Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_26598 LG7 8719723 8724428 PREDICTED: uncharacterized protein LOC108337722 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T,* 8719792 5_prime_UTR_variant
C/T 8720068 synonymous_variant p.Asn48Asn
G/T 8720083 synonymous_variant p.Ala53Ala
T/A 8720338 downstream_gene_variant
G/A 8720388 downstream_gene_variant
T/A 8720457 downstream_gene_variant
A/T 8720469 downstream_gene_variant
T/G 8720473 downstream_gene_variant
T/A 8720474 downstream_gene_variant
G/C 8720669 downstream_gene_variant
A/C 8720820 downstream_gene_variant
G/A 8720867 downstream_gene_variant
A/T 8721306 downstream_gene_variant
A/G 8721466 downstream_gene_variant
A/T 8721492 downstream_gene_variant
C/A 8721511 downstream_gene_variant
G/T 8721523 downstream_gene_variant
T/C 8721730 downstream_gene_variant
C/G 8721790 downstream_gene_variant
T/C 8721905 downstream_gene_variant
T/C 8722435 downstream_gene_variant
A/G 8722443 downstream_gene_variant
A/G,* 8722449 downstream_gene_variant
A/G 8722743 downstream_gene_variant
G/A 8722746 downstream_gene_variant
G/A 8723102 downstream_gene_variant
G/A 8723619 downstream_gene_variant
T/A 8723624 downstream_gene_variant
T/C 8724286 3_prime_UTR_variant
A/T 8724335 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_26598.1
MAKEVNKQRRVKVPFSAEDTASLLQRYDAPTVLTLLQELANYPYSKFNWNDLAAKTSTGISNAREYQMLWRHLAYGHSMANLDDDAQPLDDDSDLESEREPLPRLNRETATEAAAFVKVIMASFKLGESSATSSVIQAPLTINTPSTIDKNESSSNTDIIFPVTVKRQTLPNTSSTRVVEGNGSVRSSTSIKKKREPWSEQEDLQLRDAVQRWGEGNWATMIKKDDFPIKRSTSQLSKRWSTLRKREGDFN*


CDS Sequence:
>Vu_26598.1
ATGGCTAAAGAGGTTAACAAGCAAAGAAGGGTTAAGGTTCCTTTCAGCGCAGAAGACACTGCTTCTCTGTTGCAAAGATACGATGCACCAACGGTTTTGACGTTGCTTCAGGAATTGGCCAATTATCCGTATTCCAAGTTTAACTGGAATGATTTGGCGGCCAAAACTTCAACCGGAATTTCTAATGCTAGAGAGTATCAAATGCTGTGGCGACATTTGGCGTATGGTCACTCCATGGCAAATTTGGATGACGATGCTCAACCTTTGGATGATGACAGTGACTTGGAGAGTGAACGAGAACCATTACCTCGCTTAAACAGGGAAACTGCAACCGAAGCTGCAGCATTTGTTAAGGTAATTATGGCATCTTTTAAACTGGGTGAATCCAGTGCTACTAGTTCAGTGATTCAAGCTCCGTTGACTATAAATACTCCCTCTACCATTGATAAGAATGAAAGTTCGAGCAACACCGATATTATTTTTCCAGTAACAGTGAAGAGACAGACACTGCCAAATACATCATCAACAAGAGTGGTAGAAGGCAATGGTTCAGTCAGAAGTAGCACATCTATTAAAAAGAAAAGAGAACCATGGTCAGAGCAAGAGGATCTGCAATTACGAGATGCCGTTCAGAGGTGGGGTGAAGGTAACTGGGCAACTATGATTAAAAAAGACGACTTTCCTATCAAGAGAAGCACCTCACAATTATCTAAGAGGTGGAGCACATTGCGAAAGAGAGAAGGCGACTTCAATTGA


Promoter Sequence:
>Vu_26598::LG7:8717723-8719723(+)
AGGAGAGAGGTATGAAAGAAAACCATAGGAGAAAAGTTTGTTGGGTGGTTTGGATTTGGTGATGGCACGACATTGTGGAGAAGGACATAGTGACAGCCTAGAGTTTATGGGGGTGCTGGACAAAAGATGAGATGACGTGGTGATTTACATCACAAAAAATAAAATAACTCACGTGGACACTAACTATTTAAATATCATCGTAAAAAAAATTAATAAAATTTACAAAAATTAGAAAAATACTAAAAAAAATTGAGTATCACGACTAACAAAGTAATAAAAATAGAAACAAAAGAGATATATTAAACAAATATTTTGAAACACATCTTTCTTAATCAGCTCTAGATTGGCCAACACGAGAAGAGATGATGATACCAACAATGAGAGAATAATAGCAACAATGAGATCATACAGGCAAGAACTTCAACAAAAATGAGGATGAGAAACATTCCAACGAAAAACTTTGGTTGTTGTGAATTGGCTCGATAGAAGAAGATTAATTGTTTAAAGCAAGAATTTTAATAAGATTCATTATAAAAGCTATATCACTGTATCCGCACTAGCTTCTTCTACTACCACCATGCTTCTTCTTCCTCCAGCACGCAACAAAGAAAGGGAAAAGCAAGGTTCATTAGTTCCATAGAAGCCAAGTGCTAGGAAAATGGAGGTAAAAATGGATGGAGGATATGTTAAGAAAGCAAAGGAACATAAATGGAGGGATAATGTGGACGGCTGCGCTGCCAAGAAGAGATTCACACCTCTCATGTTAGGGTTTTTAATATATTTTTAATAAAGGGTAAAGTAATAATTTAGAAAAATTTGGAGTGTAAAAATTGGGAATACTTCATACTTTTTCCAATTTATACTTTTATATTTCATAAATAGAATAATGTGTAAAATACTTTTATTAATCAAATCAAAATCATTTAATATTAATTAAAACACATATTTTTTATTAAATTTAAAAGTTAAATATATTTTTAAGTGTTTTAACTTTTGCGGAATTAGATTAGTTCATATTTTAAACTTTGAATATTTTAATCTTTATTAATAAATGAATTTAGTTTATTGTAACTAAATGACACTAAAAATTGATTGATTTTACAAACAAATGTGTTGTTAACGGGGACACGCACTAACACTTAAACACACACCTTGACAATATAATTTGTTACCTCATATCTATTTAATTAGAAAGACTTAATATATTCATTAATAATTTTATAAAATGAAAGTGATAAAAAAGATTCAATTTTAAATGAAAGTTAAAAATATGTTTAATGTTATCTTATAATGAAAGATAGTTTTAGTGAAAGTTAAAAATATATTTAATGTTATTTTATAATGAAAGATAGTTAACAACATTGTACTTTTTTTATATAAAAACATAATCAAATTTTTAATAAAAATAGATTTATAATGAAAATGGATGATAGTATTTATTTTAATAATTTTTTAATCGAAGAATCGAACTATTAACAATTCTGTCACCCATATGCAATCAAAACGTAAAGAAATATTTATACCTAATTAACTAAATACTGTTACGCTATAAATATGACATAATTTTTATAATTCTGATATCATATATAACCTTTGTGACATGTATTTATATATTTAAAACAATATTTAACGAAAAGAGTTTCAATAAATAATCATAAATTCAGATATCTATTAAACATTTAAAAAAACACAACTTCATTTTTTCTAATCCGAGATTTTTTTTAATGAATAATGGTTTTACTAATTACATCTTGTGAAGAAAGAAATAGAAATACTGAAATAAAATAATAATAAATAAATAAAATATTACAAAATCAACGGGGTATAATTTTTTTGTCTATTTTTTTTCTCCTAAAAGAACTGATATATATATATAAACATTTCATTATATAAGGGTAATTTTGTAATCTGGGCATTTCCCCTTCCCCACTCAACGGATTTGTACTATCCGTATACTCGTTGCAATGTATAAAGGCTCCCAAGTTTATCCAACGCGCACA


Gene Sequence:
>Vu_26598(+)
AAATTGCGAGGCACTGGAAAGAGAAACAGAAGAAAACAGAAGAAGGACTGATTCGTCACTGAGAGCACAGAGAGAGAAAATTTCTTATTCTGCAACTTCCATTTGATCCCATGGCTAAAGAGGTTAACAAGCAAAGAAGGGTTAAGGTTCCTTTCAGCGCAGAAGACACTGCTTCTCTGTTGCAAAGGTCTCATTTCTTCGTTCTGTTTTTATTTTTGTTTTCAATTATTTTCATCTCGTTTTTCTGTTTATTGTTGATCTGCGTGAAACATCATGCAGATACGATGCACCAACGGTTTTGACGTTGCTTCAGGAATTGGCCAATTATCCGTATTCCAAGTTTAACTGGAATGATTTGGCGGCCAAAACTTCAACCGGAATTTCTAATGCTAGAGAGTATCAAATGCTGTGGCGACATTTGGCGTATGGTCACTCCATGGCAAATTTGGATGACGATGCTCAACCTTTGGTTTGTACGCTTTTTAATTTTTTGTGAATATGTTTTTGTTTAAACTATGATTATTTGCATTATAATTTCTATATCCTGCTCTCTCTTTTTTCATATTTTCAAGTTACATTTCTCAGATTTAAGCTGCAACGTGTTTTTTTTTTTTTTGAGTTTTACAAAGTTTGACCGAATTTTCCAAAGTCATATTCATAATTCTGTGTCATTAATTAATTGTGTGAGATGTGAGTTTCATCGAGAAGGAAACTATTGTTACTATTATTCCTGCTCTTAAAAAGACAGAATTTAGGTTGATTGTATTTTTGGTATTTGTTATGCCACTGTTTGATCAGCGAGAAGATAGAGTTTAGCTTAATAATATTTTAAGCATTTATTCTTTATACTACTGTTCGATCAAGGAGAAGATAGAGTTATTTAGGTTGACTATGATTTAGGTTTTTGATCCTTTGATAAGTGAAAAATGCAGGTTAACGACACGTTGAAATGTTCAATAATTTATAGGGATTCAGTTTATGATTTATTATTAATTATTAATCTATATTCTATCTTTTCACCTTCATCTACCTTTTTTTATCTATCAAGGGAATCGGTCCTTATTCTCTCTTTTACTTTTTATTTTATGCTCTTATATATTTTTTATGTCTCTTTTCTTTCGTACCTTTCTATCTACATTGCTTTGCCTACATATTCATCATGTCCATATGCTTGTATGCATCGTGTTTTGCAATGAAAAGAAAAGAGTCCTTTTTTTTTTAACAGAAAGTGAGTGTTTATCTTCCCTATTTTAGCCAGTAATTAAACACATGTAAAAGAGTTTTATTTTCACAAATATCTTAATTGTGTTCAATTTTATTTTTAATGATTACACAGAATAGACTAACTTAAACTTACTTATCGTGATGACATAATGTTCTAACACAACTCACTTAATAACTTAATTTTTTAATTATTTAAAATGTATATATAATTTTCTACACTTTCTATTCTAATATATAATTAGAAAATGCATATGGAACCGTGAGAGGGGGAAATGTAAAAACAAAAGGAAAAAAAGTGAAATTGTTTCGGTATAAAAAATGTTAAATATATTTTATTTATTATTAACATCTTTTATTTTAATATTATTATTTTATAATAATAAATATAAATATTAATAAAATGGTTTGGTTATGTTATAATTATTCGATGACATAATTCCATACATAATTATTATATAATATATATACATAATCATTAATATTTATGAACTTTTACACAAATCTTTTTCCCTTTTCCTTAAAGCGAAAATAAGCTTACTTTCAATATTTATTAATTTTTTATTTCTCATTTTGTGTGTTTTTCTTGCTTTTCCTTTTTTTTTTTTTACTTTTTTGTCTTTCACAAATCAAGCCCCGAATAGTCCTTCCACTAGGGCTTATAATAGTGAATGTCATCCCCACCAAGCAAATTAATGTCAATTGCCTAAAAAATTTATGAGATACGTGGTAGTCTCTTATTCAATTTTCCGTGCTTCTGATATCTTAAATCAAATATAGATATACTACTAGTGAAAATCCATAAATTTCAGACATTAGTTCCGGCTGAAATTGCAATTAAAGTTACTCCACTATACTATGATTTCTTTTTCAAGTATCTCCATCCTAATAAAGTTTAAATGTTATTACAATAAAGATAACAGTGTTTATTGTACTCGAGTAGTTATAGTTATCATGAATGTTCACCGCATGCAGATTCATGAAAACTGTATCTTAGATCAGTTTAATACTGTCCGCCTGCGGTTACTGTTTTTTGTTTGGTTTAAGCTATTGAATTTGTATTGCACATTTATAGATTCATACATATTTGGTGCTTTTCTGTAGGATGATGACAGTGACTTGGAGAGTGAACGAGAACCATTACCTCGCTTAAACAGGGAAACTGCAACCGAAGCTGCAGCATTTGTTAAGGTGTGTTATAATTTACCAAATTACTAAATTTTATCCAGGTATGTTGTGCAGCCAATTGCATATTTGTTTCACCCAATACTTTCCAACTTTTAACTAAATATTTCAAATTTGGAAGAATGTGCACAATATTTTCTAAAAGATTATTATTTAACTTGAAAGAGGAATCTAGTGTATGCTTCCTCCCATCTTTCCACTTTTGTCTTTCAATAAATTTCTTTCTCCATTTGAAGATGAACCAAATGGATTTTGAAGTCAACTTTAGAATTTGATTCACAAACATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAGTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTCTTTCTTATTATTTTAACTTAAAAAGAAGGCTAGCGTACTTAGCCTGGATTCGGATTTTTTAGGTTATTCAATGTTACTTCCCAATCGGACTTAAGGAAGAGTAACATTATCCATTGAACTAGGCTGGTCTCATCCATTTTGAGCTACAGAAGATTTATATTTAAATTAATAATTTATAAATATTTTAAATTCCATGTGGAGCAAAATGACCAAAAATAACAAAAAAAATATTTAAAGTTAATAGTATTTATAATGAACAATAGAAAGCCATAAATTTTATGAAATATTCTTGGACCATGGGACATTATTTTTCTCTATATTATTGTAGTCAAAATTCCTTATCCTCGATAAGATAATCTAATCGTGTCATTAATAAAAAAAACGTTACTTTCGAGTTGTTATTGTCGCAATTCTATTACCTAAATATTTTTTGCAATCATATTTAAGCATATCAGTTTCAGAAGAAGTGGTTCGAGAATTTCAGAAAATTGTTAATAAACGTTTTTGAAGGTTGGTCCACAAATGCTCAACATACAAACATGATTAAGGCCAAAAACTTGAGATAGCATTTTTGAACGGTAATAATCAGAGTGTGATCTATATAGATAGATAGGTTTTGTCAGCATCAATGTAAAGCTGTGATGGGTCATGCATGGGATTTTGTATTTTGTTGGATTTAAGGTATAATGGATCATGGGATTTTGGTTTTGGTGGATGTAAAGCTGTTATGCAGGTTTGTAATAGGTCATGATGAGATTTTGGTTTTGTTGGAAGCAATTTTGCATTGTTGGATGAGCCTGGGCTGTTTTAATTGTGTGGCATTCAAATGAGAGAGTTGAGGCATTTATATTGAGTGGAGATAAACATATATACAGTATAAGACAAAATTCACAAAGTCATTCATTATGTAGTTTAAGAAAAAATATCTTCAAAGAAGAAATAGTGAAAAAATATAAAATTAAAAGTAAAAGAGCAAAGCTAAAAGAACACACAAATTTGAATTTTAAGTTTACTTTAAAAAAGTTTACACAACATGACTTAACCGGAAATAAAATAAAAAACAAAATTTATTTATTATAATTTTTTCTCACATATTTAAATTAAAAATGGTACGTGGTCAGATTGGTGAAAATGTGTTTTTATTAGAGGTGCATGATATGATATGACGGTTAATTCTAGTTAACAATTGTATTAAATAATTTATTCTTTAGGTAATTATGGCATCTTTTAAACTGGGTGAATCCAGTGCTACTAGTTCAGTGATTCAAGCTCCGTTGACTATAAATACTCCCTCTACCATTGATAAGAATGAAAGTTCGAGCAACACCGATATTATTTTTCCAGTAACAGTGAAGAGACAGACACTGCCAAATACATCATCAACAAGAGTGGTAGAAGGCAATGGTTCAGTCAGAAGTAGCACATCTATTAAAAAGAAAAGAGAACCATGGTCAGAGCAAGAGGATCTGCAATTACGAGATGCCGTTCAGAGGTGGGGTGAAGGTAACTGGGCAACTATGATTAAAAAAGACGACTTTCCTATCAAGAGAAGCACCTCACAATTATCTAAGGTGTTTTAAGGGATAAATCTAGTCGTTCATGCTTTGTTGGAATGTCATCTCATTATTAATAATAATTATAACTTTCATGTTAGATATTGTCAATGATAATTTAAATACTTGCAGAGGTGGAGCACATTGCGAAAGAGAGAAGGCGACTTCAATTGATATCGCAACCTATCCCTCAACAGCTGACAATCGATCACTCAATTTTATTTTTTTTGTTCACTTGACGAACAATTCATTACGAATTATCGATGTGATTTAGATTGTTTTTAGTTCTGGAAAATTACATACCATTTCTAAATTCAATATTTGTCTATAGTCGTTTTCATGAATACAATACTTTACAGAGTGATC