Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25652 LG6 25353054 25354292 PREDICTED: leucine-rich repeat extensin-like protein 4
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   signal transduction
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 25353082 missense_variant p.Phe10Tyr
C/G 25353248 synonymous_variant p.Val65Val
A/T 25353257 synonymous_variant p.Ser68Ser
A/G 25353267 missense_variant p.Asn72Asp
G/T 25353611 synonymous_variant p.Gly186Gly
C/T 25353627 synonymous_variant p.Leu192Leu
C/T 25353812 synonymous_variant p.Thr253Thr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25652.1
MASTSASCSFTISVLFLIFVHLSCFANNLNAKHSHNHRKPQHTENPPLNPRLHMAFLGLQAWKQVIYSDPNNFTANWVGPSVCNYTGVYCAPSVDDPEVRVVAGIDLNFGDIAGFLPDEIGLLSDLALLHLSNNRFCGILPMSLTNLTLLYELDISSNRFVGPFPLVLLSLPMLTYLDLRYNEFEGPLPPQLFNKTFDAIFLNNNRFSSSIPPNLGKNSVSVLVFANNKFGGCLPESIVNFADTLEELVLINTSLSGCLPQQVGFLYKLRVLDVSFNSIVGPIPYSLAGLSHLEQLNLGHNMMSGTVPMGVCELPNLANFTFSYNFFCEEEGICQNLTSKRIVFDDRRNCLPEKPLQRSQKECSAKLEHPVDCSELCCVVGSNVSAGSVAVPPAAIPSAMPVSAPLLAPSHP*


CDS Sequence:
>Vu_25652.1
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Promoter Sequence:
>Vu_25652::LG6:25351054-25353054(+)
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Gene Sequence:
>Vu_25652(+)
ATGGCTTCAACTTCAGCATCTTGTTCCTTTACCATTAGTGTGTTATTCCTCATTTTTGTGCACCTGTCTTGTTTCGCAAACAACCTTAATGCAAAGCACAGTCACAACCATCGCAAGCCTCAACACACTGAAAATCCTCCCTTGAATCCAAGACTTCACATGGCCTTTCTTGGCCTCCAAGCATGGAAGCAAGTCATCTACTCAGACCCAAATAACTTCACTGCCAATTGGGTAGGTCCTTCAGTCTGCAACTACACAGGTGTGTACTGTGCTCCCTCAGTTGATGATCCTGAAGTGAGAGTTGTGGCTGGCATTGACCTTAACTTTGGAGACATAGCAGGGTTCCTACCCGATGAAATAGGCCTTCTGTCAGACCTTGCACTCCTTCACCTTAGTAACAACCGCTTCTGTGGCATTCTGCCAATGTCCTTAACCAACCTCACTCTACTCTATGAGCTTGATATTAGCAGCAACAGGTTTGTTGGTCCCTTTCCTTTGGTTTTGCTTTCCCTTCCTATGCTCACCTACCTTGACCTCCGCTACAATGAATTTGAAGGGCCATTGCCTCCTCAACTATTCAACAAAACCTTTGATGCCATTTTCCTCAACAACAACCGCTTCAGCAGTTCTATACCTCCAAACTTGGGCAAAAACTCAGTTTCTGTCTTGGTCTTTGCCAACAACAAATTTGGAGGGTGTCTTCCAGAGAGCATAGTGAACTTTGCTGACACTTTGGAGGAGCTTGTGCTAATCAACACCAGCTTGTCAGGTTGTTTGCCACAGCAAGTGGGGTTTCTCTACAAACTTAGAGTGCTGGATGTGAGTTTCAACAGCATTGTTGGCCCCATTCCTTATAGCCTTGCAGGGTTGTCTCACTTGGAGCAACTAAACCTGGGACACAACATGATGAGTGGCACTGTCCCTATGGGGGTTTGTGAGTTGCCAAACTTGGCAAACTTCACTTTCTCTTACAATTTCTTCTGTGAGGAAGAGGGCATCTGTCAGAACTTGACATCAAAGAGAATAGTGTTTGATGACAGAAGGAACTGTTTGCCAGAGAAGCCACTGCAGAGGAGCCAAAAGGAATGCAGTGCCAAACTTGAACACCCAGTTGATTGCTCTGAGCTTTGCTGTGTTGTTGGGAGCAATGTCTCTGCTGGTTCAGTGGCTGTTCCACCTGCTGCTATTCCCTCAGCAATGCCTGTATCTGCTCCTCTTCTTGCACCAAGCCACCCTTAA