Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25424 LG6 20762578 20764990 TMV resistance protein N-like isoform X2
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 20763210 stop_gained p.Trp179*
T/A 20763219 missense_variant p.Phe182Tyr
G/A 20763573 synonymous_variant p.Thr243Thr
A/T 20763777 intron_variant
T/C 20763791 intron_variant
A/C 20764301 intron_variant
G/T 20764310 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25424.1
MEENPSKDIMDVLRISYDGLENIEKEIFIDIACFFSNNNSYSWEPTVKKFLDYRQFYPDIGMKVLIEKSLICRQNGNIKMHDLLKELGKSIVREKAPKEPRKWSRLWNYKDLQKVMKINKEAENVEAIFIEQHEKEFLQGRIRVDALSKMDQLELLILKNVNCYGTLNFISNELRYLFWNHFPWLSLPSTFFPDQLVELILPRSNIKQLWEGKKCLPNLRNLDLSHSKNLIEVPDLSEVPRLTDLDLKGCIQLVHIHPSIGILRDLRRLNLKSCKNLIEVSDLSEVYLVPRMEIVIPGSEIPKWFSKQKASTSISMDPSAVIDDPNWIGVSICVLFVTHEGPMNLGERDYPINDLFYGVNNFGQKTYKGVSIILKKDLVTVGLDYLLIVFYSRQEFIHPQAVKFETRVASGLRFMVKKCGYRWVFKEDLRQFNSDKFFSRNSSSRKRKLLTSE*


CDS Sequence:
>Vu_25424.1
ATGGAAGAAAATCCAAGCAAAGATATCATGGATGTGTTGCGAATAAGTTATGATGGATTGGAGAATATAGAGAAAGAAATATTTATAGATATTGCTTGTTTCTTCTCCAATAATAATTCCTACTCATGGGAGCCAACAGTGAAGAAATTTTTGGACTATCGACAATTTTATCCTGACATTGGTATGAAAGTTCTGATTGAGAAGTCACTTATATGTCGTCAAAATGGAAATATTAAAATGCATGACTTGTTGAAAGAGTTGGGTAAGAGTATTGTCCGAGAAAAAGCACCCAAAGAACCAAGGAAGTGGAGCAGGTTATGGAACTACAAGGATCTCCAAAAAGTCATGAAAATAAATAAGGAAGCCGAAAATGTTGAAGCTATATTTATTGAACAACATGAAAAAGAGTTTCTACAAGGAAGAATAAGAGTGGATGCTTTATCAAAAATGGATCAGCTTGAGTTGCTCATTCTGAAGAATGTGAACTGTTATGGAACTCTCAATTTCATTTCTAATGAACTGAGATATCTATTTTGGAATCACTTTCCTTGGTTGTCTTTGCCATCAACTTTCTTTCCAGATCAACTTGTAGAATTGATCCTACCTCGTAGCAATATCAAGCAATTATGGGAAGGAAAAAAGTGTCTGCCTAATTTGAGAAATTTGGATCTGAGTCACTCCAAAAATCTTATTGAGGTGCCAGACTTAAGTGAGGTTCCACGTCTTACGGATCTTGATCTCAAAGGATGCATACAACTAGTCCACATCCATCCATCCATTGGTATTCTAAGAGACCTTCGTCGTTTGAATTTGAAAAGTTGTAAAAATCTTATTGAGGTGTCAGACTTAAGTGAGGTTTACTTGGTCCCTCGGATGGAAATTGTTATTCCTGGAAGTGAAATTCCAAAATGGTTCAGTAAACAAAAGGCAAGTACATCAATAAGTATGGACCCATCTGCTGTTATAGATGACCCAAATTGGATAGGTGTTTCCATTTGTGTTCTATTTGTCACACACGAAGGTCCTATGAATTTGGGTGAAAGAGATTATCCAATAAACGATCTTTTTTACGGTGTCAATAACTTTGGGCAAAAAACGTATAAAGGAGTTTCTATAATATTGAAGAAAGATCTGGTGACAGTTGGGTTAGATTATTTGTTGATAGTGTTTTACTCTCGACAAGAATTCATTCATCCTCAAGCAGTTAAATTTGAAACTAGGGTTGCGAGTGGTTTACGTTTTATGGTGAAGAAGTGCGGGTATCGTTGGGTATTTAAGGAGGATCTTCGACAATTCAACTCAGACAAGTTTTTCAGCAGAAATTCTTCATCACGGAAGAGGAAGCTTCTAACAAGTGAGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_25424::LG6:20760578-20762578(+)
TGCCTACTTTGGTGCAAAAGCCAGAGAATTAAGAATTATAAGAGAAGGGCATGTGAAGTGAAGAAGTGAGGAAGGAAATTGCCAAAAAAATTATTTAAAAAAAAAATCAAAACTTAACTATAGTTTCCTATCAAAATGTCGGAAATTAGTGGAGGTTTTTTAAACTCTCGAAAGATACTTCTTCTAAACACAATTTAAACAAATTTGACTCTGTTCAGAATGAACTCTTTAAGCAGCACTCCATTACTTTGCTTGAAATTTCTAAGCGCCAAATTATCACCAACAAAGAAATAAGTTCATATCAATTTTGGTCAATCATTAAGTCAAGGGGGTTGCCGGCACTAACGTATATACTTCATAACATTTATTTTATAATAATTTCAAGGCAAAATAAATTACAATTGACACAAAAGAAACTCCGATGAATGTGTTGCAGTAATTTAAAAATAATATCACACTAAGTAATAATTTTATAACGTAACAAAAAACTTATTAAACAGAATGTATATTTTATAGAAATGATTTCGATGAGTCCCACACCTACGAAAACGACATCCAATTACGCGTTTTTGTCATTTGTTTTATAAACGACTTGACTATGATCGACACCTTGAGAGTACTATCCAATACGCACATTAATCTTTTATGCTGGTCACTCTCCACCTTCTGCAATGGCTTGCAACAAAAGACAACGGAGCTCTTCATCAAACACCAAGAATTTTGATGTGTTTGTTAGCTTTAGAGGTGCAGATACTCGTAACGGTTTCACAAATCACCTTTTTGCAGCTCTTCAAAGAAAAGGAGTTGTTGCTTTCAGAGATGACCAAACAATCCAGAAAGGGGACTTTTTGGAGTCTGAACTCTTGCACGCAATCGAAGGATCTCGCGTTTTCATTGTTGTCTTCTCAAAGGACTATGCATCATCCACATGGTGCATGAAAGAGCTTACGAAGATCGTCGATTGGGTTGAAGTAACAGGTCGAAGTTTGCTCCCTATTTTCTATGATGTCACTCCTTCTGAGGTCCGAAAACAGAGTGGAGAGTTTGCAAAAGCTTTTGCTGAACACGAAGAAAGGTTCAAAGGCGACTTGGAAATGGTAAAAGAATGGAGGGCAGCTCTCGAAACAAGCTGCGATCGTTGTGGGTGGGATGTGCAAAATAAGTAAGTACATATACCCATACTTTTGTTATGCTATTTTTCAAAGTCTTAACTAAACTCTCTGTGATGATTGAACTTTGGCCGCATAGGCAACAATATGAAGAAATTGAAAACGTTGTTGAAGAGGTAATCAACATATTGGGTCGTGATCAAATTTGGAATTTTGGCGATGATTTAGTTGACATGCATTCTCGTGTTAAAAAATTGGAAGAACTTCTAGATCTGAGTGCTAATGATATTGTTCACCTTGTGGGAATTGTTGGAATGGGTGGAATAGGAAAGACCACACTTGCAACTGCATTGTTCAATAAAATCTCTCCTCAATTTAATGCTTGTTGTTACCTTGATGATTTAAGCAAAATTTATTGTAATTTTGGAGCAGCAAGTGCACAAAAACAACTTCTTTGTCAAGCTCTAAATCAAGGAAATATCGAGATACACAATGCTTCCCATGGAACTATGTTGATAAGAACTAGATTATGTCACTTAAAAGCGCTTGTTGTTGTTGATAATGTTGATCAAGTTGAACAATTAAAGAAATTGGGTTTGCAATCTGAATATCTGGGTGCAGGGAGCAGAATCATCATAATTTCTAGAAATTGTCGTATCTTGCAAAATTACGGAGTAAATAAAGTTTACCAAGTTGAAGTCTTGGACAAAACTCAATCTCTTCAATTACTTCGCAAGAAAGCTTTTAGATCGAATGATATTGGGAAAGAACATAAAGGGTTGACATTAGATATACTGAAGTATGTGAATGGTCTTCCATTAGCTATTGAAGTATTGGGCTCATTTTTACTTGATCGAGATGTTTGTGAATGGAGAAGTGCATTGACTAGAA


Gene Sequence:
>Vu_25424(+)
ATGGAAGAAAATCCAAGCAAAGATATCATGGATGTGTTGCGAATAAGTTATGATGGATTGGAGAATATAGAGAAAGAAATATTTATAGATATTGCTTGTTTCTTCTCCAATAATAATTCCTACTCATGGGAGCCAACAGTGAAGAAATTTTTGGACTATCGACAATTTTATCCTGACATTGGTATGAAAGTTCTGATTGAGAAGTCACTTATATGTCGTCAAAATGGAAATATTAAAATGCATGACTTGTTGAAAGAGTTGGGTAAGAGTATTGTCCGAGAAAAAGCACCCAAAGAACCAAGGAAGTGGAGCAGGTTATGGAACTACAAGGATCTCCAAAAAGTCATGAAAATAAATAAGGTATTTTTTTTAATATACATTCTTATCTTGTCATTCTTTAGGAGTTTACAAATTATAAAAAATATGTAATGATTTTTCCCTGTATAAAATGCTTTAGGAAGCCGAAAATGTTGAAGCTATATTTATTGAACAACATGAAAAAGAGTTTCTACAAGGAAGAATAAGAGTGGATGCTTTATCAAAAATGGATCAGCTTGAGTTGCTCATTCTGAAGAATGTGAACTGTTATGGAACTCTCAATTTCATTTCTAATGAACTGAGATATCTATTTTGGAATCACTTTCCTTGGTTGTCTTTGCCATCAACTTTCTTTCCAGATCAACTTGTAGAATTGATCCTACCTCGTAGCAATATCAAGCAATTATGGGAAGGAAAAAAGGTACTATATTGTTGGTATTTATATTTTTTTTTTCTCAAACAAACAAAAAGATGCTCCATCTCACATAGAGAAAAAAAAGAGGGGAAGGTTAACCTTTTATCATTTAGCGTTTTATCTTTTAACCTTTTTAATGGAAAATTGAAATTTTCTTACTTATGTTTCTCTTACAGTGTCTGCCTAATTTGAGAAATTTGGATCTGAGTCACTCCAAAAATCTTATTGAGGTGCCAGACTTAAGTGAGGTTCCACGTCTTACGGATCTTGATCTCAAAGGATGCATACAACTAGTCCACATCCATCCATCCATTGGTATTCTAAGAGACCTTCGTCGTTTGAATTTGAAAAGTTGTAAAAATCTTATTGAGGTGTCAGACTTAAGTGAGGTTCCACGTCTTACGAATCTTAATCTCAAAGGATGTATACAACTAGTCCACATCCATCCATCCATTGGTATTCTAAGAGACCTTCGTCGTTTGAATTTGAAGAATTGTAAAAATCTTGTCCTTAATCTGAATATCCTTTTTGGGATCAGTTCTCTTAAGAGTTTAAATATCTCAGGCTGTTCACAATTACTTAATAGTAAGATGTTAATGGACCCAAGTCACACAAAACATTTGGAGAAAGTTGATAAAAATACAAATATCATCCAATTGCCAACATCCTCTGTATACAAACTTCTAATGTTGCCTTTCCATTTTTTCTACCCTCCTAAACCTCAAGTTTCACTTGGTTTGTTATCGTCTTTTTTGTCTTTCTCTGTCCCGTGTTTGTGTGATCTTGACATAAGCTTCTGTAATCTACTTCAAATCCCAGATGAAATTGGGAACTTACGTTCTTTAAAAATATTAAATTTGGGGGGAAACAAATTTGTGACACTACCAAGCACCATCAAGCAACTTTCCAATCTTCGATGTTTGAACTTGACACAGTGCAAGGAGTTAAAATATTTGCCCGAGCTTCCAACAATACAAGAAAAAACAATTGACAGATACAGTGGGCGCTTATACACTTTTGACTGCCCCATGTTGAGTGATATGGAACACTGTTATAGCATAGTTTTTTCTTGGATGACGAAAAATCTTGAGGTGACGACGACTCCATCCTTTCTTTTGTGTCTCACTTTTTCTGTGTACACTATTTATGTATAACTGGATTTGCTTTAATCAGGTTTACTTGGTCCCTCGGATGGAAATTGTTATTCCTGGAAGTGAAATTCCAAAATGGTTCAGTAAACAAAAGGCAAGTACATCAATAAGTATGGACCCATCTGCTGTTATAGATGACCCAAATTGGATAGGTGTTTCCATTTGTGTTCTATTTGTCACACACGAAGGTCCTATGAATTTGGGTGAAAGAGATTATCCAATAAACGATCTTTTTTACGGTGTCAATAACTTTGGGCAAAAAACGTATAAAGGAGTTTCTATAATATTGAAGAAAGATCTGGTGACAGTTGGGTTAGATTATTTGTTGATAGTGTTTTACTCTCGACAAGAATTCATTCATCCTCAAGCAGTTAAATTTGAAACTAGGGTTGCGAGTGGTTTACGTTTTATGGTGAAGAAGTGCGGGTATCGTTGGGTATTTAAGGAGGATCTTCGACAATTCAACTCAGACAAGTTTTTCAGCAGAAATTCTTCATCACGGAAGAGGAAGCTTCTAACAAGTGAGTAA