Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25884 LG6 28641959 28646294 PREDICTED: TMV resistance protein N-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   defense response, signal transduction
Cellular Component   located in   cytoplasm
Molecular Function   enables   ADP binding, ADP binding
SNP Position Effect Amino acid change
G/C 28642709 intron_variant
A/T 28642750 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25884.1
MLEAFDFSAISGIEVLLDRALITISGGNRLEMHDLIQEMGWEIVHQECVKDPGRRSRLWKHEEVHEVFKYNKGTDIVEGIILDLSKLIEDIYLSSDFLAKMTNVRFFKIHSWSKFNIFNVYLPNGLNTVSHKMRYLHWDGFCLESLPANFSAEKLVELCMRCSKLKKLWDGVQNLVNLKTIDLWGSRDLIEIPDLSLAEKLENVSLCYCESLHEVHVHSKSLRVLNLYGCSSLRKFSVTSEELTRLSLAFTSICSIPSSIWHKRKLKALYLTGCRNLGELTDEPIIHGSHKHSLTELASNAERFSMKNIKSLSTLRMLWLDDCKKLVSLPKLPPSLEKLSACNCTSLDSYMTQRLVLQHMLQSRIPYLRKNDLRCYEEEYLFPGNHVIDECVFNRTGTSITIPYLWKTELWHKGWLAPEIVGIRKFNFESRAIDQRCWSILHLLYVDDLLAAVKREFSGLYQSQKTEYRDFDEIFRQLQIEAEARAENLKKTNPLPAVAPQRKQPNDTWQGEGKNAGTEKKSDGDGDGKKGRRIENGGFVVAKNNSNANLKSSGNGSVNIGKENESANIGAFDVNRLQKLKGKGDNGNGNGKKKEAVVAAKAEPKKVVKKNRVWDDSPPQTKLDFTDHLDGVGDGDKKVDFLAKEQGESMMDKEEVLGSDSERKVPSSSASSLSRSFSSLSRAAHYLPHDHIGALSPLTDRFHRNTALTPLAKENASGGNLTGLPNVRANKIGCDSNAINSLGDGRGKLSLLMQL*


CDS Sequence:
>Vu_25884.1
ATGTTGGAAGCTTTTGATTTTTCTGCAATATCTGGGATAGAAGTGCTTCTGGATAGAGCTCTGATAACAATTTCAGGGGGCAATCGACTAGAAATGCATGACTTGATACAAGAAATGGGTTGGGAAATTGTTCATCAAGAATGTGTCAAAGACCCTGGAAGACGAAGTCGGTTGTGGAAACATGAGGAAGTGCATGAAGTCTTCAAATACAACAAGGGAACTGATATTGTTGAAGGCATAATTTTAGATTTGTCCAAATTAATTGAGGATATCTATTTGAGTTCTGATTTCCTTGCAAAGATGACTAACGTGAGATTTTTCAAAATCCATAGTTGGAGCAAGTTTAACATATTTAATGTGTATCTTCCTAATGGTCTTAATACTGTGTCTCATAAAATGAGGTACCTTCATTGGGATGGATTCTGTCTTGAGTCTTTGCCAGCTAACTTCTCTGCTGAAAAACTTGTGGAGCTTTGCATGCGTTGTAGCAAGCTTAAAAAGCTTTGGGATGGTGTTCAGAACCTTGTGAATTTGAAGACTATTGACCTGTGGGGATCCCGAGACTTGATTGAGATTCCAGACTTATCCTTGGCAGAAAAACTTGAAAATGTTTCTCTTTGCTATTGTGAAAGCTTGCATGAGGTCCATGTCCATTCAAAATCTCTTCGTGTACTGAACCTCTATGGTTGTTCATCACTAAGAAAATTTTCAGTGACATCAGAGGAATTGACAAGATTGAGCTTAGCTTTCACTTCTATATGTTCAATACCATCATCAATTTGGCACAAAAGGAAGCTCAAAGCTCTTTATCTAACGGGTTGTCGCAATCTCGGCGAGTTAACTGATGAACCAATAATTCATGGCTCTCACAAGCACTCCCTCACAGAATTGGCATCTAATGCTGAGAGATTTTCCATGAAGAACATCAAAAGCCTTTCAACATTGAGAATGCTTTGGTTAGATGATTGTAAGAAACTTGTGTCTTTGCCTAAGCTTCCACCATCCCTTGAGAAGTTGAGTGCTTGTAACTGCACTTCTCTAGACTCATACATGACTCAACGTCTAGTGTTGCAACACATGTTGCAGAGTCGCATACCCTACTTACGCAAGAACGATCTAAGATGTTATGAGGAAGAGTATTTATTTCCAGGAAACCATGTGATTGATGAATGTGTGTTTAACAGAACAGGGACTTCAATAACTATTCCTTATCTTTGGAAAACTGAATTATGGCATAAGGGTTGGTTGGCTCCAGAGATTGTTGGAATACGAAAGTTTAACTTCGAATCACGTGCTATTGATCAAAGATGTTGGAGCATCCTCCACCTCCTTTACGTCGACGATCTACTCGCCGCCGTCAAACGCGAATTCTCTGGCCTATACCAATCCCAAAAAACCGAATACCGAGATTTTGACGAGATCTTCCGCCAGCTGCAGATCGAGGCCGAGGCACGCGCCGAGAATTTGAAGAAAACGAATCCCCTCCCCGCGGTGGCTCCTCAAAGGAAACAGCCAAACGACACGTGGCAGGGGGAAGGGAAAAACGCTGGGACAGAAAAAAAGAGTGACGGGGATGGTGATGGGAAGAAAGGGCGTAGAATTGAGAATGGTGGTTTTGTTGTAGCTAAGAATAATTCTAATGCTAACTTGAAGAGTAGTGGTAATGGTAGTGTGAATATTGGGAAAGAGAATGAGAGTGCTAATATAGGGGCTTTTGATGTAAATAGGCTGCAAAAGCTTAAAGGAAAAGGGGACAATGGAAATGGGAACGGGAAGAAGAAAGAGGCCGTTGTTGCTGCCAAGGCTGAACCAAAAAAGGTGGTTAAGAAAAACAGGGTTTGGGATGATTCCCCTCCACAAACCAAACTGGACTTTACGGATCACCTTGATGGGGTGGGAGATGGGGATAAAAAGGTTGACTTTCTGGCTAAAGAACAAGGGGAGAGTATGATGGATAAAGAAGAAGTTCTTGGCAGTGATAGTGAGCGTAAGGTTCCCTCTTCTTCGGCTTCTTCACTTTCCAGATCCTTCTCTTCCCTCTCCCGCGCCGCCCATTACCTCCCTCATGATCACATCGGAGCTCTCTCTCCCCTAACCGATCGCTTCCACCGCAACACCGCTTTGACGCCTCTCGCGAAGGAAAACGCTTCTGGCGGAAACTTGACTGGTCTTCCCAATGTTCGTGCGAATAAGATTGGCTGTGATTCTAATGCGATCAATTCGTTGGGTGATGGAAGAGGGAAGCTGTCGTTGTTGATGCAACTTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_25884::LG6:28646294-28648294(-)
AAGTAGAAAATAAGAATATGTCTTGGTGCCATCTGCATGACTGCGTATGCTGTGATGAACTTATTTTGAATATTCATGTTCTTCTCTATTTGATGTGAATTTTGTCAGGTTAACCACATGTTATGTTTGAAAGAATGGAGCATAAGTTTTCCCAAGTGATAAGCAATACTTGAAATTCATAATGGTTGAGCAGAAAGTTATCGGTGTTGTTGCTTCATCCTCTTACTCTCCTTCAGTGTTATCTTCTAAAAGATATGATGTGTTTCTAAGCTTTCGAGGTGAGGACACCCGCAAAAAATTCACAAGCCATCTTTATGATGCTTTGAAGCAAAAGAAGGTTGAAACCTTTATCGACAATCGTCTTGAAAAGGGAGAGGAGATCTCAACAACACTAATCCAAGTAATTGAAGATTCTCATATATCTATTGTCATCTTCTCAGAGAACTATGCTTCCTCAAAGTGGTGCTTGGGTGAACTCAGCAAGATTATGGAATGTAAGAAAGAAAGAGGACAGATTGTGATACCAGTGTTCTATGACATAGATCCATCCCATGTAAGGAAGCAGACAGGAAGCTATGAGAAATTATTTGTAACACATAAGGGAGAACCCATGTGCAACAAATGGAAAGCTGCTCTCACTGAAGCAGCCAATTTAACTGCATGGGACTCTCGGACATACAGGTAAACTAATTTGAGAGTGAGTGAAGTTGAGTTGTCCAAATTTGGTTTTAAATTATGCCAAATTTGATTTTAAATTAAGAATTCATACAATTGTCTATCACAGCTTGAGAAGCTTTCATACTAGTTCTAACCAAGCATAAACACCTTTCATACAATCTGTTTTCAGAATCCAAATTTGATCTTAAATTAAGCATGCATAAACACCTTTCATACTAGTTTGCTTGAGAAGCTTGCTGCATAGAAAAAACAAAGGCTTTTATTTGGGTTTAGTTCAAACTTTAATTTGGTCATATCACCATGATCTTCAACACATTTTGGTTACTCATCTGCACTACCATTGTTGGTCATGGATTATGTGTAGTACTTTCATAGTTGCTTGTTTTAGTTTTGAATTTGTTAGACTATCTACACATCATTTATTTATGTTTCTCTTTTCACATGCAAGGGTTGAATCTGAACTCCTTAAGGATATTGTTGAAGATGTTTTGCAAAAATTGGCTCCTATATACCCAAACTGGCACAAAGGATTGGTTGGAATTGAGGAAAACTATGAAAAGATTGAGTCATTGCTAAAAGTAGGGTCAAATGAAGTTAAAATCTTGGGAATATGGGGCATGGGTGGAATAGGTAAAACCACCCTTGCTTGTGCTCTATATGACAAACTATCTCACGAGTTTGAAGGTCACTGCTTCCTTGAAAATGTAAGGGAAGAATCAGACAAGCATGGAGTCAAAGCCTTACGTAATAAGCTTTTTTCTGAGTTGTTAGGGAATAAAAATCATTGTTTTGATGTAGCCTTTTCAGTAACCAAGTTTGTTTTGAGTAGGCTAGGACGCAAAAAAGTTTTCATAGTCTTGGATGATGTGGCTACCTCTGAGCAATTAGAAAATCTAATTGAATATTTTGATTTCATGGGACTCGGAAGTAGAGTCGTTGTTACAAGTAGAAACAAGCAAATATTTAGCCAAGTTGATAAAATATATGAAGTCAAGGAATTGAGCTTTCATCACTCCCTTCAACTTTTCAGTTTGACTGTTTTTAGAGAAAAACAACCTAAATATGGATACGAAGATCTATCAAGAAGTGCAACCTCCTATTGCAAAGGTGTTCCTTTGGCTTTGAAAGTTCTTGGTGCAAGTCTTCGTTCAAGAAGTAAGGGAGCATGGGAATGTGAATTGAGAAAACTCCAAAAGTTTCCAAATATGAAAATTCACACTGTCTTAAAATTAAGTTATGATGACTTAGATCACTCTCAGAAGGACATATTTCTAGACATTGCATGCTTCTTTAGAGGGAACCAGAGAGATCATGTGACAAAC


Gene Sequence:
>Vu_25884(-)
ATGTTGGAAGCTTTTGATTTTTCTGCAATATCTGGGATAGAAGTGCTTCTGGATAGAGCTCTGATAACAATTTCAGGGGGCAATCGACTAGAAATGCATGACTTGATACAAGAAATGGGTTGGGAAATTGTTCATCAAGAATGTGTCAAAGACCCTGGAAGACGAAGTCGGTTGTGGAAACATGAGGAAGTGCATGAAGTCTTCAAATACAACAAGGTAAATTAAAAACATTTTTGCTTCTATATGTTAATTTAAGTATACTTTAAGAATTTAGCTAGTACCTGCTAATGACTATTCCATGTTTGTTTTGTTTGGTTTAGGGAACTGATATTGTTGAAGGCATAATTTTAGATTTGTCCAAATTAATTGAGGATATCTATTTGAGTTCTGATTTCCTTGCAAAGATGACTAACGTGAGATTTTTCAAAATCCATAGTTGGAGCAAGTTTAACATATTTAATGTGTATCTTCCTAATGGTCTTAATACTGTGTCTCATAAAATGAGGTACCTTCATTGGGATGGATTCTGTCTTGAGTCTTTGCCAGCTAACTTCTCTGCTGAAAAACTTGTGGAGCTTTGCATGCGTTGTAGCAAGCTTAAAAAGCTTTGGGATGGTGTTCAGGTATATGTACTACATTTATGATCTCAGTCAAATTTTTCTTATGCTTGAGGCTCATCATTTTGAATTTAACAACTTTTTAACAGAACCTTGTGAATTTGAAGACTATTGACCTGTGGGGATCCCGAGACTTGATTGAGATTCCAGACTTATCCTTGGCAGAAAAACTTGAAAATGTTTCTCTTTGCTATTGTGAAAGCTTGCATGAGGTCCATGTCCATTCAAAATCTCTTCGTGTACTGAACCTCTATGGTTGTTCATCACTAAGAAAATTTTCAGTGACATCAGAGGAATTGACAAGATTGAGCTTAGCTTTCACTTCTATATGTTCAATACCATCATCAATTTGGCACAAAAGGAAGCTCAAAGCTCTTTATCTAACGGGTTGTCGCAATCTCGGCGAGTTAACTGATGAACCAATAATTCATGGCTCTCACAAGCACTCCCTCACAGAATTGGCATCTAATGCTGAGAGATTTTCCATGAAGAACATCAAAAGCCTTTCAACATTGAGAATGCTTTGGTTAGATGATTGTAAGAAACTTGTGTCTTTGCCTAAGCTTCCACCATCCCTTGAGAAGTTGAGTGCTTGTAACTGCACTTCTCTAGACTCATACATGACTCAACGTCTAGTGTTGCAACACATGTTGCAGAGTCGCATACCCTACTTACGCAAGAACGATCTAAGATGTTATGAGGAAGAGTATTTATTTCCAGGAAACCATGTGATTGATGAATGTGTGTTTAACAGAACAGGGACTTCAATAACTATTCCTTATCTTTGGAAAACTGAATTGTATGGTTTCATTTATTTCATCATTCTCTCTAAGGGATCACTCTTGCAGTCTGGTGTTTCGTGTTCTGTTTATCAAGATGGCATAAGGGTTGGTTGGCTCCAGAGATTGTTGGAATACGAAAGTTTAACTTCGAATCACGTGCTATGTATGTATCATGACATTACTGAATTTGATGCAATAACTGAAGACGGGCATGGCCATTTCTTCAGCAACGTAACATTTATTTTTGAAAATAGTGAAGCAAGCATACAAGAGTTTGGCATCTTTCCCATATATGGCTCAGAATCAGGGTTGAAGCTGGTTGGGAGCAGATAAATTTGAGTCGAAATTCATTGATTCTGAAGTATATATTTACCAAAATTCTACTTTGAGTAATATGAAGAAGGAAAATGTTGAAAACTACTGTAGAAATAATGAAGAATGGATAGTTGTTCAATAAACCTCTTATATGTTGTTGTGTGCTATGAATGAATTTGCAATTTTCGTCACAAAAATTGTATGAAGGACTGTAAATTTTGACAATATTGTTTGTAATTTTGTCCGAAGAGTTGAAAAACAAGTTTGCAGTTATTATGAGAAAAACTATATGAGTTCGATCTCAAAGTTAAATTTATTGTCTACTTTTTTCCAGTAAAGAGGTTAAATGTAATGTATAATTTTATGTTTCCAGGAGCTTATTTTCCTATTGTCTAGTTCCAACAAAATTCAGTACTCAAATCTTTAAGGTTTAATACCTCTTTTGGTCCCTAGAAAGGGGGCCAATGTTCAATGTGGTCCCACCTTTTTTTAGAAGTTCAATGTGATCCCATCTTTTGTAAAAAGTGTGCAATCAAGTCCTTTTTGGAAACGGCGTTAAGTTTTTAACGGAGCAGCTGACAGGGTGGACTGAAGTTAGCTACGTGGCTTTGTGTGGGTAATACGTGGCTGTGAGTGGGTGTCAGTGCGTGTTCCATCATCTTCTGCATTTCCCGTATCCTCCACAAACCTAACCCATCTTTTCCATTTTTTTTTCAATTTCCCAAATCAGAAAAAACCTATCTCAGACTGTTTGTGGCATTGCAGTGATCAAAGATGTTGGAGCATCCTCCACCTCCTTTACGTCGACGATCTACTCGCCGCCGTCAAACGCGAATTCTCTGGCCTATACCAATCCCAAAAAACCGAATACCGAGATTTTGACGAGATCTTCCGCCAGCTGCAGATCGAGGCCGAGGCACGCGCCGAGAATTTGAAGAAAACGAATCCCCTCCCCGCGGTGGCTCCTCAAAGGAAACAGCCAAACGACACGTGGCAGGGGGAAGGGAAAAACGCTGGGACAGAAAAAAAGAGTGACGGGGATGGTGATGGGAAGAAAGGGCGTAGAATTGAGAATGGTGGTTTTGTTGTAGCTAAGAATAATTCTAATGCTAACTTGAAGAGTAGTGGTAATGGTAGTGTGAATATTGGGAAAGAGAATGAGAGTGCTAATATAGGGGCTTTTGATGTAAATAGGCTGCAAAAGCTTAAAGGAAAAGGGGACAATGGAAATGGGAACGGGAAGAAGAAAGAGGCCGTTGTTGCTGCCAAGGCTGAACCAAAAAAGGTGGTTAAGAAAAACAGGGTTTGGGATGATTCCCCTCCACAAACCAAACTGGACTTTACGGATCACCTTGATGGGGTGGGAGATGGGGATAAAAAGGTTGACTTTCTGGCTAAAGAACAAGGGGAGAGTATGATGGATAAAGAAGAAGTTCTTGGCAGTGATAGTGAGGTTGAAGATGATCAATCCCAAATTACCAATTTTTCTAAACCTCCTGAAACCCTAACTTCTGATTTCCTAACCTCAGTAACATTATCAAATTTACCCTCTCACAGCCACGTAGCACCCACTCACAGCCACGTATTACCCACACAAAGCCACGTAGCTAACTTCAGTCCACCCTGTCAGCTGCTCCGTTAAAAACTTAACGCCGTTTCCAAAAAGGACTTGATTGTACACTTTTTACAAAAGATGGGACTACATTAAACTTCTAAAAAAAGGTGAGACCACATTGAACATTGACCCCCTTTCGAGGGACCACAAGAGGTATTAAACCTACTTTCAAATACACTCTCAATTATCTATAAATCCACTCAAAAAAACAATTATAAAATTACCCTCAAATCCATTCATTTACGTCACATACTTCCAAGCAAGCGTAAGGTTCCCTCTTCTTCGGCTTCTTCACTTTCCAGATCCTTCTCTTCCCTCTCCCGCGCCGCCCATTACCTCCCTCATGATCACATCGGAGCTCTCTCTCCCCTAACCGATCGCTTCCACCGCAACACCGCTTTGACGCCTCTCGGTAACGACCTTCTCTCTCAGTTTCTTCTTTCCATTTCCTTATTCAATGCCTTTTATTTTCCTCCAACCTTCACATTCTCTTTTGTTTCCGCTCCTATCACCACGCACTTCCAATTAAGCAAACATATCTATGCTCTTATTAATAACGCCAAAAACAGAAAATAGGTCATCACTGCTTCATTTTCTCAATTCGCTTTTCCTTGATTTCGATGAATCTCGTGACTCCTGTTGCTCTGCCACCTTAATTTGTTTGTACTCGCTGGTGCCGAGTTTAATTTTCTGCTTCTGATTCTCTCGTTCCTTTGATGCTAATGTCGTTTCAGCGAAGGAAAACGCTTCTGGCGGAAACTTGACTGGTCTTCCCAATGTTCGTGCGAATAAGATTGGCTGTGATTCTAATGCGATCAATTCGTTGGTATGCATCTTTTCCGTCACTGTTAATGACATTTGAAATTCTAGCCATCCTTGATGGATTGATACATGTTTTGTGTACTTTTAATTTGATATTGCTTGTGTGAAATTACATTTGTATACCTCGTTTTTGCTCCCTCTAGGGTGATGGAAGAGGGAAGCTGTCGTTGTTGATGCAACTTTGA