Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25918 LG6 29160410 29164137 PREDICTED: PI-PLC X domain-containing protein At5g67130-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 29162805 intron_variant
C/T 29162833 intron_variant
G/T 29163812 missense_variant p.Val621Phe
T/C 29164001 intron_variant
G/A,* 29164119 synonymous_variant p.Lys687Lys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25918.1
MHLVSSIQLYILQTQDSIPPKNGSFLLSSIFHHHKSKTTSECNPIEQLCHRFSLAELQAATNGFMPSLIVNGEGQCQVYKAHLKGHGDVAIKHFKTRSPDRDIEFRVEVKILCQLHHPNVVPLVGFCDHKHDKFVVYDYVSNGSLHDCLHGTNNNSVVPLSWIQRLNICIGVARGLHYIYFETKIPIIHRAVKSSNVLLDHNLVPKVADFGLCKKHPQEESRPKPPRVELRENLEVSLEYMEPEYFMTGRLSNKSDVYSFGVVMLEILCRKKACFLTPGGECEYLAKWAFDDERKGVLEKIVDPSLIGKIAPACWKVFIEIVQRCLASVEERPTMGEVTPNFVTEQMGSLPSFLLVIILPLCYCVDAACSNGKCKLNDECSSNGDCGTGLYCFSCPRGFSGSRCVRSSVTDQFKLINNSLPFNKYAFLTTHNSFAIDGEPSNRRVHRVTIINQEDSVTQQLKNGVRGLMLDAYDFDGDVWLCHSFGGHCMTSQLLYEPAIDTLKEVAAFLSANPEEIVTLILEDYVKTPKGLTRVFTEAGLMKFWFPVTRMPKKGDWPLVSDMVAKNQRLIVFTSRKSKEQSEGIAYQWNYMVENQYGDGGRKAGSCPNRKESSPLDDMSKSLVLINYFRTIPLKPITCKDNSGGLVDMLKTCHGAAGNRWANYVAVDYYKRSEGGGSFKALDKLNGKALVWL*


CDS Sequence:
>Vu_25918.1
ATGCATCTTGTAAGTAGCATTCAGTTATATATTCTTCAGACGCAGGATTCCATTCCACCCAAAAATGGCTCCTTTTTGCTCTCTTCCATTTTTCACCACCACAAATCCAAAACCACGAGCGAATGTAATCCAATAGAACAGCTCTGTCACCGCTTCTCTCTTGCTGAGCTTCAAGCAGCCACAAATGGGTTCATGCCGAGTTTAATTGTCAATGGAGAAGGTCAATGTCAGGTCTACAAAGCCCACCTCAAAGGCCATGGAGACGTAGCCATCAAGCACTTCAAGACTAGAAGCCCAGATCGTGATATAGAATTCAGGGTCGAAGTCAAGATTCTGTGTCAACTACACCACCCAAATGTTGTTCCTTTGGTTGGTTTCTGTGATCACAAACATGACAAGTTTGTTGTGTATGATTATGTCTCCAATGGAAGCCTCCATGATTGTTTGCATGGCACCAACAATAACAGTGTTGTTCCCTTGTCATGGATACAAAGACTTAACATCTGCATCGGGGTGGCTCGTGGACTGCACTACATTTACTTCGAAACCAAGATACCTATCATACACCGTGCTGTGAAATCAAGCAACGTTCTTTTGGACCATAATTTGGTGCCTAAAGTGGCAGATTTTGGACTTTGCAAGAAGCACCCACAAGAGGAGTCAAGGCCAAAGCCACCAAGAGTTGAGTTGAGGGAGAACTTGGAGGTTAGTTTGGAATACATGGAGCCGGAGTATTTTATGACTGGAAGGTTATCAAACAAATCAGATGTGTACTCTTTTGGGGTGGTAATGTTAGAGATTTTGTGTAGGAAGAAAGCTTGTTTTTTAACCCCAGGTGGAGAATGTGAGTACCTTGCTAAGTGGGCCTTTGATGATGAAAGGAAGGGGGTTCTTGAGAAGATTGTTGACCCATCTCTCATTGGAAAAATAGCACCTGCTTGTTGGAAAGTGTTCATTGAGATTGTTCAGAGATGTTTGGCATCAGTTGAAGAGAGGCCAACGATGGGTGAAGTGACACCCAACTTTGTCACAGAACAAATGGGTTCTCTTCCGAGCTTTCTTTTGGTAATTATTCTTCCCTTGTGTTATTGTGTTGATGCTGCTTGCTCCAATGGAAAATGCAAGCTAAATGATGAGTGCTCGTCCAATGGTGATTGTGGAACCGGACTCTATTGTTTCTCATGTCCACGTGGGTTTTCAGGCTCTAGGTGTGTGAGATCTTCTGTCACAGATCAATTCAAGCTCATAAATAATTCTCTTCCATTCAACAAGTATGCCTTTTTGACAACGCACAATTCTTTTGCTATTGATGGAGAACCATCTAACAGAAGAGTACATCGAGTCACCATCATTAATCAAGAAGACAGTGTAACCCAGCAGCTAAAAAATGGAGTTCGGGGACTAATGCTAGATGCGTATGATTTTGATGGAGATGTGTGGTTATGTCATTCATTTGGAGGCCACTGCATGACTTCACAGCTTTTGTATGAACCAGCTATAGATACACTTAAGGAAGTTGCAGCTTTTCTATCTGCCAACCCAGAGGAAATTGTCACACTCATACTGGAGGATTATGTTAAAACACCCAAAGGATTGACAAGAGTCTTCACCGAAGCTGGTTTGATGAAGTTTTGGTTTCCTGTGACAAGAATGCCAAAAAAAGGAGACTGGCCTCTTGTGAGTGATATGGTTGCTAAAAATCAAAGGCTAATTGTGTTCACTTCAAGAAAATCTAAAGAACAAAGTGAAGGCATTGCATACCAGTGGAATTACATGGTTGAAAATCAGTATGGAGATGGAGGAAGAAAAGCGGGAAGTTGTCCAAATAGAAAAGAATCTTCTCCTCTTGATGACATGAGCAAGTCCTTAGTGTTGATAAACTATTTTCGCACTATTCCACTTAAGCCAATCACATGTAAAGATAACTCTGGAGGTCTCGTTGACATGCTCAAAACCTGTCATGGTGCTGCTGGCAACAGGTGGGCTAATTATGTTGCTGTTGACTATTACAAGAGAAGTGAAGGAGGAGGATCCTTTAAAGCTTTGGATAAACTCAATGGGAAGGCTCTTGTGTGGTTGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_25918::LG6:29158410-29160410(+)
ATTTTAGGGTTCGCGTGCTGGATTGGACGAAGGTAATGAGGTGGATGATGGTGGTTCTGAGGAGAAGCAGTAGTGGCTGTTCTAGGTCATTGGATCTGTGCGTGGAGGGTTTCTGCGATTAGGTATTCGCGACTCTGGGTTCTTTCGCGTGGTGTGATTTGCTGTGTTTGGTGGTTCTTTCATAACACGAAGGAGCTCGCAAAAACGGCGCTGCTCAAGGGGTTGATGGTGGTGGCACGATTTCGAATACCCAAACCCTAACTCAGAATTTTTAATCACTGCCACTTTCACGTCAACTGCCACTTATGAAGGTAAACAGTCACGTTGCACAGATTACTCCATGCTGTCAGCTGGATCGTTAAATATTTAACGCCATGACCAAAAAGGATTTAATTGGACATTTTTTTCACAACTTGGGACCACATTAAACTTTTTAAAAAAGGTAGGACGAACTTGAACATTTCGTTTATAAAAAGGGACAAAAAGAGGTATTAAGCCTAATAATAATAATAATAATAATTTTATCAATAAAATATATATAAATAGTAGGACAATTTGGGTGTCCTAACCCAAATACAACAATTTTACATAATTCTTCTATACATAATATTCTATTAATATTCCAAACAACTTTAGATTACAATAATTATAATATGTTCTTGCCATTTTTATGTTAAAAAAAATATATTTAGATTAGAAACAACAATACATAATCGACCAAATCATCATAATACATGTTCAAACAATAAAAGTCAAATACATCTAAATACGTTGACCAAAATATCCTCGAACATACACCTTATATTTGAGATAATAATAATATTGAAAGTAGTTATAATGGAACTGCAATCGTAGACAATAATTACATCTTAACGCTAATTCTAACGACAATCTAATTCTAATGATAATTGTTAAATTGTTAAGATAAGGTGATATGATTATAATGATGACAGAAGATGATGATGATAATGATAAGATTGATTTGAAAACGTGGAAATATAGTGGGAAATTTTTTGGAAACAAGTGGCTGCGGTTGTTGTAATAACCGTGTGGAGGTGGTGATTGCGGTTCCTACCATAACAATAATAATGGAAGCTTAAAAAATCTGATACAAGTGACGATAAAAACAACAATAATTTTAACAAGAGTAGTGATAACACCACAAAAATAATGATGATAATGATGGAGGAACTAAGATAAAAAGAGAGTTAATTATCCTACTTTATCCTTAACATAAGAAATTTCTTTTTGAAAAAAAAAATCATGTCAATACACATAGTAATTAATTTTAGCTGACTTTAATAATGCAGTTATTTTCAGTTTCAAAGTCTATGCCTTCTGCTTCAAAGTCCATATCTTTTGTAATTCTTTTATTTTTAAAATATATTTTGGAGGATTGAAAGATATAAATGTATTTAAATTATTATTTAGTGTATTGAAATAAGTCTTCAATCGAAACTTAAGAGAGGGAAAGTTAATTTTAAAACTTTTTTTTCCATGTCATTAGGATAAATTACTTAATTTGAAGTATTATTTACTTTAAAATTTTGAATTCACGGTCTCGAAAGTTTTTTTTTTCAAAAATCAAAATAATGGGAAAAAAAACACATACTTAAGTTATAATTAAAGAATAATAATACTTTTGACACAATTTTTTATTTTCACACTAAAATGATACTTTGTGGATTCTATTAATAGTTTTATTCAACTAGTCATATTAAACCATTTTATAAATAAATGATATGACACATGTCAAATGAATATATTTGATATACAGGCGTGTCAAGATACTCATTCTCGTACTTAAAAGGTTCAATGTTACTTTGGGATCAGTGTACATTTCCACAAGACTTGACTTTGTGCGTGATAATTCTTCCAATGGCAGATGACAAATTGCAGCAATCAATGGCAATCACATTCAAGATCACATGTTTTCAAGTCAAGCCCACAAATTTGACCATAGTTTGAATCAATCCATCCATTCATAGCAGCGAGAACCA


Gene Sequence:
>Vu_25918(+)
ATGCATCTTGTAAGTAGCATTCAGTTATATATTCTTCAGACGCAGGATTCCATTCCACCCAAAAATGGCTCCTTTTTGCTCTCTTCCATTTTTCACCACCACAAATCCAAAACCACGAGCGAATGTAATCCAATAGAACAGCTCTGTCACCGCTTCTCTCTTGCTGAGCTTCAAGCAGCCACAAATGGGTTCATGCCGAGTTTAATTGTCAATGGAGAAGGTCAATGTCAGGTCTACAAAGCCCACCTCAAAGGCCATGGAGACGTAGCCATCAAGCACTTCAAGACTAGAAGCCCAGATCGTGATATAGAATTCAGGGTCGAAGTCAAGATTCTGTGTCAACTACACCACCCAAATGTTGTTCCTTTGGTTGGTTTCTGTGATCACAAACATGACAAGTTTGTTGTGTATGATTATGTCTCCAATGGAAGCCTCCATGATTGTTTGCATGGCACCAACAATAACAGTGTTGTTCCCTTGTCATGGATACAAAGACTTAACATCTGCATCGGGGTGGCTCGTGGACTGCACTACATTTACTTCGAAACCAAGATACCTATCATACACCGTGCTGTGAAATCAAGCAACGTTCTTTTGGACCATAATTTGGTGCCTAAAGTGGCAGATTTTGGACTTTGCAAGAAGCACCCACAAGAGGAGTCAAGGCCAAAGCCACCAAGAGTTGAGTTGAGGGAGAACTTGGAGGTTAGTTTGGAATACATGGAGCCGGAGTATTTTATGACTGGAAGGTTATCAAACAAATCAGATGTGTACTCTTTTGGGGTGGTAATGTTAGAGATTTTGTGTAGGAAGAAAGCTTGTTTTTTAACCCCAGGTGGAGAATGTGAGTACCTTGCTAAGTGGGCCTTTGATGATGAAAGGAAGGGGGTTCTTGAGAAGATTGTTGACCCATCTCTCATTGGAAAAATAGCACCTGCTTGTTGGAAAGTGTTCATTGAGATTGTTCAGAGATGTTTGGCATCAGTTGAAGAGAGGCCAACGATGGGTGAAGTGGTAGTGATTCTTGAAAATGCATTTTTGTTGCAAGAGAGAGCAGATGTGTGAAGGAGTGTGATGAGCCTAGAACTGAGACACAAATGACAAAAGCTGAGTGGCAATGGCATTAAGAAGAGAATACGGTTATTGTTGTATTTTTCATGTTTCTTTTCAATTTTTGTAATATTGGTTTGGCAATGGCAATGGCATTTGGAAGATGAAAAACTCTAAAATTAACTCTCTATTTTAATAGTGGTTACCTCCTTTGTCTCTTGTTAATATTAGTCCATACGAGCCTTTAGCGAAAGTTGTCTTGAAAACAACACTATGCATGTACATTTTACTTATGAGCGTATTTGATTTAAAAGGATAATCTTTCCTGCGTTTTTGTTTGTAACTTACATGTACAGGAAAAAGCTATATATTTTGTTCTACCGTAGTAGCATCAACAACAGTTGTTGAACCAGAATCTTGTATTGTCAACACCAAGATCTAGCACTCAAATAAAAATCCAAAACAACCCTTCAACTGTTGGTGTTGCTTTCTAAAAGTAGAAGATAACTATGAAAAGATGGGGACACTTTCAGATTAGTGAAATACTAAGTTGTCTTTATTTCCAATAATTAATGCAGCATAAATACATAACCTCTTACACTTCAGTTGTTCATAAGAATTGAGAAAGCCATGAGTCGCTTCCCTCTTTTCATTTTTAACATATATTAGATCATTTGTGATTATCTTTTCGTTATCACTTCCTTTTAGACACCCAACTTTGTCACAGAACAAATGGGTTCTCTTCCGAGCTTTCTTTTGGTAATTATTCTTCCCTTGTGTTATTGTGTTGATGCTGCTTGCTCCAATGGAAAATGCAAGGTTTGTATAGCCTACCACCTATTGTTTGAATCATGCCTTTAACTTTTCAGTTTCAAAATTAGTATTATATTTGTTTTTCAATCTTTGATCAGCTAAATGATGAGTGCTCGTCCAATGGTGATTGTGGAACCGGACTCTATTGTTTCTCATGTCCACGTGGGTTTTCAGGCTCTAGGTGTGTGAGATCTTCTGTCACAGATCAATTCAAGCTCATAGTAAGATTCTCATTTCTCCTTGGTCTTTGCCTTATTTCTCAAGAAACTGTCACAACACAGCCTAGAGATTTTTGAAATGCCATCATCGAGCGACATAATATAAAGTACTTGAACACTTGGCAGGGTTTTGGTTCTGGTGATGTATAGAAACTAGTTCCATCATTTTACATGAACTGAATATTAACTGCTATTGTTTGAAAAAATCAGGAAAATTTTTCAAGACTTTGTATTATTATATTTTTTTTGGATACCAAAAGAAAAAAAGTTATAATATGAGATATGTACAGTGTCTTTAGACAGAAAAGGAAATTTAGGACTGTTTCTTAATCAAATTTTTAACTGCTGTTTTTTTTTTTCTTTTGGTATAGAATAATTCTCTTCCATTCAACAAGTATGCCTTTTTGACAACGCACAATTCTTTTGCTATTGATGGAGAACCATCTAACAGAAGAGTACATCGAGTCACCATCATTAATCAAGAAGACAGTGTAACCCAGCAGCTAAAAGTATGTTACTCGTTACTACTAGCCTTATCTTCTATTAACTTTTATGATGTTCTGTTTCACTACTTCCCAGGATGTTTAAGGGTCACTATTTTCTGCCATCAATGTTTCATCTGTAGAATGGAGTTCGGGGACTAATGCTAGATGCGTATGATTTTGATGGAGATGTGTGGTTATGTCATTCATTTGGAGGCCACTGCATGACTTCACAGCTTTTGTATGTAAAATTCATCTTCCCAGTAGTGTTTTTTTTGGCCTAGGATTTTCCTAACTCTTTTCTCTACAAAAATACAAACATTTATGACTAACACTAATTCAGCTACAAAAGATCCTAACTTTGTATTCTACAAGTAGGAACCAGCTATAGATACACTTAAGGAAGTTGCAGCTTTTCTATCTGCCAACCCAGAGGAAATTGTCACACTCATACTGGAGGATTATGTTAAAACACCCAAAGGATTGACAAGAGTCTTCACCGAAGCTGGTTTGATGAAGTTTTGGTTTCCTGTGACAAGAATGCCAAAAAAAGGAGACTGGCCTCTTGTGAGTGATATGGTTGCTAAAAATCAAAGGCTAATTGTGTTCACTTCAAGAAAATCTAAAGAACAAAGTGAAGGCATTGCATACCAGTGGAATTACATGGTTGAAAATCAGTGTAAGATATCACCAACCATTAAATCTTTCGTGTTCTTCACGCGGAGTACATTTTTATTCCATTTTGGTGTGATCTTAATTTCCGCAGATGGAGATGGAGGAAGAAAAGCGGGAAGTTGTCCAAATAGAAAAGAATCTTCTCCTCTTGATGACATGAGCAAGTCCTTAGTGTTGATAAACTATTTTCGCACTATTCCACTTAAGCCAATCACATGTAAAGATAACTCTGGAGGTCTCGTTGACATGCTCAAAACCTGTCATGGTGCTGCTGGCAACAGGTGGGCTAATTATGTTGCTGTTGACTATTACAAGGTAGAACTTTGGCACGTTTTCTCTTTTGCTACTAATTTTGTTGCTGAAGCATAAACTTTTGACTCATTCGTTCTAATATTAGCTATGTTTGAGGATCATTGTGCAGAGAAGTGAAGGAGGAGGATCCTTTAAAGCTTTGGATAAACTCAATGGGAAGGCTCTTGTGTGGTTGTGA