Genomic Resources - Ricebean Portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Gene Details:

Gene ID	Chr. No.	Start Position	End Position	Function	View on
Vu_26486	LG7	6328941	6333787	PREDICTED: homeobox protein HD1	Map

Annotations

category		relationship type		keyword

No SNPs found.

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_26486.1

MQEPRLGMMGGLSGEVSGDHHRQLKAEIATHPLYEQLLAAHVACLRVATPIDQLPLIDAQLSHSHHLLRSYVSHHTHSLSPNDRQELDNFLAQYLIVLCTFKEQLQQHVRVHAVEAVMACRDIENTLQALTGVSLGEGTGATMSDDEDELQMDFSLDQSSAEGHDMMGFGPLLPTESERSLMERVRQELKIELKQGFKSRIEDVREEILRKRRAGKLPGDTTSVLKNWWQQHAKWPYPTEDDKAKLVEETGLQLKQINNWFINQRKRNWHSNSQSVTSLKSKRKR*

CDS Sequence:
>Vu_26486.1

Promoter Sequence:
>Vu_26486::LG7:6333787-6335787(-)

GAACCAAACATTGACACCTCAACCTTCGACCCACTTTATCAACAACTAACAAAATTAAACTTAAATGAAGGTTGGTCACATCTTTTTTTTTTTTCTTTTCTGCAGTGGAGCTTCACTTTTTTTTTAATATACATCTTTTGCTGTTGCCTATGTATTCAATATCGTCGGTTAATTAATTTAAAACATCATATTATTATAACTAATTGTTTCCTTTTCTATTTGGTACAACTAACTATGGTTGAATTTTGCCCTCCCCACTAATTACTTTAATTAATAATAATATCTTATTTTTAATACGCGTAACTAGTTGTCGAATAAAATTACTCTTCAATTATGAAATAAATATGAAGTATAAGTTAAACAAACTGATAACTGCGCTGTCGGTGATTTGTTTCGTATAATTAAAATGTTGATACAGCGAACAAAAAAAAATGAAAAGTTGATCGTGCCGTTAAATTTCAGAATACGCATTAAATCTGACCTAAATTTATTTATGTAAAAACAAGATCATAATTTTATTTCTACAACTAACATTATTGGTGTGTGACAACAATAGAATAACTGTAAGGCTTCACCCATACACAACACAGAAGCAGTTACGGTTACCCACATTGCTTAAAGCGGATCGTTTTTTTTAAGACGTCTGATTTAATTAATGGAAATAATATAAAGTAATGTTTGGCAGTTTGATGATTTTGATGAGGCCGAAAAACTGCGACGCACATGTTCATAATTCAGGAACAGTTAATTCTGTGTTCTGTTTGGAAGCCTAAAAATGTAGTATGAAGTTTTTTTGTGATCGCAATAGACGAAACATGTTGGTCTTGTTGTTGAGGGAAAATTACTCTGTACGAAGGAGAACCGTTTATAAGGGGACAGAAGGAAAAATATATGTTTATTAATGTTTTACAAATTATGTTAACTTTGACATCTAACATTGAAGAAGCAAGCATGTGGATTGGTATGAAGCTCATACGACGCTCCTTGCCACGTTTGTTATCAAAGTGTCCTACAAGTTTCGTACATGCATGAGGCAATACTTCCACAGGGCTTACTTCATTCTCTTTATACCCTTTTTTTTTTTTAAATAATTGTGATAAATTTTCTTGTATTGAAATTTTGGTACAATAATTGTGATACACGAAGGGCGTATGACGTAAATTTAATGATTAAATGCATTTGAAGAAGGATTGGAAAGAAGATGTGAATGTAAGTGAAAAGCATGATGAAAATGAAAAGTGTTTGACATGTTTAAACAAAGTTTTAGCAGAGTCCTTGAAGTACCTAATTGTTTTGTCTGTTTGTTATCTCTTTTACTTTTAAAGGCACAGATTTTTTTCTTTGGTGGTGATAGGTGTGATAAACCCAAACCATCGTCGCCAATCAAATCAAAGTACCTTAGCCTAAAAATCCATTAATGTTCCAGATAAAAAATAAAAAAAAAATAAAATAAATAAAAGAAGAGGAAAAAGAAACGAAGGTGTCAGGTGACAGAAGCAGCTTTATCTTCTTTTTCTGACCTCGCTTCCATCCCCTTTCATAGTAATGATTCCGCAGCTTACTCTTTTCTCTGTCTCTCTTCCTCTTTCTATTCTCTCTCTCTTAAATAAAGAAAACAAAACTTCAATCTCTCTCACACAAACACACAGCACAAGCACAGCGCAGAAATCAACCGTGTTTAATGCCTTTGCTTCACCCTCTTTCTCTGTGTATGTAAAATCTTTGTTTTTATCAGAGGTCCTGCAGAAAGTTGTGTCTCAGATCCCTATATACACCGAAAACGATACAACTCTGTGCACTCTGTACTCTGCTTCTTTCTCTCTCTATCTCTGAAAATCATCATTTACAATTTTACACACAACCTATTACCGAATAGGGTGGTCCTCAACCTCGCTCTTTTTTCTTTTTTTTCCCTCTGCCTTCTGCCTGCCCTATATTATTCTGCTCTGCCTTTATCAATCCATCCATCGCGCTTCTCTTTCTCTCTAAAAATTGAGAAA

Gene Sequence:

>Vu_26486(-)

ATGCAAGAACCGAGACTGGGAATGATGGGCGGGTTAAGCGGCGAGGTCTCCGGCGATCACCACCGTCAACTGAAGGCGGAGATAGCCACACATCCGCTGTACGAGCAGCTCCTGGCTGCACACGTCGCATGCCTCCGTGTGGCCACTCCCATCGACCAACTTCCTCTCATCGATGCTCAGCTATCTCACTCTCACCATCTTCTACGATCTTATGTCTCTCACCATACCCACTCTCTCTCCCCCAATGACCGCCAAGAACTCGACAACTTCCTGGTAAATAAACCGAACAAACAATATTGTTATTTTCTTTCTCACATACACACAATTTCATGGATCCCTCTTGTTTGCTGTTACCACCGCAGGCACAGTATTTGATAGTTTTGTGTACTTTCAAAGAACAACTTCAGCAACATGTCAGAGTCCACGCCGTTGAGGCTGTCATGGCCTGCCGCGATATCGAAAATACCTTGCAAGCTCTCACAGGTATTTATTTACCAGTAAACTCTATTTTTTTTATCTCCTCTTACTCCATTTTTTTATCTACCATTTCTTATAGAAGAAAATCATCATCCATATTGATAAAAAAACGACGTATGATGTTGCCATTTTTTGTGAGGAGTTAATTAATGTTAATTTTCTGAGCGTGTGAAAGCATTTTTTGTTTCTTGTGATTTACGCGATTTAGCAGAAAGGAAAGAAGGTACATAATAATGGTATACATATTTTTTTCTTTTGTAAAAGTTTCTGTTGTCGAGTTAATTAGACTAAGGAATGGGGTGGTAGGGTCTAGAAATGTTATCTGGTGGAGTGTACACAAATGGCAATGAGAAGAGTTAGTTAGTTTGGTGAGGAATGGTAGACCCTCTTCTCCCACTATGTCACTGCCAACAACCTATAATGCCGTGACCCAATTATTTTCTCCCAGAAAGGATCTCCTATATATATATATTTATCCTATAATGCAACTTTCAGTAAGATTTCTTACACCATCTTGTTTTACTATTTTACTTGTATATTTATATTTGTAAGTATTTGATTAAATCAAGTATGGAAGTGGGGGATGGGAAATGAGACAAATTAATTAGCTTGTTTTAAACATTGGAATGATTTTAAACATCTCCTGACAAAGTATTTAATTGTAGGAGATGACAATGATTTTAAACAGTAGAAATTAGAGATTTTGGAGCCTTCCTAGTTTGTTTTCCCTGCCATATAAAGATCCCACATGAGTTTCTTGTCAATCTGCATCATGTTTCAGTACTGATAGTTCACACATAATATATTTGCTGAGATGAAAGAAAATAGAATAGATAGGATAGGAAGGGTAAAGAGAGAAGAATTCACAAGTTGATGTACTAGAGAAAAACATATATAGGACTAAAAACATTAAGTTGATTATCATCAAAAATATGTCGCCATCTTATGTATAAGGGTTTGAGATAGTGGAGAAAGGATATTGAGAGAATAAAAAAGATGAAGAGTGTTAAATTATATAAAAATAATAGACAAAATAAAAGGAAGGAAAACATTTAAAGAAACGAGTGAGAAAAATATCAAAACTCTTTCTTAAAAGGATCCTATGTTATTGAACATGCTTCCATGGAACTGCATGCTGCGTTCTAATAACCAGGCTGGCCTGTGTCTATAACGCATAAGCAAACGCACCCGAAGCTGAAAATTACATTCGAAGCCTTATATCACAACATTTACTCTTACAAATAATTCAATACGAGTTTAGTCAATCAATCATAGATCGATAGAAAATTTAAAATACTTAATATTAATTAAAAATCGGAGTTTATGAATTGTAGTTATACGACACTATAAAATATCTTCAATTACAGTATATTATTTATTCAGTATAAAAGCTTCTTTATTTATATTTTTCGTACTATAAATGTGTGTTAATCTGAAGGTTGATGAAGGATTAACCAAAGGGTCGATCTTTATTTAATATTTGATATTTGAATGTGTCTTTCTGTTTTTCCGGCCTTGTTATTACAATCCACCATTCAGTTAGTTGCATTAACAGTGGGAACTATTTAGGGTCTGGTTATTATAATTAAACACTAAGTTCTTATGGTTAAAATTAATTTTTACGTATTAACTTATGAATTAGTTAAATAAGAAACGTTACTTTTTTTATTAATTTATAAACAGTATTTTAAAAAAAATCGTGTTACTTGTGTTAGCTTTGGAACAATATATGTAGAGCTAACGTAAATAATTAACCAATTGAACATTTCATATAATACATGCTTTAGAAGACTGCTAAAATAAAGAATTGAAATTTTTGTAGAAAAATATTAGCAATATATTTAACAGTAGTTTTTAATAACATTTTCGTTATATTAATTTTTTTAACTTGTATTCTTAGAACACTCCATTTGACACTCTTTTATTGATTATCCTTGAGACAATTTAAATTGTTTTATTAAATTTATTGTTACTAATATACCAAATACCATGATTTTAAAAAGCCTCTTTTAGTAGTGATTGTTGAATAGTTGTTTTGCTCTTGTAATTTTTACATGTTAGGAATTGAATTTTACTCCAATTATATTACATTAAGTCTTTATTTTTTTATGATTTTGTTTCTTTGGAAATATTTCAGTGGTTATGTATGAATTAATTGTACCAGGGTGTATCAGTGGTTGGTTTAGTTGAGTTGGAAAAACTACACAATAATCACTTGAATTCAATAGAGCGCATTAAGTATTGCCAAGAGTAGGAGTGGGCAAAATTAGTTGGATTGAATTGAAATTTTCAGATCCAGCAAATTAGAAAAGTTAAGGGTCTATAATAAAAAAATTGTCAGTTTAGTTTTGAACATTGAACTGCTACATTTGCTGAACTGATTTATTTCATGACAGTTCAAAAATGAAAAAAATAACAACATGAAAGTGTTGTTGTATTTAGCTATACAACATCAAAACACAAAATATATAGATAAATTAGATTTCGTAAACCTGATAAGAGCTTACCTTATTTGGAATTAGTAGTAACAAATTAGTAGCTCTGCAATATTTTGAATATTTTATTTAAAACATGTTATTAGAAGCAATGAATTGGTTCGAACATAATTCAATTCAATTAGTGTAAAGATTAAGAATAAGTGTCGATTTGAAACTAAAAATAGTAGTCTATAACGGACTGAAAAAAACTCAACTAAAAATTATTTTTTCAGTGTAATTCAAGTATTACACCTGTTAAAAGCTTTGCATAAGTGGTAGATACATGAAGGATTTCTTTCAATATTAGAAAACTATATGGAGAAATTTTCTGGTTTAAGGAGATATGGTAGTAGTAGATATGAGGAATTTTTATGGTTATTTTGATATCCAACTAACGTGCAGCTGATAATTATGAATGATATAACTGCACATATGGCGTATTAAGTGGGATAAAGAAGAGATATTCAACTGTCCCTTTAGGATATCTTCAAAGTATTACTCACTTTAGGATAAAATAATTAACTTGAATTCGCCTGGTCAATGTCATCCCTGAATTATGATTAAAAATAGATGATTAGTCCATTATTGATGTTATCGGCAACTAACTTTATTGCATGCTTTTATGTATGATTAAGATGTGTCGAACATTTTGGCACTATTCAGACCCGTCATTGTTCCACTGACAAACCAAAGGGGCCCTTCTATCTTCACTTCTCTCCCTCATCTGCACTTTCAATTTCAAATCACCAAGTTGCCACCCAAAATTTATGCCATGCATCTTCTGCTCTAGCACATTAAATCCAGCCAAAACAAATTTCCTTTGTAAGACTAATTACTTCTTAAGTGTAATTTCTATGTAGAAGAAGATGATCCCAAGATGTCAGAGAAAAATATTTGGAGTATTGAACAAGAGTTTTATCAACCATATACTATGCTTTGACTACCCTCTTTTCCATGTATTTAGCCATTACGTTGTGTGATGTGTGAAAATATATTTCTGAAGTTGTTTTTGTCGTTACATTCTCAAAATTAAGTCATATGGAATGCTGTTTAATCATATTTCAGGAGTGAGTCTGGGAGAAGGAACTGGGGCAACAATGTCAGATGATGAAGATGAGTTACAGATGGATTTTTCTTTGGATCAATCCAGCGCTGAAGGGCATGACATGATGGGATTTGGTCCCTTACTTCCTACAGAATCTGAAAGGTCACTGATGGAGAGAGTTCGTCAGGAACTAAAGATTGAGCTGAAGCAGGTCATTCTTGTACTCAATATATATACATGCTACCTGTTCTTGCACTTTACATGTGGTTTCATATTTTCAGTAAGTTTGAATCACCAACCAGTTTTACTTTCTGCAGGGTTTCAAGTCAAGAATTGAAGATGTCAGGGAGGAAATATTAAGGAAACGTAGAGCTGGGAAATTACCAGGTGACACAACTTCTGTGTTAAAGAATTGGTGGCAGCAACATGCAAAGTGGCCTTATCCTACTGTAAGTGAACACCTTCTCATCATGTTCCTTTCATCTTGCGTGTAATCAATATTTTCATAATTTTGTGTTTCCTTGAAATCAATTCTAGTATCAACTTATGCATGCGTCCACAACGTTGTTTCTTTGCTAAGAAAGAGTTCATATGTCATACCCCAACATTGCTAAGATTCTGCTATTTGTGACATCTATGATGTATCATTGGCATGTTATCAATGATACATTAATGACCTCTGACTGATTGATTTTGCTTTGTTTCAGGAAGATGACAAGGCAAAACTTGTGGAGGAGACAGGGTTGCAGCTGAAGCAAATTAATAATTGGTTCATCAATCAAAGGAAACGCAACTGGCACAGCAATTCTCAATCGGTTACCTCTTTGAAGTCGAAACGCAAGAGGTAG