Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_26586 LG7 8353632 8357227 PREDICTED: GATA transcription factor 25
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 8353785 intron_variant
C/A 8353826 intron_variant
G/T 8354050 intron_variant
C/A 8354056 intron_variant
A/T 8354304 intron_variant
A/T 8354305 intron_variant
A/G 8354537 intron_variant
C/A,* 8354608 missense_variant p.Arg226Leu
G/T 8354609 missense_variant p.Arg226Ser
G/T 8354943 synonymous_variant p.Thr174Thr
T/A 8355235 intron_variant
A/T 8355239 intron_variant
T/A 8355243 intron_variant
C/A 8355249 intron_variant
T/C 8355427 intron_variant
C/G 8355532 intron_variant
C/G 8355533 intron_variant
A/C 8355544 intron_variant
G/A 8355545 intron_variant
C/T 8355548 intron_variant
T/A 8355560 intron_variant
T/G 8355630 intron_variant
C/A 8355633 intron_variant
A/T 8355742 intron_variant
G/A 8355907 intron_variant
A/C 8356550 intron_variant
C/T 8356554 intron_variant
A/G 8356646 missense_variant p.Val120Ala
T/G 8356738 intron_variant
C/T 8356778 intron_variant
A/G 8357051 synonymous_variant p.Asp59Asp
C/G 8357056 missense_variant p.Glu58Gln

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_26586.1
MEPPAMYGHSQPLNMPPQISAAESNGSGPDPALDAHHHIHYETHALEDGAAGAMVVVEDVTSDAVYVSGGGGPEESSQLTLSFRGQVYVFDAVTPDKVQAVLLLLGGCELSSSGSPCVDVVPQQNQRGSMEYPARCSLPQRAASLDRFRKKRKERCFDKKVRYGVRQEVALRMHRNKGQFTSSKKQDGANSYGTDQDSGQDDSQSETSCTHCGTSSKSTPMMRRGPSGPRSLCNACGLFWANRGALRDLSKRNHEQSLVPVEQVDDGNVSDCRTAANPAHNNLAAYSEHDNPALVADRKVFQSQKMLE*


CDS Sequence:
>Vu_26586.1
ATGGAGCCACCAGCAATGTACGGACACTCCCAGCCACTGAACATGCCTCCGCAGATCTCTGCCGCCGAAAGCAACGGCTCCGGCCCCGACCCCGCCCTCGACGCCCACCACCACATTCACTACGAAACTCACGCGCTCGAAGACGGTGCCGCCGGTGCCATGGTCGTTGTCGAGGATGTCACTTCCGATGCGGTCTACGTCTCCGGCGGTGGAGGGCCCGAAGAGTCCAGTCAGCTTACGCTGTCGTTTCGTGGCCAAGTTTACGTCTTCGATGCTGTTACGCCTGATAAGGTTCAAGCGGTGTTGTTACTGTTGGGTGGATGTGAACTGTCTTCGAGTGGTTCGCCATGTGTGGATGTGGTGCCTCAACAGAATCAGAGGGGTTCAATGGAATATCCTGCAAGATGTAGTCTACCACAGCGAGCTGCGTCGTTAGATAGGTTCAGGAAGAAGAGGAAAGAGCGATGTTTTGATAAGAAAGTGAGATATGGTGTACGGCAAGAAGTTGCGCTCAGGATGCACCGTAATAAGGGGCAATTCACTTCATCTAAGAAACAAGATGGAGCTAATAGTTATGGTACAGACCAAGATTCAGGACAGGATGATAGTCAATCAGAAACCTCATGCACACATTGTGGCACTAGTTCAAAATCCACCCCAATGATGCGGCGAGGGCCGTCTGGTCCAAGGTCACTTTGCAATGCTTGTGGGCTTTTCTGGGCAAATAGGGGTGCTTTAAGAGACCTTTCCAAGAGAAATCATGAACAGTCTCTTGTACCAGTTGAGCAGGTCGATGATGGTAACGTCTCAGATTGTCGGACTGCCGCCAACCCTGCGCATAACAATCTGGCTGCATACTCAGAGCATGATAATCCTGCTTTGGTAGCTGATCGTAAAGTTTTCCAGTCCCAGAAAATGCTCGAGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_26586::LG7:8357227-8359227(-)
AGACTCAAATACCTTTCAAATTATGCCTTGGTAATCAAGTGTAAGCCTTTTTGGCCATTGTAATCGATTACAAGAACCCTGTAAGCGATTACACGAACAAAAATCTGGTTTTGTATAAAAACTTGTGTTGCAGGAGCCAGTTGTGGGCACATAAGTAGCCAAAGACATTTTACGTAATTTTTTCATATTTCTTGAATGGATGAGAGTTTTTTTTAATGTTTAAGTGTGAGTAGAGCCTGAAAACTAGATTTTGGGCAGTCCTTGGGGGAGGAAAGACGAATGTTGGTGTCATGACCAAGTTAACATGCTGTCAACTTTGACCTTTGCTGGCTATTTTAATGATAACTTTTTCCACCGACCTCAAAATGATGTGATTCTTTTTTTATTAGAAACTAGAGTAAAAAAGGTTTCCAATGACTACTAATTTGTAATTTTTGGACATCTGAGTAGGTACAGTTTATTCCTTAAAGTTAACGCTTTATATATACCTGCCAACTCTGACCTTTGCTGGTTGTTTTGCTCATAACTTTCCCACTGATCTCCAAATGAGTTGATTCTTGTTTTGTTTCTCCACTGATCTCCAAATGAGTTGATTCTTGTTTTGTTGGATTCTAGACTCAAAGACCTTTCAAAATATGCCTTAGTAATCAAGTGTAGGCCTTTTTGGCCATTATAATCGATTACAAGGACCCTATAAACGATTACACGAACAAAAATATGGTTTTGTACAAAAACTGGTGTTGCAAGAGCCAGCTGTGGGCACATAAGTAGCAAAGACATTTTACGTAATTGAATTGAATATTTTGTTTAGGCACCTGTGTGATGTGATTCTTTTTTTAGGCACCAACACTCAATTGAATTGGATCTTTTTTTAGGCACCAACACTCAGGCCTATCAAGGTCGCTTACAAAATCAATTTTTGTACCAAACACCCATAACCAAATAAAAGTTTCAATATATATGGTCGAACAACACTAGTAGAGAACATATGGTACTAGATCAAAATTGAAATTTTATTCCTATAATATATTATCAGTACATAATACCCAACATTTATAATCTTGATCTTTTGTATACAAAAAAACATGTGCAAGTTCCAACTCGAGTGAAAAATTTCTTTCCATCAAGAGGAAGACCCCATGCTCCAGACAAAGTGAAAATGGTGGAGAGAGACGAAGAAGAGGAAAATGCCGCCAACCCGAAAACGGAACACATAGAAGGTGAAATTTCTTTCAATGGATAGGAAGACCCGCGAGAATGAAAGCAATGCTCCATGAAAATGGTGGAGATAGATGAAGAAGACGGAAATAAAAATGGTGAAGAGTGAGGAAGTCTCAAATGAAACCGCGAAATGAAGAGAAAAATCTCAAATGTCTTTCTAAAAATACCCTCCACAACAAAATGACCCTCTTAATAAAATATTACAAACCAACCAATAAAAAAACACGTGTCATTATCAAAAAGTTGACAAATTTTGGATCTTCAAATAAACGTTTTCCCATTTAATTATAAGCAATTTAGTTGATGATGTAAATTTTTGTGAACAACCCAGTGGATGAGAGAGGAAGTGATGATGGTGAAAACGGTATATTGATTACGAATAAATAAATAAATAAATAATTAAATAGTGTTGGGTTTTGTGAGAGATATTATTATTATTATTATTAAATTAAATAAAGTCGGTTATTGAAAACTTGAAATTCCATGGGGCAAGTGGCATGCGGCATGCGGCATGCGTATTGGGCCTGGGCCGAAGGGGGCAAGCCTCGTAAATATGAGCACTGACAAGGTCAATTTTTCATTCTCCCTTTTTCTGAATCAATTCCTGTCTTGTCCTTCTCTTCCACCTTCACTCCCTCCATTCCTTCGTCCCTTCACACAGACACTCTCTCTCTCAAAAACACTCACAAATCGGAATCAAATTTAAAATCCCACTAGGTTAGGGTTTCCAACTCCCCTCCAATTCTCCCTGTAATGCACTGTGATTCCCGGGCCCTACA


Gene Sequence:
>Vu_26586(-)
ATGGAGCCACCAGCAATGTACGGACACTCCCAGCCACTGAACATGCCTCCGCAGATCTCTGCCGCCGAAAGCAACGGCTCCGGCCCCGACCCCGCCCTCGACGCCCACCACCACATTCACTACGAAACTCACGCGCTCGAAGACGGTGCCGCCGGTGCCATGGTCGTTGTCGAGGATGTCACTTCCGATGCGGTCTACGTCTCCGGCGGTGGAGGGCCCGAAGAGTCCAGTCAGCTTACGCTGTCGTTTCGTGGCCAAGTTTACGTCTTCGATGCTGTTACGCCTGATAAGGTGCAATTTCCCCCTTCCTCGTCCTTATTTATTTTCCCTTGTTTTGTGGTTCCTTTTTGTTTATCATTTTTTCTTTTGTTCTTCGTTGATTCGGCGTTGCAATTGTATGATTTTTTATTTTATTTTATGGTTTTTGGTAATTCATTGAATTGATGGACGGGGCGTGAAGTTATTTATTTAATTACTTTGATAAATTTAATCTGTATTTGGCTTCACGTGGCAGGTTCAAGCGGTGTTGTTACTGTTGGGTGGATGTGAACTGTCTTCGAGTGGTTCGCCATGTGTGGATGTGGTGCCTCAACAGAATCAGAGGGTATTTTCTGATAATAGAAGAATATTATATATTATTCACACCCGCTTGCACTTGTATCGCTTTACAATTGATTTATTAGTAAAATCACCTGATGCAGAGTACTTTGTCCCACCAGATATTGATAAAGTGAGACATTGTGATTTGTATATTTATTAACCAGAGTCAGGTAGTAAATACTGAATAGTAACTTTGATGTTCGGTGGTAATCAACTTAACTTAAAGTTATGTTGTGGGCAGACCTATCATTGGTTGACCAAATTTGTTAATATTTGGTCATTAGTGGTAGATGTACTGATATCAGGAGATTATTGTTGCAAGGTTACTTAGTCAATGATAAAGTGATGTGTGGGTATTCATAGTAGAATTTCATTAATGTTTACGTTCTCAGTGCTGGGTAGTGTTTTAAATATTTTTGGGTCCTTCTGCAGGGTTCAATGGAATATCCTGCAAGATGTAGTCTACCACAGCGAGCTGCGTCGTTAGATAGGTTCAGGAAGAAGAGGAAAGAGCGATGTTTTGATAAGAAAGTGAGATATGGTGTACGGCAAGAAGTTGCGCTCAGGTTTGTTTGATAATTAAGATTCTGTGGTGTGCGATAGAACTTGCGAGTATTAGATTGAACTGTATGAACATGTACATAATTATTTACAATCTGGGTATAAAAGTTTATGGATAACTGAGAGAGTTTGCTATGTTGCTACAAATCAAATAATTTACTGGTAGTAAATATAATATAATTGGGAAGTATGCTAAATAATTGAAACGATAGCAAGCTGGATTTTAGACTTTATTTTACAAAATATTGTGTTGGCTTCGAGCTTCATTTTACATAGACTTGTGTTCAACTCGTTGGGAATTGGTGAAGTTACGGCTAGAGCCCATCCATATAAACTGTTCTAATACAGAAATATGTGCTTTTAAACTGCCATCTAGTTTTGAAGTTTGAACTGGCATATAATATTTAGTTACATACATTATATTGAGTGGGTAGTAATACCCAACTGACTCTCTGCCATCATGTGTTGAGGGGAAATTTAACTTGGTAACTGTGAAAGAATCAACTATACAGAATCCTGTCCTTTCTGATTGTGGAACTGGATTTGAATTTGAATTTAATGTCTAATCTTGTTAAGCTATGGTTACGTATTAATGTAAGCTGATGTCTAATAAACTTTTGCAATCTCAGAGTGTAATTTAAACTTTGTTAACTGTAGTAATTTTATTTTTTAAGCTTTTTTTTTTTAATTTAAAATGAAACTTGCTTTATTTTTATTACAAGATTTCCAAAGCTACTCCATGTTATCTTTTTGTAAGTGACTGATTTTGATGCCGAGATTTTAAAATTTGGATGATCTATTTTCTTCTTAAACTTGTGTTCCTATTATATGAGAAAAATATTGACCCATAGACTTATTTCGGTTAACAAGAAACTTCATTCCTTCTCTACTCTCGCAAAATTTTAGTTCACCAAGAATTTAATATAATGTATAATGTAACAGCATTACAACTCAGTGAGTTTTTCTTGGACTTGTTATCTCGAAAATGAATCTTTTATAATCTCTTTAATTTTTCAACATTGTAAATGTTTCCCCTTTTAGTTTCACTCATCATTTTAACTGTTATATGTTAGTTGTTTCAGTGCCTATTTATACTTATTTGATAAATAAATGTAGGATGCACCGTAATAAGGGGCAATTCACTTCATCTAAGAAACAAGATGGAGCTAATAGTTATGGTACAGACCAAGATTCAGGACAGGATGATAGTCAATCAGAAACCTCGTGAGTTGTGTTAATTATATTTTCTTTTAGCCATACAATTTGTCGCACTTTATAATTATATAATTCACATTATTAGAGACTTATATTGAGAAGTTATTACTAGATGAAGCTAATTTCCCTTTACTGGGAGGTTTCTAACTAGATGTTTTATCATTTCTTTTTTGTGGCATGTGTCTACAGATGCACACATTGTGGCACTAGTTCAAAATCCACCCCAATGATGCGGCGAGGGCCGTCTGGTCCAAGGTCACTTTGCAATGCTTGTGGGCTTTTCTGGGCAAATAGGGTAGGTATTTTCATCATACTGCTTTTGTTTTCGGGGAAAAATTATATACAAGTTTGAATTAATGTCTAGATGTATATATTCTTATAACTATAGAAATTTATATCAATGGCTGCCTAGTAACGATCAACATATACATTCTCAAGCATAGCATGCTCCTTTACTCCATTTGTATTGGAATTGGGAAGGGTTGATCTATATAAAACCTACAATTTTGTATTTTATTTTTTCTTTTTCTGTATATGTGGTAAGATTTTTAAAATTTATTGCAGCTTTAATGTCCATATTGAAGTGTTTTTAGTTTTATCTGTAGAATATATTTAAGAGCAATGTCTGTTTGTCTGTTATAGATGTTCTAGTATGTACTGTAGCTACATATGTAATCCATTAATCAAACTGCATATGACGTGAAATGCATATGATGACCTCAAGCTGTGCCTTTTGGTGCTAATTTTCTTCTACTAGATTCACAGGGAGCCAATTTAACATTTTCCCCTTAATCTGCAAGGCACGTAATCTTGCATTGGGGGAGGTGCAAATATATTGTTCATGAGAATGAATTCAAATTGCTCAATTCTGAATTTGCGATTATCTTTTAGCTGATTGGTTATAGTTGTTGGTGTTCCACCTTTTGACGATGTTATTGTGCAGGGTGCTTTAAGAGACCTTTCCAAGAGAAATCATGAACAGTCTCTTGTACCAGTTGAGCAGGCATGCATTCATTTATTATCTAGTAATCCAAATGGTAATATGTACATGCCCTTACATTTTTCTTGAATCTGATAACCAGGTCGATGATGGTAACGTCTCAGATTGTCGGACTGCCGCCAACCCTGCGCATAACAATCTGGCTGCATACTCAGAGCATGATAATCCTGCTTTGGTAGCTGATCGTAAAGTTTTCCAGTCCCAGAAAATGCTCGAGTAG