Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_26059 LG6 34586281 34587506 receptor-like protein 12 isoform X4
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T,G 34586306 intron_variant
T/A,* 34586312 intron_variant
G/A 34586398 intron_variant
G/A 34586425 intron_variant
G/A 34586435 stop_gained&splice_region_variant p.Gln227*
T/C 34586463 synonymous_variant p.Thr217Thr
T/C 34586686 missense_variant p.Lys167Glu
G/C 34586689 missense_variant p.Leu166Val
C/A 34586724 missense_variant p.Trp154Leu
A/G 34586727 missense_variant p.Ile153Thr
T/G 34586728 missense_variant p.Ile153Leu
G/A 34586753 synonymous_variant p.Thr144Thr
T/G,* 34586758 synonymous_variant p.Arg143Arg
G/A 34586766 missense_variant p.Thr140Ile
T/A,G 34586767 missense_variant p.Thr140Ser
C/A 34586768 missense_variant p.Leu139Phe
G/A 34586773 missense_variant p.Pro138Ser
T/C 34586777 stop_lost p.Ter136Trpext*?
A/T 34586784 missense_variant p.Val134Glu
A/T 34586800 missense_variant&splice_region_variant p.Tyr129Asn
T/G 34586855 intron_variant
A/G 34586861 intron_variant
G/T,* 34586866 intron_variant
C/G 34586898 intron_variant
A/T 34586907 intron_variant
A/T,* 34586938 intron_variant
G/C 34586986 intron_variant
A/T 34586992 intron_variant
A/G 34587039 missense_variant p.Ile119Thr
T/G 34587042 missense_variant p.Tyr118Ser
G/A 34587050 synonymous_variant p.Cys115Cys
G/A 34587053 synonymous_variant p.Cys114Cys
G/C 34587056 stop_gained p.Tyr113*
G/A 34587063 missense_variant p.Ala111Val
G/A,* 34587074 synonymous_variant p.Val107Val
G/T 34587079 missense_variant p.His106Asn
G/A 34587087 missense_variant p.Thr103Ile
T/C 34587088 missense_variant p.Thr103Ala
G/A 34587099 missense_variant p.Ala99Val
A/G 34587141 intron_variant
T/G 34587143 intron_variant
C/T 34587144 intron_variant
A/G 34587146 intron_variant
A/C 34587149 intron_variant
C/T 34587157 intron_variant
T/A 34587165 intron_variant
T/C 34587169 intron_variant
C/T 34587222 synonymous_variant p.Gly95Gly
A/T 34587278 missense_variant p.Phe77Ile
G/A 34587307 missense_variant p.Ser67Leu
G/C 34587399 synonymous_variant p.Val36Val
G/C 34587411 missense_variant p.Ile32Met
A/G 34587416 missense_variant p.Phe31Leu
T/G 34587418 missense_variant p.Tyr30Ser
T/G 34587425 missense_variant p.Thr28Pro
C/A 34587428 missense_variant p.Asp27Tyr
C/T,A 34587431 missense_variant p.Val26Phe
A/T 34587438 synonymous_variant p.Ser23Ser
G/T 34587439 missense_variant p.Ser23Tyr
T/A 34587449 missense_variant p.Thr20Ser
C/A 34587452 missense_variant p.Asp19Tyr
T/C 34587454 missense_variant p.Asp18Gly
C/A 34587504 start_lost p.Met1?

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_26059.1
MCCEGCWKEEKQALLGLDDTFISWNVDTDYFISWNVDTDCCEWYGVFCNSSTGRVAQLHLYGVWWKSTVNYSDFSVFKDLKNLSLSNNNIVGCVGDAELPNLELLDMSDNKLDTAASIISCLDGLPSLNVPKLRSNLKALDISENHLTNDILPYLEGFTSLKELYLAETELDSDFHFEGLWSKLRNLEVLDLSFNNFNQTDIGYALSGLSSLNSLYLRHSGLSWRSICSV*


CDS Sequence:
>Vu_26059.1
ATGTGCTGTGAAGGATGTTGGAAAGAAGAGAAACAAGCACTTTTGGGTTTAGATGATACTTTCATCTCTTGGAACGTCGACACAGATTATTTCATCTCTTGGAACGTCGACACAGATTGCTGTGAATGGTATGGAGTGTTCTGCAACTCCTCCACAGGGAGAGTGGCCCAACTCCATCTTTACGGTGTCTGGTGGAAGTCAACAGTTAATTACTCGGATTTTTCTGTCTTCAAAGATTTGAAGAACCTCTCCTTGTCAAATAACAATATAGTTGGTTGTGTTGGGGATGCAGAGTTGCCAAATCTCGAACTCCTTGACATGTCTGATAACAAGCTGGATACTGCTGCCAGTATTATATCTTGTTTGGATGGCCTTCCATCTCTTAATGTACCAAAGCTGCGTAGTAATCTGAAGGCCCTTGACATAAGTGAGAACCATTTGACTAATGACATCTTGCCATATCTGGAGGGATTCACATCTTTAAAGGAACTGTATTTGGCTGAAACTGAATTGGACTCGGATTTTCACTTTGAAGGTTTATGGTCAAAATTGAGGAATCTTGAGGTCCTTGACTTGTCCTTTAACAACTTCAACCAAACTGATATTGGCTATGCTCTTAGTGGACTCTCATCCCTCAACTCTTTATATTTAAGACACAGTGGATTGAGTTGGAGATCAATTTGCAGTGTCTGA


Promoter Sequence:
>Vu_26059::LG6:34587506-34589506(-)
AATGTAATATCTTATAGTTATATTATAATTATTGAGACATGTCCATGTCTATCTTGGATTGAAGTTGGTGGTGGATGAAGTCAAGTCATCTTTTTTTTTTTCTTCGTCTTTGTATGTTTTAACTATTAATATTTATTGGCTTAATATCCTATTTTGTCCTCAGTTTCACTCAAAAATGTCAAATTAGTCCATTTTTTAAAAAATGCGTCAATTACGTCTTCACTTAATAAACTTTGCATCAATGAAATCCCTTCCGTTAAATCCGTACAAACGGCATTAATTAAAGAAAGAGAAAAATAATTAACGCCGTTTATACGGATTTAACGGAAAGGATTTCACTGATGCAAATTTTATTAAGTGAGGACGTAATTGACGCATTTTTTAAAGGATAGACTAATTTGACATTTTCTAAAGAAACTGAGGATAAAATAGGATATTAAGCCATATTTGTTTTAATTAAATAAAATCGGTAATCAACAAACATTTAAATTGTATGCTTTATATTACGATTAAAAGTAATGATAAATCTATTTTTTTTTAAATATGAGTTGTATTTTAGATTTCTAAACAAGATTTCATATTATGAAAATTTATTTTATTAATTATAACACAATTATTGAGTTATGTTTATCTTGAATTCTATTTAAAGATGATTGTGACTTTGGGTGGACTAAATAATAAACTATACTTTAGTGAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATATGTATATGTATATATATGTATATATATATATATATTATATACATATTTTTCTTATATAATTAAAATTAAAATTAAATAAATAATACTTAATTGAATAATTTAAATTATACTATGTTTAAATTTATGATAACCTAATAGTTTTAAGTGTATAAATTATATTTTCAATTTATAATAAATAATCTATATTGATATGACTTTATTTTTTAATTGTAGACGTATGTGTATTTTGGGTTTCACTTGGTGTTGGTTTTGGCTTATTAGTTGACGTGAAATCAATTTTGTTTTAATTTTTTAAGTCTTTATATGTTTAATTAATAATTATTAATAAGAAGGTCAATATATAATTATTTTTCATAATTAAAATTAATAATAAATAATTACCTTTTGTTTACAAAAACGTATTATAAATTTTTGAAGGATAATTATTAAATATATAAATTATATTTATTTTAACATTTATAAGTAATTTAAATAGTGTAAATTTATTTTTAATTATAACATAATTATTGAGAAATGTATGTTTTAAATTCATCTCCACCTTTGGATTGAGCTCAAGTGATCATCTATAAAAAAAGTTTTTCTCTTTCTAATGTGTAATTATTTTTTTTTATTTTAATCTTTTAGTAATGTTTTTTAAAATTCATATAATTAATAATAATAAAATAATTACTTATATTTATATTTTTATCCTAACAACCTTTTTAAAATTTAAATAATTATTCATAATGATAAAATTATTTACGCAATAAAATAGTTATCTATAAATAAATTATAAAAATTAATCACTTTTATAATTATCTTTTATAAATATTATTTTATAATTTATTGATGCTTTTATTTTAATAAATAAAAATTATTTTATAATTTAATAAATTGGAAAACTATAAAATTAAAAAGTATCGAAGTAAATCTGGTGGAATAAACAATCCTTAAAATTTTCTCGTTCAAATAAGCATTATAATTCATATATTAAAAAAACAGAATGAATGTATTTTCATTAGTTTTTTTTAAGCCGTCTCTTGTTTTTTTATTTTTATAGAAATGAATTAAATCAGTTTCATTCTCTAAAAATTAAAAAGTCACTTACCAAAACTTACACGTGGACTTTCTAATTCAAATTGAAAGTATAGATGCATTGGAACATAAAGTATTTAAGAGAGGGAGAAGTTGTTGATTCGATAAAGAAAAAAAATGAAGAGTGTGAGCGTGTGTTTCCTCATTTTCCTTTTATTGGAAATA


Gene Sequence:
>Vu_26059(-)
ATGTGCTGTGAAGGATGTTGGAAAGAAGAGAAACAAGCACTTTTGGGTTTAGATGATACTTTCATCTCTTGGAACGTCGACACAGATTATTTCATCTCTTGGAACGTCGACACAGATTGCTGTGAATGGTATGGAGTGTTCTGCAACTCCTCCACAGGGAGAGTGGCCCAACTCCATCTTTACGGTGTCTGGTGGAAGTCAACAGTTAATTACTCGGATTTTTCTGTCTTCAAAGATTTGAAGAACCTCTCCTTGTCAAATAACAATATAGTTGGTTGTGTTGGGGATGCAGGTATTCTTTCCTATAATTCTATTGCTCTTTTGCTTACTCAAAACTACAAATCTGTCTGTTATGTTTTATGGAATACTCATTATTTCAACTTTCTTTTACATACTTTCCAGAGTTGCCAAATCTCGAACTCCTTGACATGTCTGATAACAAGCTGGATACTGCTGCCAGTATTATATCTTGTTTGGATGGCCTTCCATCTCTTAAGTATCTTTATTTAGGGGATAACAGCTTCAATACATCTTCATTAAACCACGGTGAGACTAGCTATTTTTTATTTTTTTAAGAAAATGACAACAATATTATTTTTTATTATCATGAAGATCTTCTAATTTTTTATACTATATATATCTTTTTTTTCAAATTTGTTGGGTTCTTTCACAACTTTTGGTGTGTATATGTAAGTTTTTGAAAGTGTACCAAAGCTGCGTAGTAATCTGAAGGCCCTTGACATAAGTGAGAACCATTTGACTAATGACATCTTGCCATATCTGGAGGGATTCACATCTTTAAAGGAACTGTATTTGGCTGAAACTGAATTGGACTCGGATTTTCACTTTGAAGGTATTTTCCACTTCATTAATAAAGCTGAGCATTTTTACGTTTTAATTAACGAAGGATATATTCCTTACAGGTTTATGGTCAAAATTGAGGAATCTTGAGGTCCTTGACTTGTCCTTTAACAACTTCAACCAAACTGATATTGGCTATGCTCTTAGTGGACTCTCATCCCTCAACTCTTTATATTTAAGACACAGTGGATTGAGTTGGAGATCAATTTGCAGTACGTTCCCGTATACTTTCCATATTACAAATCTTCATCATTTGTTATTTTATGTTAGAAAGCATATCTAACAGCCTATAAATTGTTAGATATATCAAAATTGAGTTCTTTGGAGAACCTTATCTTATATGAGAACGACTTGAAGGTGTCTGA