Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25596 LG6 24222771 24226429 PREDICTED: transcription factor VOZ1
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 24222859 3_prime_UTR_variant
A/T 24223025 3_prime_UTR_variant
C/A 24223180 missense_variant p.Lys473Asn
T/C 24223432 synonymous_variant p.Gln389Gln
T/C 24223796 intron_variant
T/A 24223830 intron_variant
G/T 24224186 stop_gained p.Cys264*
C/A 24224194 stop_gained p.Glu262*
C/A 24224353 stop_gained p.Glu209*
C/G 24224539 missense_variant p.Val147Leu
T/C 24224707 intron_variant
A/C 24224789 intron_variant
T/C 24224790 intron_variant
T/A 24224814 intron_variant
A/C 24225182 intron_variant
T/C 24225288 intron_variant
T/C 24225677 intron_variant
G/A 24225707 synonymous_variant p.Thr71Thr
A/T 24225839 missense_variant p.Asp27Glu
G/A 24226080 intron_variant
T/A 24226095 intron_variant
G/C 24226186 intron_variant
C/T 24226203 intron_variant
T/G 24226414 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25596.1
MMRESSKGKFGSSSIQSMKEKEKHLVDKIQGIFSNLQCARKEGRGSDIVIFEEQMHQLLREWKAELESPATSLADGSFDSFTSELAQLLQVIEEKDDATSPLTKPGPLKTELQTSNINDNNFQFFQEKHFDDNQPLGHNFEGSASTVYNNAFNNSDMEQLDFHPFSLNQDMNHNQVGHNSDLIGQVDLYQDLGHNTEIKHSESNQFSIEGFDCSQFFGAEDTVHHGENIIPNILPNICPPPSAFLAPKCALWDCFRPAQGVEWCRNYCSSCHELLANNEGLPGMTPILRPGGIGVKDGPLFAAVLAKTQGKEVGIPSCEGAASTKSPWNAPEFFDLSFLEGEAIREWLFFDKPRRAFESGNRKQRSLPDYSGRGWHESRKQVMKEHGGQKRSYYMDPQPLSYLEWHLYEYEINNHDGCALYRLELKLVEKKKSPKGKVTKESLNDLQNKMGQLTAAVLSSDDGIPIKGKTNAKSENDGSPEN*


CDS Sequence:
>Vu_25596.1
ATGATGAGAGAAAGTTCCAAGGGCAAGTTTGGATCCTCTTCTATTCAATCCATGAAGGAGAAGGAAAAACACCTGGTGGATAAAATTCAAGGGATTTTCAGCAATCTTCAGTGTGCAAGAAAAGAGGGCAGGGGTAGTGACATTGTGATCTTTGAGGAGCAGATGCATCAGCTTCTCCGCGAGTGGAAGGCGGAACTGGAGTCTCCAGCCACCTCCTTAGCTGATGGAAGCTTTGATTCGTTTACCAGTGAACTTGCCCAACTGTTGCAAGTGATTGAGGAGAAAGATGATGCAACTAGTCCATTAACAAAACCTGGGCCGTTGAAGACTGAGCTCCAAACAAGTAACATTAATGACAACAATTTTCAGTTTTTTCAGGAGAAACATTTTGATGATAACCAACCTCTAGGTCATAATTTCGAAGGCTCTGCTTCAACTGTGTACAACAATGCTTTTAATAACTCAGATATGGAACAGTTGGATTTTCATCCATTCAGTTTAAATCAAGATATGAATCACAACCAAGTTGGTCACAACTCTGATTTGATTGGTCAGGTGGATTTATATCAGGACCTCGGGCATAACACAGAAATTAAACACTCAGAATCAAATCAATTTAGCATAGAAGGTTTTGATTGTAGCCAATTCTTTGGAGCTGAGGATACTGTGCATCATGGAGAAAACATTATACCTAACATTCTTCCAAATATCTGCCCTCCACCATCTGCTTTCTTAGCTCCAAAATGTGCCCTGTGGGACTGTTTCAGACCCGCTCAAGGGGTAGAATGGTGCAGGAACTACTGTAGCAGTTGTCATGAGCTGTTGGCAAATAATGAAGGTCTTCCTGGCATGACTCCAATTTTACGACCAGGGGGCATTGGTGTAAAAGATGGTCCTTTGTTTGCTGCTGTTCTTGCGAAGACCCAGGGAAAGGAAGTGGGCATCCCCAGTTGTGAAGGCGCCGCATCAACTAAATCTCCCTGGAATGCTCCAGAGTTCTTTGATCTTTCTTTTCTTGAGGGTGAAGCTATTAGGGAGTGGCTATTCTTTGACAAGCCTAGAAGGGCATTTGAAAGTGGAAACAGAAAACAAAGATCACTTCCAGATTACAGCGGACGCGGTTGGCATGAGTCAAGGAAGCAGGTGATGAAAGAACATGGAGGACAAAAGAGGTCCTATTACATGGACCCCCAGCCTCTTAGTTATCTGGAGTGGCATTTGTACGAGTATGAGATCAACAACCACGATGGTTGTGCATTATACAGACTAGAATTAAAGCTTGTTGAGAAAAAGAAAAGTCCTAAAGGAAAAGTGACCAAGGAATCTCTTAATGATTTACAGAACAAGATGGGACAGCTTACTGCTGCTGTTCTATCATCTGATGATGGAATACCCATCAAGGGAAAAACAAATGCCAAGTCTGAGAATGATGGATCTCCAGAAAATTAA


Promoter Sequence:
>Vu_25596::LG6:24226429-24228429(-)
ATATATTATTAATAAATATCATTTATATTATTTTTATATTTCAATAATTTTATTTTATATCAATTAAAATAATTTTTATCCATTATATTTATTAAATTTTTTACAAAAATTTACAAACTTTATTTCTAAATTTATTATGAATCATTTTTTATTTTTTGAGTAATAATATCTTAACATAAATTATATAAAGATAAAATAATTAAAAAAGTATAAATTTTTATATTATTTATAAAATAAAAATAAAAAATAAATAAAAATAATGAAATACTTAGACGTGTCAAAAAAATCTTTTATTAATATCTTTTAAAGAAAAGTAAACAGAAAAACTTTTCTTCGTTTTCATTATTTTTATACGTTATTTAAGGAAAAGTATTCATTATTATTTATAAATGTGATTTACAACCTTTATACATAACACTCAGCTTTTTCTGTATGTAATGTCAATCAAGTCTGATCCACCCACTTCTGCAGGTTTTATAAACAGCAGAAACCGTACAAACGAAACTACCCTTCCAAAGCTAACAACATAACACAAAGGATAAAACCCTAATGACAGAATGCAACGTATAAGCAACATGTTATTTATTTTGCAAATATTTGGAGACTAGTTATAGCTCTTATAATTAAAGAATACATAAAGTTTTTTTAATTAATTTCTAATAATGTTTACTTTTTATCGAATGTATATGTTTTCTAGTTCATTTGATAAAATTACATTTTAAATTAAAATTATTTTCTTCTTTAAGTATTAAATATATTCTTTTATTTACAGCTTATTACTAATCTTATTTTTTCAATGAAATTATGTTACTATAATGTTTTATATTTTGTGTATCAAAATTAAATCTAATATATTTTATTTTTGCCTTTGTCTAAACATTATGTATGATAGATATACAATGATACATTTAAATAGCTTTTACTTTGCTCTTTTAGAAGTAAAAACTTAAAATTTAAGATTAAAATAAATAATCTAATCAAACATATTGAAATGACAAAAATATTATTCTCAACAAAAATAAATTGAACCACAAAAATTCTCTTAAAAGTATGATGAATATTTAAAGGACTAGCTTAATTGTAGTTTTTTTTTTGAATTACAATAGAGCAGTCATCCCATCTCTGGAAAGTTTTTTCCTACACTTCCAAAATTCTAATATTATCTCTTCCTTTAATAATATCGAAATTCGAAAACTGGTCAAGAAACTTACTTAAACAGTTTTGTAGATAATTTTTTTCATTTTAATTTTTTAATTTACTTTTTTATTTAATAATAGTAAAAATGAAAAATAACAATAAAATATATTAAAAAAAGTTAAAAAATTAATATTTTAAAATTGAAAACAAATTTGAAAAAATTATTTGTTTAAATTTAATAATAGAAAAAATATTTTTCTTACCTAATAAATATTTAATAAATTTATTATTTTTAAATAATTTTGTATAAAATAATATTTTTATTAATAATAATAATATTTTTTGATTACTAAATTAAAATAAATAATTTTTTTATTTAAAATAATAAATTTTGTTTTTAATTTTTTAATATGTTTTATTATTATTAATGAATAAAAAACATAAAAATGGACTAAAAAAAGTAAAAAAAAGAACATCTTAATCGTTTTTAAAAACTGGTTAAAGAATTTTTTAGTTGACTTTTCGAAAGTTGATAAAAAATTCTTTTTTTAAAAATCTTTCTTAATCAATTTTTAAAAATCGGTTAAATAAGTTTTTTAATTGGTTTTTTAAAATCTGAAATTATTAATTTAAAAGATAATATTAAAATTTTAGAGATAGAGAATAAATTTTACAGTAAAGACTCATTTACTGTGACAAAACAAGTTAAAGTATGATAAGGAATAATTAGAAAAGGCACAGACCAAAATTTCTTGCGTCTAATTGAAGTTTCCAAGGTGCAAAAGATCACCACATCATTATTATTATTATTTATTATTAATAATAAATAGAAAAATAAAATAAAAATCTGCGAATTCATCGTA


Gene Sequence:
>Vu_25596(-)
GGAATTGAGGGCTTCAATTTCCACGATTGGCTTCTGTGAGTCTCTCTCACTCGTCGTGAGCTGATCCCAGTGGAGCCGTCATCTACAGTCATCTTTCCCCTTTCTACGTCGTCGTTTTGCACCCCATTGCTCCCTTCTCTCCAATTCAAGATCAAAGGTAAAATACCCATCGAGCTAATTTCGGTTGAACTAGTTTTAAGTTCAACGTAGATGTAGAAAGCCCCAAGCTTTGTCATTTGGGTGCACCGTCAATGTTGATTTTTTTGTGTCACTTTTTTTTTTTCTGAAGAGTTTTATTGTGGATTGTGGTTTGATCAGTGACATGCATAAAACTAGATTCTGTTATGTACATGTTTGTGAAAAACGTTTGTCTAAGTTAGCCCAATGCTTACGAACTGAATCAGCCTCGGTTGCATGTTACATTTTTAAGATTTTTCTGATGTGATGTTATTTAATTGTGCTAATTAGTGCCCTACATTGGTTATTGTGTGATAATTGTTCTAGGAAGGTATGATGAGAGAAAGTTCCAAGGGCAAGTTTGGATCCTCTTCTATTCAATCCATGAAGGAGAAGGAAAAACACCTGGTGGATAAAATTCAAGGGATTTTCAGCAATCTTCAGTGTGCAAGAAAAGAGGGCAGGGGTAGTGACATTGTGATCTTTGAGGAGCAGATGCATCAGCTTCTCCGCGAGTGGAAGGCGGAACTGGAGTCTCCAGCCACCTCCTTAGCTGTATGTATTTAGGTTTTCGGACATGGCTAATTATTATGTCTGTGCTTTCTTTGTTCATCTCAAAGAAGAGTTGACGGTTGTTGTAATATGTTCTGGCAATAACATTCTGTAGGATGGAAGCTTTGATTCGTTTACCAGTGAACTTGCCCAACTGTTGCAAGTGATTGAGGAGAAAGATGATGCAACTAGTCCATTAACAAAACCTGGGCCGTTGAAGACTGAGCTCCAAACAAGTAACATTAATGACAACAATTTTCAGTTTTTTCAGGAGGTAAGTTTCTTTAACTAGTGCAGGACTCATTTTTGTATTTGTGGTTTGTTTCCTTACCCTATTCACTAAACTTTACCAGCACTATTTTTCTTTATTATACTTGGCTGTTTGCTTTTGTTATATTTGAAGATGGAAATAATGTGTTTTGTTAATCCATACAAGTATTTTCTAAATGGTATCAATTCAACCATATGGAAAAATGTGCCAAGGTCAGGTGAAGCTTGTGTTTGCTGACTGAATTTTATAGGTGTAAAAGTAGAAGGATTATATGTTTTAACTGGCGAATTTGGTTATATCATGCCAACACAGGACTTTTGGTTACATCAAAAGTGTTCACTTCAAATAGTTCGAGTGCTTTTCTTGGTACTAGATAGTTAACCAAAAAAAATATAAAATCAAGGAGAACTTTTGAAGTTATGAAACCCATTGGTTAAGATATTTTCCCAACTTTGTGTATATAGAAATTGAACACGAGTCCAACGCCATAAGTGCAAGGAACATCAAGTTGTTGAAAGTTTTAGTCAGAACATGCAGCCTCGTTTACATTTTAACTTCTAGGTTGCTTCCAACTTGTCAAACTTCATTGGTTGAGGGAGAGATACAGAAAAGTGAACCCTTATAAAATACATCTAGCTAATAATAATTAACAACTTAATTGGTTAATGCTTGAGTGGTTTGTTGTTCCTAAAACAAATTGCAATTTTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAACTAATGCACATGTATAAAGAAATACATGCATGAACCAAAAGTTCTATTTTTTGAATAATATTTCTGTGCTTTAATAATTGGTACTTGGTATCTTGCAGAAACATTTTGATGATAACCAACCTCTAGGTCATAATTTCGAAGGCTCTGCTTCAACTGTGTACAACAATGCTTTTAATAACTCAGATATGGAACAGTTGGATTTTCATCCATTCAGTTTAAATCAAGATATGAATCACAACCAAGTTGGTCACAACTCTGATTTGATTGGTCAGGTGGATTTATATCAGGACCTCGGGCATAACACAGAAATTAAACACTCAGAATCAAATCAATTTAGCATAGAAGGTTTTGATTGTAGCCAATTCTTTGGAGCTGAGGATACTGTGCATCATGGAGAAAACATTATACCTAACATTCTTCCAAATATCTGCCCTCCACCATCTGCTTTCTTAGCTCCAAAATGTGCCCTGTGGGACTGTTTCAGACCCGCTCAAGGGGTAGAATGGTGCAGGAACTACTGTAGCAGTTGTCATGAGCTGTTGGCAAATAATGAAGGTCTTCCTGGCATGACTCCAATTTTACGACCAGGGGGCATTGGTGTAAAAGATGGTCCTTTGTTTGCTGCTGTTCTTGCGAAGACCCAGGGAAAGGAAGTGGGCATCCCCAGTTGTGAAGGCGCCGCATCAACTAAATCTCCCTGGAATGCTCCAGGTGAGTACACCAAATTTATTACCTCTCTGTTGTATATCACTGCTTAATTTTAGGATAAAGAATACACACATTGGTCATGTGAAAATCTTTGACATTGTTATCCAATCAGAGACTTTGATGTATTGAAAGTTTGTTGATTGTATAATAACTACCATAAAATTATGCTAAGAATAATTTGGCTGATAATATAGAACTTTTTACATTGACTGTGTGTATGAATTAAATTCTTAATTATGTTGAATTGTTCATTAAAGCTTCTCAAATTCTACCTTTAGGCTTGTCTAATGAATGGGTTATAGAAGAAATTGTTACTGTCCATGTTTTATTGTTTTTCATCTACATTGTTTAGGTTTGAAATGTTACCTTTTCTCTGGTGCAGAGTTCTTTGATCTTTCTTTTCTTGAGGGTGAAGCTATTAGGGAGTGGCTATTCTTTGACAAGCCTAGAAGGGCATTTGAAAGTGGAAACAGAAAACAAAGATCACTTCCAGATTACAGCGGACGCGGTTGGCATGAGTCAAGGAAGCAGGTGATGAAAGAACATGGAGGACAAAAGAGGTCCTATTACATGGACCCCCAGCCTCTTAGTTATCTGGAGTGGCATTTGTACGAGTATGAGATCAACAACCACGATGGTTGTGCATTATACAGACTAGAATTAAAGCTTGTTGAGAAAAAGAAAAGTCCTAAAGGAAAAGTGACCAAGGAATCTCTTAATGATTTACAGAACAAGATGGGACAGCTTACTGCTGCTGTTCTATCATCTGATGATGGAATACCCATCAAGGGAAAAACAAATGCCAAGTCTGAGAATGATGGATCTCCAGAAAATTAAATCAATACTCAATCTGGTGATTTTACCATATGACTGACAAACTTGTACATATTTGAGGATATATCATAGCATGTGAAAGTTTCTTACTTTCCTTCAACAAGGTAAAAGGCAAATGGAATTCTCTTTTGGTAGAATGAGCTCACACTCTTGTGCTGAATTTGTCGTTAATTATACTTTTGATATTGGCGTTATTTGAAGTCTACTCATAAGAAATTCGTTATGTGCTTCATAGATTAGAAGTTAGATCTATGTTGTTAGGAAGACTCTGCATACTTTCTGATGGGTCAGTGTAAGACTCTGCAAATTTCTGACATATTCATAAACTAATTAGCATTTATTTGGTTGTAAATGTTCTCTAATTTATGGATTATTTTCAACG