Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_27017 LG7 23087155 23089768 PREDICTED: putative disease resistance protein RGA1
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 23087944 stop_gained p.Lys294*
A/T 23088128 missense_variant p.His232Gln
C/T 23088372 intron_variant
T/C 23088380 intron_variant
G/C 23088456 intron_variant
G/T 23088461 intron_variant
G/A 23088912 intron_variant
A/C 23088917 intron_variant
T/G 23088977 splice_region_variant&intron_variant
C/G 23089079 missense_variant p.Val150Leu
T/C 23089115 missense_variant p.Ile138Val
C/T 23089117 missense_variant p.Arg137Lys
C/A 23089131 synonymous_variant p.Val132Val
A/G 23089167 synonymous_variant p.Ile120Ile
G/A 23089179 synonymous_variant p.Pro116Pro
T/G 23089197 synonymous_variant p.Thr110Thr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_27017.1
MAELFLFSIAESLIAKLASHAFQEAYRVVGLYHDLRNLRKTLSLVKAVLLDAQQKQDHNHQLREWLTHLKTVFSEAEDVLDELECQTLQNKVVKAHGNTKDKQNPNDDDTSLSVIPIVGIGGLGKTTLAKFVFNDNRIQECFPLKMWVCVSDDFDIKQLIIKIIYSANDENVPPHQQNLNMFRIHDLVHDLALFVATDECLHVNFKIQNIPDNVRHLSFAESSLFGNLVTKTSTVVRSVLFSDGAAAAIDEAVLNTCLSKFKCLRVLDLRGSTCKTLPRAIAKMKHLRYLDISENINIKRLPNSICKLQSLQVLLIKGCMELEVLPKGLRQLINIRHLEFSTKQTILPVNEIAQLGSLGYLYIESCHNVKSIFGETLVVTDCGNLDLELWKGDHEKESPKLKLKFIGFNSLSQLVALPKWLQEAAKSLQCLYVLNCDNIETLPDWLTTLTDLKALGLINCPNLLSLADNIHHHTALESLRIEGCANLYTKYEPNVGEFWSKISHIKNIVIDEPEEPKKNQRKRPT*


CDS Sequence:
>Vu_27017.1
ATGGCCGAATTATTTCTCTTCAGCATAGCAGAGTCACTCATAGCAAAGCTTGCTTCTCATGCTTTTCAAGAAGCTTATCGAGTGGTGGGTTTATACCACGATCTTCGAAACCTTAGAAAGACTCTCTCTTTAGTCAAGGCTGTTCTGTTAGATGCTCAGCAAAAGCAAGATCACAACCATCAACTCCGCGAATGGCTCACTCACCTTAAAACTGTCTTCTCCGAAGCCGAAGATGTTTTGGATGAACTTGAGTGTCAAACACTGCAAAACAAAGTGGTCAAAGCTCATGGTAACACCAAAGACAAGCAGAATCCTAATGATGATGATACAAGTCTATCTGTTATCCCCATTGTGGGGATTGGAGGCTTGGGAAAGACTACACTTGCAAAGTTTGTGTTCAATGACAACAGGATCCAGGAGTGCTTCCCATTGAAGATGTGGGTGTGTGTTTCTGATGACTTTGACATTAAGCAACTTATTATCAAAATCATCTATTCTGCCAATGATGAAAATGTTCCTCCTCACCAACAGAATTTGAACATGTTTAGAATACATGATTTGGTGCATGATCTTGCCCTATTTGTTGCGACGGATGAGTGTCTACATGTGAATTTCAAAATTCAAAATATTCCAGATAATGTTCGACATCTGTCTTTTGCCGAAAGCAGTTTGTTCGGAAATTTAGTCACCAAAACATCAACAGTTGTGAGATCCGTACTGTTTTCAGATGGTGCAGCAGCTGCCATCGATGAAGCTGTACTAAATACGTGTCTGTCAAAGTTCAAATGCTTGCGAGTTTTGGATTTACGTGGTTCGACATGCAAGACTTTGCCCCGTGCCATTGCTAAGATGAAACATTTGAGATATTTGGACATTAGCGAAAATATCAACATTAAGAGACTCCCGAACTCTATTTGCAAGCTCCAAAGTTTGCAAGTGTTGTTAATTAAGGGATGCATGGAGCTGGAAGTATTGCCCAAAGGATTAAGACAATTAATCAATATCCGTCATTTGGAGTTTAGCACAAAGCAAACTATTTTGCCTGTGAATGAGATCGCCCAATTGGGGTCGCTTGGATACTTGTACATTGAATCATGCCATAATGTGAAGTCCATCTTTGGAGAAACATTGGTTGTTACGGACTGCGGTAATTTGGACTTGGAACTGTGGAAGGGCGATCATGAAAAAGAAAGCCCGAAGCTGAAGTTAAAATTTATTGGATTTAACAGTTTATCACAGCTGGTGGCCCTGCCTAAATGGCTTCAGGAAGCTGCCAAATCCTTGCAGTGCTTGTATGTTTTAAATTGTGACAATATCGAAACACTTCCAGATTGGTTAACGACTCTGACTGATCTCAAAGCACTTGGTTTAATAAATTGTCCAAATCTTTTATCTCTGGCAGATAACATTCATCACCACACTGCACTTGAAAGTTTGAGGATTGAAGGTTGTGCTAACTTATATACAAAATATGAACCCAATGTTGGAGAGTTTTGGTCCAAAATATCACACATAAAAAACATTGTGATTGATGAACCAGAAGAACCTAAGAAGAATCAGAGGAAGAGGCCGACATAG


Promoter Sequence:
>Vu_27017::LG7:23089768-23091768(-)
TCCATATGTGGCCTCTGGGTTACTACATCCTACACTCTCACTTTTTTCTTCCTGCATCCCTATAAATTATAATATCCTCATTTTACCTTTTATTAAAAATATTAAAAACTCTAAATTACTAATTTCAAATTACCTTTCCTTCTTTGTGTTGCGAAATGTCTAGCACCTTCCTCCCTTTCGCTTCATTTTCTTCTTTTACACATAAATGTGCAAGATTGAAAGCGAAATCCCCACTCGACGTGTGATGTGAGGTGAATGATTGTAGAAGAAAGGAAATTTAACAGAAAATTAACCATGGAAAAGTGGTTGTTTGGGTTATTTAAAAAAATAAATACTTCTAGGATGTTTCGAAAGGTATTTTTAAATCCAAAAATATTTTCTGAAACGTCCATTCTAAAATATTTTTTTTTTATATTTTGAAATCACTATTCCAATAGTTATTTCTTGATCTGGAATATAAAAGAGTTTCCAAAATGAGTCTTCTGGATAGTATTTAGTATTTTTGGATCCGAAAAATATCTTTCGGAAAACTTGTTTAGAATTTTTTTTATATTTCAGAATGACTTTGCTGGAAAGTGTTTTTGAATCTGGAATATAAGTGTATAGTATGGACTCCTTGTTTGGTTAACAAGTGGATCAATCGGTCTTGATGATGAGCCATTTGGTTGAATGGATAGACCAACATCTAACATTATTAACGGAAGGTAAAGCATAATTAGCAACTTAACGCACAAATTAAGCATGAAATGAGGATTATATCAGTATAGTATGATATCTAGGCCGAACGGTTAGTATCCAAGACCGATCGGTTTATTTAATATAGCAGCACTCGTCAACCAGGTCAAACCAGGTTAAATGATGTTGGGTCACAACGCTCGTCAACTAAGTCAAACCAGGTTAAAAGGTGTTGGACAGGGATTTGTAGGACTGAGAGACTAACCTTGTTGACGTGTCTTTGTCGCCTTTGGACGTTTATGTCGCTCGCTTTCCTACTCACTTGTCCTTTGATGCAAGGGGATGTACCTGCAGAAAGCACTCAAGTTAGGCTTAGGTTATGGAGCCTTAACCCTTAAGAAAGTGATTTTGTCATCACTGTAGAGTATTTTTGAGTGTGAGTAGAACGTATCTAACTTTTAGCCTTGACCCTGTATTTATAGGTTATCACAAGCCTAATAAAATATAACCATACTTACCTTAAACAGATTTACCTTAAAATTCGGTTAGTTGCTCATAAACAGCTTTATGAATATATTTGATCAGATATCTTTCATTATTTTATCTTCTGCTGCATTATTAGTCCAATAACTTAAATGTTGTCCCGATTGTGACCGAACACCTTTTAACATGGTTTGACCTGGTTGATGAGCATTGTGACCCAACATCATTTAACCTGATTTGACCTGGTTGACGAGCACGACTACTGTAGATAAACCGATCGATCTTGGATGCTAACCATTCGGCCTAGATATCATACTATACAATAACATATATAGAGCATGATTAGTTCATAAAAAAAGATAAAAGCCCAACACAACGTATTAATAGTGAATTCAATGGGTTACTCTAACATTTATTCTCACCTAACTTAGATTTTATCTCACTTGAGAAAAGGACCGGTAAGACTTGAAGCTCTTAAGAATCAGTCAAAACAAAGAGTATTCAGCTAGCCTTTAAATGTCGTTGGAGTGAAGTTACAATTTGTCTATTTTATTTTTTTGTTTCGTTTTGAGTTGGATTAGAAAATACGTTCAGAGTAGTCAAAGAAACTAACTCCTTTTACTCAATATTCATTTATTCGCATATTTTATTTCTATTTAAAAAATTTTCTAATTAAAAATAAACCAATATCAAAAGTCTTTTGTTTAACCATTTCTATTGGCGGGTATTTATCATTTGCCCTCTTATTTCTTTTTAACCGCTGCTGAAAATAATGTAACAAATGGCATTAGTTGTCGAGTAGTTCTGGAATCTCATCTCTTCCGTTTGTATTTCAAACAACT


Gene Sequence:
>Vu_27017(-)
ATGGCCGAATTATTTCTCTTCAGCATAGCAGAGTCACTCATAGCAAAGCTTGCTTCTCATGCTTTTCAAGAAGCTTATCGAGTGGTGGGTTTATACCACGATCTTCGAAACCTTAGAAAGACTCTCTCTTTAGTCAAGGCTGTTCTGTTAGATGCTCAGCAAAAGCAAGATCACAACCATCAACTCCGCGAATGGCTCACTCACCTTAAAACTGTCTTCTCCGAAGCCGAAGATGTTTTGGATGAACTTGAGTGTCAAACACTGCAAAACAAAGTGGTCAAAGCTCATGGTAACACCAAAGACAAGGTAAGTCACTTCTTCTCCACTTCTAATCCACTTCTTTTTCGCTACAAGATGACACAACAAATTAAATATATCAACAAAAGACTAGACAAGGTTGCAGCGCATAGGCATAAGTTTAGTCTTCAAATAATTGATGTTGACACACGTGTTGTTTATCGGAGAGATATGACACACTCTCGTGTCAGTGATTCAGATGTGATTGGAAGGAAAACGATAAAGAAAAGATGATAGAACTTTTGATGCAGCAGAATCCTAATGATGATGATACAAGTCTATCTGTTATCCCCATTGTGGGGATTGGAGGCTTGGGAAAGACTACACTTGCAAAGTTTGTGTTCAATGACAACAGGATCCAGGAGTGCTTCCCATTGAAGATGTGGGTGTGTGTTTCTGATGACTTTGACATTAAGCAACTTATTATCAAAATCATCTATTCTGCCAATGATGAAAATGTTCCTCCTCACCAACAGAATTTGAACATGTTGGATATGGAGCAACTGCAAAAGCAATTGAAAAGAAAACTTTCCGGACAAAAGTTCTTACTCGTATTGGACGACGTATGGAACGAAGACCGTGTTAAATGGGTTGAGTTGAGGAATTTAATCCAAGTAAGCGGAGCAGGAAGTAAAGTTGTAGTGACCACACGTAGTCATTCGATTGCTTCCATGATGGGTACAGTTCCCTCTCACATTTTAGAAGGTCTTTCCAAAGAGGAGTCATTGTCTCTGTTTGTGAAGTGGGCATTTAAAGAAGGAGAGGAGGAAAAACATCCTCACTTAGTAAATATTGGCAGAGAAATTGTGAAAAAATGCAGAGGGGTTCCATTGGCAGTGAGAACATTAGGTAGTTTACTATTCTCCAAATTTGAGGACAGTGAATGGGAATATGTGAGTGACAATGAAATCTGGAATTTGCCTCAGAAAAAGGATGACATTTTACCTGCCCTTAAACTGAGTTATGATCTCTTGCCATCCTACTTGAAGCAATGTTTTGCATTGTTTTCCCTTTACCCAAAGGATTATTTATTCCCTAGCTATGAAATAGCTGCGATTTGGGGGTCACTTGGACTCATTGCACTACCAAAAACGAGTAGGACACTTGAAGACGTGGCAAATCAATATTTGCATGAACTCTTGTCAAGATCCTTTCTCCAAGATTTTGAAACCTTTGGCACTATTTTTAGGTTTAGAATACATGATTTGGTGCATGATCTTGCCCTATTTGTTGCGACGGATGAGTGTCTACATGTGAATTTCAAAATTCAAAATATTCCAGATAATGTTCGACATCTGTCTTTTGCCGAAAGCAGTTTGTTCGGAAATTTAGTCACCAAAACATCAACAGTTGTGAGATCCGTACTGTTTTCAGATGGTGCAGCAGCTGCCATCGATGAAGCTGTACTAAATACGTGTCTGTCAAAGTTCAAATGCTTGCGAGTTTTGGATTTACGTGGTTCGACATGCAAGACTTTGCCCCGTGCCATTGCTAAGATGAAACATTTGAGATATTTGGACATTAGCGAAAATATCAACATTAAGAGACTCCCGAACTCTATTTGCAAGCTCCAAAGTTTGCAAGTGTTGTTAATTAAGGGATGCATGGAGCTGGAAGTATTGCCCAAAGGATTAAGACAATTAATCAATATCCGTCATTTGGAGTTTAGCACAAAGCAAACTATTTTGCCTGTGAATGAGATCGCCCAATTGGGGTCGCTTGGATACTTGTACATTGAATCATGCCATAATGTGAAGTCCATCTTTGGAGGTGTGAAATTCCTTCTCTTAAAACATTGCGCATTCTGAACTGTCAGAGTTTAAAGTCAATGTCGCTGGATGGTAAAAATTTTCCTGAATTAGAAACATTGGTTGTTACGGACTGCGGTAATTTGGACTTGGAACTGTGGAAGGGCGATCATGAAAAAGAAAGCCCGAAGCTGAAGTTAAAATTTATTGGATTTAACAGTTTATCACAGCTGGTGGCCCTGCCTAAATGGCTTCAGGAAGCTGCCAAATCCTTGCAGTGCTTGTATGTTTTAAATTGTGACAATATCGAAACACTTCCAGATTGGTTAACGACTCTGACTGATCTCAAAGCACTTGGTTTAATAAATTGTCCAAATCTTTTATCTCTGGCAGATAACATTCATCACCACACTGCACTTGAAAGTTTGAGGATTGAAGGTTGTGCTAACTTATATACAAAATATGAACCCAATGTTGGAGAGTTTTGGTCCAAAATATCACACATAAAAAACATTGTGATTGATGAACCAGAAGAACCTAAGAAGAATCAGAGGAAGAGGCCGACATAG