Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_26019 LG6 32273423 32274507 myb-related protein 305 isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 32274302 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_26019.1
MYWGKVLGGQIGGGGVMEEEVWRKGPWTAEEDRLLVEYVRLHGEGRWNSVSRLAGLKRNGKSCRLRWVNYLRPDLKRGQITPQEESIILELHARWGNRWSTIARSLPGRTDNEIKNYWRTHFKKKAKSPSDAAEKARNRVLRKQQFQQQQLLQQQQQQYQAQQQLQFNFDMKGIMALLEDNNTCRAPYAAPQTRQEMINMQQNTTEEQFLYSMLNSNFSAPETSSEETFLDGLWNLDHGNFTVTSAASKVGLYNLVAPFC*


CDS Sequence:
>Vu_26019.1
ATGTATTGGGGGAAAGTTTTGGGTGGCCAGATAGGTGGTGGAGGTGTGATGGAGGAGGAGGTATGGAGGAAGGGACCATGGACTGCTGAAGAAGACAGGTTGCTTGTTGAGTATGTCAGACTGCATGGTGAAGGAAGATGGAACTCTGTTTCTAGGCTTGCAGGGTTGAAAAGAAATGGAAAGAGCTGCAGATTGAGGTGGGTGAATTATCTGAGGCCTGATCTCAAGAGGGGACAGATAACACCACAAGAAGAGAGTATAATTCTGGAGTTGCATGCAAGGTGGGGAAACAGGTGGTCAACAATTGCAAGGAGTTTGCCAGGGAGAACTGACAATGAGATAAAGAACTATTGGAGGACTCATTTCAAGAAAAAGGCTAAAAGTCCCTCTGATGCAGCTGAAAAGGCAAGGAATAGAGTCCTGAGGAAGCAGCAATTTCAGCAGCAACAGTTGCTGCAGCAGCAGCAGCAACAGTATCAGGCACAACAACAGCTACAGTTCAACTTTGACATGAAAGGCATCATGGCCTTGCTTGAGGATAACAACACATGTAGAGCACCTTATGCAGCACCTCAAACTAGACAAGAAATGATCAACATGCAGCAAAACACCACAGAAGAGCAATTCTTGTACTCCATGCTCAATAGCAACTTTTCTGCACCAGAAACCTCATCTGAAGAAACTTTTTTGGATGGTCTGTGGAACTTGGATCATGGGAATTTCACTGTAACTAGTGCAGCAAGCAAAGTTGGTCTATACAATTTAGTTGCTCCCTTCTGTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_26019::LG6:32274507-32276507(-)
GTTTATCAATATTGATAAATGTAAATAACCTCATAATTATATTTATATCTACTCTTAACCAATTGTTGTATGCCTATCTCTTATGTCTTTTCTGTTTTTATTTTATTCTTTTATTGATGTCGTAGAAGAAAAAAAAAAGATAAAAGAATATTTGAGGTATTTTGCAGCATTTAGTTTCTCTCTATACGTATACACACACACACATATATATATATATATATATATATATATAGAGAGAGAGAGAGAATGATAAATATGATCTCTTGAGGGATCATGCAGTTAACTAGACATCATAATATAAGATTTAATCTCACTTTTGGCACATCACCTTACCTTAAGACAGAGTATTATAATAAGTACTTAGGATTTTTTGTAGGGGATTTCCTTATATGAGACAAGAAAAAAAAAGGTTAAAAGGATCACCACAGCAATAATAATAATAATAAAAGAGGGCCAAAAAAGAAAATAATTTTTATTTTAATTCACAAGCTACGCTGATCAATAAAATGCTCATCTTCCAGAAAAAAAAACTTGAATAAAAAGTGGATTTTTTATTAAAACAGGGAAAGGAAAAAGAAAGGTTAACATTCTCTTGTTAGTGCATGAAAGATCTTAGATTTTGCATAAATAAATTAATAGGTAATTTAATAATTATATAGAGATGAAAAGAGTTGATGGTTCCAGCATTCTACCAGCACTATCTTTCCAAAAATATGATGAGAAGACAACACCTGTCACCTTAGATGACGTCGAAGGCATGATAGCCCTAACATTTAAATACAGACAATACTGAAAATGGTATCCAACAATATTATAGTTTAATGAAGTTTCAGAGATTATAGTCCTCTTGAGAAGTAAGCAAATCCAACACCTGGGGAAACATCATTAGTCCTTTTGTAATTTCTTGTTTTAAAAATGCCCACCACCATAATTTTTTGTCTCATACCTTGTATTATGCTTCCTTAAGCTTCTAGTTTTGTGTCCAGGTGCAATCACCCTATTTTACAGGTGTCCTCAGGCAATCACATTTCTCTTTCCATATCATTTTCGCATCTATTTTCTCTTTTATCTTTACTCATGTCACCTAATTGCATAACACATTCTTCAATTTCCAAATATGCCTTTATGTTAAACAAAAATTAATTTTACATGTAATTCCTTTAATTACCTCTTTTAACACCTAATAAATAAATAATATTTTTATTTTTCTAATTGATTCATCTCTCCAACAAAATTTTACACCACTGATAGGAAATGGGATATTTATATATCATCACCCTTTATTAAAATAAAATAGCGAGTTATTACTTTATCAAAAGTTTCTATTTTCTAAACCTCTCATTGTCACACAAAAATTTCCCTAGATTATAAGGGGTGCTATTGTTTATCTCTAAATTGAATTTAATATTTAATTTAATCATTATATTGATATAAATTACTTATAGTTGGAAATCATGGGGGAAAAGGAAAATTTTGAGTGTTCATGATATAAATATTTCTCTTGTTACGTAATTTATTTCACAAAAAAAATAACATTAGAAAGCAGAATCTAGTATTTTATTTTATAATATATGCAGTACTATTTTTTTTATCAAATAATTAAAGTTAGAATTATAATGGAATAACAAATAAGGAAGTTTTGTAGTAATTATTATCTAAATGACAGAAAGAGTGTAATGGTATTTTGGTCATTTGGTAGTTGAAGGACAAGCGTGCAACATTTTCAGTGTCACTTTGGTCCTTAGGGTTTGTTTATTGAAACATGTTCTTAGAAAAGTGTTACCCGTAGTACCTTAAACAGTGAAGTGGATAGACATCATACGAAGTTAAGAAAGTGACCTTTGATTGACTGATAGAATCCAGTTGGGCAAAACATCTCAGGTATAAATATGCAGCAAACACCACAGCCAAAACATGCATCAAACATTAGACCTAATTGAGTGTCACAGAAATTGTAAGAAACCATTTTTCTCCAAGAACAAACTTGGAACCCTTATTGC


Gene Sequence:
>Vu_26019(-)
ATGTATTGGGGGAAAGTTTTGGGTGGCCAGATAGGTGGTGGAGGTGTGATGGAGGAGGAGGTATGGAGGAAGGGACCATGGACTGCTGAAGAAGACAGGTTGCTTGTTGAGTATGTCAGACTGCATGGTGAAGGAAGATGGAACTCTGTTTCTAGGCTTGCAGGTAATTAACAACACTCGATCAACAATAATCTTTTACTGCTTTCTTCATTGAATTTCATTTCTATAAGTTACAATCCAACTGTGTTTTCAACTTCTTCTGTACATAGTGTTCCTTAAATATCTTCATTTTGAACATTATACTGCAGCATGGCAAAAACTGTTCTATGATCTGATATCGATAGGGTTGTTGTTGTTTGTTCATCGACAGGGTTGAAAAGAAATGGAAAGAGCTGCAGATTGAGGTGGGTGAATTATCTGAGGCCTGATCTCAAGAGGGGACAGATAACACCACAAGAAGAGAGTATAATTCTGGAGTTGCATGCAAGGTGGGGAAACAGGTAAAATTTATATGCATGTTCATTCTCTTGCCCTTTTGCATGGCAGCATTTTTTTCTAAGTTCTTGATTGCTAACTACAAAACCGAAAACTTCAGGTGGTCAACAATTGCAAGGAGTTTGCCAGGGAGAACTGACAATGAGATAAAGAACTATTGGAGGACTCATTTCAAGAAAAAGGCTAAAAGTCCCTCTGATGCAGCTGAAAAGGCAAGGAATAGAGTCCTGAGGAAGCAGCAATTTCAGCAGCAACAGTTGCTGCAGCAGCAGCAGCAACAGTATCAGGCACAACAACAGCTACAGTTCAACTTTGACATGAAAGGCATCATGGCCTTGCTTGAGGATAACAACACATGTAGAGCACCTTATGCAGCACCTCAAACTAGACAAGAAATGATCAACATGCAGCAAAACACCACAGAAGAGCAATTCTTGTACTCCATGCTCAATAGCAACTTTTCTGCACCAGAAACCTCATCTGAAGAAACTTTTTTGGATGGTCTGTGGAACTTGGATCATGGGAATTTCACTGTAACTAGTGCAGCAAGCAAAGTTGGTCTATACAATTTAGTTGCTCCCTTCTGTTAA