACAACACGTAGGTAAGACTTTTCTAATGGAGGAGGTGTAGGCATAAAATTCATATTCCGGAATTGGAAATAGAAAATATATTATTAGAAAACACTTTTCGAAATATTTTCCTCAAATAAACATTTTGGAACATATTTTCATAATATCATTTCTGAAAAAACACTCATCAATTTTATTACAAAATTAATTTTATGAATTTATACATTATTTCTCCGAAAACAACAATAAGAAAAATCATTTCTCACCCCTTCGTACCTTAATATATTCAACATGATCTTATCAATATGTGGTAAGATTCTAATTGTGATTTAATTATTTTTTTATGTAGAAAGAACTTGTTTTTGTTGAGACAAGAAATATCCATTAACAAAAGATTCTTTAATATATAAGTGAGAGTAAGATCAACATAAATATTTTTATTAAAATAATAGTTATTTAGAGAATAATAATGATATAATAAATAATAATAAAATAATAAATAATGATATAATCAAATTATAAAAAAAATTAAAAAAAATCTTATTGAATCATATTTTTTAACATGCATATTAAACTATATAAAAATACACGTCGTCCCCTTTGTGTCCATAAACATAACGAGAAAACTTTAAAGAAAATAAACATGGGTAAAATTAGAAATTCAAAAAATGATGATGTGTAGGTAAATAAAATTGCCTGAAAGAACATACAAAATGACTTCGTTGAATGGAACATTACGAAGTCAAATCCCTTGCAACGTCATTCTAGAAAAAGAATTTCGCTAAACGTGAAAGTGGGGCTCACAAAATTAACGTCGGTGATCCTATTTTCGAACGTCAAACATCCTCTTCCTCCATCCTCTTCCCATTTTACAGACATCACCCTCTGGATATCGAGCGTGAAGAGGATTGCGTTGAACGTAAAACGTCAGTTTACATGGTTTTCCAACTAGAAAAATGTATTTTTAACGACTTAACAACTTTTTTATAACAGTAATATTTAGTTTGTATTACTGTTACAAATGTACGTGCCAATAAAATATTATATCACCAACATTATTTGATATTGGAAAGGACCTTAAAAGTCAAAAAAAAACAGGAACCTTTTCTACACCACTATAAAAGTTTGTGGACAACTGCAAAAAGCCCAGATAATATCAAGATATTTCTCATTTGCCCTCTTATTTCTTTTTAACCGCTGCTGAAAATAATGCAACAAATGGAATAGTTGTCGTGTAGTTCTGGAAACAACT


Gene Sequence:
>Vu_27019(-)
ATGGCCGAATTATTTCTCTTCAGCATAGCAGAGTCACTCATAACAAAGCTTGCTTCTCATGCTTTTCAAGAAGCTTATCGAGTGGTGGGTTTATACCACGATCTTCGAAACCTTAGAAAGACTCTCTCTTTAGTCAAGGCTGTTCTGTTAGATGCTCAGCAAAAGCAAGATCACAACCATCAACTCCGCGAATGGCTCACTCACCTTAAAACTGTCTTCTCCGAAGCCGAAGATGTTTTGGATGAATTTGAGTGTCAAACACTGCAAAACAAAGTGGTCAAAGCTCATGGTAACACCAAAGACAAGGTAAGTAACTTCTTCTCCACTTCTAATCCACTTCTTTTTCGCTACAAGATGACACAACAAATTAAATATATCAACAAAAGACTAGACAAGGTTGCAGCGCATAGGCATAAGTTTAGTCTTCAAATAATTGATGTTGACACACGTGTTGTTTATCGGAGAGATATGACACACTCTCGTGTGAGTGATTCAGATGTGATTGGAAGGAAAAACGATAAAGAAAAGATGATAGAACTTTTGATGCAGCAGAATCCTAATGATGATGATACAAGTCTGTCTGTTATCCCCATTGTGGGGATTGGAGGCTTGGGAAAGACTACACTTGCAAAGTTTGTGTTCAATGACAACAGGATCCAGGAGTGCTTCCCATTGAAGATGTGGGTGTGTGTTTCTGATGACTTTGACATTAAGCAACTTATTATCAAAATCATCAATTCTGCCAATGATGAAAATGTTCCTCCTCACCAACAGAATTTGAACATGTTGGATATGGAGCAACTGCAAAACCAATTGAAAAGAAAACTTTCCGGACAAAAGTTCTTACTCGTATTGGACGACGTATGGAACGAAGACCGTGTTAAATGGGTTGAGTTGAGGAATTTAATCCAAGTAAGCGGAGCAGGAAGTAAAGTTGTAGTGACCACACGTAGTCATTCCATTGCTTCCATGATGGGTACAGTTCCCTCTCACATTTTAGAAGGTCTTTCCAAAGAGGAGTCATTGTCTCTGTTTGTGAAGTGGGCATTTAAAGAAGGAGAGGAGGAAAAACATCCTCACTTAGTAAATATTGGCAGAGAAATTGTGAAAAAATGCAGAGGGGTTCCATTGGCAGTGAGAACATTAGGTAGTTTACTATTTTCGAAATTTGAGGACAGTGAATGGGAATATGTGAGTGCCAGTGAAATTTGGAATTTGCCTCAGAAAAAAGATGACATTTTACCTGCCCTTAAACTGAGTTATGATCTCTTGCCATCCTACTTGAAGCAATGTTTTGCATTGTTTTCCCTTTACCCAAAGGATTATTTATTCCCTAGTTATGAAATAGCTGCGATTTGGGGATCACTTGGACTCATTGCACTACCAAAAACAAATAGGACACTTGAAGATGTGGCCAATCAATATTTGCATGAACTCCTGTCAAGATCCTTTCTCCAAGATTTTGAAAACTTTGGCAATAAGTTTAGGTTTAGAATACATGATTTGGTGCATGATCTCGCCCTATTTGTTGCGTCGGATGAGTGTCTACATGTGAGTTTCAAAATTCAAAATATTCCAGATAATGTTCGACATCTGTCTTTTGCCGAAAGCAGTTTGTTCAGAAATTTTGTCACCAAAAAATCAACACTTGTGAGATCCGTACTGTTTTCAAATGGTGCAGCAGCTGCCATCGATGAAGCTTTACTAAATACGTGTCTGACAAAGTTCAAATGCTTGCGAGTTTTGGATTTACGTGGTTCGACATGCAAGACTTTGCCCCGTGCCATTGCTAAGATGAAACATTTGAGATATTTGGACATTAGCGAAAATCTCAACATTAGGAGACTCCCAGACTCTATTTGCAAGCTCCAAAGTTTGCAAGTGTTGTCTATTAAGAGATGTATGAAGCTGGAAATATTGCCCAAAGGATTAAGAAAACTAATCAGTATCCGTTCTTTGGAGTTTAGTACAAAGCAAACTATTTTGCCTGTGAATGAGATCGCCCAATTGGGGTCGCTTGAATTCTTGAGCATTGAATCATGCCATAATGTGGAGTCCATCTTTGGAGGGGTGAGATTCCCTTCTCTTAAAACATTATGCGTTGGGGATTGTCAAAGTCTAAAGTCATTGTCTCTGGATGGTCAAAATTTTCCTGAATTAGAAACATTGCTTGTTAAGGACTGCGGTAACTTGGACTTGGAACTGTGTAAGGGCCACCATGAAGAAGAAAGCCCGAAGCTGAAGCTAAAACTTGTATTATTTTTCGGTTTATCACAGATGGTGGCCCTGCCTAAATGGCTTCAGGAAGCTAGCAAATCCTTGCAGCGCTTGTATGTTTTAAATTGTGACAATATTGAAACACTTCCAGATTGGTTAACAACTCTGACTGATCTCAAAGCACTTGGTTTAATAAATTGTCCAAATCTGGTATCTCTGGCAGATAACATTCATCACCACACTGCACTTGAAAGTTTGAGGATAGAAGGTTGTGCTAACTTATATAAAAAGTATGAACCCAATGTTGGAGAGTTTTGGCCCAAAATATCACACATCAAAAACATTGTGATTGATGAACCAGAAGAACTTAAGAAGAATTAG