Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25582 LG6 23922698 23924938 PREDICTED: basic leucine zipper 61 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 23922812 missense_variant p.Thr309Ser
T/C 23922813 synonymous_variant p.Pro308Pro
A/G 23922890 intron_variant
T/A,G 23922892 intron_variant
T/G 23922893 intron_variant
C/A 23923077 intron_variant
A/G 23923393 intron_variant
T/C 23923472 intron_variant
A/G 23923768 splice_region_variant&synonymous_variant p.Ser249Ser
A/T 23923813 intron_variant
A/C 23924218 intron_variant
T/C 23924220 intron_variant
C/T 23924222 intron_variant
A/G 23924254 intron_variant
T/C 23924416 missense_variant p.Lys175Glu
T/A 23924430 missense_variant p.Glu170Val
G/T 23924453 missense_variant p.Asn162Lys
G/T 23924493 missense_variant p.Ser149Tyr
C/A 23924504 synonymous_variant p.Pro145Pro
T/G 23924638 missense_variant p.Met101Leu
G/A 23924888 synonymous_variant p.Asp17Asp
G/A 23924904 missense_variant p.Thr12Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25582.1
MAQLPPKVPNMTPNWPDFSSPHQKMPSLKTMAPNVSNQNPSWVDEFLDFSAARRGAHRRSVSDSVAFLEAPMLDHHCKSRGSDGGGDNESEFERFDDEQFMSMFSDEASGNNNSNNNDNDNNNNINYYHSNNNTMMALTVSCSNPSTPSDHNSINDEKEMMNKEKEEEQEKKQVKNESDEDESQCKQEITQNPDDCNNSNANAATCSSEKITDPKRVKRILANRQSAQRSRVRKLQYISELERSVTSLQAEVSVLSPRVAFLDHQRLLLNVDNSALKQRIAALAQDKIFKDAHQEALKREIERLRQVYHQQNIKKMDNAAGSTSQSPLPSPKPRCDTLTEKEQLINV*


CDS Sequence:
>Vu_25582.1
ATGGCTCAATTGCCACCAAAAGTTCCAAACATGACACCCAATTGGCCAGACTTTTCTTCTCCTCACCAAAAGATGCCTTCCCTCAAAACCATGGCACCAAACGTCTCAAACCAAAACCCTTCATGGGTGGATGAGTTTCTTGACTTCTCAGCCGCCAGACGCGGTGCTCACCGCCGCTCGGTGAGTGACTCCGTCGCCTTCCTGGAGGCACCAATGCTGGATCATCACTGCAAAAGCCGCGGGAGTGATGGTGGTGGTGACAATGAGAGCGAGTTCGAGAGGTTTGATGACGAACAATTCATGTCCATGTTCAGTGATGAGGCTTCAGGGAATAATAATAGTAATAATAATGACAATGATAATAATAATAATATCAACTACTACCATAGTAATAATAACACCATGATGGCACTCACGGTTTCCTGCTCCAACCCGTCTACACCCTCTGATCACAACAGCATCAACGATGAGAAGGAGATGATGAACAAGGAAAAGGAGGAGGAGCAAGAGAAGAAGCAAGTGAAGAATGAGTCAGATGAGGATGAAAGCCAATGCAAGCAAGAAATCACACAAAACCCCGATGATTGTAATAATAGTAACGCAAATGCAGCAACTTGTTCCAGTGAGAAAATCACAGACCCCAAGAGGGTCAAAAGAATCTTGGCAAATAGACAATCGGCACAGAGATCAAGAGTGAGGAAGCTGCAATACATTTCTGAGCTTGAACGAAGTGTGACTTCATTACAGGCTGAAGTTTCTGTATTGTCTCCGCGAGTTGCATTTTTGGATCATCAACGTTTGCTTCTAAATGTTGACAACAGTGCTTTGAAGCAAAGAATCGCCGCGCTGGCCCAAGACAAGATCTTCAAAGATGCACATCAAGAAGCACTGAAGAGGGAGATAGAGAGACTGAGGCAAGTGTATCACCAACAAAACATAAAGAAGATGGACAATGCTGCAGGATCAACATCCCAATCACCATTACCATCTCCAAAACCACGATGTGACACACTCACTGAAAAGGAACAACTTATCAATGTCTGA


Promoter Sequence:
>Vu_25582::LG6:23924938-23926938(-)
ATATTGTTTTATGTTTTATGTTTCATGTTTACTTTACAAATACAAGTTCTTATATTTGAATAATACAAGTGATGTTATATTGCTAAACTCAATCAATGATTGGATGATTCTGGGATGCATATTATGACGGTCTGTCTGTGTTTTGAAAATGTTATGCAGGTCTGTCTGTGTTGAACTTCTTATGCAGGTTTGTGTAGTTGGACAATAAATACAAATTTAACTTAATTTTGTTTAGTCCTTACCATCGACCTTTTTCTTCGCTAATTACAGACGGCCTTTGACCTTCAGTAATTACCAATGGCCTTTACCTTTGGTAATTACCAATGGTCATATCCTTCGATAATTAGCGACGGTAATATCTTTCGGTAATTACCAAAGGAAAAGACTGTCGGTAATTACTAAAAATCAAAGACCGTTGATAATAATTAGCGACAAAAGGTTTATTGACAGATATTTGGTCGTCGCTAATCCATCGGTAATACATTACCGACGGATTTTGGTTGTTTCCGATGGATTATGACAGTAAATAATGTCCTTCTTTTTTGTAGTTTGTATATTTAAAATAAATTTAATGTATGCAAACTGAAAATCAATTCACATTTACTAATATAAATAAAAAAACAAAAAAAATGTTTTAGTTTAAACAATTTACTTTGTTTAATTATCAAAATTACATTGAAAACAAATACTTAAATACATTTAATCTAAGAACACCTATTATGCATAACTTCATAATATGCTGATAATTTGTGTTTAATTAATAAGATATCCTATGTATTCGTAATTCTATTTGATTTTGTTACTATCATCGTCAAAAACAATATTTGTGATAAGTAATATAATTGCATAATTAGGATTTAAAATGCAAAGCAATGGATAAAATAAAAGAAACCAGTATAAATCAATTTACATGCTCACCTACCAACCCATGTGATTTAAGCACGTGGTCATTGTTCATAGATAAAGATAAAAACCCCAACCCATATGATTTCACCAATCACTAACCACCCAAAATTATCCCATTAACTCTTTTAAACTTTTCCCCAACATCAGGAACCATCCATTCAAACCAATTACCTAATTTCGATTTCATCTTAAATTTGTTTAGCCCTATTTCTTCCACTTCAACCTTATTTAAACATGATAGTTACGCGTTTGCCTCTAACTCCCACCATTCTAATTAATTACCATGCCTAATTATTGCAAGAAAAAAAAAACTTAACCCAACAGTTTAATTAGTTAAACGAATAGCCCTAGAAGGGTATACCTAATTAACTAAATACTGCATGAGAAGAAAAGGAAATTTAATAGACGGAGGTGATGGAATGGTTAAAATTAGAGATGGTAATGTAATATTAATATGGTAATAATAAGAAGAAGAGAGAAAGGTAAAAATATATAAAAATGATGAGACTATTATTATAAGGGTACCCTACAAAAGGGACGGTCACAAGGGCACGTGGTGGCTGATTCCCACTGGTTATTTATAATTAAACCAGTGGCGACTTTCCAGTAATGCCGTTGAGTTGAGGAGACCCAACCCCTTTCTCCTCCCAGCTGTTCATAGCTGTCCAATCTCTCTCTCATCCATGTGACCCCACTGCACAACACACATAGATGCAGATACCCCAGAGATTTATTGGGATTTTAAAACCTCCATAATCATTTTTTCTTATTCTTTTTCTTTAAAAAATCATTATTTCTTCTTCTTCTCCTCCTCCTTCCTTTCTTCCCTTTAACATTCCCTCACCTTGTATTAGACCCTTTGCCTCAAACCTTCTTCCCTTTAACATTCTTTCATTTGCAACTATATATAATTATATGTGCATATAGATAGACATAATATATACCAACATTGTGTTTTGTTTTGGTTTGGTTTGGTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGAGATATTTATATACTTAGTCTTCTTCTGTTTCTTTCTCTCTAATTCTTCTTCTTCGTCATCTTCTTGAGAGATCGTGTTGATTGGTGTCACTCAAA


Gene Sequence:
>Vu_25582(-)
ATGGCTCAATTGCCACCAAAAGTTCCAAACATGACACCCAATTGGCCAGACTTTTCTTCTCCTCACCAAAAGATGCCTTCCCTCAAAACCATGGCACCAAACGTCTCAAACCAAAACCCTTCATGGGTGGATGAGTTTCTTGACTTCTCAGCCGCCAGACGCGGTGCTCACCGCCGCTCGGTGAGTGACTCCGTCGCCTTCCTGGAGGCACCAATGCTGGATCATCACTGCAAAAGCCGCGGGAGTGATGGTGGTGGTGACAATGAGAGCGAGTTCGAGAGGTTTGATGACGAACAATTCATGTCCATGTTCAGTGATGAGGCTTCAGGGAATAATAATAGTAATAATAATGACAATGATAATAATAATAATATCAACTACTACCATAGTAATAATAACACCATGATGGCACTCACGGTTTCCTGCTCCAACCCGTCTACACCCTCTGATCACAACAGCATCAACGATGAGAAGGAGATGATGAACAAGGAAAAGGAGGAGGAGCAAGAGAAGAAGCAAGTGAAGAATGAGTCAGATGAGGATGAAAGCCAATGCAAGCAAGAAATCACACAAAACCCCGATGATTGTAATAATAGTAACGCAAATGCAGCAACTTGTTCCAGTGAGAAAATCACAGACCCCAAGAGGGTCAAAAGGTATACTTAGTTAAACATTCATGTTCAATTCATGCTTTTAGTTCCTCGTAAACTTGCATTGCATTGACCCGTGTGATATTCAGTTCGGATAATAACGTTTCTCAAAACAAATGGATAATGTTTTAGTTACAACATTGAAACAAACAAGTAATGTACTATGTAAATATATATGTATTTCATGTTTGTTTTTTCTCTCGATAATATGAATACCTGTGACTATTTAATGTTTATGGATTACTCTTGTGGAAAACATGCTCTTCATGATATTCATCATCTGATTCCTGTTTTGCATTATCTCAGAATCTTGGCAAATAGACAATCGGCACAGAGATCAAGAGTGAGGAAGCTGCAATACATTTCTGAGCTTGAACGAAGTGTGACTTCATTACAGGTGCATTTAGTTGACTGTAAAAAGTTATATACAAGGCTTATGATATAATTAGATAGAATTAACAATTAGCAATTTACATGGTTTTGTTTGGCTTAACTGTTGATTCTCATGATAAATGAAGGCTGAAGTTTCTGTATTGTCTCCGCGAGTTGCATTTTTGGATCATCAACGTTTGCTTCTAAATGTTGACAACAGTGCTTTGAAGCAAAGAATCGCCGCGCTGGCCCAAGACAAGATCTTCAAAGATGGTACTTGCTTTACATGTTATCTTCTATTATTAAACTATATCATCATCTGCAGAAATCTTCTTTAGGAAACCAATTGTTGAATTAATTACTTATCATTTTGTTAATGTTGAAACGGCTGAGAGAGCCGAATGTTAATAACCTTCTGATTAAGGCTAACTTAGTAAATCGTACATTATTATCAATTAGATTGCATAAGCAAAAAAACTATATATATAGTAAATGGTAAGGGGTTGGTTTTTCATATCTAACTTGAAGGGAAAGTAATTATACTGTTTTTTTTCTAAAGTTAATATGTCTATTTCTGAAATCCTTTTATGTCAACTACTGTCAGTATCATGGACAGCACCTGTGTATGATAAAGAGTTAGTTTCAAGCTTTTAGAGTTAAGTTCACGAGAAAAAAAAATATATGATAAATAAAACACTTTTTTTGTATCTAACCTGTACTTTTCGAATTCAATAACAATAAGCATGCTACTCCTCGAAGTTGGTCTAGTATTCAGGATCATAAAAATTAAATACATTGTACTGTTTGCCTCTTTTTAGTGCAAGTTATTAAGAAAACTAGGTGTATAATTTTGTTCCTTCGAAAGGCAAAAGAAATAGGCCAATTATTAAGTTGCAGAGTAATGTTGATTTTAGTGAAAAAAAGGGTTGCATGCAAAGCATATCTAGATCAGTGTGCTAATCATGCATGTTGATTTTAGTCATTAAGCACGCAGTTATATATAAATAATGCAATCACGTACACAAATATATATAAATATATAAATGCAGCACATCAAGAAGCACTGAAGAGGGAGATAGAGAGACTGAGGCAAGTGTATCACCAACAAAACATAAAGAAGATGGACAATGCTGCAGGATCAACATCCCAATCACCATTACCATCTCCAAAACCACGATGTGACACACTCACTGAAAAGGAACAACTTATCAATGTCTGA