Genomic Resources - Ricebean Portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Gene Details:

Gene ID	Chr. No.	Start Position	End Position	Function	View on
Vu_26710	LG7	13105892	13106785	PREDICTED: uncharacterized protein LOC108347293	Map

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category		relationship type		keyword

SNP	Position	Effect	Amino acid change
C/G	13106742	missense_variant	p.Ser15Thr

View accession wise SNPs

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_26710.1

MEQGQCWTKRKYSLSSSLSSPTNPSCGDSWEEQAFAEDAANSLGGCVWPPRSYSCSFCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLKQQPSSPHNEILCHDLQTQLHMPVQSPLDDYLYPSPVCGLPCKKTKPNSYHDFVASPSSPSHSKALLAPSVNSGNSRDETMIPFYDSSVLHKISPISNSSESWPCLAEDHRLYSCKFHPQADTKKSSKGDTDDIDGDMILNSVVCSTHPSLQFESTKEADHISYKKKKTDASSSPFSPKSSSVDRHHMQTKMFEFSPSSVEELDLELRLGYRSKV*

CDS Sequence:
>Vu_26710.1

ATGGAACAGGGTCAATGTTGGACTAAGAGAAAGTACTCTTTGAGCTCTAGTCTTAGTTCACCAACCAACCCTTCCTGTGGTGACTCATGGGAAGAACAGGCTTTTGCAGAAGATGCTGCTAATTCTCTTGGTGGCTGTGTGTGGCCTCCAAGATCATACTCTTGTAGCTTTTGCAGAAGAGAGTTTAGGTCAGCACAGGCTCTAGGTGGCCATATGAATGTTCATAGAAGGGATAGAGCAAGACTAAAGCAACAACCCTCAAGCCCCCACAATGAAATTCTATGTCATGACCTTCAAACTCAACTCCATATGCCAGTTCAAAGTCCTTTGGATGATTACCTATACCCGTCTCCTGTTTGTGGATTACCTTGTAAAAAAACTAAACCTAATTCTTATCATGATTTTGTTGCTTCACCTTCTTCACCCTCACATTCGAAGGCTTTATTGGCTCCATCAGTTAATAGTGGTAACTCCAGAGATGAAACCATGATTCCGTTTTATGATTCCAGTGTTCTCCACAAGATTTCTCCTATCAGTAACTCTTCCGAATCCTGGCCATGTTTAGCTGAAGATCATAGATTATATTCATGTAAGTTCCATCCTCAAGCTGATACGAAGAAATCCTCCAAGGGCGATACGGATGATATTGATGGGGATATGATCTTGAATTCAGTTGTGTGTAGCACTCACCCATCTTTGCAGTTTGAGAGTACTAAAGAGGCAGATCATATCAGTTACAAGAAGAAGAAAACAGATGCTTCCTCATCACCATTTTCACCAAAGTCAAGCTCAGTTGACAGACATCATATGCAGACAAAGATGTTTGAATTTAGCCCTAGCTCAGTGGAAGAGCTAGATCTGGAGTTAAGGCTTGGTTACAGGTCCAAGGTATAG

Promoter Sequence:
>Vu_26710::LG7:13106785-13108785(-)

CTATAGGTAGTGGCCATAAGTCTTCCTCTTAATGGAAAGGATTATCATCTTGGTCTTCAAATTAGGTCAAACTTGTGTTTTTAAGATTTTTCTTCTACAAATTGGAGACACCCTAAGCCTATAAACAGAGGTGTCTCCACTCTTGTATTCTCACTTTGATATTAGTGATGAAATGTTGTCAAATTGTTGAGCCATTCTATTAATATCTAAAGTCAAAGCTAGAGCATATCCAATGTGGTCTCTTTTAGCCACCTTCCTCCAGAGTTAGCCTAACCTCTCTAAAGCACCATGAAACACCACCCAATCAACACGAAAATACCAAAGGTCTTGGTCACTTTCCCATATATGACCTTGCTTCCACACCTTCATCATCACTATAACATCTCTTCATGTTTTGGCCCAACCTAACTTGAGGAGGTTGCTATGATAGTATAGAACTGTTATAGTATAATCTAAAATAACTCTATCTTATCCTTCTTTTATATCTGTTCTAATTATATCCACCTACGAGGATCTATGTTATATGTGTCTAGATAATCGTATGTTATATGTGTCTAGATAATAGTATAGACGACAAAGTTATAAAACATTATAGTCCTACAAATGGTTATCAAGGAAATGGTTTAAGTATATAATATTTATATTATATAAATCCCCCTTAGTGTATAAAATATTATTCATTTTTTCAAAGTTTTGTTATGTTTTTTTCATTAAGTATTAGTAAATACATTTATGTATTTATATTAAGTTATGTTTTCTTATCCATTGTGAAATACTTTAAATTAGTAATGGAAATCTTACTAAATTGAATGTAAATTAGAATCTAAATTAATTTCTAATATTAATTATCAAAGTTTTAGCTACTTATATAAAAAAAAATTATGAATTTTTTTTAACCAGTTTACCCCTATTGGGTGTTAGTCATTATTTGTTTTATATTATCAAAACATAATTTAAATTAATATAAAAAATGTAAACTCAACAAATATGAAAATAGATTACTTCAGTCCATCCAAAAGTGAATAAATAACCTGACCTCAAGTGCATGAAACTTGTAAGATTAGAAAAGAAAAACTTACATATTCTTACCCAAATTTCTCGAGACCGAAATTAAATTCAATGTTTCAAGAAATCAAACTTGTAACTGGTTTATACAGTATAGGATATTTGGATAAATATACATAATATTTGGAGTAAACTCCATTAATATGAAATATTTAGTTTTTTACTTTGAATGAGGATGGATGGAGTATATACTAGTTTTATTAAGTTATCTTTTAATAGAGTTTTCATCTATATAAGATTTAAAAGATCCAATTGATATCAATAAAAAAAATTGTTGTCTGAATCATAAAATGGGATTACTTACAATCACATGGTAAAAATTATGTATTTTATGGAAGGTTACAATTATCATAAAGTTTATTATTATTTTATTAAGAAATTGTAAAGATGTAAACCTTATATATATTAAATCTTCTGTACAATGAAAAGCAAGTAATATTAACAAAAGAAAACACAGTGGTGGATCTCTCTGAGGAGATTGCAGTCAGATTTTTGAGTTAAGTCAGTACTACAGTGGTCACTCCATCGCATCTCATGTTATGTAACACATTAGAGGTCCCACGTCAGTAACTTTCAAACTCATGGCTGCTGCTACTTTGCTTCTCCTCACAAAGAAAATACAGAAATAAGGGAACTTGTGAGCACTGATATTCATTCTGGTGTCTCTTCTTTGACTCCTTTGGAAAACCAAACACAAAACAGCACAGCAAAAAGGTTAGAGTACCCACCACTTCATCTTCCACACAAAAACCTCCTTCAAGCAATCCCTATCTAAGATCCAAAGATAGTATAGACTCATGTGACTCTCAATTCCTTGCTTAAATATGGGGTTACCTGCATAACCCTCTTCATCCATTTACATATCCACCTCTTTCTCTTCTCCATATTGCTCTTTTCCTAAGGGTTTTGGGTGATAGTTTGTGGTTTGTGTTCCA

Gene Sequence:

>Vu_26710(-)