Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25763 LG6 26951478 26952899 PREDICTED: transcription factor MYB34-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 26951598 missense_variant p.Ala202Glu
G/C 26951602 missense_variant p.Pro201Ala
G/T 26951629 missense_variant p.Leu192Ile
A/G 26951646 missense_variant p.Leu186Pro
T/A 26951817 missense_variant p.Glu129Val
T/C 26951971 intron_variant
T/A 26952102 intron_variant
T/A 26952119 intron_variant
A/G 26952131 intron_variant
G/C 26952136 intron_variant
G/A 26952323 intron_variant
T/A 26952354 intron_variant
T/G 26952400 intron_variant
G/A 26952441 intron_variant
C/G 26952450 intron_variant
G/A 26952494 missense_variant p.Pro82Ser
G/C 26952547 missense_variant p.Ser64Cys
A/G 26952647 intron_variant
A/T 26952707 intron_variant
C/T 26952716 intron_variant
G/A 26952729 intron_variant
C/T 26952735 intron_variant
G/T 26952750 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25763.1
MVRTPFYDKNGVKKGAWSREEDDKLRAYVHTYGHSNWRQLPKFAGLARCGKSCRLRWLNYLRPNLKHGNYTPEEEEIIIRLHQQFGNRWSLIAEKLPGRTDNEVKNYWHSHLKKSLKRSEMTASELKLKGGDNKSFEGNLKESGEYENSEKLGGNSGDDIFPHILESSLPISAETPEGDNYTLITGAEEDGVPPLVSYKEFTGDFWSEPFLLEDTIHTFKDDICTGKGMALLIPNFDAAYFL*


CDS Sequence:
>Vu_25763.1
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Promoter Sequence:
>Vu_25763::LG6:26952899-26954899(-)
GGCGGACACACACTCTGACGCTCAAGTCAGTAAAGTGACCGAGTGATTATTATAGCAAGTAGAGCATGTATTATGCAACCTGGTCTGAAGTCATACTTGAGATCTTTATTTATAATGATTGTAATGAGATTTTACCTTTCTTGGGCCTGATGATGGCACAATCATACCTTAATTTTCATTAGGGACTTTAATGAACTATTACTGTTTATAATCTAACCATGTGGTTGGCCTAGTGGTTGGTCGACCGAGACGGTCAATCAGTATGGGTGGTCGGCCTGGTCGGCCAGGGTTGTTGGCCTGGTGGCGATCTAAGAGGAACCGTTCGACCTAGGAATAGCCGTTCGGTCTGGACCATGTGGTCGGCTAGGGTTGTAGGCCTAGTGGTTGACCTAAGAACCGTTCGGCATATGGGGTAGGGAGGACCGTACAGTTTCTATTATGAATAAAAAATTATAATTAATCTCATTGATAAATAAAATAATTTCTATTATGAATGGTTTCTAAATTGATTATTAACATTAATTATCAATGTTTTAATTATAAAAACTGGTCTCTAATTGAAAAATTAGCTTCTATACATATTTTTGGTTAAATATTATTGATAATTAAAATATCTTTTATTATAAATAAAAAGTTATAATTGGTTTCTAAATTATAATTCATAAATCAATAATAATTTTTTGTTAATAATAAAGAAAATTTTAAATATTTACAGTTGTCTTAATTAATATAATAACTAATTATTTTAGATATTAATCATTTTTAGTCTATAAAATAATGTCAGGCAGTGAGTATAATTATTAATTACTTTTTATTTCTAAATTTAGTTGGTATATAATGACTTTTTTTTAATGTATACTTTATCCGATAGTTAAACTGATCTGTTTGTTTTACAACCGAAAACTTTTCTCTTTTATATATATTTTCAATATGATTTGATCCTTGGTCTGTTTTAAACAATTCGAATTTTAAGAACTAAGAACAATATATTGAAATATTTAAATATGGGAATCTTCGTGAGATGTAACTGTATGAAATTAAAAGTTTTAAATAGGGTTATAAGCTGCTGCTAATCTTGTTTTCATCAAAGTCAGTTGGATAAATCCAATGCAGATGTTCCAATAAAACAACTTTTAATCCTTCATTTAAATACATCCAATGCAAATATTTCAAAGATGCCAATGTTGAGTCAAAAATTGTACAGGAAGTCTTTGCACACAGTAAAATGTTTATGCATTGCCTTTTCTTATGGTTTATTCATCCACTTTTGACTTTTCTTTCTTTTGTTTAGTTCCTTTTCAGTTTATTTCTTTTGTTTTCAATCACTTTGCATTAGTGAAACACTTCCTTCATAAACTCTTAATAATCTTGTATTCTATTTGATTAAGATTGTGTGAAAAGTTGACATTTAATTATGCAGCACAGGTTTCCATTTTCAATGTGTTTAAACTGGGAAGATTCATCTCCGGTTATATAACATATACTGCCACTTAATTTGCATAACCGAAATTTCCAAGTCATCAATAAAAATCCATTTATAATAAACTCTTTCTTTCTCTCAGTCTATTTTTTATTTTATTTTAATCACAGTCAAGCGATACTTCAATTAGTTTATGATCCATTCAATCTATAATAAAATTAATTATTTATGCAAAGACTCTGAAATTCACATAAAACAATATCATGAAGTGGTATTACTTACAGAATACATGATTATCCAACAATAAAATGACTTGCTGCATTCACATCTATATATAATTTATCCGTGACATCAGGAAATGGAGAGGAAAAAAATAATGGTAAACAACTAATAAATTAATGCGTGGACCTAGATTGGGTTTTGGTCCATTTTTTAATCTATTTTAGGGTTGTTTAATTTAGGGAACTATTAGATGAAACGCGTTTTAGTTTATATATAATTCCCAAAGAAATTCTGAAGACTGTGCTTCATAAGTTTTCTGGGAGTCATTCTAAAGCCTAATTAATCTTTACTTATAAAG


Gene Sequence:
>Vu_25763(-)
ATGGTAAGAACTCCTTTCTATGACAAAAATGGAGTGAAGAAAGGTGCATGGAGCAGAGAAGAAGATGATAAGTTAAGAGCTTATGTTCACACTTATGGTCACTCTAATTGGCGTCAACTCCCCAAGTTTGCAGGTATATATTATTCTGTCAGATCATGATCATCGATGTTCAGTTTCAGTTTCGTTTTGATTTGTATCATTAATGACTCTTTAACTGTATAGTTAACTGATGATTTATAATGGTAAACATTCTGATGAGGTTTGAACGTTGCTTTTGTATACTTCTGTTGCAGGTTTAGCAAGGTGTGGGAAAAGTTGCAGACTTCGTTGGTTGAATTACTTGAGACCAAATCTAAAACACGGGAACTACACCCCAGAGGAAGAAGAAATAATCATCAGATTACACCAACAATTTGGAAATAGGTATATATATGTCTTTTCAACTTTTAGAATTCATTCAAAACTTCTATTCTGGGTTCCCCAGATCCATGCATATTCCAGATTTTGAGAGAAATTCCAGATTTCTGACAAAAAAAAATCATTCCAATGTTTTCTGCTTTCATTAGATTTCATTACCGAAAACTATCAAACAATCAGATCATGTCTCCATGTTTCTCATACTCTTGTTTGACTCTATCTTTTGTGCTTCTTTCTTCTTGTACATATGATTAACATGAATTTAGGAAGATAAGTGGATATATTTCATAGATTAAAAAGTAATCTTCAAACTTAATGTTATATTTAATGTTAAATAAGTTTAGAACTGGATTCAACTTATATACATGTGATTTAAATTTAAATTTAAAGTAAAGTTTGCACCCTCTAATATAAATCTACCTGAATCCTAGGAATGTGATGAGACTGAAGTGAACCTTAATGTAAACCTGATATATAGAGTTATTGTTGGATGATATGTGATGTTTATAGAATATTAATAAATGGTGTTGACCTGATAGATGGTCCTTGATTGCTGAAAAACTTCCTGGAAGAACAGACAACGAGGTAAAGAACTATTGGCACAGCCACCTGAAGAAGAGCTTGAAGAGAAGTGAAATGACAGCATCTGAGCTGAAGTTGAAGGGAGGTGATAACAAGAGTTTTGAAGGAAATTTAAAGGAGAGTGGTGAATATGAAAATTCTGAAAAGCTAGGAGGCAATAGTGGTGATGATATCTTCCCTCATATTTTAGAAAGTTCATTGCCCATTTCCGCAGAAACACCAGAAGGAGACAACTATACGCTTATCACTGGTGCTGAAGAAGATGGTGTTCCTCCATTGGTATCATACAAAGAATTCACCGGCGATTTTTGGTCTGAGCCATTCCTTCTAGAAGATACTATTCATACTTTTAAAGATGACATTTGCACTGGTAAAGGAATGGCTTTGTTAATTCCAAACTTCGATGCTGCATATTTCTTGTAA