Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25429 LG6 20891624 20893993 TMV resistance protein N-like isoform X2
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 20891741 missense_variant p.Met385Ile
G/C 20891767 missense_variant p.Gln377Glu
T/C 20891821 missense_variant p.Arg359Gly
A/G 20891999 synonymous_variant p.Asp299Asp
C/A 20892311 intron_variant
G/A 20892903 intron_variant
A/G 20892909 intron_variant
T/G 20892938 intron_variant
T/C 20892960 splice_region_variant&intron_variant
C/A 20892983 missense_variant p.Val233Leu
T/A 20893123 intron_variant
G/T 20893292 missense_variant p.Pro202His
G/C 20893420 missense_variant p.Asn159Lys
A/G 20893894 missense_variant p.Phe34Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25429.1
MEENPSKDIMDVLRISYDGLENIEKEIFIDIACFFSNNNSYSWEPTVKKFLDYRQFYPDIGMKVLIEKSLISRQNGDIKMHDLLKELGKSIVREKAPKEPRKWSRLWNYKDLQKVMKINKEAENVEAIFIEQHGKEFLQGRIRVDALSKMDQLELLILNNVNCYGTLNFISNELRYLFWNHFPWLSLPSTFFLDQLVELILPRSNIKQLWEGKKCLPNLRNLDLIHSKNLIEVPDLSEVYLVARMEIVIPGSEIPKWFSKQKASTSISMDPSAVIDDPNWIGVSICALFVTHEVPMNLDERDYPTNGTLYYGVNNVINFGLKMYSRVSLKFKKDLVTVGLDYLLIVFYSRQDFIHLLNRHSDTMHDLQAVKFETWVQSLPGLHFMVKKCGYRWVFKEDLQQFNSDKFFSRNSSSRKRKLLTSE*


CDS Sequence:
>Vu_25429.1
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Promoter Sequence:
>Vu_25429::LG6:20893993-20895993(-)
AATTTGAAAGTAGGGAAAAACCAGAGAATTAAGAATTATAAGAGAAGGGCATGTGAAGTGAAGAAGTGAGGAAGGAAATTGCCAAAAAAATTATTTAAAAAAAAAAATCAAAACTTAACTATAGTTTCCTATCAAAATGTCGGAAATTAGTGGAGGTTTTTTAAACTCTCGAAAGATACTTCTTCTAAACACAATTTAAACAAATTTGACTCTGTTCAGAATGAACTCTTTAAGCAGCACTCCATTACTTTGCTTGAAATTTCTAAGCGCCAAATTATCACCAACAAAGAAATAAGTTCATATCAATTTTGGTCAATCATTAAGTCAAGGGGGTTGCCGGCACTAACGTATATACTTCATAACATTTATTTTATAATAATTTCAAGGCAAAATAAATTACAATTGACACAAAAGAAACTCCGATGAATGTGTTGCAGTAATTTAAAAATAATATCACACTAAGTAATAATTTTATAACGTAACAAAAAACTTATTAAACAGAATGTATATTTTATAGAAATGATTTCGATGAGTCCCACACCTACGAAAACGACATCCAATTACGCGTTTTTGTCATTTGTTTTATAAACGACTTGACTATGATCGACACCTTGAGAGTACTATCCAATACGCACATTAATCTTTTATGCTGGTCACTCTCCACCTTCTGCAATGGCTTGCAACAAAAGACAACGGAGCTCTTCATCAAACACCAAGAATTTTGATGTGTTTGTTAGCTTTAGAGGTGCAGATACTCGTAACGGTTTCACAAATCACCTTTTTGCAGCTCTTCAAAGAAAAGGAGTTGTTGCTTTCAGAGATGACCAAACAATCCAGAAAGGGGACTTTTTGGAGTCTGAACTCTTGCACGCAATCGAAGGATCTCGCGTTTTCATTGTTGTCTTCTCAAAGGACTATGCATCATCCACATGGTGCATGAAAGAGCTTACGAAGATCGTCGATTGGGTTGAAGTAACAGGTCGAAGTTTGCTCCCTATTTTCTATGATGTCACTCCTTCTGAGGTCCGAAAACAGAGTGGAGAGTTTGCAAAAGCTTTTGCTGAACACGAAGAAAGGTTCAAAGGCGACTTGGAAATGGTAAAAGAATGGAGGGCAGCTCTCAAAACAAGCTGCGATCGTTGTGGGTGGGATGTGCAAAATAAGTAAGTACATATACCCATACTTTTGTTATGCTATTTTTCAAAGTCTTAACTAAACTCTCTGTGATGATTGAACTTTGGCCGCATAGGCAACAATATGAAGAAATTGAAAACGTTGTTGAAGAGGTAATCAACATATTGGGTCGTGATCAAATTTGGAATTTTGGCGATGATTTAGTTGACATGCATTCTCGTGTTAAAAAATTGGAAGAACTTCTAGATCTGAGTGCTAATGATATTGTTCACCTTGTGGGAATTGTTGGAATGGGTGGAATAGGAAAGACCACACTTGCAACTGCATTGTTCAATAAAATCTCTCCTCAATTTAATGCTTGTTGTTACCTTGATGATTTAAGCAAAATTTATTGTAATTTTGGAGCAGCAAGTGCACAAAAACAACTTCTTTGTCAAGCTCTAAATCAAGGAAATATCGAGATACACAATGCTTCCCATGGAACTATGTTGATAAGAACTAGATTATGTCACTTAAAAGCGCTTGTTGTTGTTGATAATGTTGATCAAGTTGAACAATTAAAGAAATTGGGTTTGCAATCTGAATATCTGGGTGCAGGGAGCAGAATCATCATAATTTCTAGAAATTGTCGTATCTTGCAAAATTACGGAGTAAATAAAGTTTACCAAGTTGAAGTCTTGGACAAAACTCAATCTCTTCAATTACTTCGCAAGAAAGCTTTTAGATCGAATGATATTGGGAAAGAACATAAAGGGTTGACATTAGATATACTGAAGTATGTGAATGGTCTTCCATTAGCTATTGAAGTATTGGGCTCATTTTTACTTGATCGAGATGTTTGTGAATGGAGAAGTGCATTGACTAGA


Gene Sequence:
>Vu_25429(-)
ATGGAAGAAAATCCAAGCAAAGATATCATGGATGTGTTGCGAATAAGTTATGATGGATTGGAGAATATAGAGAAAGAAATATTTATAGATATTGCTTGTTTCTTCTCCAATAATAATTCCTACTCATGGGAGCCAACAGTGAAGAAATTTTTGGACTATCGACAATTTTATCCTGACATTGGTATGAAAGTTCTGATTGAGAAGTCACTTATAAGTCGTCAAAATGGAGATATTAAAATGCATGACTTGTTGAAAGAGTTGGGTAAGAGTATTGTCCGAGAAAAAGCACCCAAAGAACCAAGGAAGTGGAGCAGGTTATGGAACTACAAGGATCTCCAAAAAGTCATGAAAATAAATAAGGTATTTTTTTTAATATACATTCTTATCTTGTCATTCTTTAGGAGTTTACAAATTATAAAAAATATGTAATGATTTTTCCCTGTATAAAATGCTTTAGGAAGCCGAAAATGTTGAAGCTATATTTATTGAACAACATGGAAAAGAGTTTCTACAAGGAAGAATAAGAGTGGATGCTTTATCAAAAATGGATCAGCTTGAGTTGCTCATTCTGAACAATGTGAACTGTTATGGAACTCTCAATTTCATTTCTAATGAACTGAGATATCTATTTTGGAATCACTTTCCTTGGTTGTCTTTGCCATCAACTTTCTTTCTAGATCAACTTGTAGAATTGATCCTACCTCGTAGCAATATCAAGCAATTATGGGAAGGAAAAAAGGTACTATATTGTTGGTATTTATATATTTTTTTTTCTCAAACAAACAAAAAGATGCTCTATCTCACATTTTCTTTGCTTTCTTTTACATGGTCATTTTTTCAACTTACATTTACACAGAAGAAAAAGAGGGGAAGGTTAACCTTTTTTCATTTATCGTTTTATCTTTTAACCTTTTTAATGGAAAATTGAAATTTTCTTATTTATGTTTCTCTTACAGTGTCTGCCTAATTTGAGAAATTTGGATCTGATTCACTCCAAAAATCTTATTGAGGTGCCAGACTTAAGTGAGGTTCCACGTCTTACGGATCTTAATCTCAAAGGATGTATACAACTAGTCCACATCCATCCATCCATTGGTATTCTAAGAGACCTTCGTCGTTTGAATTTGATGAATTGTAAAAATCTTGTCCTTAATCTGAATATCCTTTTTGGGATCAGTTCTCTTAAGAGCTTAAATATCTCAGGCTGTTCACAATTACTTAATAGTAAGATGTTAATGGACCCAAGTGACACAAAACATTTGGAGAAAGTTGATAAAAATACAAATATCATCCAATTGCCAACATCCTCTGTATACAAACTTCTAATGTTGCCTTTCCATTTTTTCTACCCTCCAAAACCTCAAGTTTCACTTGGTTTGTTATCGTCTTTTTTGTCTTTCTCTGTCCCGTGTTTGTGTGATCTTGACATAAGCTTCTGTAATCTACTTCAAATCCCAGATGAAATTGGGAACTTACGTTCTTTAAAAATATTAAATTTGGGGGGAAACAAATTTGTGACACTACCAAGCACCATCAAGCAACTTTCCAATCTTCGATGTTTGAACTTGACACACTGCAAGGAGCTAAAATATTTGCCCGAGCTTCCAACAATACAAGAAAAAACAATTGACAGATACAGTGGGCGCTTATACACTTTTGACTGCCCCATGTTGAGTGATATGGAACACTGTTATAGCATAGTTTTTTCTTGGATGACGAATAATCTTGAGGTGACGACGACTCCATCCTTTCTTTTGTGTCTCACTTTTTCTGTGTACACTATTTATGTATAACTGGATTTGCTTTAATCAGGTTTACTTGGTCGCTCGGATGGAAATTGTTATTCCTGGAAGTGAAATTCCAAAATGGTTCAGTAAACAAAAGGCAAGTACATCAATAAGTATGGACCCATCTGCTGTTATAGATGACCCAAATTGGATAGGTGTTTCCATTTGTGCTCTATTTGTCACACACGAAGTTCCTATGAATTTGGATGAAAGAGATTATCCTACAAACGGTACTCTTTATTACGGTGTCAATAATGTCATCAACTTTGGGCTAAAAATGTATTCAAGAGTTTCTCTAAAATTCAAGAAAGATCTGGTGACGGTTGGGTTAGATTATTTGTTGATAGTGTTTTACTCTCGACAAGATTTCATTCATCTTCTAAATAGACATTCAGATACCATGCATGATCTTCAAGCAGTTAAATTTGAAACTTGGGTTCAGAGTCTTCCAGGTTTACATTTTATGGTGAAGAAGTGCGGGTATCGTTGGGTATTTAAGGAGGATCTTCAACAATTCAACTCAGACAAGTTTTTCAGCAGAAATTCTTCATCACGGAAGAGGAAGCTTCTAACAAGTGAGTAA