Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_26184 LG6 38321673 38326687 PREDICTED: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g27290
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 38323883 intron_variant
A/G 38324326 intron_variant
G/A 38324333 intron_variant
G/A 38324664 intron_variant
T/C 38326248 missense_variant p.Met489Thr
T/C 38326269 missense_variant&splice_region_variant p.Ile496Thr
T/A 38326287 intron_variant
C/A 38326314 intron_variant
T/G 38326317 intron_variant
C/G 38326331 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_26184.1
MNENVTLVSTNGTFEAGFFSPGNSRSRYLGIWYKTISPRTVVWVANKETPLQDHSGVLELDSDQGFLSIKNGAGAQIWSSNASSNTPSKPVVVELLESGNMVVKDGHDNFLWQSFDYPGDTFLPGMKLGMNLKTGHHRALRSWKSLYDPTPGEFSFGVDTRGLPQLVITKSDDIVYRPGSWNGVRVTGVPAQGSHPLTKSLFVMNEDEIFYEIQLLNSSTKLRSRLLPEGYQIRLIWSDEGEKWDTVYSGSFDECERYGMCGANAICNVSGEPQHCECLSGFKSKAADSTCDRIRPLDCNKGDSFKKYEGVKLPDTSSSWYDTRMSLEECEKLCLSNCACTAYAQLNISANGSGCLQWFNDIVDIRTLADGQDFYLRIAASKFQDHALNRKIGGIILGCTIFIIAIVVFGFIFCLRRNKLKQSDFGMARIFNLDQDEANTNKVMGTYGYMPPEYAVHGSFSVKSDVFSFGVIVLEIISGRKNRGFRDPHNELNLLGHAWRLWIEKRPMELMDESMDNAVDPSQILRYIHIGLLCVQHRPEDRPNMSSVVLMLNGEKLLPEPTQPGFYTGRNNLTMTDSSLRNLDACSLNEMSETLLLAR*


CDS Sequence:
>Vu_26184.1
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Promoter Sequence:
>Vu_26184::LG6:38319673-38321673(+)
CTTCTTTCTGAAAATAACTTGTCTGAAATCACCACTGTCAAAGATCATCTCCACAGCAAGTTTCACATTAAAAATCTTGGAGATCTCAAATATTTTCTGGGATTCGAAATTGCTAGATCTCAAACTGGAATATGCATCAATCAAAGAAAATATTGTCTTGAATTGATTTCTAACGCTGGTATGTTAGGATGTAAACTTGCTCCCACCCCTGTTGATCCTTCTATCGAACTTCATGCTGATGAAGGCATCCTTCTCACAGATCCTTCTTCTTACCGGCATCTTATTGGACGACTTCTCTATCTCACTAATACATGGCCTGACATTGCTTTTGTCGTCCAACAACTTAGCCAGTTTGTTTCCGCTCCTCGTCAACCTCATATGCAACAAGCCATGAGGATCATTAGATACTTAAAGAATGCTCCTGGTTCTGATCTATTATATGCTGCTAATAATTCCTTCCGCATTCATGCATACTCTGATTCTGATTGGGCTATTATGCTACCACTAGAAGATTCATTTCTGATTTTTGCGTCTTTCTTGGAACTGCTCTTATCTCCTAGAAATCAAAGAAACAAACCACTGTTTCCAAATCTTCTTTTGAAGCCAAATACAGGTCTTTAGCTTCCCTAACATGCGAATGTTTCTATCAAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTGTGTGTGTTCACGTAAACACAGTCATTCAATACTAAACATTATATGCACTCATTCTATCTTATTTATACTATTTTATTGACCTTGAGTATTAAAGAGTTTTCTACAAGGGGATCTGTCTCTAATTTTTGTAAGCTCGGTCGAGATTGTTCAACAACAATCCAACACCCTAAGAGCATTGACTCCCCTTGAAGATTGCTTGGTGATTTCTGGAAATAACAAATATATATAATCCAATGTTCAAATTAATCCTCCTTTTGCTACTCCAGAGTAAGATATATTGTTGAGCAATATGCATTTCAATTTTATTCTCAACGCGAAGAACGAAGACAAAAACTTTTGATCTCGATTTTTAAAGTTACAAACTTTTTAACCACGAGCAAAATTGGAAAATAAATATAAAATATAATAAAGAATATGTTAGAGAATGATAACGACAGAAAAATATATAAACTACTATCCCAGTGCCTATCGTCAAGAGTGGAATGATCGCTATATTTATTTACCTTAAATTTGCTAGATATTTTTTTTGCCTTTTACCGTATTCATTGGTGTGGGGACGGTCACACGTACATGCTATTTATTATACGGGGAAAGTAATTATCAAAACATAAAGAATATAATTCTTTATTGTGTAAATCTCTATTTTCATTTATCTACTTGAATTGCATATTATTAATTTAAAGCTACTAATGAAGGAGACTTTTACCTAAAAGAGATTTGAAATGGTAGTCAATATGCGAACTTCAAGTTGCATCTGAATATCTTCATCAAATACTACTCTTAAGAAAATTTCTTTTGGTGTGTTTATCATGTTAAAACTCCATCAAACGCTTCTCTCAAGAAAATCGATTTTTTTAATGCTTATTAATATTTTTCAGTACTTGTCAAATCTATTTAGAGACAACTTTATATTGAATTATGAGCACAGGTTTAAATCCAGAATTACTCGTTCGAGTTAATGCATTAAGATTCTCATCAATTTCCGCAACTACCCGAGAAATAAATAGTCATTAAAGTATTTATTTATTCAGCCTTCTTTCCTTTATAGTGCATCTCACTAAATTAACCACAAATAAACACAGTCTTCACTGTTTGAATTTTCTTGACCATGTCCTAGGAGATGTTTATTTTCCTCTTTGTTGTTTATAACTAGCCAACCACATTGTCTATGATAGAAACCGTACCAAAATCAATGGAGAGCTTTGAAATCCTTGGTGGATGCCTTTTGTTCCTCTCTTTGTTATCCATTTCCTCCACTTTGGACATGATTACTCCGACCCAACCTCTGAGAGATCGTA


Gene Sequence:
>Vu_26184(+)
ATGAATGAGAATGTAACTCTTGTCTCAACAAATGGAACCTTTGAAGCAGGATTCTTCAGCCCTGGAAATTCCCGTAGCCGTTACCTTGGAATTTGGTACAAAACCATATCCCCCAGAACAGTGGTTTGGGTGGCCAACAAAGAAACACCACTTCAAGACCACTCTGGAGTCTTAGAACTAGACAGTGATCAAGGGTTTCTTAGTATAAAAAATGGCGCAGGAGCCCAAATATGGTCCTCAAATGCATCATCAAACACACCAAGCAAACCAGTTGTCGTGGAGTTGTTGGAATCAGGAAACATGGTTGTGAAAGATGGCCATGATAACTTTTTATGGCAAAGCTTTGATTACCCTGGTGATACTTTTCTTCCAGGAATGAAGCTTGGAATGAACTTGAAAACCGGTCATCACCGAGCTCTGAGATCTTGGAAATCCCTCTACGATCCTACTCCAGGTGAATTTTCATTTGGTGTTGATACTCGTGGCCTTCCTCAACTAGTTATCACGAAGAGTGATGACATAGTTTATAGACCAGGCTCTTGGAATGGTGTTAGAGTCACAGGAGTACCTGCACAAGGATCTCACCCATTAACGAAATCCCTTTTTGTTATGAATGAAGATGAAATCTTCTATGAGATTCAACTCTTGAATAGTTCAACTAAACTGAGAAGCAGATTGCTCCCAGAAGGGTATCAAATACGTTTAATATGGTCAGATGAGGGTGAAAAATGGGATACTGTATACTCTGGTTCGTTTGATGAGTGTGAGAGATATGGTATGTGTGGTGCTAATGCTATTTGCAACGTGAGTGGAGAACCTCAGCACTGCGAATGTTTGAGTGGATTCAAATCCAAAGCTGCGGATTCAACTTGTGATCGAATTAGACCTCTGGATTGCAACAAGGGAGATAGTTTTAAGAAGTACGAGGGAGTGAAATTGCCAGACACATCTTCATCTTGGTATGATACGAGAATGAGTCTTGAGGAATGCGAGAAATTGTGCTTGAGCAACTGCGCTTGTACTGCATATGCTCAATTGAATATCAGTGCCAACGGAAGTGGCTGCTTGCAATGGTTTAATGACATTGTTGACATCAGGACACTAGCAGATGGACAAGATTTTTATCTGCGAATTGCAGCTTCAAAATTTCAAGGTATGTATACCTTTTTACAATTCATTCTTGGTTAATTCTATCGTCTTTTCATGGATGCTAAGTTCTACCCTGCTAGAAAGTAAGAAGCATTTATGATGAATTATGAAATAGATACAAAGTTATGCTAGGTGAATGCAGGTACAGTAAGCGTACTCGGTAGAAGGTAAGGTATATATATACGGGGAAAAGAAAAAAACAAAATATACAAAGGGTATGCTATTAACTTTTTAGAAATATATATATGCAAATGATGAATACGAAATATTTGTGGATTTCGTGAAAGTATTTATTTATTTATTTATAAAAAAAGGAATTCTCATGACTCACATTGCTGAACAAGTTTCGACAATTGCGAAACTCAGGCGCTGAAATCGAATACTAAAGTAAACCCAAATTACTGCAAAATACCGTGATTATTTTTGAAAAATGTTTTCTTAATAATTTTTTTACAACAATCTCTGAATAGATTATGCAATAGTTTATGATGAATCAATTTTAAATATATAAACCAATAAAATAATTACACATAATTTATCATGAAAAAATTGTTAAAAAAATTGTTAACTTGTCAAAAGTCAAGAAAAAAAATACTTAGTCATGAATGGAGATGAGAAATAAATCTCTTTGCATAGGTATTATCGCATGAACATATCCCGCTTTCATTGAAGAATTTTCATATTAATTATATTAATTGAGCATGGATAAAAGTATGGTTAAAACTTGATTGTTTAAATTGGATATGGATTAAGGATAATAACGTGCATGTAAGTATGTAAAATTGTTTTAATTGGGTATGGATTACACGGATGAAGATGTATGAATATATGTATACCTAAGTATGTGCAAGACTTTATTGTTTACATTGTGTATGGATTATATATATCTTTTTATATGCATCTAACTCATTTATGTCATCACGTGTCATAATGTTACATTTTTGTTTTCTATTAATAAAATACTCAATTTATTCACTTTAAATATTTTTAATTATTTTTTATGTTTCAACTTAAGAATATTTTACTCTCAATTTTAAGTATAGTTAAATCCTTAATTTATTTAGAAGAACATAACTTATATTCTTTGTTCTATTTGGTATAATTCATTCAATGTCTAAATTAAATTTTTCCCTTTGCTTGATTTCATTTAAATGATTGTATTTCGAGAAATAAAATCCTTGATTTGTTGAATCAACACATCTAAACATTTTTAGTCTTTTCTACCATTATTTGATATTTATTTATTTATTATTTTGTACTTTAATTCAATACTTACACAATTATAATTTCTCTTATGATTTCTGAAATTGAATAAAAAATATATATAATCTTTATATTAAATACTTGATGTTTATATAACTCTAACAATATAAACATAACTAATATTTTAAACATCAATGGGTACTACCAGTACGATGTTATTATATCCATATTATTAGAGAGGGACCACACCCACCTATCTCTTGTCATCCTTGTAGTTACAAATGTTAAGCTCAATATTAAGAATGAAAGAAAATAATGGAGAAAGAAAAGAAAAATGTATTTGAGGGTGTAGAAAAATAATCGAAGTTAAGTAGGATGTTTTTGAAATTATTTTTATAAGAAAAGAAAAAAAAATATACATGAAATAAAACAAAAAATAAAATAGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAACTTAAATTGGGATACTTATATTATTTTCTTTTCAAGTTTTTATTTTCTTTCAATTTGGAAAGTTGCATATCCCTTATAAACCAGAAGATGTGTTCCCAAGGTTAAGTTGTACAAGAATTTCTATATATCTCTGTTTCTGTTTATATGTGATGTAAATGGTCCAATGTGAAATTGTGTGTCTGTTGATTATTAGTTGATTATGTTCTTAATCTTTCAGATCACGCCTTAAACAGGAAGATAGGAGGAATTATACTTGGCTGCACTATATTCATCATCGCCATTGTAGTATTTGGGTTCATATTTTGCCTTAGGAGGAATAAACTCAAGCAGTCAGGTGAAGTCATTATGATTAAATATTGCCAATGTAATTTTTGTTATATTTTACTTTAAACCGAACAATGACGGAATGTAAATAATGTTAAAAAAAAATCCAAACAAATGACTGGATTCTTCAATTTACTATGGTTTGTTTGAAAATTAACAACCTTTAAATAAGTGGACCAAATACATATAACAAAACGCTTCTAAATAAATGAAAAATTAAAACTATTTATCTTTATTTTATCTCAATCAAAAATAAACTAAATTTTATTAAACCCAAAATAATAAAATAAGATTTAAACAAAATTATTAATAAATTCTTAAAATTTAAATTTACCTCAACAAATAACAATTAATCTTCGTTTCTATGCGTTGAATTTTGTTACACTTTACGGAAAATTCTTCTCTATTATATCTTTGTTTTGCATAAGATCTGATAATTTTTTTAGTGGCAGAAACAGAGTACTGGAAGGAGAAGAATAAGAACGATGACATTGATTTACCAATATTCGATTTTTTATACATCTCCGATGCCACAAATAACTTTTCTGAGAGTAATAAATTGGGACAAGGGGGATTTGGACCAGTGTACAAGGTATGAATTAAATTTTAGTTACCATTCATCTTCGCATAGAAATAACTTTTAAAAATTATTGTCAGGGCATATTATCAGATGGGCAAGAAATTGCAGTTAAGAGGCTTTCCAAAACTTCAGGACAAGGTTTGGACGAGTTTAAGAACGAAGTAATGTTGATTGCAAAACTTCAACACCGCAATCTGGTAAAGCTTCTTGGTTGTTCTTTTGAGCAAGAGGAAAAGCTGCTAATTTATGAATTCATGCCAAATAGAAGCTTGGATTACTTTATTTTTGGTGGGGCTTTTGTTATGATCTAATTATTCCAATTTTTGTGATATTTTCCGTCAGACTGTTATGCTAACATGGTAGTGAATTTTCAGATTCAATAAGAAGTACCTCAATAGGTTGGGCTAAGAGATTTGAAATCATTGATGGAATTGCTAGAGGACTCCTCTATCTTCATCAAGATTCTAGACTGAAAATCATTCATAGGGATCTCAAGACTAGTAATGTTCTTCTTGACAGCAATATGAAACCAAAAATATCAGATTTTGGTATGGCTAGGATATTTAACCTAGATCAAGATGAAGCAAACACAAATAAAGTGATGGGAACATAGTAAGTTTTTCTATACTTGTTTATTTCTTTCCCCTTTTGCAAACAGTTCTAAATGCTCATGTCTGAGTAATGCTTTTTTTCGCAGTGGTTATATGCCTCCCGAATATGCTGTACATGGATCATTTTCAGTCAAATCAGACGTATTTAGTTTTGGCGTAATTGTATTGGAGATAATCAGTGGGAGGAAGAATAGAGGATTTCGTGACCCACACAATGAGCTAAATCTTCTTGGACATGTAAGTTAAAAACTTAATAACAATGAGCTAAAATCTTTTTGTAACAATAAGTCTTACTGAACTAAGGATTGAGTTAAATTTAAAATTATTTTTTAATGATTTTTTATAGGCATGGAGATTATGGATTGAGAAAAGGCCAATGGAACTAATGGATGAATCAATGGACAATGCAGTTGATCCATCTCAAATATTAAGATATATTCATATTGGTTTGTTGTGCGTACAACATAGACCAGAGGATAGGCCAAATATGTCTTCGGTAGTTTTAATGTTGAACGGTGAAAAGTTATTGCCTGAGCCAACTCAACCTGGATTTTACACGGGAAGAAATAACTTGACCATGACAGATTCTTCTTTAAGGAATTTGGATGCGTGTTCTCTCAACGAAATGTCTGAGACATTACTTCTGGCAAGATAG