Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25560 LG6 23668414 23669641 PREDICTED: transcription factor bHLH30-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 23668596 synonymous_variant p.Glu61Glu
G/T 23668667 missense_variant p.Arg85Met
A/C 23668749 upstream_gene_variant
A/G 23668908 upstream_gene_variant
G/A 23668924 upstream_gene_variant
A/C 23668933 upstream_gene_variant
T/G 23669011 upstream_gene_variant
A/T 23669062 upstream_gene_variant
A/T 23669221 missense_variant p.Lys122Asn
T/A 23669455 missense_variant p.Phe200Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25560.1
MEIMEMEEFLWGGDIDGDVPKGNSDGFEGSSGMIGSGCGSSFSLVLDRERGELVEAPVKLERKGVSTERTTEALKNHSEAERRRRARINAHLDTLRSVIPGAMKMDKASLLGEVIRHLKELKRNAAQACEGLMIPKDNDEISVEEQEGGLNGFPYSIRASLCCEYKPGLLSDIRQALDSLHLMITRADIATLEGRMKNVFVIISCKEHNFEDASYRQFLAGSVHQALRSVLNRFSVSEDILGTRKRRRISIFSSSSLEDFL*


CDS Sequence:
>Vu_25560.1
ATGGAAATCATGGAAATGGAGGAATTTTTATGGGGTGGTGACATTGATGGGGATGTTCCTAAGGGGAACAGTGATGGTTTTGAAGGAAGCAGTGGAATGATTGGAAGTGGGTGTGGTTCATCTTTCTCTCTGGTTTTGGATAGGGAGAGAGGGGAGCTTGTGGAGGCTCCTGTGAAATTGGAGAGAAAAGGGGTGTCCACTGAGAGAACCACTGAAGCTTTGAAGAACCACAGCGAGGCAGAGAGGAGAAGGAGGGCAAGGATTAATGCACATCTTGATACTCTTCGCAGTGTCATTCCCGGTGCTATGAAGATGGACAAAGCATCATTACTTGGTGAGGTTATCAGACATTTGAAAGAGCTGAAAAGGAATGCAGCACAGGCTTGTGAAGGTTTGATGATACCAAAGGACAATGATGAAATAAGTGTTGAAGAACAAGAGGGTGGGTTGAATGGTTTTCCTTATTCAATTAGAGCATCACTATGTTGTGAATATAAACCTGGCCTGTTGTCTGATATAAGACAAGCACTAGATTCTCTTCATCTTATGATAACAAGGGCAGATATTGCAACCTTAGAAGGCAGAATGAAGAATGTTTTTGTGATCATTAGCTGCAAAGAACACAACTTTGAAGATGCTTCATACCGTCAGTTTCTGGCTGGTTCTGTTCACCAAGCTCTTAGATCTGTGCTCAATAGATTTTCTGTTTCAGAGGACATTTTAGGAACCAGGAAAAGAAGAAGGATTTCTATATTCAGTTCTTCATCTTTGGAAGATTTCTTGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_25560::LG6:23666414-23668414(+)
TTTCCTAATTTATCAAAGTTTTTTTTTTATATATTTTGAAAGTTTAAAATTTTAATTTTTCATGAAATTATAAATAAATTTTATATAATTTTAAGTTTGATTATGCTTAATATTTAATTTATAACATTTTAATTAGTAAGATAGTTCTATTTAATTGGGATGTTACATAAATAAATAATATATATTTTTTTTAGAAAAAGTATTAAAAGAAGGACGAGTTTTGTTAAAGAAAACCTTATGAAAATAAAAGTTTGTAATAAGAGTAGTTTTTTTTTCCTTATAACTTAATATTAACCATTTTAGTAATTTCATTATTAGAGTGTGTTGGTTTCTAGAGAAAAAAAAAACATTTTTCAGTTTGCTCTTAAGGAAGTATTTGAGCGAAAAGTATAATCAATTAACATAATAAATACTGTAATTTTTTCAAGTAGAACTTTTAAAAGAAAGACGATTTTATTTTCTTTTTTTTTTATCAATGAAAACATTAAGAACTAGAGAGATAAAATTTTCTCATTTTTAATTTTTTGTTGAAAAATTTCCAAGTTTAAGTAAGTGATTAAAATCTGAACATTTTTCCTTTAATAAAAAATGTAAATAAGATTTTTTTTTATTAAAATACTTTTCTGGTTTTTATAATATAACATTGACCATAAGAAGGTATTGTTTCGGAGAGAAGAAACACACAGAAATATTGTATCAAAAATAAAGTTTAAAAAAATAAGATAATAAAAATATGTAAATCGCTCAACAAAAACCATTATACATAAGAAACTCTTTTTGGCAGCTGAAGAACTATTTGCTTGGAAAATATATAATCAATTAACATAATTATATTTTAATATAATCAATTAATTTTTTAATGTAATTATAATTATATTTCTATCATAATGTAATAAGTAATTAAAATAAATATATTATAATAATAAATAAATTCATTTTAATATATATTTATTTTGAATTATAATGTTTTATTCATTAAAAGTTAATAATAATTGTTTGTTTTAATTTTAATTTATATTGTAATTTTTTTAGAAATATTCTTTTAATATACATAAAATTTTTCCACTACACTAATTAATTAAATCACCTATAAATTTACCGTTCATTTCCTTTCATTTTTGACTATTTTATCTTCGATTCAAACCATCTATCCAATCACTTTTTCTTCCTTTTCTTTTTGTACTCACAAAACAGTAATTACCAGAATTCAAAATCTATTTTTCTATCTTCTGGTGAAATTGTGTGTAGTAATGTCAACTTTTACTGCTGATTAACTGTATAAAAAAATAATTACTCATTTAGTAATTTTTAAAAATTTTCTTATTTATTCCAAAACCTTCAACTTGACTTTGTTTAAAATATTTGAACCCAGTTTCCTTCTACCAACAAATAGAGTACTGTATGAAGTTAGGTATTGACAATTTTTTTTGCATAATTTCCATCACAGATTTATCAATTATATATATTCCTGAATAGTGGACTGCTTCAAAAATCAATTTTGGTAGATTTGAAAACCACCCTATTGGAAGATTTGACCGAGCAAGTACAGATCTGAATTTAATTTGTTCTAAAAATGAAAAATGAATGGATTCTACATGATTCTGGTACGGGAAAGATATTTAAAATATAAAATGTTGCAGGAGGCACACTCAAATTTTTGTTGGGACAAACTAGTCGAATATAATATAAAAGGTGTTTGTGTGTGTTCTTCCATCCTTAGCAACACTGGTAAGTTTTCTGTAATCTTACTTAGTAAGTACCCTTCAGATCTTTACCATTACGTCCTTTGCCATCTTCATATGCTGCCACTGACACAGTTTCTGACACTCACCACTTGCACTCTCTATCTTTGGCTCCAAAGATACACTCCAAACCCACAATGAGAAAGAACAAAACAGCCCCCACTTTATGTTTCACTTGCTATTTCTGAAACTGCCGACCCTTTTGACCAACTAGCTTTTGTTATTATTCTTCTTGCTGTTGCTGTTGTTACTGAGCCA


Gene Sequence:
>Vu_25560(+)
ATGGAAATCATGGAAATGGAGGAATTTTTATGGGGTGGTGACATTGATGGGGATGTTCCTAAGGGGAACAGTGATGGTTTTGAAGGAAGCAGTGGAATGATTGGAAGTGGGTGTGGTTCATCTTTCTCTCTGGTTTTGGATAGGGAGAGAGGGGAGCTTGTGGAGGCTCCTGTGAAATTGGAGAGAAAAGGGGTGTCCACTGAGAGAACCACTGAAGCTTTGAAGAACCACAGCGAGGCAGAGAGGAGAAGGAGGGCAAGGATTAATGCACATCTTGATACTCTTCGCAGTGTCATTCCCGGTGCTATGAAGGTCTGTTCAACATTTTTTTTTTCAGGCATAATTTTTCTTTTCCTTTTCCTGTAAATGATTAGAAAGCATGTAAACCATTTGAATGTTTGTCAGAAAGGTAGTCATTTAATTGAATTGGGTCATGAAATTCAAGGGATGTGCAATAACGATCTGGTTAACTTTATCTGAATTTGGTTCATATCATGTTTGTAGTATTGCGTCATCTTCATTTGAGCTTTTAACCTTCTCTTCTGCTTCCATTACCATCTCAGAGTGTCCTGATGAAAAGTGTTGTTAGCTTGAATTTAATTGTTACTTTTGACTGTCAATGACTCGATTTGAGTTTTCTATCTAACTATGTGAACTTTAGTTTGATTTGAGAAGCTCAGATGTCAGTAGAAATAAACATGTTTCACTATTCATTCATTGTTTGAAAACTTGAGCTTCACTTTTGGACATGTAGATGGACAAAGCATCATTACTTGGTGAGGTTATCAGACATTTGAAAGAGCTGAAAAGGAATGCAGCACAGGCTTGTGAAGGTTTGATGATACCAAAGGACAATGATGAAATAAGTGTTGAAGAACAAGAGGGTGGGTTGAATGGTTTTCCTTATTCAATTAGAGCATCACTATGTTGTGAATATAAACCTGGCCTGTTGTCTGATATAAGACAAGCACTAGATTCTCTTCATCTTATGATAACAAGGGCAGATATTGCAACCTTAGAAGGCAGAATGAAGAATGTTTTTGTGATCATTAGCTGCAAAGAACACAACTTTGAAGATGCTTCATACCGTCAGTTTCTGGCTGGTTCTGTTCACCAAGCTCTTAGATCTGTGCTCAATAGATTTTCTGTTTCAGAGGACATTTTAGGAACCAGGAAAAGAAGAAGGATTTCTATATTCAGTTCTTCATCTTTGGAAGATTTCTTGTAA