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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_26067 LG6 34684788 34687796 PREDICTED: transcription factor ICE1-like isoform X2
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 34685391 intron_variant
T/A 34685701 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_26067.1
MMEGYSLPPPPGEEDAPPPSWGRPNSQEEDIAIALGAPLSFKSMLQQQPQQPQPQPPQLDSYFNFNINSAIPIPFVPTMESFPPLDPFSPSLSSSPFFNNSNNTSMPFDPGFDLGLDNGLHSSCPPLFSQVQPGFEFGELEALTAAPGHVPFMEGPKGENPLERVQPTLYRKRRGTAEIPGLETVRRKGRKWEEGEAEEGSSADVDGSGLNYESDENDNGNNGLKRSENGEDHKGKRKGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGDAIDYLKELLQRINDLHNELETTSAGSSLLPSASTSFQPLTPTLPTLPCRVKEELYPGTLPSPKNQPAKVEVRAREGRAVNIHMFCTRRPGLLLSTMRALDNLGLDVQQAVISCFNGFALDVFKAEQCREGQDVLPEQIKAVLLDSAGFHGMM*


CDS Sequence:
>Vu_26067.1
ATGATGGAGGGCTATTCTCTTCCACCACCGCCCGGTGAAGAGGACGCGCCACCACCGTCATGGGGTAGGCCCAATTCACAGGAAGAGGACATTGCCATTGCCTTGGGTGCCCCTCTTTCCTTTAAATCCATGCTTCAACAACAGCCTCAACAACCACAACCACAGCCACCACAACTTGACTCTTACTTCAACTTCAACATCAACTCTGCTATTCCCATTCCCTTTGTTCCTACTATGGAATCTTTTCCCCCTCTGGACCCCTTCTCACCTTCACTTTCATCGTCTCCTTTTTTCAACAACAGCAACAACACCAGCATGCCCTTTGACCCGGGCTTTGACTTGGGCCTCGACAACGGGCTTCACTCTTCGTGCCCCCCTCTTTTCTCCCAGGTTCAGCCGGGCTTCGAGTTTGGAGAACTGGAAGCTCTTACTGCTGCACCTGGGCATGTGCCCTTTATGGAGGGACCGAAGGGGGAGAATCCTCTTGAGAGGGTGCAGCCGACCCTTTACAGGAAGAGGAGGGGAACGGCGGAGATTCCGGGGCTGGAGACGGTGAGGAGGAAGGGGAGGAAGTGGGAGGAGGGGGAGGCTGAGGAAGGGAGCAGTGCTGACGTGGATGGTTCTGGGCTGAATTATGAGTCTGATGAGAATGATAATGGAAATAATGGTTTGAAGAGAAGTGAGAATGGTGAAGATCACAAGGGGAAGAGAAAGGGGTTGCCTGCCAAAAATCTCATGGCGGAGAGGCGCCGCCGGAAGAAGCTCAATGATCGGTTGTACATGCTCAGGTCTGTTGTGCCCAAGATTAGCAAGATGGATAGGGCTTCAATACTTGGGGATGCAATTGACTACCTGAAGGAGTTGCTGCAGCGGATCAATGATCTCCATAACGAGCTGGAGACAACTTCGGCGGGCTCGTCACTGCTGCCGTCTGCTTCTACAAGCTTTCAGCCTCTAACACCCACCCTGCCAACTCTTCCCTGCAGGGTCAAGGAGGAACTGTATCCTGGCACCTTGCCAAGCCCTAAAAATCAACCTGCAAAGGTTGAAGTTAGAGCAAGAGAAGGGAGAGCTGTGAACATTCACATGTTTTGCACCCGCCGACCAGGCCTTTTGCTGTCTACCATGAGGGCTTTGGACAACCTCGGATTGGATGTACAGCAGGCTGTAATAAGCTGTTTCAACGGCTTTGCTTTAGATGTGTTTAAAGCTGAGCAATGCAGAGAAGGGCAGGATGTGCTACCTGAGCAAATCAAAGCAGTGCTCTTGGATTCAGCAGGGTTTCATGGTATGATGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_26067::LG6:34687796-34689796(-)
ACCGAATTAATTTCTCAAAAAGTAGGAATAAGGATAAGTTGTAACTGAAATATGAGTAAAGAACATGCCTAAACATTAATGACAATTTAATTAATGAGAGTTACTTTATAAACTTTTGACTAGAAAAAAATTAAACAGGTGTTTTTAATTAAAAATTTCTATTCATCACATATTATTTTTCTCTAAATTTCAATTGTTTAACCCATTCTTATTTCTAATTGTGGGATTTACCTCTTTTACTAATTTTCTTAATATATAAATATTTAATTGACTGATAAATATTGTTAAATATATTATTTTTAGTTAATTTATTATTATTTTTTATTTATATTTTAGGTTTAATTTATATTTTTTCAATTATAAATAAAAAAACTAAGTATTTAACTTCATATATAATTTCTCATAATATATATTTAGTATAAAAGATGATTAACTTCATATATAATTTTTCATAATATATATTCAGTATAAAGGATGATTAACTTAATACATAATTTTTCATAATATTTAACTAACATAATATTTAATTAATTGATTGGACTGTTTATTTAGAATTATTGAAAATTTAAAAGCAATGCAAGTGTTTAAAGAAAAACTTACATAGGTATTAAAAGTTATTGATTAAAATTAAGATAACAAAAAATTTAACGATTAATTATAGATTGTTTAAGTATTCAGCTAACCTACAAATTTGACCATATTTAATTTTACCAGAAAAATATTGATTTAGATTTAAGATATTGTGGATCTGAATTCGACCTGACTGGCTGCTTATATTAAAGATGTTTAACTAGAGTAATGAGTTTTTGATTTTGAATTCCCAAAGTACATGTTCAAAACAATTTTTTTCTAAACTTTATTAGCTTGATCAAAACTAACTCATTATTGATTTAGTTTATTTGATTAAACTTTAATAGATCAAATTCAAAACTCCACTGGTATTTAAATCGGGTTAGATAGAAAAATTAATTAAATTCAAGACCGTTAATTAATTAATTTAAATATAATTTTAGGCAACGATCCTTCTTTTTTATATGTATAATAAATACTCTGTCCATTTTAAACCAATGATACGATTTTAGGATTTTTTTTTATACAAATTAAGAAATATTTAACTTGTATAAATTATCCACTCTTGTCGTTTATATTTTTCTATGCATTCCAACTAATTTATTTATATTCATATAAACATTTTTTATACTAGTTTTTACTAAAAAAAATAACATTTAGTTGCAATCCAAATACCTTGTAAAACTCGAAATAATTAATATATGAAAAATACATACAACCATAAATTTTTCTGTAAAGTTAAAATATCAAATTTAGAATTGAGGAAGAAGGAAGTACACAGTGATTGGACATTATAAGTATTTATTACAGATTATAATAAATTTAATGTATATGAAAGTTTATTTCAAAGAGAAATGCTTTAACCATATTAGATGAATACAAAAATAGTGAGAAAACAACAAAAGTGAATAACGGTAGTAGTACATTGAGAAGGGTAACTTCTAGAAAACGTAGGCCTTTTGTTTTTATTTGTAATATACAAATGGCAATATATATGTAGATTTTGATATTATAATTTTCTACTTTAAATATAAATATTATTATAAAAAGTTGAAAGAAATGAGATTTTGTAAAGTAGTGATAAACGAAATTAAAAGTTAAGAGAGTATAGAAAAGGACAGAATCAAAGGTTTTAGCTGCAAATGTTGTTACAGGAAAGAAGATTGTTTGGTGTAGCAATAATCATGAAACTTTAACAGAACACAGTTACCACTTCCTTCCTTAGGAACTTTACCATAACAGAAGGCACACATCACACTCTGATGCGATAACAAGAGTTAAAGCAGAGAGTTTAAGTTTTGTCCAAATAAAAAAATCACGACACACACTCTCACACACATGGATAAACCACACCCTTTCAACCGTTTCCCACTCCATTCATTTTCTCACCACAACAGACAAATATAAATTTCATTCGCTCACACACACTC


Gene Sequence:
>Vu_26067(-)
ACACACAACATAACCATTCTCACTCACTTTCCCACCTTCTTCTCCGTTCTCTCATCATCATCATCATCATCATGATGGAGGGCTATTCTCTTCCACCACCGCCCGGTGAAGAGGACGCGCCACCACCGTCATGGGGTAGGCCCAATTCACAGGAAGAGGACATTGCCATTGCCTTGGGTGCCCCTCTTTCCTTTAAATCCATGCTTCAACAACAGCCTCAACAACCACAACCACAGCCACCACAACTTGACTCTTACTTCAACTTCAACATCAACTCTGCTATTCCCATTCCCTTTGTTCCTACTATGGAATCTTTTCCCCCTCTGGACCCCTTCTCACCTTCACTTTCATCGTCTCCTTTTTTCAACAACAGCAACAACACCAGCATGCCCTTTGACCCGGGCTTTGACTTGGGCCTCGACAACGGGCTTCACTCTTCGTGCCCCCCTCTTTTCTCCCAGGTTCAGCCGGGCTTCGAGTTTGGAGAACTGGAAGCTCTTACTGCTGCACCTGGGCATGTGCCCTTTATGGAGGGACCGAAGGGGGAGAATCCTCTTGAGAGGGTGCAGCCGACCCTTTACAGGAAGAGGAGGGGAACGGCGGAGATTCCGGGGCTGGAGACGGTGAGGAGGAAGGGGAGGAAGTGGGAGGAGGGGGAGGCTGAGGAAGGGAGCAGTGCTGACGTGGATGGTTCTGGGCTGAATTATGAGTCTGATGAGAATGATAATGGAAATAATGGTTTGAAGAGAAGTGAGAATGGTGAAGATCACAAGGGGAAGAGAAAGGGGTTGCCTGCCAAAAATCTCATGGCGGAGAGGCGCCGCCGGAAGAAGCTCAATGATCGGTTGTACATGCTCAGGTCTGTTGTGCCCAAGATTAGCAAGGTATGAAAAACCAAAACAAAAAAGAACTAAATTTTTCATAAATTGTTCTTCATTGTTCTTGATTATTGGTTTGTTTCAATGTTCATTGTGTTTTGTTTTGTTTTGGGGGTGACTGGTTTTATCTTACAAAAGTAGAAATGGAACAAAACTTATATGTAATTTTTAAGTATTTTTGGTGTTATATTTTGTTAATCCGAGTAATTAAAGTTTATATTAGATGTTAATGTACATTATTGAGGTGGAGTTTTGATTTTGGTAGAAGAATTCTACCAAAAGAATCTAATTTTGGGGTTGTGCTTGAGGAGAAATATAAAAGTTGTTTATGAAAGAATTGTTTCTGGAGAAAATTTTCTAAACATGATATTATTCTGAGGTTCTCTATTTCCGGTTGTTGTCTCCTATGCTGATAAATGTCATTTTGTGACTTATGTTTGGTGGAGAATCTGGTGTGTGGTTGTGCATATTGATGACAGTTTTGAAGAATTTGTAGTTCATTCGTGTTAGGAGCTTAGGAAGGGTGCATGCTGATGTTCTTGTATTTGTTTGCAGATGGATAGGGCTTCAATACTTGGGGATGCAATTGACTACCTGAAGGAGTTGCTGCAGCGGATCAATGATCTCCATAACGAGCTGGAGACAACTTCGGCGGGCTCGTCACTGCTGCCGTCTGCTTCTACAAGCTTTCAGCCTCTAACACCCACCCTGCCAACTCTTCCCTGCAGGGTCAAGGAGGAACTGTATCCTGGCACCTTGCCAAGCCCTAAAAATCAACCTGCAAAGGTAATTTTTTTTTGTTGATTTAATTGCAGAATGGTGATTGTACAAGGTTGAAAATGCAGCTTGTTGTACGTAGACCATGTGAACTATGCTGCAATTGAAACTTTTAGAAAGATAACTTCTGAAAATTTTCAAAAATTTTGAAACTGAGTGATGCACAGAAGTTTCTTAGTCACATATTTGTATGCTTCAAACAGAAGTTTCTCTGGACTTTGAAACACATTTATATGCTTCAAACAGCAAGAGTGAACTCAAATTTGAAACTAGGAGACGCTAAGGTGTAGCGAAAGATCCTGGTATAAAAATTGGTATACTAGGAACTAAGAAAAAGTGTGGGTGAGAATGCTCCAATTTGAGTTGTGAAAGCAGAGAAAAATTTACTCCTACTACTCCTGTGTCTTCCATTGCAGTTGTATACCATTCAGAGTCTAAGAAGAAACCAGTGATGGCCAACTAGATTGATATACATTTTTATTCTGACAGAACTTAATTGCATGGTGATTGAGAAATTGTTTTAAAGTGACTTTGGTACTTCTGATATTATATATAGGTTGAAGTTAGAGCAAGAGAAGGGAGAGCTGTGAACATTCACATGTTTTGCACCCGCCGACCAGGCCTTTTGCTGTCTACCATGAGGGCTTTGGACAACCTCGGATTGGATGTACAGCAGGCTGTAATAAGCTGTTTCAACGGCTTTGCTTTAGATGTGTTTAAAGCTGAGGTATAATTTTCTCTCCTTTTCCAGTAACTATTATTTAACTTACTTTTGCATTGTGATGCTTGTCATTGCTCTTAAGGCTCAGTGATGCCACACATTGCATGTTCAGTATTGATTTCTGGTGCCTACATCTGTTCTGTTGGATAAATTTGATTAGTTATGCTCAGAATCTTGCAGCACTAAAATCATTAAAAATTTATGTTTGAGTTTGTGAGTTGCATTTGGTATTGAGTATATGAATCTGAAGTTTTTAGGTTTGATGTAGTGTTTGTTGTTTGTTAGCAGCAATGCAGAGAAGGGCAGGATGTGCTACCTGAGCAAATCAAAGCAGTGCTCTTGGATTCAGCAGGGTTTCATGGTATGATGTGATGAAAATGCTTGATGAGTTTCCCTTGTAGAGCAACCAACCATAGTTGCTGTGGCTTGCAGTTTGTAAATGCAGTGCTTCTTCTTCTTATTCTCCTCTGTAGAGGCCTTACTGTTTTGGCCATGATCAAATAGGTTAGTTGAATCTGTAGGTTGAGTTATCTTTGGTATTTTTTTCTTAATCGTTCTTTTGACAAAAGCCAACTTCTGTTGTTTACTTAATTTTCAACTGATGTAATAAATCGTTTTATTTCTTTTCTATTT

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