Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25626 LG6 24859549 24862857 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 24859579 missense_variant p.Ala118Thr
C/G 24859797 missense_variant p.Cys45Ser
T/G 24859961 intron_variant
A/C 24860153 intron_variant
G/T 24860158 intron_variant
G/C 24860159 intron_variant
G/A 24860291 intron_variant
C/T 24860402 intron_variant
C/T 24860408 intron_variant
A/G 24860409 intron_variant
A/C 24860491 intron_variant
A/C 24860629 intron_variant
C/A 24860642 intron_variant
C/T 24860737 intron_variant
C/T 24860742 intron_variant
G/A 24860836 intron_variant
A/G 24860902 intron_variant
T/G 24861424 intron_variant
C/T 24861631 intron_variant
A/G 24861970 intron_variant
G/T 24862008 intron_variant
T/A 24862258 intron_variant
G/A 24862267 intron_variant
C/A 24862488 intron_variant
C/A 24862489 intron_variant
G/A 24862537 intron_variant
A/G 24862554 intron_variant
G/A 24862557 intron_variant
A/T 24862653 intron_variant
T/A 24862707 intron_variant
C/A 24862728 intron_variant
T/G 24862797 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25626.1
MTVKTSRVLARLTQYAYTLRVTEKCDIYSFGVVILELVTGRPPIDAEYGENGLVKWVSSALEHEGVDHVVDPTLDYRFREEISKVLSVGLQCTSSNPITRPTMRKVVKMLREVTAVPKRTSVNDGNE*


CDS Sequence:
>Vu_25626.1
ATGACTGTGAAGACTTCTCGTGTTCTCGCACGGTTAACACAATACGCATACACTCTGAGGGTGACCGAGAAGTGTGACATATACAGTTTTGGAGTGGTGATTTTGGAGTTGGTAACTGGGAGACCCCCCATTGATGCAGAGTATGGTGAAAATGGTTTGGTGAAATGGGTTTCCTCTGCATTGGAACATGAAGGAGTGGATCATGTAGTTGATCCTACGTTGGACTACAGATTCAGGGAAGAAATAAGCAAGGTGTTGAGTGTAGGTCTGCAGTGCACCAGCTCCAACCCAATAACTCGCCCCACAATGAGAAAAGTGGTTAAAATGCTTCGTGAGGTTACAGCAGTGCCCAAGCGCACAAGTGTAAACGATGGAAATGAATGA


Promoter Sequence:
>Vu_25626::LG6:24862857-24864857(-)
AATGTATGTATTGTTGTTATGAATTAAAGTATATAAGCTTACCCTTTCGTTTTTCCTTGTGTTGTCTACTGTCTATGTACGTTCGTCCTGTCGTGCAATGATCATCCGTGTGGATGTGAGTAGAAGGAGAGGCCACTCTGGAAGACGTTATTGAAGAAGAAAATCTGGTCAAGGTGGAAGTAAAAGTCGAGCCTTAGGACGCTCGTTATGATAGGATTGTAAATGTTAGACTTCATTTTGACGTTCGGTTAAATATTTTGTAAAACCGTTCGTTCTAGACTTTCCTTGTTTCCGTTTCGTGAACGGTATTTTCTGTATATAAGTCGTTCGGCTTTGGAACCTCGTTTTATTAATATAAAGACTGCATTGATTTACTGTTAATTGTGATTGATTCTGATTTATGGTAATTACTGTATTTTGGGATGTTACATTAATGATTTAAAGATATTTGTAACTATAAAATTTATAATATAAGTGAATTATTTATCAACTATGTTTTAATGATGGATTCATAAATATTGAAATACTTTAATTTATATTGAAATCATAAATGAAAAAAAAATCACAATTACTTCATTGATTAAAACTTTCAATTGAATCAACTAAAAATTCTTTATAAACAAATAATTAGATTTAAAATAACAAAATACTTTAAAGTCAACAAATACTTAATAGTTTAAATGATATTTCTATATTTTACGACAAATTAGTTTATTATGATTAAACATACTTTATTATCTTTTAAGTTGTACAAGATCTTTTACTCATAATTGATTATTATAAGTTATAATCCATTATTTTTAATAATATATTAGGTTGTTGTTATTGAGTTTTTAACTTTAACGAAAAAGAAATTTAATTAAAATATTTGATTAATCTTTTATATAATTAATTATCTCAAACTTGGTGGAGAAAAAAAGTTTGTGTTTAATCTTTTAACTACACGAATAATTGATTAGATTGTTTAAATTAGGTTTACAGAATTAACAAAAGAACGATATAATCAGTTTTTTGTTAATAATCGATATTAATAAGTAAATAATCAATTTTTTTTATAAATTTGATTTTTTATGTTTTCTTAAGAAATTACTTACATTGTTTCGAACACATTTTATACGTTGCTTCAGTAAATGCTTTTATACATAATAATATGAAGTGTAGTTGTAATTAAATTTTATCGAGACGATAAAATCAATATCTATAAAGGCGGGATGTAATTAGATGGAAATTTAAAAATAAAAGAATCAATACAGAATCAATTTTATCTTTCTTTACATCCTTATATTTTATTTTTCAATCTTTATATATTTCTTCCTTTAATTTTTTTGCACTTAAATATTTCAAATGGATAGATTACAATTTTTTTTTCAAGATCTATTAATATTTTCAAAAGATTTTAGAACAAAAATTATTTCTTTAGAAGTAATTTGCTTTTAAAAAAATGGAAATTGTATCGTGAATCACACACAAGATATAGTGAACAGGAACTTAAACCTTCAGAAAATCTATCTTAAATTTAACATCTAAAAAATTGGTTGGAAACTTCACTGAAACATCTGACAAGCTCTATTGAGAATTGAAAACTTAAAATTAAAGGTTCGTATAGTATAACAAACTAAATTTATTTTAAAATTATAGGGAATAAAAAATAAAATCAAAATATTGATAAGAGTTAAATATATTTTTATTAATATTAAATATAAAATTGAAATTTACTTTTATCTCAAAATTTGATATATTAAACTTAAAAATAAAAAAAAAAATATAATTTTTTTAATCTAATAACATTAATTTTTTAGATTTTTTTAACGGTATTTTAATCTGATATTAAATTAAAAAGACTTTGTACATTCATTTATAAACAAGTTTAAATTTCCCATCTTATAACTAAAAAGACACTCACCCCTCTTTATAATATAATGTAACAGCTGGTGAGTTATGGGCATGATCAGATTTTGGAGTATGAAGCAGACATATGCACCAAAAACGTGAAATGCAGC


Gene Sequence:
>Vu_25626(-)
ATGACTGTGAAGACTTCTCGTGTTCTCGCACGGTTAACACGTACGTCTCTTTGATCCATTATCAAATCCAACATGGGACCCACCGCTGTCCCTTACTGTGCTTCTGTGTGTTACTTGTAGCAGTGTTTCGTCATGCAAATTCAGAGAAAAAACCGAAACAAACGACCACTCCGAACACAACATATTTCTATCTTCGGCAGAATGTTCGTGTTTTTTCTTTTCTTCCTCTTCCTTCTCTCTCCTCCGCGATTTTCTCTCTCTCTAACCCAAGACGGCCTTTTCCTCCTCGAGGCGCGCAGCCGCTTCTCCGACCCCCAGAACTCACTCTCCTCCTGGAACCCCGCCGCCTCCACCCCCTGCCAGTGGAGGGGCGTCACCTGCAACAATCATTCCGCCGCCGTCATCGCCATCGATCTCTCTTACTCCTTCCTCTCCGGCCCCTTCCCCGCCGCCCTCTGCCGCCTCCCCTCCCTCTCTTCCCTCAACCTCTCTTACAACCTCATCAACTCCACCCTCTCCGCCGTCTCTCTCTGCCGCTCCCTCCTCCATCTCGACCTCTCCCAAAACGCCCTTGTGGGTCCCATCGACTCCCTCGCCGCACTCACCTCCCTCCGCTACCTCGACCTCTCCGGCAACAACCTCTCCGGAGAAATTCCCGAGACCCTCGCCGCCCTACCCCACCTCGAAACGCTCAACCTCGTTAGCAATCTTCTCACAGGTACCATCCCCGCTTCACTCGGTAACCTTACTTCGCTGAAACGCCTTCAACTTGCTTACAACTTGTTCAAGCCGGGTCCCATGCCGAGTGAACTCGGGAAACTCGGAAACCTTGAAACGCTTTTTCTCGCTCTGTGCAACCTTCAAGGTCCCATTCCAGACACCTTCAGTAATCTCGTTAACTTGACAAGCCTCGACTTGTCTCAGAACAGCATCACCGGTAACATTCCGCAATGGTTCACGCGTTTAACGCGCGTGACCCAAATTGAGCTTTACCAAAACTCGCTCTCTGGGGAGCTACCCAGAGGAATGTCGAAGATGACGAGTTTGAAACTATTTGACGCGTCCAGGAACGAGTTGACTGGGACGATTCCGACCGAATTGTGTGAGTTGCCACTCCAGTCACTGAATTTATTTGAGAACAAACTCGAAGGGTTTTTGCCAGGGGCCATTGCGCGTTCCCCGAACCTCTCTGAACTCAAACTTTTCAGTAACAGACTTATTGGAACGTTGCCGAGTGATTTGGGCAGTAACTCACCGTTGAACCATATTGACGTTTCGTATAACCGGTTTTACGGTGAAATTCCGGCGAACATTTGCCGGCGGGGCCAGCTTGAGCAGCTAATCTTGATATACAATTCGTTTTCGGGTGAAATTCCCGAGAGTCTCGGGAAATGCAAGAGTTTAATGAGGGTTCGGTTAAGAAACAATAATCTATCGGGAAGTGTTCCTGAAGGGGTTTGGAGTTTGCCCCGTTTGCATTTGCTTGAGCTTTTGGAAAATCACTTTTCTGGGCACATTTCTAAGGCGATTTCTGGCTCTTCCAGCTTGTCAAATTTGTTGCTTTCAAATAACCGGTTTTCTGGGTCGATTCCTGGGGAAATCGGGTTATTGGACAATCTTGTGGAGTTTGCTGCTAGTAATAATAATCTCTCGGGTCAGATTCCAGGGAGTATGGTGAAGTTGAAGCAGTTGGTTAATCTCGACCTTAGTTCTAATAATCTTTCTGGTGATCTTAATTTTGGTGGAATTGGTTACTTGAGTAAGGTCACTGACCTTAATCTGTCACATAATAGGTTGGATGGAAATGTTCCAAGTGAATTAGGAAGCTTTCCTGTGCTTAATTATCTTGATCTTTCTTGGAACAATTTCTCGGGGGAGATCCCATTGCAGTTGCAAAATTTGAGACTATCTGAGCTGAATTTGTCTTACAACCAGCTTTCTGGGGACATTCCTCCTCTTTATGCCAATGCCAAGTACAAAACGAGTTTTATAGGGAATCCTGGTCTCTGTAGTCATCTCCCCGGGCTTTGTAATAGTTATAGTAGGAATAAGAACTGGAGGCACACGTGGATTTTATGGTCCATTTTTGTGCTTGCTGGAGTTGTGTTCATTATTGGAGTGGCTTGGTTTTACTTGAGGTACAGGAAGGTGAAGAAATTGAAGAAAAGGTTATGCACTTCGAGTTGGAAGTCGTTTCACAAGCTGCAGTTTAGTGGGTTAGAGGTTGCTAAGTTGCTGAATGAGGCCAATGTGATAGGAAAGGGAGCATCCGGGAAGGTGTACAAGGTGGTGCTCAGCAACGGTGAGGTGGTGGCAGTGAAAAAAATGAGTGTAGGAGCCCCAAAGAAAGTGGATGAAAATGGTGGTTCCAGAAAAGATGAATTTGATGCTGAAGTAGAAGCACTGGGGAGGATCAGGCACAAGAATATTGTGAGGTTGTGGTGTTGCTGCAACAGTGGGAACGACAAGCTTTTGGTTTTTGAATACATGCCAAATGGGAGCTTGGGTGATTTGTTACAGGGTAGCAAGAAGAGCTTGTTGGATTGGCCTAAAAGGTGTAAAATTGCTGTTGATGCTGCTGAGGGGCTTTCTTATTTGCATCATGATTGTGTCCCACCGATTGTCCACAGGGATGTGAAATCTAACAATATATTGGTTGATGAGGATTTTGCTGCAAAAGTTGCAGATTTTGGTGTTGCCAAAATGGTGACAAAAGCCGGCCAAGGGACAGAATCAATGTCTGTTATTGCAGGATCATACGGCTACATTGCACCAGGTTTGTGAAATTTAGTTCAGAAACACATTTTAAAAAATATGCACTTTCTACTTGAATAATACTTCGTTTTGCATCTGAATGTAGTAATATTAACCATTATCAGTTAAGACCTTTAAAGCTAGCCATAAATGTTACAATTTGTCTTCCTTTGAATTTAGTTGAACATGTGGTTACTTCATTGATGTGCAGAATACGCATACACTCTGAGGGTGACCGAGAAGTGTGACATATACAGTTTTGGAGTGGTGATTTTGGAGTTGGTAACTGGGAGACCCCCCATTGATGCAGAGTATGGTGAAAATGGTTTGGTGAAATGGGTTTCCTCTGCATTGGAACATGAAGGAGTGGATCATGTAGTTGATCCTACGTTGGACTACAGATTCAGGGAAGAAATAAGCAAGGTGTTGAGTGTAGGTCTGCAGTGCACCAGCTCCAACCCAATAACTCGCCCCACAATGAGAAAAGTGGTTAAAATGCTTCGTGAGGTTACAGCAGTGCCCAAGCGCACAAGTGTAAACGATGGAAATGAATGA