Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_26183 LG6 38265333 38268498 PREDICTED: TMV resistance protein N-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 38265388 missense_variant p.Lys906Met
G/T 38265394 stop_gained p.Ser904*
A/G 38266049 synonymous_variant p.Thr712Thr
A/T 38266743 missense_variant p.Ile481Asn
T/C 38267431 intron_variant
C/A 38268247 missense_variant p.Glu84Asp

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_26183.1
MHSRVKKLEELLDLSANDIVHLVGIVGMGGIGKTTLATALFNKISPQFNACCYLDDLSKIYCNFGAASAQKQLLCQALNQGNIEIHNSSHGTMLIRTRLCHLKALVVVDNVDQIEQLKKLGLQSEYLGAGSRIIIISRNCRILQNYGVNKVYQVEVLDKTQSLQLLRKKAFRSNDIGKEHKGLTLDILKYVNGLPLAIEVLGSFLLDRDVCEWRSALTRMEENPSKDIMDVLRISYDGLENIEKEIFLDIACFFSNNNSYSWEPTVKKFLDYRQFYPDIGMKVLIEKSLISRQNGNIKMHDLLKELGKSIVREKAPKEPRKWSRLWNYKDLQKVMKINKEAENVEAIFIKQHEKEFLQGRIRVDTLSKMDQLELLILKNVNCYGTLNFISNELRYLFWNHFPWLSLPSTFIPDQLVELILPHSNIKQLWEGKKCLPNLRNLDLSHSKNLIEAPDLSEVPRLTDLDLKGCIQLVHIHPSIGILRDLRRLNLKSCKNLIEVSDLSEVPRLTDLNLKGCIQLVHIHPSIGILRDLRRLNLKNCKNLVLNLNILFGISSLKTLNISGCSQLLNSKMLMDPSDTKHLEKVDKNTNIIQLPTSSVYKLLMLPFHFFYPPKPQVSLGLLSSFLSFSVPCLCDLDISFCNLLQIPDEIGNLRSLEILNLGGNKFVTLPSTIKQLSNLRCLNLTQCKELKYLPELPKIQEITIGRCYSLYTFDCSKLSDMEHCYSIVFSCWMTKNLEDYLVPRMEIVIPGSEIPKWFSKQNASTSISMDPSAVIDDPNWIGVSICALFVTHEGPMNLDERDYPTNDYLYYGVNNFINFGLKMYSRVSLKFKKDLVTLGLDYLLIVLYSRQDFIHLLNRHSDTMHDLQAVKFETWVESLPGLGFMVKKCGYRWVFKEDLQQFNSDKFFSRNSSSRKRKLLTSE*


CDS Sequence:
>Vu_26183.1
ATGCATTCTCGTGTTAAAAAATTGGAAGAACTTCTAGATCTGAGTGCTAATGATATTGTTCACCTTGTGGGAATTGTTGGAATGGGTGGAATAGGAAAGACCACACTTGCAACTGCATTGTTCAATAAAATCTCTCCTCAATTTAATGCTTGTTGTTACCTTGATGATTTAAGCAAAATTTATTGTAATTTTGGAGCAGCAAGTGCACAAAAACAACTTCTTTGTCAAGCTCTAAATCAAGGAAATATCGAGATACACAATTCTTCCCATGGAACTATGTTAATAAGAACTAGATTATGTCACTTAAAAGCGCTTGTTGTTGTTGATAATGTTGATCAAATTGAACAATTAAAGAAATTGGGTTTGCAATCTGAATATCTGGGTGCAGGGAGCAGAATCATCATAATTTCTAGAAATTGTCGTATCTTGCAAAATTACGGAGTAAATAAAGTTTACCAAGTTGAAGTCTTGGACAAAACTCAATCTCTTCAATTACTTCGCAAGAAAGCTTTTAGATCGAATGATATTGGGAAAGAACATAAAGGGTTGACATTAGATATACTGAAGTATGTGAATGGTCTTCCATTAGCTATTGAAGTATTGGGCTCATTTTTACTTGATCGAGATGTTTGTGAATGGAGAAGTGCATTGACTAGAATGGAAGAAAATCCAAGCAAAGATATCATGGATGTGTTGCGAATAAGTTATGATGGATTGGAGAATATAGAGAAAGAAATATTTCTAGATATTGCTTGTTTCTTCTCCAATAATAATTCCTACTCATGGGAGCCAACAGTGAAGAAATTTTTGGACTATCGACAATTTTATCCTGACATTGGTATGAAAGTTCTGATTGAGAAGTCACTTATAAGTCGTCAAAATGGAAATATTAAAATGCATGACTTGTTGAAAGAGTTGGGTAAGAGTATTGTCCGAGAAAAAGCACCCAAAGAACCAAGGAAGTGGAGCAGGTTATGGAACTACAAGGATCTCCAAAAAGTCATGAAAATAAATAAGGAAGCCGAAAATGTTGAAGCTATATTTATTAAACAACATGAAAAAGAGTTTCTACAAGGAAGAATAAGAGTGGATACTTTATCAAAAATGGATCAGCTTGAGTTGCTCATTCTGAAGAATGTGAACTGTTATGGAACTCTCAATTTCATTTCTAATGAACTGAGATATCTATTTTGGAATCACTTTCCTTGGTTGTCTTTGCCATCAACTTTCATTCCAGATCAACTTGTAGAATTGATCCTACCTCATAGCAATATCAAGCAATTATGGGAAGGAAAAAAGTGTCTGCCTAATTTGAGAAATTTGGATCTGAGTCACTCCAAAAATCTTATTGAGGCGCCAGACTTAAGTGAGGTTCCACGTCTTACGGATCTTGATCTCAAAGGATGTATACAACTAGTCCACATCCATCCATCCATTGGTATTCTAAGAGACCTTCGTCGTTTGAATTTGAAAAGTTGTAAAAATCTTATTGAGGTGTCAGACTTAAGTGAGGTTCCACGTCTTACGGATCTTAATCTCAAAGGATGTATACAACTAGTCCACATCCATCCATCCATTGGTATTCTAAGAGACCTTCGTCGTTTGAATTTGAAGAATTGTAAAAATCTTGTCCTTAATCTGAATATCCTTTTTGGGATCAGTTCTCTTAAGACCTTAAATATCTCAGGCTGTTCACAATTACTTAATAGTAAGATGTTAATGGACCCAAGTGACACAAAACATTTGGAGAAAGTTGATAAAAATACAAATATCATCCAATTGCCAACATCCTCTGTATACAAACTTCTAATGTTGCCTTTCCATTTTTTCTACCCTCCAAAACCTCAAGTTTCACTTGGTTTGTTATCGTCTTTTTTGTCTTTCTCTGTCCCGTGTTTGTGTGATCTTGACATAAGCTTCTGTAATCTACTTCAAATCCCAGATGAAATTGGGAACTTACGTTCTTTAGAAATATTAAATTTGGGGGGAAACAAATTTGTGACACTACCAAGCACCATCAAGCAACTTTCCAATCTTCGATGTTTGAACTTGACACAGTGCAAGGAGTTAAAATATTTGCCCGAGCTTCCAAAAATACAAGAAATTACAATTGGCAGATGCTATAGCTTATACACTTTTGACTGCTCCAAGTTGAGTGATATGGAACACTGTTATAGCATAGTTTTTTCTTGTTGGATGACGAAAAATCTTGAGGATTACTTGGTCCCTCGGATGGAAATTGTTATTCCTGGAAGTGAAATTCCAAAATGGTTCAGTAAACAAAACGCAAGTACATCAATAAGTATGGACCCATCTGCTGTTATAGATGACCCAAATTGGATAGGTGTTTCCATTTGTGCTCTATTTGTCACACACGAAGGTCCTATGAATTTGGATGAAAGAGATTATCCTACAAACGATTATCTTTATTACGGTGTCAATAATTTCATCAACTTTGGGCTAAAAATGTATTCAAGAGTTTCTCTAAAATTCAAGAAAGATCTGGTGACACTTGGGTTAGATTATTTGTTGATAGTGCTTTACTCTCGACAAGATTTCATTCATCTTCTAAATAGACATTCAGATACCATGCATGATCTTCAAGCAGTTAAATTTGAAACTTGGGTTGAGAGTCTTCCAGGATTAGGTTTTATGGTGAAGAAGTGCGGGTATCGTTGGGTATTTAAGGAGGATCTTCAACAATTCAACTCAGACAAGTTTTTCAGCAGAAATTCTTCATCACGGAAGAGGAAGCTTCTAACAAGTGAGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_26183::LG6:38268498-38270498(-)
AGGCTTAAGTAATTAATAATCATCAGCATAAAATAACAATATTATGAATTTGGGACTTTTTAATCAGATTCCTACCTTAGTGAGAGAATCTTTCCGCAATTTTTCAACGAGTGCAGAGGGAATCGAACCGGAGAGGTCATTGTTCTCCAATATAATTGAACCTATGACAGTGAGAATGAACCAAGGAGTTTTGAGGAAGCTGCCCAAAATCATAATTGGAAGAAACCTATGCAAGAAAAAATTTCTGCCCTTGAGAAAATTAAAATTTTTAAGAGTTACCAATATAAACTGAACCACCAAGTAATGTTCAGAAAAAGAATATTGGGGGATTTTACAGCCATAACAACTTGTCAGCTTTTAAGCACAAAAATCTAAGAAATTGATCATATTAAGCCATATAAATTAACAACTATATCCACATCACCTTTTTCTTTTTATAAATTCACAGCTTCCCTAATTCCTCCCAAATTTCCACCAAAACCTAAACCCCGTAAAGAATCTTCTACATTTTCATCATGGCTGCCAAAACCCAAACCCCAACAAATTGTATGTTCCATCCAATGTCAAGAAGGTCTTCTTACATGCCCGTTCCTACATGTGAATGGAACAAGGTTTTTTAAATGATGCTTGGGTTTTCCGAAGAGGATATGTGGCTGAAAAAGGAATTTGAAAGTAGGGAAAAACCAGAGAATTAAGAATTATAAGAGAAGGGCATGTGAAGTGAAGAAGTGAGGAAGGAAATTGCCAAAAAAATTATTTAAAAAAAAATCAAAACTTAACTATATATAGTTTCCTATCAAAATGTCGGAAATTAGTGGAGGTTTTTTAAACTCTCGAAAGATACTTCTTCTAAACACAATTTAAACAAATTTGACTCTGTTCAGAATGAACTCTTTAAGCAGCACTCCATTACTTTGCTTGAAATTTCTAAGCGCCAAATTATCACCAACAAAGAAATAAGTTCATATCAATTTTGGTCAATCATTAAGTCAAGGGGGTTGCCGGCACTAACGTATATACTTCATAACATTTATTTTATAAAGGCAAAATAAATTACAATTGACACAAAAGAAACTCCGATGAATGTGTTGCAGTAATTTAAAAATAATATCACACTAAGTAAGAATTTTATAACGTAACAAAAAACTTATTAAACAGAATGTACATTTTATAGAAATGATTTCGATGAGTGCCACGCCTACAAAAACGACATCCAATTACGCGTTTTTGTCATTTGTTTTATAAAAGACTTGACTATGATCGACACCTTGAGAGTACTATCCAATACGCACATTAATCTTTTATGCTGGTCACTCTTCGCCTTCTGCAATGGCTTGCAACAAAAATCAACGGAGCTCTTCATCACACACCAATAATTTTGATGTGTTTGTTAGCTTTAGAGGTGCAGATACTCGTAACGGTTTCACAAATCACCTTTTTGCAGCTCTTCAAAGAAAAGGAGTTGTTGCTTTCAGAGATGACCAAACAATCCAGAAAGGGGACTTTTTGGAGTCTGAACTCTTGCTCGCAATTGAAGGATCACGCGTTTTCATTGTTGTCTTCTCAAAGGACTATGCATCATCCACATGGTGCATGAAAGAGCTTACGAAGATCGTCGATTGGGTTGAAGTAACAGGTCGAAGTTTGCTCCCTATTTTCTATGATGTCACTCCTTCTGAGGTCCGAAAACAGAGTGGAGAGTTTGCAAAAGCTTTTGCTGAACACGAAGAAAGGTTCAAAGATGACTTGCAAATGGTAAAAGAATGGAGGGCAGCTCTCGAAACAAGCTGCGATCGTTGTGGGTGGGATGTGCAAAATAAGTAAGTACACATACCCATACTTTTGTTATGCTATTTTTCAAAGTCTTAACTAAACTCTCTGTGATGATTGAACTTTTGCCGCATAGGCAACAATATGAAGAAATTGAAAACGTTGTTGAAGAGGTAATCAACATATTGGGTCGTGATCAAATTTGGAATTTTGGCGATGATTTAGTTGAC


Gene Sequence:
>Vu_26183(-)
ATGCATTCTCGTGTTAAAAAATTGGAAGAACTTCTAGATCTGAGTGCTAATGATATTGTTCACCTTGTGGGAATTGTTGGAATGGGTGGAATAGGAAAGACCACACTTGCAACTGCATTGTTCAATAAAATCTCTCCTCAATTTAATGCTTGTTGTTACCTTGATGATTTAAGCAAAATTTATTGTAATTTTGGAGCAGCAAGTGCACAAAAACAACTTCTTTGTCAAGCTCTAAATCAAGGAAATATCGAGATACACAATTCTTCCCATGGAACTATGTTAATAAGAACTAGATTATGTCACTTAAAAGCGCTTGTTGTTGTTGATAATGTTGATCAAATTGAACAATTAAAGAAATTGGGTTTGCAATCTGAATATCTGGGTGCAGGGAGCAGAATCATCATAATTTCTAGAAATTGTCGTATCTTGCAAAATTACGGAGTAAATAAAGTTTACCAAGTTGAAGTCTTGGACAAAACTCAATCTCTTCAATTACTTCGCAAGAAAGCTTTTAGATCGAATGATATTGGGAAAGAACATAAAGGGTTGACATTAGATATACTGAAGTATGTGAATGGTCTTCCATTAGCTATTGAAGTATTGGGCTCATTTTTACTTGATCGAGATGTTTGTGAATGGAGAAGTGCATTGACTAGAATGGAAGAAAATCCAAGCAAAGATATCATGGATGTGTTGCGAATAAGTTATGATGGATTGGAGAATATAGAGAAAGAAATATTTCTAGATATTGCTTGTTTCTTCTCCAATAATAATTCCTACTCATGGGAGCCAACAGTGAAGAAATTTTTGGACTATCGACAATTTTATCCTGACATTGGTATGAAAGTTCTGATTGAGAAGTCACTTATAAGTCGTCAAAATGGAAATATTAAAATGCATGACTTGTTGAAAGAGTTGGGTAAGAGTATTGTCCGAGAAAAAGCACCCAAAGAACCAAGGAAGTGGAGCAGGTTATGGAACTACAAGGATCTCCAAAAAGTCATGAAAATAAATAAGGTATTTTTTTTAATATACATTCTTATCTTGTCATTCTTTAGGAGTTTACAAATTATAAAAAATATGTAATGATTTTTCCCTGTATAAAATGCTTTAGGAAGCCGAAAATGTTGAAGCTATATTTATTAAACAACATGAAAAAGAGTTTCTACAAGGAAGAATAAGAGTGGATACTTTATCAAAAATGGATCAGCTTGAGTTGCTCATTCTGAAGAATGTGAACTGTTATGGAACTCTCAATTTCATTTCTAATGAACTGAGATATCTATTTTGGAATCACTTTCCTTGGTTGTCTTTGCCATCAACTTTCATTCCAGATCAACTTGTAGAATTGATCCTACCTCATAGCAATATCAAGCAATTATGGGAAGGAAAAAAGGTACTATATTGTTGGTATTTATATATTTTTTTTTCTCAAACAAACAAAAAGATGCTCCATCTCACATTTTCTTTGCTTTCTTTTACATGGTCATTTTTTCAACTTACATTTACACAGAAGAAAAAGGGGGGAAGGTTAACCTTTTTTCATTTATCGTTTTATCTTTTAACCTTTTTAATGGAAAATTGAAATTTTCTTACTTATGTTTCTCTTACAGTGTCTGCCTAATTTGAGAAATTTGGATCTGAGTCACTCCAAAAATCTTATTGAGGCGCCAGACTTAAGTGAGGTTCCACGTCTTACGGATCTTGATCTCAAAGGATGTATACAACTAGTCCACATCCATCCATCCATTGGTATTCTAAGAGACCTTCGTCGTTTGAATTTGAAAAGTTGTAAAAATCTTATTGAGGTGTCAGACTTAAGTGAGGTTCCACGTCTTACGGATCTTAATCTCAAAGGATGTATACAACTAGTCCACATCCATCCATCCATTGGTATTCTAAGAGACCTTCGTCGTTTGAATTTGAAGAATTGTAAAAATCTTGTCCTTAATCTGAATATCCTTTTTGGGATCAGTTCTCTTAAGACCTTAAATATCTCAGGCTGTTCACAATTACTTAATAGTAAGATGTTAATGGACCCAAGTGACACAAAACATTTGGAGAAAGTTGATAAAAATACAAATATCATCCAATTGCCAACATCCTCTGTATACAAACTTCTAATGTTGCCTTTCCATTTTTTCTACCCTCCAAAACCTCAAGTTTCACTTGGTTTGTTATCGTCTTTTTTGTCTTTCTCTGTCCCGTGTTTGTGTGATCTTGACATAAGCTTCTGTAATCTACTTCAAATCCCAGATGAAATTGGGAACTTACGTTCTTTAGAAATATTAAATTTGGGGGGAAACAAATTTGTGACACTACCAAGCACCATCAAGCAACTTTCCAATCTTCGATGTTTGAACTTGACACAGTGCAAGGAGTTAAAATATTTGCCCGAGCTTCCAAAAATACAAGAAATTACAATTGGCAGATGCTATAGCTTATACACTTTTGACTGCTCCAAGTTGAGTGATATGGAACACTGTTATAGCATAGTTTTTTCTTGTTGGATGACGAAAAATCTTGAGGTGACGACGACTCCATCCTTTCTTTTGTCTCACTTTTTCTGTGTACACTCTTTATGTATAACTGAATTTGCTTTAATCAGGATTACTTGGTCCCTCGGATGGAAATTGTTATTCCTGGAAGTGAAATTCCAAAATGGTTCAGTAAACAAAACGCAAGTACATCAATAAGTATGGACCCATCTGCTGTTATAGATGACCCAAATTGGATAGGTGTTTCCATTTGTGCTCTATTTGTCACACACGAAGGTCCTATGAATTTGGATGAAAGAGATTATCCTACAAACGATTATCTTTATTACGGTGTCAATAATTTCATCAACTTTGGGCTAAAAATGTATTCAAGAGTTTCTCTAAAATTCAAGAAAGATCTGGTGACACTTGGGTTAGATTATTTGTTGATAGTGCTTTACTCTCGACAAGATTTCATTCATCTTCTAAATAGACATTCAGATACCATGCATGATCTTCAAGCAGTTAAATTTGAAACTTGGGTTGAGAGTCTTCCAGGATTAGGTTTTATGGTGAAGAAGTGCGGGTATCGTTGGGTATTTAAGGAGGATCTTCAACAATTCAACTCAGACAAGTTTTTCAGCAGAAATTCTTCATCACGGAAGAGGAAGCTTCTAACAAGTGAGTAA