Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25430 LG6 20951986 20957109 PREDICTED: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g27290
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 20954303 intron_variant
A/C 20954364 intron_variant
C/A 20954386 intron_variant
G/A 20954858 intron_variant
C/G 20954905 intron_variant
C/T 20954934 intron_variant
G/T 20954960 intron_variant
A/G 20956824 synonymous_variant p.Lys538Lys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25430.1
MESFEILGGCLLFLSLLSISSTLDMITPTQPLRDRMNENVTLVSTNGTFEAGFFSPGNSRSRYLGIWYKTISPRTVVWVANKETPLQDHSGVLELDSDQGFLSIKNGAGAQIWSSNASSNTPSKPVVVELLESGNMVVKDGHDNFLWQSFDYPGDTFLPGMKLGMNLKTGHHRALRSWKSLYDPTPGEFSFGVDTRGLPQLVITKSDDIVYRPGSWNGVRVTGVPAQGSHPLTKSLFVMNEDEIFYEIQLLNSSTKLRSRLLPEGYQIRLIWSDEGEKWDTVYSGSFDECERYGMCGANAICNVSGEPQHCECLSGFKSKAADSTCDRIRPLDCNKGDSFKKYEGVKLPDTSSSWYDTRMSLEECEKLCLSNCACTAYAQLNISANGSGCLQWFNDIVDIRTLADGQDFYLRIAASKFQDHALNRKIGGIILGCTIFIIAIVVFGFIFCLRRNKLKQSDFGMARIFNLDQDEANTNKVMGTYGYMPPEYAVHGSFSVKSDVFSFGVIVLEIISGRKNRGFRDPHNELNLLGHAWRLWIEKRPMELMDESMDNAVDPSQILRYIHIGLLCVQHRPEDRPNMSSVVLMLNGEKLLPEPTQPGFYTGRNNLTMTDSSLRNLDACSLNEMSETLLLAR*


CDS Sequence:
>Vu_25430.1
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Promoter Sequence:
>Vu_25430::LG6:20949986-20951986(+)
CAAAGCTCTGCCGACCACTCTCTATTTATCAAACATTCTCCCTCTGCTATCACTATTATCCTAGTATATGTTGATGATATCCTTCTTTCTGAAAATAACTTGTCTGAAATCACCACTGTCAAAGATCATCTCCACAGCAAGTTTCACATTAAAAATCTTGGAGATCTCAAATATTTTCTGGGATTCGAAATTGCTAGATCTCAAACTGGAATATGCATCAATCAAAGAAAATATTGTCTTGAATTGATTTCTAACGCTGGTATGTTAGGATGTAAACTTGCTCCCACCCCTGTTGATCCTTCTATCGAACTTCATGCTGATGAAGGCATCCTTCTCACAGATCCTTCTTCTTACCGGCATCTTATTGGACGACTTCTCTATCTCACTAATACATGGCCTGACATTGCTTTTGTCGTCCAACAACTTAGCCAGTTTGTTTCCGCTCCTCGTCAACCTCATATGCAACAAGCCATGAGGATCATTAGATACTTAAAGAATGCTCCTGGTTCTGATCTATTATATGCTGCTAATAATTCCTTCCGCATTCATGCATACTCTGATTCTGATTGGGCTATTATGCTACCACTAGAAGATTCATTTCTGATTTTTGCGTCTTTCTTGGAACTGCTCTTATCTCCTAGAAATCAAAGAAACAAACCACTGTTTCTAAATCTTCTTTTGAAACCAAATACAGGTCTTTAGCTTCCCTAACATGCGAATGTTTCTATCAAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTGTGTGTGTTCACTCATTAGTAAACACACTCATTCAATACTAAACATTATATGCACTCATTCTATCTTATTTATACTATTTTATTGACCTTGAGTATTAAAGAGTTTTCTACAAGGGGATCTGTCTCTAATCTTTATAAGCTCGGTCGAGATTGTTCAACAACAATCCAACACCCTAAGAGCATTGACTCCCCTTGAAGATTGCTTGGTGATTTCTGGAAATAACAAATATATATAATCCAATGTTCAAATTAATCCTCCTTTTGCTACTCCAGAGTAAGATATATTGTTGAGCAATATGCATTTCAATTTTATTCTCAACGCGAAGAACGAAGACAAAAACTTTTGATCTCGATTTTTAAAGTTACAAACTTTTTAACCACGAGCAAAATTGGAAAATAAATATAAAATATAATAAAGAATATGTTAGAGAATGATAACGACAGAAAAATATATAAACTACTATCCCAGTGCCTATCGTCAAGAGTGGAATGATCGCTATATTTATTTACCTTAAATTTGCTAGATATTTTTTTTGCCTTTTACCGTATTCATTGGTGTGGGGACGGTCACACGTACATGCTATTTATTATACGGGGAAAGTAATTATCAAAACATAAAGAATATAATTCTTTATTGTGTAAATCTCTATTTTCATTTATCTACTTGAATTGCATATTATTAATTTAAAGCTACTAATGAAGGAGACTTTTACCTAAAAGAGATTTGAAATGGTAGTCAATATGCGAACTTCAAGTTGCATCTGAATATCTTCATCAAATACTACTCTTAAGAAAATTTCTTTTGGTGTGTTTATCATGTTAAAACTCCATCAAACGCTTCTCTCAAGAAAATCGATTTTTTTAATGCTTATTAATATTTTTCAGTACTTGTCAAATCTATTTAGAGACAACTTTATATTGAATTATGAGCACAGGTTTAAATCCAGAATTACTCGTTCGAGTTAATGCATTAAGATTCTCATCAATTTCCGCAACTACCCGAGAAATAAATAGTCATTAAAGTATTTATTTATTCAGCCTTCTTTCCTTTATAGTGCATCTCACTAAATTAACCACAAATAAACACAGTCTTCACTGTTTGAATTTTCTTGACCATGTCCTAGGAGATGTTTATTTTCCTCTTTGTTGTTTATAACTAGCCAACCACATTGTCTATGATAGAAACCGTACCAAAATCAA


Gene Sequence:
>Vu_25430(+)
ATGGAGAGCTTTGAAATCCTTGGTGGATGCCTTTTGTTCCTCTCTTTGTTATCCATTTCCTCCACTTTGGACATGATTACTCCGACCCAACCTCTGAGAGATCGTATGAATGAGAATGTAACTCTTGTCTCAACAAATGGAACCTTTGAAGCAGGATTCTTCAGCCCTGGAAATTCCCGTAGCCGTTACCTTGGAATTTGGTACAAAACCATATCCCCCAGAACAGTGGTTTGGGTGGCCAACAAAGAAACACCACTTCAAGACCACTCTGGAGTCTTAGAACTAGACAGTGATCAAGGGTTTCTTAGTATAAAAAATGGCGCAGGAGCCCAAATATGGTCCTCAAATGCATCATCAAACACACCAAGCAAACCAGTTGTCGTGGAGTTGTTGGAATCAGGAAACATGGTTGTGAAAGATGGCCATGATAACTTTTTATGGCAAAGCTTTGATTACCCTGGTGATACTTTTCTTCCAGGAATGAAGCTTGGAATGAACTTGAAAACCGGTCATCACCGAGCTCTGAGATCTTGGAAATCCCTCTACGATCCTACTCCAGGTGAATTTTCATTTGGTGTTGATACTCGTGGCCTTCCTCAACTAGTTATCACGAAGAGTGATGACATAGTTTATAGACCAGGCTCTTGGAATGGTGTTAGAGTCACAGGAGTACCTGCACAAGGATCTCACCCATTAACGAAATCCCTTTTTGTTATGAATGAAGATGAAATCTTCTATGAGATTCAACTCTTGAATAGTTCAACTAAACTGAGAAGCAGATTGCTCCCAGAAGGGTATCAAATACGTTTAATATGGTCAGATGAGGGTGAAAAATGGGATACTGTATACTCTGGTTCGTTTGATGAGTGTGAGAGATATGGTATGTGTGGTGCTAATGCTATTTGCAACGTGAGTGGAGAACCTCAGCACTGCGAATGTTTGAGTGGATTCAAATCCAAAGCTGCGGATTCAACTTGTGATCGAATTAGACCTCTGGATTGCAACAAGGGAGATAGTTTTAAGAAGTACGAGGGAGTGAAATTGCCAGACACATCTTCATCTTGGTATGATACGAGAATGAGTCTTGAGGAATGCGAGAAATTGTGCTTGAGCAACTGCGCTTGTACTGCATATGCTCAATTGAATATCAGTGCCAACGGAAGTGGCTGCTTGCAATGGTTTAATGACATTGTTGACATCAGGACACTAGCAGATGGACAAGATTTTTATCTGCGAATTGCAGCTTCAAAATTTCAAGGTATGTATACCTTTTTACAATTCATTCTTGGTTAATTCTATCGTCTTTTCATGGATGCTAAGTTCTACCCTGCTAGAAAGTAAGAAGCATTTATGATGAATTATGAAATAGATACAAAGTTATGCTAGGTGAATGCAGGTACAGTAAGCGTACTCGGTAGAAGGTAAGGTATATATATACGGGGAAAAGAAAAAAACAAAATATACAAAGGGTATGCTATTAACTTTTTAGAAATATATATATGCAAATGATGAATACGAAATATTTGTGGATTTCGTGAAAGTATTTATTTATTTATTTATAAAAAAAGGAATTCTCATGACTCACATTGCTGAACAAGTTTCGACAATTGCGAAACTCAGGCGCTGAAATCGAATACTAAAGTAAACCCAAATTACTGCAAAATACCGTGATTATTTTTGAAAAATGTTTTCTTAATAATTTTTTTACAACAATCTCTGAATAGATTATGCAATAGTTTATGATGAATCAATTTTAAATATACAAACCAATAAAATAATTACACATAATTTATCATGAAAAAATTGTTAAAAAAATTGTTAACTTGTCAAAAGTCAAGAAAAAAAATACTTAGTCATGAATGGAGATGAGAAATAAATCTCTTTGCATAGGTATTATCGCATGAACATATCCCGCTTTCATTGAAGAATTTTCATATTAATTATATTAATTGAGCATGGATAAAAGTATGGTTAAAACTTGATTGTTTAAATTGGATATGGATTAAGGATAATAACGTGCATGTAAGTATGTAAAATTGTTTTAATTGGGTATGGATTACACGGATGAAGATGTATGAATATATGTATACCTAAGTATGTGCAAGACTTTATTGTTTACATTGTGTATGGATTATATATATCTTTTTATATGCATCTAACTCATTTATGTCATCACGTGTCATAATGTTACATTTTTGTTTTCTATTAATAAAATACTCAATTTATTCACTTTAAATATTTTTAATTATTTTTTATGTTTCAACTTAAGAATATTTTACTCTCAATTTTAAGTATAGTTAAATCCTTATAATTTATTTAGAAGAACATAACTTATATTCTTTGTTCTATTTGGTATAATTCATTCAATGTCTAAATTAAATTTTTCCCTTTGCTTGATTTCATTTAAATGATTGTATTTCGAGAAATAAAATCCTTGATTTATTGAATCAACACATCTAAACATTTTTAGTCTTTTCTACCATTATTTGATATTTATTTATTTATTATTTTGTACTTTAATTCAATACTTACACAATTATAATTTCTCTTATGATTTCTGAAATTGAATAAAAAATATATATAATCTTTATATTAAATACTTGATGTTTATATAACTCTAACAATATAAACATAACTAATATTTTAAACATCAATGGGTACTACCAGTACGATGTTATTATATCCATATTATTAGAGAGGGACCACACCCACCTATCTCTTGTCATCCTTGTAGTTACAAATGTTAAGCTCAACATTAAGAATGAAAGAAAATAATGGAGAAAGAAAAGAAAAATGTATTTGAGGGTGTAGAAAAATAATCGAAGTTAAGTAGGATGTTTTTGAAATTATTTTTATAAGAAAAGAAAAAAAAGTATACATGAAATAAAACAATAAAATAAGATATATATAACTTAAATTCGGATACTTATATTATTTTCTTTTCAAGTCTTTTATTTTCTTTCAATTTGGAAAGGTGCATATCCCTTATAAACCAGAAGATATGTTCCCAAGGTTAAGTTGTACAAGAATTTCTATATATCTCTGTTTCTGTTTATATGTGATGTAAATGGTCCAATGTGAAATTGTGTGTCTGTTGATTATTAGTTGATTATGTTCTTAATCTTTCAGATCACGCCTTAAACAGGAAGATAGGAGGAATTATACTTGGCTGCACTATATTCATCATCGCCATTGTAGTATTTGGGTTCATATTTTGCCTTAGGAGGAATAAACTCAAGCAGTCAGGTGAAGTCATTATGATTAAATATTGCCAATGTAATTTTTGTTATATTTTACTTTAAACCGAACAATGACGGAATGTAAATAATGTTAAAAAAAAATCCAAACAAATGACTGGATTCTTCAATTTACTATGGTTTGTTTGAAAATTAACAACCTTTAAATAAGTGGACCAAATACATATAACAAAACGCTTCTAAATAAATGAAAAATTAAAACTATTTATCTTTATTTTATCTCAATCAAAAATAAACTAAATTTTATTAAACCCAAAATAATAAAATAAGATTTAAACAAAATTATTAATAAATTCTTAAAATTTAAATTTACCTCAACAAATAACAATTAATCTTCGTTTCTATGCGTTGAATTTTGTTACACTTTACGGAAAATTCTTCTCTATTATATCTTTGTTTTGCATAAGATCTGATAATTTTTTTAGTGGCAGAAACAGAGTACTGGAAGGAGAAGAATAAGAACGATGACATTGATTTACCAATATTCGATTTTTTATACATCTCCGATGCCACAAATAACTTTTCTGAGAGTAATAAATTGGGACAAGGGGGATTTGGACCAGTGTACAAGGTATGAATTAAATTTTAGTTACCATTCATCTTCGCATAGAAATAACTTTTAAAAATTATTGTCAGGGCATATTATCAGATGGGCAAGAAATTGCAGTTAAGAGGCTTTCCAAAACTTCAGGACAAGGTTTGGACGAGTTTAAGAACGAAGTAATGTTGATTGCAAAACTTCAACACCGCAATCTGGTAAAGCTTCTTGGTTGTTCTTTTGAGCAAGAGGAAAAGCTGCTAATTTATGAATTCATGCCAAATAGAAGCTTGGATTACTTTATTTTTGGTGGGGCTTTTGTTATGATCTAATTATTCCAATTTTTGTGATATTTTCCGTCAGACTGTTATGCTAACATGGTAGTGAATTTTCAGATTCAATAAGAAGTACCTCAATAGGTTGGGCTAAGAGATTTGAAATCATTGATGGAATTGCTAGAGGACTCCTCTATCTTCATCAAGATTCTAGACTGAAAATCATTCATAGGGATCTCAAGACTAGTAATGTTCTTCTTGACAGCAATATGAAACCAAAAATATCAGATTTTGGTATGGCTAGGATATTTAACCTAGATCAAGATGAAGCAAACACAAATAAAGTGATGGGAACATAGTAAGTTTTTCTATACTTGTTTATTTCTTTCCCCTTTTGCAAACAGTTCTAAATGCTCATGTCTGAGTAATGCTTTTTTTCGCAGTGGTTATATGCCTCCCGAATATGCTGTACATGGATCATTTTCAGTCAAATCAGACGTATTTAGTTTTGGCGTAATTGTATTGGAGATAATCAGTGGGAGGAAGAATAGAGGATTTCGTGACCCACACAATGAGCTAAATCTTCTTGGACATGTAAGTTAAAAACTTAATAACAATGAGCTAAAATCTTTTTGTAACAATAAGTCTTACTGAACTAAGGATAAAACCAATTTATATAAATGAAAGTAAATCTTATTGTAAAATTGAGTTAAATTTAAAATTATTTTTTAATGATTTTTTATAGGCATGGAGATTATGGATTGAGAAAAGGCCAATGGAACTAATGGATGAATCAATGGACAATGCAGTTGATCCATCTCAAATATTAAGATATATTCATATTGGTTTGTTGTGCGTACAACATAGACCAGAGGATAGGCCAAATATGTCTTCGGTAGTTTTAATGTTGAACGGTGAAAAGTTATTGCC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