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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25777 LG6 27146291 27150554 PREDICTED: uncharacterized protein LOC108340487 isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   microtubule cytoskeleton organization, protein autophosphorylation, drought recovery, drought recovery, protein autophosphorylation, microtubule cytoskeleton organization, drought recovery, protein autophosphorylation, negative regulation of growth
Cellular Component   is active in   cytoplasm
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus, nucleus, cell cortex region, nucleus
Molecular Function   enables   protein binding, protein serine/threonine kinase activity, protein kinase binding, microtubule binding, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein binding, protein binding
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 27146450 3_prime_UTR_variant
T/A 27146577 3_prime_UTR_variant
T/C 27147699 upstream_gene_variant
C/T 27147738 missense_variant p.Gly429Glu
G/T 27149951 5_prime_UTR_variant
C/T 27150464 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25777.2
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>Vu_25777.3
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>Vu_25777.1
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CDS Sequence:
>Vu_25777.2
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>Vu_25777.3
ATGTTTAGATTTTCTTGTTTCCATGCTAATGTACACGGCAATAAAACAAAGAAAACAGTTCAACCTTCTACTGAAGTAATGTTGAAGACTTATCAAGATGCTGCCCAAAATCAACGCCGTAAAGATTCATCTAATCCTCCAAGCGCATATTCACCCCTTCTGAAAGAACAAGCAGACCAGCAAATAGATATGACAGGGATTCATATTAGCAACTGGGATTCAGTTGAGCGCAGTTGTAGGTCAGAGGATATGAGTAGCAAGTTTTCCTTTGAAAATGACAGTCAAGTTAACCAACCTAGGCCTGTTATGAAGAAGAGTCAGTCTCTTCAAAGTGTGCTTGATCAAGGCATAAGGGATGGTGATGAAGATATGGGGCTGTCGTGTGATGATGCCAAAAGCCCAATTGAGTCAAAGATGTCAACTTCCAAAAAGTATCATAATGGAAACCCTGTTGATCAGTATGGAAGTAATCCAAACATTGAGTTTGCTGCCAGTTCAGGTTTTGCAAATGATGCCTCACTTTTTTCAATTGGAGACCCGACACCTTCAGATAAAGACGCCCGTGAAATTTCTGACACTCCTTTATCTGGTGAATATGTTGGTGACATTCCTGACCAGACTTCTGTTCCTGGTAGTGTATCACTACGGAAGTCACATTCTTCACCCAATATCAGAGCTTCCATACTTTCTACTGAAAAAGATGCTTTTAGACGTGCATTGTCAAGATCCTGTGAGGATCTTCATGCTTTAAGCATGAGGCACAAAGAGGAATTCATCAACGACTTTAATGATCAAATTAGGGGAGATCACGAAAGAGAGAATGACATGGGAAAAACTGAAGATGGACATATGGACAACCTCTTTGATGATGGTTTCGATTCTTATCTGCTTACTGGTTCAGCAAAAGACTGGGTAATGCCATTGACATATGATACAGGTGATTCCAAAACCCTTCAAGGAGATTCCTCAGTTGAATTTCCTAACAAGGATTTCAAGATTAAGCGCATTGAAGATTGGGTTATTGGTCTGCAGCATTGTGGACCACCCGTAGAGGAAACAAATGAAGTGCTGCCTGAAGTTGTTAAGCCTTTAGCTGATGTTAACACAGTAAATGGTGTGACTGCTGCCATTGTAGATCACAAGGCCACTCCAGGAATGGATGCAGCTAAAAGATATATATCTTCTCTGGGGCCTAATGCCACTACCGCTCAGCTGGCTAATCATGGGTTGGTTGTGATCCCCTTTTTGAGCGCATTCGTCAGTTTGAAAGTGCTCAATCTGTCTGGAAATGCTATCGTGAGGATAACTGCTGGTGCTCTTCCCCGTGGACTTCACGCACTGAATTTGTCTAGAAACAAGATCTCCACTATCGAAGGATTACGCGAACTTACAAGACTTCGTGTCCTAGACCTCAGTTACAACCGTATATTAAGAATTGGACATGGCCTTGCATCCTGCTCATCTCTGAAAGAGTTGTACCTGGCTGGAAACAAGATCAGCGAAGTGGAGGGTCTGCACCGTCTCTTAAAATTAAGCATCCTGGATCTCCGTTTTAACAAGATTTCAACTGCCAAATGTCTGGGCCAACTTGCAGCAACTATAACTCTTTGCAAGCTATCAACTTGGATGGGAACCCTGCCCAGAAAAATGTTGGAGATGAACAGATGA

>Vu_25777.1
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Promoter Sequence:
>Vu_25777::LG6:27150554-27152554(-)
TTATTATATATTCTCAACCTTGGACATTTTATTAACTAAAATAAAATTCCCACTTTAACAATATTTGTTCATCTTTCACTCTTTTAATGGATATTCAAGGTTTTCTCAACATTTACTATGCAATAAGTTCTATAAATTCTTTTTATAAGAGTGTTTAATATTATTCTAAATTGCCTTCCTTATATCACACCACTTTTAAATAACTCATAATTTTTTTACTAGCTTTATTGCATGTCTAGTAAAAACTCACATTTATATTTTTTTATTTGCAATTCATTTTTAAAATTTCAAAATTTAATTTAATTATTAAAATACATTTTTTTATTCCTAATAATCAGAATTGTACTTAAAATATAGTTCTTAATATTATTTTTTATTCTCAACGATCATTACTAAAGTTTTATTTTTTTATTCTGAGTGAATATAATTATTTGAAAATTTTATTAAAATAATATAACAAACTATCTTTATTCTTAAAAAAAATATAATTCCTTAACAAGTTTTAAACATTGTCTCAAAAATATCCATTATAAAACTCATTTACCACATTCTTAACGTGTGAAAAGTATTATTATATTTTATTTCTCTCCTTTCTTTTTTCAACTAAAAAAGAAATAGGTTATAGTGAAAATTTTACTTATATATTTAATTATATTTCTCAATAATTATATTTAATTAATATTATAAAATAAAATTTATATTTAATTATTTACTTATATATTACAAATTGAAGTATAAATTTGTAACATAAATGAAGTGAGAATACGTTTTTTTCTTTTAAATTAAATGACTGTAATGTGGAGAAAGAATCTACGTTTATGCAGTGAAGCATCGTTATTGATAGACACACCTCTAGAGAATAGGAGTTTTACGAAATATTTTGGGCTTGCTAATGATACCTCCGAATCACCTAATGCCACATCTTACCTTCCAATTGGTCAATTTGATATCTATATTTTAAGGTGATAATATCTAGATGTTAATTTAGATTATAAATAAAACGTGAGGATTAAATTAGTGTGAAACTATGCTAATTAACATTCGTTGGAAATTAAAAAAAGAGTTTCTGTACAAGTAGCCTCGTACAATTTATGACAAAACACTATCTCTGGTGATGATGACAACATAGCTTTCGCATGAAAACAAACATCATTGGTCAATAAACGTCATCATGTCCTATAATCTTTATTACAACCACATGGCTTCATCCAATCACCAAAACCTGTTTGTTTGTATTTGCATTCAATTTAATTATCAATTATCACTTCCTCACAAATCAAATCAAATGCCTTTCACTTTTTTATCCAACCTATATCTGCCGACTTTCAGCATTAGACATTTAACCATACAAAAATATCAGGGCCAAACCAAAAATAAGGTATATATTTATATATATATATATGTATATATAATTAAAGTTTATTTCTAAACATCACAAATATTAATCATCATTATCTTCTAAAAGCTAGAATATCAAGATAATAATATGAAAATAAAATATAATTAAATATTATATAATCAGTTATCGATTTAGATTGTTGACCAGTAATTGCTTAATTACTTATTTTGATAAATATATCATGACCATAACAATAAAATTCGTTTAAATTTAATTTGTTTAGTTACAGTTTTCTAAAATCAAATTTACACACCCTAGATGCCTTGAATCTATTAGTTTAGTTGTGTCGATGGATTAACTCCTTATAATTCTAAAAAAAGGAGAAAGAAATATTATTTTTAAAATTGAATAAATGAATAAATTTAGGTACAGAACCCAAATATGTTAATACTAATTTTTATTAGAACAAATAGATAAATTCATAAAATAAACAAACAATAAAAAAAAAGATATTTTAACTTTTTGAATAACTTTAAAATCTCCGGAATTTGAACCAGATTAAAATATATTGCATCGAAAATATTTGCAGTTACAAATATACTTTTTGATTAACGGTGACTGTGATGGCCTCTAATCATTGACATTAACTGATGCAGACTGT


Gene Sequence:
>Vu_25777(-)
AGAAAACATTTTATTTAATTCAGATCTGATTTGTTAGCAGGCTAGGGTTAGCAATAGATAGGATGTAGTTGTTGGTTCCTACTGAATACGGTTTATTCGGCTTGTTATTATTATTATTATTTATTAACGACTATATATAGGAAAAATGAATGGAAGGTGATTCTTTGGTGGCGTAGCCTAGCAGGTCAGGGGAAACGGAGGAAGAAGAATCTCTTTCTCTATACAACAGTGCCTCTTCCTTCATTCTTTCAAAGAGGTCTCCTGTCTCTCTCTCTCTCTCCACCCTCTGTATGTCATATCCTGTGTTCTTTCTTCCTCATGGAACCTCTGCTATTGCAAAATCCCATGATTTATGAATAATTTTGTTGTATATTCGATTCAAAGATGCGATTTTGTTTGATCCCATTGCTGCCCTTTTTCGAATAAATCAATGGGCATGGTCAAAGTTTTTCCTTGATTGCTGTTTGGATTTTTTTTTTATTTGGGGGGTTTTCATTTTTCAAATATTTGGTTTGTCGAATTTGTTTTGTTTGGAATTTTTGAAGAAGTCCAACATGGTTGAGGCAGTCTTGGAATTTAGAGTTTAGGGAAGAATGAAGAAACCGTTTTGAAGTATCGACGTAAAGATGGGGTCTGTTGTATTTCTTTTGTAGAGGTCACATGTACATTGAGACAATCATGGTTGGACTGGTAGGATTATTATGAACAGCTAAAGTCTCCCTCCATGTCTTTCATTGCATACGCAGAACTCGAACTTGAGATAATTAATTAAGCTGCAACTTTCGTACCGGTTGATCCACGAGCTCTGTGGTTGGGGTCTATTGTATTTGTTCTTGTGACTTAGGTAAAGAATAGAATGATACACTATATTGCAGATTATGTGAATGGTTTCTATAGGTTTTATCTTCAAGTTATGTTTTTAGATTGAGAAAAAAAATGCTTTTTGGTTTGTTTTTTTAACGGTTGATCATGTTCTTCTACTTTTACTATAATTATATATCAGATTGACCTTTATTCTTGGTTCCTTTTTGTTTACCAGGACTGCATCTCTTATGCATATCTGTCTCTGGATTCTGCCGGTTGGAAAGGAATTTATTTCACTCTGGCCGCTATAACAGAGTCAAACTATTCTCGCACCTCTAGGAGGGTGTGGGGTGACGAAGAGGGAGTGATTTGGCTTTGTGTTTTGCGAAGATCAAAGTCTTCGGATATATGGAGATTGTGCCGTGTTTCAGTGGGCTTGTCGCTTGATTATGGCTAAGGGTGGCTTTTGCGGTTTTGCCAGAAGCTCTTTCTAGTTTGCCACTGAATCTGAGAGCAAATTTAGTCCTTGATTAGGCTTCTGGAAAATTGATGCACGGTATAGATTGTAATTGGTATTTGTTTTTCTGCCTTAGAGAAAGTTGTGTTTAGATGTAGCTGTGAACGTCATTGCAGCAATGTTTAGATTTTCTTGTTTCCATGCTAATGTACACGGCAATAAAACAAAGGTAAGTATAAGATGTATGAATTGCTTGGTATTATTTGTTGATATGATATATATCATGGCCTATGTTGACTTTGTGCTTTCCCCTTAAATCAGAAAACAGTTCAACCTTCTACTGAAGTAATGTTGAAGACTTATCAAGATGCTGCCCAAAATCAACGCCGTAAAGATTCATCTAATCCTCCAAGCGCATATTCACCCCTTCTGAAAGAACAAGCAGACCAGCAAATAGATATGACAGGGATTCATATTAGCAACTGGGATTCAGTTGAGCGCAGTTGTAGGTCAGAGGATATGAGTAGCAAGTTTTCCTTTGAAAATGACAGTCAAGTTAACCAACCTAGGCCTGTTATGAAGAAGAGTCAGTCTCTTCAAAGTGTGCTTGATCAAGGCATAAGGGATGGTGATGAAGATATGGGGCTGTCGTGTGATGATGCCAAAAGCCCAATTGAGTCAAAGATGTCAACTTCCAAAAAGTATCATAATGGAAACCCTGTTGATCAGTATGGAAGTAATCCAAACATTGAGTTTGCTGCCAGTTCAGGTTTTGCAAATGATGCCTCACTTTTTTCAATTGGAGACCCGACACCTTCAGATAAAGACGCCCGTGAAATTTCTGACACTCCTTTATCTGGTGAATATGTTGGTGACATTCCTGACCAGACTTCTGTTCCTGGTAGTGTATCACTACGGAAGTCACATTCTTCACCCAATATCAGAGCTTCCATACTTTCTACTGAAAAAGATGCTTTTAGACGTGCATTGTCAAGATCCTGTGAGGATCTTCATGCTTTAAGCATGAGGCACAAAGAGGAATTCATCAACGACTTTAATGATCAAATTAGGGGAGATCACGAAAGAGAGAATGACATGGGAAAAACTGAAGATGGACATATGGACAACCTCTTTGATGATGGTTTCGATTCTTATCTGCTTACTGGTTCAGCAAAAGACTGGGTAATGCCATTGACATATGATACAGGTGATTCCAAAACCCTTCAAGGAGATTCCTCAGTTGAATTTCCTAACAAGGATTTCAAGATTAAGCGCATTGAAGATTGGGTTATTGGTCTGCAGCATTGTGGACCACCCGTAGAGGAAACAAATGAAGTGCTGCCTGAAGTTGTTAAGCCTTTAGCTGATGTTAACACAGTAAATGGTGTGACTGCTGCCATTGTAGATCACAAGGCCACTCCAGGAATGGATGCAGCTAAAAGATATATATCTTCTCTGGGGCCTAATGCCACTACCGCTCAGCTGGCTAATCATGGGTTGGTTGTGATCCCCTTTTTGAGCGCATTCGTCAGTTTGAAAGTGCTCAATCTGTCTGGAAATGCTATCGGTTAGTAGTATAATTTCCTTATTCATTATCGATTTCCTTCAAACTGACAGTACTAAATCCAGTTATCTTTGTTCTGAATTCTCCTTTCAGTGAGGATAACTGCTGGTGCTCTTCCCCGTGGACTTCACGCACTGAATTTGTCTAGAAACAAGATCTCCACTATCGAAGGATTACGCGAACTTACAAGACTTCGTGTCCTAGACCTCAGTTACAACCGTATATTAAGAATTGGACATGGTAAAACAAATTCTGGATTACATCTCAAGTTTCTTATTTATAGAACTTCTTATAGAAATAACATGTTGATGCCATTATCTATTGACATCCAATCTTTTTCTTCATCTGCAAAGGCCTTGCATCCTGCTCATCTCTGAAAGAGTTGTACCTGGCTGGAAACAAGATCAGCGAAGTGGAGGGTCTGCACCGTCTCTTAAAATTAAGCATCCTGGATCTCCGTTTTAACAAGATTTCAACTGCCAAATGTCTGGGCCAACTTGCAGCAACTATAACTCTTTGCAAGCTATCAACTTGGATGGGAACCCTGCCCAGAAAAATGTTGGAGATGAACAGATGAAGAAATATCTGCAGGGCCTTCTACCCCATCTCGTCTACTACAATCGGCAGCCTATAAAAGTGAGCACTTTGAAGGATGGAGCAGAACGGTCGGTTCGGCTAGGAATGAATTCCCATCAGTTTGATCGCAGCCTTAGGTCGGATCGCAAGACCACAAGGAAGAGCAGCCAGGGTGGTGTTGGCTCACGAAGGTCAGTGGCCACTTCCACTCATGTTCGCAGAAATGTGGATTCACCAAAAGTATCCAGAGGCAAACAAGCTCTGCCACCATCTAGAACCAAAGTACCAACCCACACTCGCCATCAGTTTGAAGCCTCCACCAAAGTATTGAACGTGACCCCAAAGCTTTCCATGCGCAAGAGTCGCAGCGAGGGAAATTTTGGAGCTCTGTGAGAGGCTGTTAAGTACAAAGTTCATTCCTTTACCGCATTGTTTCAGTATGCATCTGTTTGCCTTGGTATGTTGTATTCTTGTCATGCTTTCGTTTTGCAGTTTATCGCTTCTGTTTTGGTGCACTAGATATTAATACGTTGATTTGTGGGTTGTAATGCCCAATAAGCTGCTGCTTTCTGTCACAGTATTTCTATTCCATTATGTGTTGTGTTGTGTTTTGTTCGTTCAGAACATCATTTTCAATTTGTCTAGAGAACAAGTTTGGTGCGATTGCAATAAATTTCCTCTTTGGAAGGATAGTTTGTCACTTCCATGATTTTGTTATGTGGGGTTGATGTGCTCCTTACTGATATTAGGATTAAACAACTGTATCTTAGCTGGATCAGTGTAATTAAACCAAGTTACTAGGCCTTGGCCCCACTTATTTAGTGCAGATTATTTATTTGAATACTTATCTTTGAAACATTTGC

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