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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_26791 LG7 17054131 17075940 PREDICTED: uncharacterized protein LOC108319501
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   regulation of transcription by RNA polymerase II, signal transduction, regulation of transcription by RNA polymerase II, regulation of transcription by RNA polymerase II, regulation of transcription by RNA polymerase II
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding, RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding, DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 17061817 intron_variant
G/T 17061823 intron_variant
G/T 17061922 intron_variant
G/T 17061926 intron_variant
T/A 17063478 intron_variant
G/A 17063578 intron_variant
G/T 17064182 intron_variant
A/C 17064393 intron_variant
T/C 17064780 intron_variant
A/G 17066231 intron_variant
T/G 17067428 intron_variant
G/A 17067436 intron_variant
C/T 17067615 intron_variant
C/T 17067616 intron_variant
A/G 17067617 intron_variant
A/G 17067627 intron_variant
T/C 17067630 intron_variant
A/T 17067859 intron_variant
C/G 17067864 intron_variant
C/T 17069734 intron_variant
A/T 17072005 intron_variant
G/T 17072010 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_26791.1
MDCASVGSEEYSLLKDLRLEIEAKDGTFSLCFWLYFTTSSAFPSTIIQQVYSDISESAPFLVIDDNKRIHLLPVLLLHEEAPDTGNINSWAEVPHATIDFKFPLEKWVHVGCQVCPDYIQLQINGEIVGEKSHCSLLNEKSGSRDLKKLTLANVGGDGNSVQCYVHNFEIYPTIASVKDYHLKDPPLKLSIDESSVSEIEEESDGVWAVVGGKASCRRNFSLDVVLSDAFGQPVDKENEVFASLLYADTRVLVENTTDDEAPLLASYDGIEFSSRERPSKLMLGRASFKLKISQLSSKCDNRFFVIRFCVPKLGNYPFLETYSHPIRCISRSRNTRLSTLVWKKSTALNCSSVSQSSALDDGSFELQHSGHEAQANPLVKRFRLGQDKTSVSVKTDPTLEQPDEECNSQVQTANQVENEFPRSFDGRPANFNEAYDSPSDSESIGEGNSPLNTASKRYPISDMTIFKYCLASLAEKSLILKEIATSAPDKEILEFANHVSHYSGCSHHGNQILIAKRLINHGRNLWKVMPLNNHHILWENAVYEIQEHFVNIACCSSRSLSPQDLNLLRRIAGCQEYLTQENFEKLWCWLYPVAITISRDWVNPIWKSTSPKWIEGFITKEEAEASLQGPTGFQEPGTFVLRFPTSRSWPHPDAGSLVVTYVGNDYKLHHRLLSLHQVYGSYSTGDRRVDMKPLQDMLLAEPELSQLG


CDS Sequence:
>Vu_26791.1
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Promoter Sequence:
>Vu_26791::LG7:17075940-17077940(-)
TTCAGTGGTGTCGGTGTAAGTAAAGCTATATTTTTGTTAAAAGTATGTTTGTTATGTAAATCTAGTATCTTCATGAATGGTGACATGATTTAAATGTAAATGGGGTATTTATTCTAGTATTCATTGTATAATATGATGATTATTGATAGTATGGTGTTTGAATGTTAGCAAGGTGTGATCGTGGTAATATTATTGTTCAAATTGTATATGTTTAAGTTGTACTTTGATGATTGGAATTGGTTGATAGGGTAGGGAGTAAAGAGTTCTCAAATGCAGAGGTTTAAAGTTGAAAATGGAGGTTTTAATAGGCATTTTTGTGAGATAAGATTTAGATTGAGAAATCTGGTGTTTCGAGTTTGATTATATGTTATTTGAAGGTTGTTAGCAACTTGAATTAGTAAATATTTGATAAGGAACTAGGTACGGGTCAATGTAGTGATTTTGGTATGTTTTAGGTTCAATTTTAGAGGTTTTAATTAATAGGTGAAAGTCTAAAAGAAATAAGACTGAGGTAAAATAAAACTTTTAAGTCCATCCTTAGGTGATTTAAAGCTGGTTTGAACTTTAAGAATGGTGGGAAAACTAATGTGAGACTTATTACTAGTTGATATGTTGAAATTGGCTTGAATTAGAACTAGTTTTAGGGGTTTTACGAACGTCGAAACTCTAGAAATGGTCTAACACAAGACCTCAAACTTGTATCTTTGGCGTTTACCCCCATTTACATTTAAATCATATCACCATTCATGAAGATACTAGATTTACAAAACAAACATACTTGTAACAAAAATATAGTTTTTCTTACTTTACACCGACACCACTAAACTCTAAGAACGTCAAAACCCTTGCTTCCAACTCAAGAAACTCTAAAAATGCCTACAAACTATAGAATTGAGATTAGAAAAGATCATTAAGACAGTTGATTGACAAAGAACAACAAATAGATAAGGGTGAATACATGCGCCAACCCTCAAAACCAAAGATTTTATAACAAAACAACGAAAGGAAAAAGGAGTCGAAACTTACTTGCTCTATAGGAGAAATTGATCAGGTAGAAACGTAGACCTTGTTGTCATGGTCATTTAGGGACCTCTTGATCGTTAAAGAGATGATTTAGGAGTTAGAACTCTTTCAGAGAAGGTAGAGAACTCAAGAAAAAAGTTTTAGAAAAAATGAATTGTGTTTTAGATAATAAGACGATATAAACTTCTCTTTATATCATGAAATCTTTATTATTAAAATAAGTCGATCTCATTAAACTAAAACACCAATCTACTTTATACACTCAAATTTCTCGGTTATTACATTAATAAATCATAAATTAATTTTTATAAAAAGTCTATAAAAATAAATAAGTTTTATAATTTTTTTAAACTATAAATATCTATTTGAATTCAAAAGAATACTTACTAAAAAATAAAATTGAAAAATAATTTTTTATTTGAATTTAGAAAAATAATTATTAAAAAGATAAAAGTGAAAACAAAATATGTACAACAATCTCCTTTATTAATAATAAAATAGTATAAATTATAGATTCTATATAGTTATATATAAGAGAGAATATATATTTTTCCTAACTATTTCGAATCCACTTTTTATCAATAATTCTCCCAGATAAATAATATAAACACACATCTTTTAATTTGTAAATATTTTTTTAGATCATAATTTTTTAAATTGTATTATTACATTTAATCTAAAAAGTAGGGATACACAGGGCGAGAGCGCGTGTTTGTATTAGTTGGAACTTGGAAAGAAAAATTCTCCCTTGTGAGCCTACACCGTTGCCGTGCACCTCCAAGCAGGAGATCCGAGCACACACCGAAACGCGCAACCAAACCGTTAGTTTCAGAGCCGAACAAACGGAACCACCAACAAGCCAAACACAAACCCACACTTCTTCTTCTGCTAACCCAAGAAAGAGAAAGAAACAGAGAAACAGGAAGCGAAAGAGTTCACCATAACGCAGAGAACTCCACTTTTGATCACACTCAGAG


Gene Sequence:
>Vu_26791(-)
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