Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25525 LG6 22858256 22873095 serine/threonine-protein kinase EDR1-like isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 22858313 missense_variant p.Trp20Arg
G/C 22858315 missense_variant p.Trp20Cys
G/T 22858317 missense_variant p.Trp21Leu
G/A 22858992 intron_variant
A/T 22859003 intron_variant
T/C 22859250 missense_variant p.Val114Ala
T/A 22859371 intron_variant
A/C 22859372 intron_variant
T/A 22859413 intron_variant
A/T 22860420 intron_variant
T/A 22860421 intron_variant
A/T 22861682 intron_variant
T/A,* 22862151 intron_variant
T/A 22862576 intron_variant
A/C 22862610 intron_variant
C/T 22862611 intron_variant
T/A 22862658 intron_variant
A/T 22862667 intron_variant
A/C 22863235 intron_variant
A/T 22863530 intron_variant
A/G 22863540 intron_variant
T/C 22863541 intron_variant
T/A 22864144 intron_variant
G/T 22864515 splice_region_variant&intron_variant
A/C 22864521 intron_variant
G/T 22865627 missense_variant p.Leu515Phe
G/A 22865710 intron_variant
T/A 22865956 intron_variant
T/G 22865998 intron_variant
T/A 22866309 intron_variant
G/A 22866602 missense_variant&splice_region_variant p.Gly577Ser
T/A 22866682 intron_variant
T/C 22866689 intron_variant
G/T 22866794 intron_variant
C/A 22866807 intron_variant
A/T 22866812 intron_variant
A/G 22866860 intron_variant
A/T 22872040 downstream_gene_variant
A/T 22872041 downstream_gene_variant
A/T 22872174 synonymous_variant p.Gly603Gly
C/G 22872430 splice_acceptor_variant&intron_variant
T/A 22872846 synonymous_variant p.Val731Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25525.1
MEEGREDAASAERRPSNMSWWPSDFVENFESVSLSSQDETLNNKELAGHANQDVMSPQKASQILWRTGMLSEPIPNGFYSVIPEKRLKKLFDSIPTLDELQALGGEAFRADVIVVDSEKDRRLSMLKQLIVALVKGLNSNPPAMIKKIAGLVSDFYKRSNVESPAKAALEESSHMFENHGVQMLGQIRHGSCRPRAILFKVLADTVGLESRLMMGFPNDGAADCVDSYKHMSVIVVLNSVELLVDLMRFPGQLLPRSTKSILMTHISAAGESDSAENDSCDSPLEPNSPLYGVSDSVEKEENLQFHRRFEVSSNVSGLPLRNRMLRSYTSLERNLSFSQSEPNIATAFGRRSRKKVIADQRTASSSPEHPSLRAHGLSKLSGDRTAFRDFADDQSKPRSSYKSDGASSSEARRIRRRSISMTPEIGDDIARLIVALLWLWKSNFNLDGHQERSPLYSLHHDPVTSQKAMSLPSSPHDYRGQASESSGVSEYPMNDELESTWNKVLQSPMFNDGPLLPYEEWNIDFTELTVGTRVGIGFFGEVFRGIWNGTDVAIKVFLEQDLTAENMEDFCNEISILSRLRHPNVILFLGACTKPPRLSMVTEYMEMGSLFYLIHVSGQKKKLSWRRRLKMLRDICRGLMHIHRMKIIHRDVKSANCLVDKHWTVKICDFGLSRIITESPMRDSLSAGTPEWMAPELIRNEPFTEKCDIFSLGVIMWELCTLNRPWEGVPPERVVYTVANEGSRLDIPEGPLGRLISECWAEPHERPSCEEILSRLVDIQYSLF*


CDS Sequence:
>Vu_25525.1
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Promoter Sequence:
>Vu_25525::LG6:22856256-22858256(+)
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Gene Sequence:
>Vu_25525(+)
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