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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_26362 LG7 2809966 2812714 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 2810551 downstream_gene_variant
T/A 2811020 downstream_gene_variant
T/A 2811106 downstream_gene_variant
T/A 2811348 downstream_gene_variant
A/T 2811871 downstream_gene_variant
G/C 2811965 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_26362.1
MKDGGRKQGAPSPCAACKLLRRRCAQDCVFAPYFPADEPHKFANVHRVFGASNVNKMLQELPEHQRGDAVSSMVYEANARVRDPVYGCVGAISSLQQQIDVLQTQLAVAQAEAVHLRVRQNASLYSPTSPTNTASPSSKIIHSQQPKPIFDIDMDMVVDHTTYTDSIWVLEIVVIAAVAVAVRAVADTVRPLN*


CDS Sequence:
>Vu_26362.1
ATGAAAGATGGTGGTAGGAAGCAGGGTGCACCCTCACCCTGTGCTGCATGCAAGCTCCTTAGGAGAAGGTGTGCTCAGGATTGTGTTTTTGCTCCTTATTTTCCTGCTGATGAACCCCACAAGTTTGCCAATGTTCACAGAGTCTTTGGTGCCAGCAATGTCAATAAGATGCTTCAGGAGCTACCAGAGCATCAGAGAGGAGATGCAGTGAGCAGCATGGTGTATGAGGCAAATGCAAGAGTGAGGGACCCAGTGTATGGGTGTGTGGGGGCCATTTCATCTCTTCAGCAACAGATTGATGTGTTGCAGACCCAATTGGCAGTGGCTCAAGCCGAAGCAGTGCATCTCAGAGTGCGTCAGAATGCATCTCTCTACAGCCCCACTAGCCCTACCAACACTGCTTCTCCATCTTCCAAGATCATTCACTCACAACAACCCAAACCTATTTTTGATATCGACATGGACATGGTCGTCGACCACACCACCTACACTGATTCAATCTGGGTTCTAGAAATAGTGGTGATTGCGGCGGTGGCGGTGGCGGTGAGAGCTGTGGCGGACACTGTTCGCCCGCTTAATTAG


Promoter Sequence:
>Vu_26362::LG7:2807966-2809966(+)
TAAGTTATATTTGAGCAATGGTCATGTCTTGATGCATCAGAAGAGCATAATGATGAGGATGACATCATTAGGACAATGTGCTAGGTTAACGTTGTTAGTGAAAAAAATAAAGGATGACTATATGGGATAGGACAACTTACTCAAATCACACTACTAAAAGAGGCACTCTCAAGCACCAACCATCTTCTTCCAACAGTGCTAAAGAGGTTGGTATCCACCTCATGCAACGACTAGAAGCACGTGATTAGGCTTATGATGATTTGAGTCGCAAGTTTGCCACTTTGCAAAATATGGTCATGAGATTCTTGTCTCTGGAAGCACAGAGTTGTCTTCAACAGCCTTAGTCTAACCCAATATCGTCCCATCAACAACTCAGTAAAAGCCCACCCCACCCCACTCCAGCTACAATTCCAACAGCAGCAATAAAACCCTAAAGAAGAAGAAAATTATGATGGATACGTAGTTTATTAGGACTTTGTTACTTATAGACATACTTTTAAAAATTTTATGGTTGTCTAAATTGCCTTATAAACATGTTTGTGATGTTTGTCTGATATTGTATTAATGTTTGTTTGGATTTTATTGTTTGGTTGATTTTTCCAATTTGTATTGCCTTTGTTTATGTCCAGGATGTTTGTGTGGTAAGTAGGAAATAAATCCAATACATTAGAAACTACCATGTCATTTATCGACATAATTTATCGATGGATAAATTCGTCAGTAATCACCCACACTATTCATGTAATTATTGATGGATTCATCCTTTGATAGGATACATCCATATGTAATTACAAAAATATATATTCGTCGATAATTATTGATGGACGATATCGATCGATAAATTTTACCTACAATATTTTTATCGACAGATTTTAATCTATTTGTAATTTATCGAAAAAACAATGATTATCAACGAATTTTTATTATTTTCGATAGATATTGACCATCAATTATTTCAGTTCTTTTAGTGGTTGTAGAGATGTTATTTATGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTATTTCTTTTATTTTCATTTTAAAAAAGTGTTTGTTTTCTTTTAATCCCTATAAATGTTACTTTTTTATTTTATTTTCAATAAATATATAACTTTATGTACATGATATTACAAAATACAACTAAATTTAACTTTGACGTCAAATTAATAAGAAGGATGATTTTAAAAAAGTTGTCAAGGATTAAAATAACAACAAAAGTTTAAGTAGCAAAACTAAAATAATTGTAAACGTTAGGTACAAAAACTTAATTAAACCAAAATATAATAATTATTGTTAAAAGTAAATATATCTAAAAAGGACTGTCGACTAACCTAGCATACATAAACCCATTAGAAATGCAGACAAACTAAACAGGCCATGTCAAAAGCAATCAAATTTAATTGAGCTAGCAATCAATCCATTTTAACACTTCCAATATTAAAATTTTATAGTATAACCATAAACCATGCATATTTTTAATGAAATAGAATTATTTAAAATAGATAGGATATACTATAATAATAACCCTAGTGAGACCTACTCATTGATAACATAAATTGCGAGTCGCACGCATGAAGCAGTACGGGACAAGAAGATGTTGGGGACCCAACGAAACATGGATGAAAATGTGAAGAACAACCAAAGGTGATTAATTTAATTCTATGTGTTAATTAATTGGACCCACATGAATTCTACATAGAGTAATGCACAACTCTGCTGCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTAATTATTATATAATGCAGGCCTCCTTCATTCCCTAACCCCACCACCCTCTCTTTCTTTCTCTCTCTCACACACACACACACGCCCTCTGTCTTTTCTTCCTTTTATTTACTTTATTTTCAACTATAAATCCTTCTTTTGTTGCTCTACCATTCTCATGTCCTTTTAGAAGTTTCAGAAGAAGGGAAACA


Gene Sequence:
>Vu_26362(+)
ATGAAAGATGGTGGTAGGAAGCAGGGTGCACCCTCACCCTGTGCTGCATGCAAGCTCCTTAGGAGAAGGTGTGCTCAGGATTGTGTTTTTGCTCCTTATTTTCCTGCTGATGAACCCCACAAGTTTGCCAATGTTCACAGAGTCTTTGGTGCCAGCAATGTCAATAAGATGCTTCAGGTTCTTTCCTCTCTTATATTAAATGCTTCATTCCTTCAGGATTCTCCTTATTATCTTACATGCATCTCAACATTTTACTTTTCACCAACTATGATCTTGTTTCCTAGGTCGCTTTTTACTTTTTTCTTTCAATTCTTTTTGTGAATAACATGTAACTAAGAAATATTGAAATTCATAAGTCAAGTTTCTGAACAAAATTAGTATTCAATAAAATGAAAAAATAATAACGTAAATAACTCAAAAAACAGTTTTTTTTTTCTCTTTCTCAACCACCTTTCAAGCATATGAACTCTATTAGGTTCAAAGACTGCAGACTTTCTTAACGAATTTATGGTGTCTGTTTTTGGTATAAAGATCAACAACCTTGCAGACTAGTGCGACGCTTTCCTTGACCATTGCTCAATCTTTCACATTATTTTCTTGTAAGCTTTAACATGCTTCTGTCTTTTCTTCTTACTTTAAACTATTTACGTCATATATATACATGGTAGCTAGTACATTTGTTTATGGCATGTTTCTATCTTCTGCCGATTATTTTCCATGGTTGTGGAACTATAGCATATAGAAATTCCGTAATATGATATACGAAAATGATTTGGTGTGAAAAAGTTTGAAAATAATACTAGCTTAATTTATTTGTATGCATTAGACAAAGTTGTATGTATCGGTGTGTGGAAAATATAATATAGAATTATTGGTACGTTGAATTAAGCTTTGGAGAGAAGTGATTGTGAAAAACCACGAATTGATACTTTTTTTTTTTTTCTAAGTAGCCCTTGAAAAATTAGAAAAGGTGGAGAAGATTAGGCATTCGGCGCCTTCAAACCTCACATCTCACATCTCACGTCCTAATCCCTTTGTCTGCTTTTCCATTCATTCATATTTCAATATTAGGTCAGTCTCATCTTTTGGTCTGCCATGTGTTCGTTAAAAATAAAAAAGAATAGGACAAATGAAAATAAATAAATAAAAAATCTCCTTTGAAAAAGTTTATGCGTAGCCTTATATTTATTTAGATTTTTGAGAAACTAAAATATTGTATCTCTTTCTTCATGGATCGTATCTTGGGCCACCCAATAGGAGCTTCAAAACGTGGTTTTGTCACCAAAAGTCAGGGTCAAGCACAACACAAAGCGAAACTTAACAAGCAACGTACGTGCGTGATTGTGTGAAACCACGTTTAAGAATCCAAACTCCACTTCACCTTCTCTTGTCACAAACCAAAAGAAAAACAAATTATTGAAGTAACATCCTGCTTCTGCACCACGTGAACCTGCTTTTGTCATAAATTTTTTAATCATATCCATTCAATAAAATTACTCATTTCGTTGTCAAACATCAAATATTGTAACTTATCGGATCCTTTAAGATGCTTTTATTGCTAAAACAATTTCATTAACTAGTTCAAAAATAATAATAATAATAATATACCCTCTTTCTTCTCTAGTCCTATAGAGAGAGAGGGTCCTTCTAAGTACTCAGTTAAACTTGAGAAATTTAAAAAATATATATATTTAAAATTTGAAGAACCTTTTTCTCTTGATCTTCTTCGTGTCCCTTCTCTTCAGCAACGACTTTTTATATTATATACGAATAAATGAAACCTAGTGAAAGGATAGTATACTGACTAGAAAAAGAAGTGTTAAGTAATTAAGGATGCTTTTGTTAAAAAGTTTAACGCAGAAGATAAATTGAACGTCTTAAAAAGTATCCAGAAAAAGTCCAAAAAAGGACAGAGATTAATATAATACAGGTGATGCAATATGAAAAAAAAATGAGATAAAAAAAAGGTGAAAGTAGTAGTACTGTTGAAGCATATGATGAAACAGTTACAAAAGTAACGAGTGAAAGTGACATTAATGTTATATCAGAAACTTTTTCTTCATCAGTTATTTAATTGTTACAGGAGCTACCAGAGCATCAGAGAGGAGATGCAGTGAGCAGCATGGTGTATGAGGCAAATGCAAGAGTGAGGGACCCAGTGTATGGGTGTGTGGGGGCCATTTCATCTCTTCAGCAACAGATTGATGTGTTGCAGACCCAATTGGCAGTGGCTCAAGCCGAAGCAGTGCATCTCAGAGTGCGTCAGAATGCATCTCTCTACAGCCCCACTAGCCCTACCAACACTGCTTCTCCATCTTCCAAGATCATTCACTCACAACAACCCAAACCTATTTTTGATATCGACATGGACATGGTCGTCGACCACACCACCTACACTGATTCAATCTGGTGATCCATGCTACCACCTCTTTTTATATTCTTACTATTATATATAATACTTAGACACAAAACCTATATCAGACTAAAGTAATGCATTCTCTATACTTTTACTTTCATCACTGCTAAAACAATGCCTTCTTTATTATCGTTATAAAGTTTGTTGGAAACCGCAAAAATTTCACAGGTTTTTGTGATTTCTAATGGATTTTAAGCAATAATAAGAAATGTGTTAATGTTGAAAAGTGATTTCTCATTGTAGAATGGAAGTAGGGTTCTAGAAATAGTGGTGATTGCGGCGGTGGCGGTGGCGGTGAGAGCTGTGGCGGACACTGTTCGCCCGCTTAATTAG

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